More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0568 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_0568  30S ribosomal protein S3  100 
 
 		 278 aa  556  1e-157  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1092  SSU ribosomal protein S3P  80.21 
 
 		 288 aa  432  1e-120  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0581638 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4315  ribosomal protein S3  92.99 
 
 		 272 aa  414  9.999999999999999e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4501  ribosomal protein S3  74.91 
 
 		 308 aa  399  9.999999999999999e-111  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0588  30S ribosomal protein S3  87.16 
 
 		 315 aa  394  1e-109  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6043  30S ribosomal protein S3  88.07 
 
 		 325 aa  397  1e-109  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.80949  normal  0.136813 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5130  ribosomal protein S3  89.47 
 
 		 268 aa  393  1e-108  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.805435 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2640  30S ribosomal protein S3  88.04 
 
 		 270 aa  389  1e-107  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.659159  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3899  30S ribosomal protein S3  77.29 
 
 		 278 aa  390  1e-107  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0694  ribosomal protein S3  72.7 
 
 		 282 aa  386  1e-106  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.429613 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0312  30S ribosomal protein S3  82.97 
 
 		 341 aa  387  1e-106  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00243469 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0937  30S ribosomal protein S3  82.96 
 
 		 292 aa  382  1e-105  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0855011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4309  ribosomal protein S3  79.5 
 
 		 288 aa  377  1e-104  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.395435  hitchhiker  0.00385634 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3917  ribosomal protein S3  79.92 
 
 		 288 aa  378  1e-104  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.490752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1019  30S ribosomal protein S3  78.01 
 
 		 287 aa  377  1e-103  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6608  ribosomal protein S3  76.15 
 
 		 275 aa  376  1e-103  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1036  30S ribosomal protein S3  78.01 
 
 		 287 aa  377  1e-103  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.261714  normal  0.488282 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1046  30S ribosomal protein S3  78.01 
 
 		 287 aa  377  1e-103  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29680  SSU ribosomal protein S3P  76.42 
 
 		 276 aa  371  1e-102  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.778759 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1129  ribosomal protein S3  72.76 
 
 		 279 aa  370  1e-102  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04040  SSU ribosomal protein S3P  84.54 
 
 		 286 aa  368  1e-101  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10721  30S ribosomal protein S3  77.59 
 
 		 274 aa  369  1e-101  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.680794  normal  0.235718 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5043  30S ribosomal protein S3  76.76 
 
 		 278 aa  366  1e-100  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.084323  normal  0.283696 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3752  ribosomal protein S3  83.1 
 
 		 272 aa  367  1e-100  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.40456  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0593  ribosomal protein S3  75.62 
 
 		 271 aa  362  3e-99  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.122908  normal  0.632593 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2969  SSU ribosomal protein S3P  78.22 
 
 		 277 aa  362  3e-99  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.530475  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3429  ribosomal protein S3  80.54 
 
 		 268 aa  362  4e-99  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2681  ribosomal protein S3  75.93 
 
 		 276 aa  362  5.0000000000000005e-99  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1311  30S ribosomal protein S3  75.93 
 
 		 280 aa  361  9e-99  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.119681 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3137  ribosomal protein S3  74.58 
 
 		 258 aa  359  3e-98  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0633  ribosomal protein S3  76.07 
 
 		 279 aa  356  1.9999999999999998e-97  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20810  SSU ribosomal protein S3P  78.08 
 
 		 276 aa  355  2.9999999999999997e-97  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23750  SSU ribosomal protein S3P  70.82 
 
 		 280 aa  352  2.9999999999999997e-96  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.167158  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2653  ribosomal protein S3  75.45 
 
 		 276 aa  348  7e-95  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17100  SSU ribosomal protein S3P  78.67 
 
 		 272 aa  347  1e-94  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0525637  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1191  30S ribosomal protein S3  73.53 
 
 		 265 aa  325  5e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.124427 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1713  30S ribosomal protein S3  69.86 
 
 		 267 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.295513  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0260  ribosomal protein S3  71.09 
 
 		 272 aa  316  2e-85  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2172  ribosomal protein S3  61.99 
 
 		 237 aa  283  2.0000000000000002e-75  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.686933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23410  SSU ribosomal protein S3P  61.99 
 
 		 244 aa  281  6.000000000000001e-75  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000415625  hitchhiker  0.000000143523 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2454  30S ribosomal protein S3  62.56 
 
 		 219 aa  280  2e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.14409 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2024  ribosomal protein S3  57.85 
 
 		 224 aa  276  2e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.145772  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1939  ribosomal protein S3  57.85 
 
 		 224 aa  276  2e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1940  SSU ribosomal protein S3P  60.19 
 
 		 224 aa  276  3e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1346  ribosomal protein S3  60.68 
 
 		 395 aa  276  3e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0221  30S ribosomal protein S3  60.39 
 
 		 221 aa  276  3e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000649554  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1179  ribosomal protein S3  54.81 
 
 		 262 aa  275  8e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.484191  normal  0.192694 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0428  30S ribosomal protein S3  59.71 
 
 		 219 aa  274  1.0000000000000001e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00750639  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4921  ribosomal protein S3  58.45 
 
 		 230 aa  274  1.0000000000000001e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0969238  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01230  ribosomal protein S3  60.39 
 
 		 214 aa  274  1.0000000000000001e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.845852  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0404  ribosomal protein S3  65.7 
 
 		 288 aa  273  2.0000000000000002e-72  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4020  ribosomal protein S3  53.39 
 
 		 260 aa  272  4.0000000000000004e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.251089  hitchhiker  0.00000649383 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0231  ribosomal protein S3  60 
 
 		 218 aa  272  5.000000000000001e-72  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1917  ribosomal protein S3  56.95 
 
 		 224 aa  271  6e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.652876 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2851  30S ribosomal protein S3  60.19 
 
 		 211 aa  271  8.000000000000001e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.588721  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0292  30S ribosomal protein S3  59.42 
 
 		 220 aa  271  8.000000000000001e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0100891  normal  0.0448261 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1739  ribosomal protein S3  61.5 
 
 		 222 aa  270  2e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000032444  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0707  30S ribosomal protein S3  58.85 
 
 		 210 aa  269  2.9999999999999997e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000377493  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0632  30S ribosomal protein S3  60.19 
 
 		 211 aa  269  2.9999999999999997e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000111736  hitchhiker  0.00000000169292 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1352  30S ribosomal protein S3  59.71 
 
 		 210 aa  269  4e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.112713  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0853  SSU ribosomal protein S3P  57.35 
 
 		 210 aa  268  5.9999999999999995e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000111374  hitchhiker  0.000095719 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1518  ribosomal protein S3  59.72 
 
 		 220 aa  268  7e-71  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.337721  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0939  30S ribosomal protein S3  58.1 
 
 		 211 aa  268  7e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0016445  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1073  30S ribosomal protein S3  58.1 
 
 		 210 aa  268  7e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000789266  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0686  30S ribosomal protein S3  58.74 
 
 		 210 aa  268  7e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.15256  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3322  30S ribosomal protein S3  58.1 
 
 		 211 aa  268  8.999999999999999e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000677184 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3018  ribosomal protein S3  52.48 
 
 		 241 aa  267  1e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0195481  hitchhiker  0.00883263 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2396  30S ribosomal protein S3  56.13 
 
 		 217 aa  267  1e-70  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0132783  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0987  ribosomal protein S3  59.81 
 
 		 245 aa  266  2e-70  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.499926  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1155  ribosomal protein S3  62.02 
 
 		 236 aa  266  2.9999999999999995e-70  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000113812  hitchhiker  0.0000354115 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0113  30S ribosomal protein S3  59.07 
 
 		 218 aa  266  4e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09940  SSU ribosomal protein S3P  57.66 
 
 		 235 aa  265  5.999999999999999e-70  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.257564  hitchhiker  0.00000258289 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0764  ribosomal protein S3  55.76 
 
 		 222 aa  265  7e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000320467  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0064  30S ribosomal protein S3  57.77 
 
 		 217 aa  264  1e-69  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00697995  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0117  30S ribosomal protein S3  57.21 
 
 		 218 aa  263  3e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00121985  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1901  30S ribosomal protein S3  57.28 
 
 		 217 aa  261  6e-69  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.563087  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0843  30S ribosomal protein S3  58.69 
 
 		 228 aa  261  1e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.401464  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1477  30S ribosomal protein S3  55.92 
 
 		 221 aa  261  1e-68  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000764619  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3999  ribosomal protein S3  55.34 
 
 		 223 aa  261  1e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.217214  normal  0.669985 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08910  30S ribosomal protein S3  58.69 
 
 		 228 aa  261  1e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0180544 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3661  ribosomal protein S3  54.42 
 
 		 219 aa  259  4e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000178065  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0460  30S ribosomal protein S3  58.22 
 
 		 228 aa  258  7e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.521801  unclonable  0.00000018203 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0490  30S ribosomal protein S3  58.22 
 
 		 228 aa  258  7e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.208972  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5781  ribosomal protein S3  52.52 
 
 		 302 aa  258  7e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.336905 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0493  30S ribosomal protein S3  58.22 
 
 		 228 aa  258  7e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000464846  normal  0.111354 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4743  30S ribosomal protein S3  58.22 
 
 		 228 aa  258  7e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0129797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3903  30S ribosomal protein S3  58.22 
 
 		 228 aa  258  9e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0436883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2909  SSU ribosomal protein S3P  54.59 
 
 		 226 aa  257  1e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06310  30S ribosomal protein S3  58.94 
 
 		 228 aa  257  1e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.91278  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1232  SSU ribosomal protein S3P  53.64 
 
 		 223 aa  257  1e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855016 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0848  ribosomal protein S3  60.68 
 
 		 249 aa  257  2e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0301  ribosomal protein S3  50.63 
 
 		 228 aa  257  2e-67  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00276484  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0873  30S ribosomal protein S3  56.52 
 
 		 221 aa  256  2e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000095133  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0632  ribosomal protein S3  57.75 
 
 		 228 aa  256  3e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00163492  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4542  30S ribosomal protein S3  57.75 
 
 		 228 aa  256  3e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0688366 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5073  30S ribosomal protein S3  57.75 
 
 		 228 aa  256  3e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000216562  normal  0.14822 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0329  ribosomal protein S3  55.8 
 
 		 224 aa  256  4e-67  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000625588  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0164  30S ribosomal protein S3  56.52 
 
 		 229 aa  256  4e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000022982  decreased coverage  0.0000484078 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4684  30S ribosomal protein S3  56.52 
 
 		 229 aa  255  7e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000205507  unclonable  0.0000000169741 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0427  30S ribosomal protein S3  57.97 
 
 		 232 aa  254  9e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.159032  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>