194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0480 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_0480  folate-binding protein YgfZ  100 
 
 		 352 aa  691    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.339791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0919  LigA  72.24 
 
 		 328 aa  477  1e-133  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0655  folate-binding protein YgfZ  62.11 
 
 		 328 aa  394  1e-109  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2873  hypothetical protein  57.78 
 
 		 343 aa  380  1e-104  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8240  folate-binding protein YgfZ  57.71 
 
 		 335 aa  362  8e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.496327  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4342  folate-binding protein YgfZ  54.44 
 
 		 340 aa  342  8e-93  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.964763  normal  0.943713 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0884  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  51.75 
 
 		 360 aa  317  2e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.233435  hitchhiker  0.00165742 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4250  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  53.33 
 
 		 324 aa  315  5e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0974011  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04980  folate-binding protein YgfZ  51.73 
 
 		 369 aa  307  2.0000000000000002e-82  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0062  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  53.8 
 
 		 352 aa  303  3.0000000000000004e-81  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0467  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  50.14 
 
 		 385 aa  298  1e-79  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.535785 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3086  folate-binding protein YgfZ  52.5 
 
 		 399 aa  291  1e-77  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000150861 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0444  folate-binding protein YgfZ  46.58 
 
 		 389 aa  288  8e-77  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.401201 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3028  folate-binding protein YgfZ  48.67 
 
 		 379 aa  281  1e-74  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3415  folate-binding protein YgfZ  47.54 
 
 		 396 aa  279  5e-74  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5037  folate-binding protein YgfZ  47.25 
 
 		 369 aa  273  3e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3008  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  48.37 
 
 		 361 aa  266  2.9999999999999995e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.6459  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2719  folate-binding protein YgfZ  48.23 
 
 		 361 aa  265  1e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00239345 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6837  folate-binding protein YgfZ  45.73 
 
 		 364 aa  261  1e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4625  folate-binding protein YgfZ  47.62 
 
 		 368 aa  260  3e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17390  glycine cleavage system T protein (aminomethyltransferase)  46.92 
 
 		 398 aa  256  5e-67  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0376  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  42.93 
 
 		 369 aa  254  2.0000000000000002e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.126236 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0313  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  42.41 
 
 		 369 aa  252  8.000000000000001e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03590  folate-binding protein YgfZ  48.97 
 
 		 386 aa  250  3e-65  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.663588 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37750  folate-binding protein YgfZ  42.27 
 
 		 376 aa  249  4e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.356305 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4536  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  44.02 
 
 		 356 aa  231  2e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.935602  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4623  glycine cleavage T-protein, C-terminal barrel  44.02 
 
 		 356 aa  231  2e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4919  glycine cleavage T-protein, C-terminal barrel  44.57 
 
 		 356 aa  230  3e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3572  folate-binding protein YgfZ  45.37 
 
 		 349 aa  229  6e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0682209  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5709  folate-binding protein YgfZ  42.98 
 
 		 344 aa  228  1e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5109  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  43.97 
 
 		 361 aa  221  9.999999999999999e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.80079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1638  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  44.38 
 
 		 367 aa  221  9.999999999999999e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.246382  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0952  folate-binding protein YgfZ  41.43 
 
 		 389 aa  217  2e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10826  hypothetical protein  41.76 
 
 		 368 aa  206  4e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0841313 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25690  folate-binding protein YgfZ  39.94 
 
 		 369 aa  193  4e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6150  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  62.94 
 
 		 409 aa  174  2.9999999999999996e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.274671  normal  0.61333 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1256  folate-binding protein YgfZ  31 
 
 		 293 aa  94.4  3e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.196155  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3469  folate-binding protein YgfZ  30.11 
 
 		 375 aa  92.8  8e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4173  folate-binding protein YgfZ  29.26 
 
 		 336 aa  91.7  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.534178 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1117  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  31.38 
 
 		 293 aa  90.9  3e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.191945 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2780  glycine cleavage T-protein barrel  34.55 
 
 		 316 aa  90.5  3e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.369075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1501  folate-binding protein YgfZ  29.82 
 
 		 384 aa  90.5  4e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.119461  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4696  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  26.18 
 
 		 349 aa  88.2  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.77868  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0266  folate-binding protein YgfZ  30.94 
 
 		 362 aa  87.8  3e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0098053 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0748  folate-binding protein YgfZ  27.51 
 
 		 325 aa  85.5  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.485087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2704  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  29.62 
 
 		 293 aa  84.3  0.000000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0689598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2375  putative glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  28.82 
 
 		 294 aa  84.3  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.240972 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1238  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  29.51 
 
 		 293 aa  80.9  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.582319  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2628  glycine cleavage T protein, aminomethyl transferase  26.22 
 
 		 342 aa  79  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.509615  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0855  folate-binding protein YgfZ  29.31 
 
 		 339 aa  79  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.22028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2848  LigA  30.74 
 
 		 304 aa  77.8  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3735  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  26.85 
 
 		 328 aa  77  0.0000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0261257 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0173  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  31.21 
 
 		 309 aa  77  0.0000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1651  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  28.51 
 
 		 327 aa  76.3  0.0000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.411538 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0332  folate-binding protein YgfZ  27.45 
 
 		 386 aa  76.3  0.0000000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.97102  normal  0.0439096 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2938  folate-binding protein YgfZ  30.92 
 
 		 304 aa  75.5  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.428228  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3032  folate-binding protein YgfZ  30.74 
 
 		 304 aa  75.5  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.156046  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2871  folate-binding protein YgfZ  28 
 
 		 326 aa  74.7  0.000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1989  folate-binding protein YgfZ  24.35 
 
 		 354 aa  74.7  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.36576 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0063  folate-binding protein YgfZ  25.94 
 
 		 356 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4331  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  27.89 
 
 		 293 aa  72  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.388249 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0061  folate-binding protein YgfZ  25.94 
 
 		 356 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000369449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3692  folate-binding protein YgfZ  27.01 
 
 		 267 aa  71.2  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0180331  normal  0.0362221 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4019  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  27.34 
 
 		 293 aa  70.9  0.00000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0309  aminomethyl transferase family protein  26.64 
 
 		 268 aa  68.9  0.0000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0748  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  27.53 
 
 		 316 aa  68.9  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.642058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1100  folate-binding protein YgfZ  27.82 
 
 		 279 aa  68.2  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4821  folate-binding protein YgfZ  29.37 
 
 		 285 aa  67  0.0000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1985  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  27.51 
 
 		 248 aa  67  0.0000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3450  glycine cleavage T-protein barrel  26.57 
 
 		 327 aa  66.2  0.0000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0834766  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0262  glycine cleavage T-protein, C-terminal barrel  33.48 
 
 		 275 aa  66.2  0.0000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.00715457  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0706  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  28.51 
 
 		 282 aa  65.9  0.0000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.503998 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1464  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  26.57 
 
 		 354 aa  65.5  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.24907  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1416  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  28.9 
 
 		 292 aa  65.5  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2474  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  24.24 
 
 		 347 aa  64.7  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.839994  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0954  glycine cleavage T-protein-like  28.85 
 
 		 344 aa  64.7  0.000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.436358  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4304  folate-binding protein YgfZ  29.12 
 
 		 284 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4673  folate-binding protein YgfZ  29.12 
 
 		 284 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.363501  normal  0.948417 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0959  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  28.57 
 
 		 288 aa  63.9  0.000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2285  glycine cleavage system T protein  25.77 
 
 		 370 aa  63.9  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010894 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4360  folate-binding protein YgfZ  26.86 
 
 		 293 aa  63.2  0.000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.689561  normal  0.989492 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0712  folate-binding protein YgfZ  25.66 
 
 		 291 aa  62  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.537236 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1526  glycine cleavage system T protein  25.24 
 
 		 371 aa  61.6  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.293085 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3708  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  27.21 
 
 		 324 aa  61.6  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0106413 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1164  folate-binding protein YgfZ  33.33 
 
 		 302 aa  61.2  0.00000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000602813  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0505  folate-binding protein YgfZ  26.32 
 
 		 277 aa  60.8  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.262303  normal  0.803186 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2622  glycine cleavage T-protein barrel  24.83 
 
 		 287 aa  60.8  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.96003  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3533  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  27.59 
 
 		 337 aa  61.2  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2547  folate-binding protein YgfZ  25.2 
 
 		 325 aa  59.7  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0731  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  28.51 
 
 		 238 aa  59.7  0.00000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.607247  normal  0.0872303 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2940  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  31.09 
 
 		 312 aa  58.9  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.352014  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1254  folate-binding protein YgfZ  26.03 
 
 		 322 aa  58.9  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1881  folate-binding protein YgfZ  25.96 
 
 		 348 aa  59.3  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.428189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03031  GcvT-like aminomethyltransferase  28.07 
 
 		 280 aa  58.2  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  hitchhiker  0.000485176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1756  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  28.22 
 
 		 362 aa  58.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.971274  normal  0.141351 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2098  glycine cleavage T-protein (aminomethyl transferase)  26.13 
 
 		 354 aa  58.2  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.438328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3364  glycine cleavage system T protein  26.14 
 
 		 369 aa  58.2  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0812  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  28.08 
 
 		 273 aa  57  0.0000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000519539 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0240  hypothetical protein  24.69 
 
 		 356 aa  56.6  0.0000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.116766  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2950  hypothetical protein  26.03 
 
 		 321 aa  56.6  0.0000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.128339 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>