96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0468 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_0468  hypothetical protein  100 
 
 		 424 aa  849    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.748006 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0913  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase-like protein  79.25 
 
 		 429 aa  673    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.323703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0648  domain of unknown function DUF1727  69.79 
 
 		 412 aa  578  1e-164  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2714  putative ligase  64.04 
 
 		 418 aa  499  1e-140  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4348  domain of unknown function DUF1727  62.09 
 
 		 418 aa  498  1e-139  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0229746  normal  0.964565 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3448  hypothetical protein  56.81 
 
 		 420 aa  441  9.999999999999999e-123  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00766091 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3222  hypothetical protein  57.08 
 
 		 415 aa  441  9.999999999999999e-123  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0406463 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2661  hypothetical protein  57.45 
 
 		 410 aa  437  1e-121  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.857902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4298  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase-like protein  47.24 
 
 		 411 aa  348  9e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1034  domain of unknown function DUF1727  47.92 
 
 		 394 aa  327  2.0000000000000001e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4002  domain of unknown function DUF1727  46.84 
 
 		 412 aa  315  9.999999999999999e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0442  domain of unknown function DUF1727  45 
 
 		 425 aa  312  7.999999999999999e-84  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.624005  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1706  hypothetical protein  47.98 
 
 		 421 aa  304  2.0000000000000002e-81  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0418667  hitchhiker  0.00728652 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13744  ligase  45.66 
 
 		 413 aa  301  2e-80  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00431951  normal  0.370504 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4901  hypothetical protein  45.34 
 
 		 408 aa  296  5e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4990  hypothetical protein  45.34 
 
 		 408 aa  296  5e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5269  hypothetical protein  45.23 
 
 		 408 aa  296  6e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.235064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5520  hypothetical protein  45.22 
 
 		 425 aa  285  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1291  hypothetical protein  45.73 
 
 		 406 aa  280  3e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0282  Mur ligase  43.61 
 
 		 416 aa  276  5e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6531  hypothetical protein  43.37 
 
 		 417 aa  276  7e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.830465  normal  0.333233 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1627  domain of unknown function DUF1727  31.8 
 
 		 462 aa  191  2e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3270  domain of unknown function DUF1727  33.49 
 
 		 458 aa  175  9.999999999999999e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.704416  normal  0.0775739 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0514  hypothetical protein  29.31 
 
 		 445 aa  172  1e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.265585  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1250  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase  29.17 
 
 		 455 aa  171  2e-41  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000012325  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1430  Mur ligase family protein  29.93 
 
 		 437 aa  170  5e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.67526  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1442  domain of unknown function DUF1727  35.28 
 
 		 408 aa  169  1e-40  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1788  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase  27.62 
 
 		 452 aa  168  2e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3108  domain of unknown function DUF1727  31.7 
 
 		 448 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3012  domain of unknown function DUF1727  31.7 
 
 		 448 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0450  hypothetical protein  29.02 
 
 		 445 aa  166  5.9999999999999996e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3614  hypothetical protein  32.17 
 
 		 463 aa  166  6.9999999999999995e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.529006  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2945  domain of unknown function DUF1727  33.77 
 
 		 474 aa  163  6e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.833945  hitchhiker  0.00605856 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1233  Mur ligase family protein  30.26 
 
 		 441 aa  162  1e-38  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.198792  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1946  hypothetical protein  30.42 
 
 		 437 aa  161  2e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.102068  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1980  hypothetical protein  30.42 
 
 		 437 aa  161  2e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.270286  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1559  domain of unknown function DUF1727  30.1 
 
 		 445 aa  161  3e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.181708 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1208  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase  27.62 
 
 		 449 aa  160  5e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.970096  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0884  mur ligase family protein  28.76 
 
 		 447 aa  159  9e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4285  hypothetical protein  28.41 
 
 		 447 aa  155  1e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0500  hypothetical protein  31.42 
 
 		 491 aa  153  5e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.496593  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0588  hypothetical protein  33.89 
 
 		 469 aa  152  8.999999999999999e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.414158  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0996  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase  34.81 
 
 		 455 aa  149  1.0000000000000001e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00110541  normal  0.028804 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1599  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase  27.67 
 
 		 445 aa  148  2.0000000000000003e-34  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.709076  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0966  hypothetical protein  28.74 
 
 		 464 aa  146  5e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0985  domain of unknown function DUF1727  26.56 
 
 		 443 aa  147  5e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000265712  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1392  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthetase MurC-like protein  26 
 
 		 451 aa  146  8.000000000000001e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0524526  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1206  Mur ligase family protein  26 
 
 		 451 aa  145  1e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0554717  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1785  domain of unknown function DUF1727  26.77 
 
 		 446 aa  145  2e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0144804  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0013  domain of unknown function DUF1727  27.68 
 
 		 444 aa  142  9.999999999999999e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3016  hypothetical protein  31.87 
 
 		 436 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1255  hypothetical protein  30.14 
 
 		 507 aa  139  8.999999999999999e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1153  domain of unknown function DUF1727  28.85 
 
 		 474 aa  139  8.999999999999999e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1345  domain of unknown function DUF1727  30.26 
 
 		 476 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000649333  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2009  hypothetical protein  29.58 
 
 		 466 aa  133  5e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000964515  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0443  domain of unknown function DUF1727  31.78 
 
 		 463 aa  133  6e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0008  hypothetical protein  25.94 
 
 		 446 aa  132  9e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3001  domain of unknown function DUF1727  31.35 
 
 		 744 aa  130  6e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.954679 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2069  domain of unknown function DUF1727  24.41 
 
 		 467 aa  125  1e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0981076  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0440  hypothetical protein  25.39 
 
 		 467 aa  124  4e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1027  domain of unknown function DUF1727  32.92 
 
 		 456 aa  112  1.0000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.964533  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0076  Mur ligase middle domain protein  28.5 
 
 		 472 aa  110  4.0000000000000004e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000585492 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2036  domain of unknown function DUF1727  28.83 
 
 		 430 aa  98.2  3e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000388378 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2306  hypothetical protein  27.54 
 
 		 429 aa  88.6  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0105732  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1327  Mur ligase middle domain protein  24.12 
 
 		 470 aa  87.4  5e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.00000399076  decreased coverage  0.000242236 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17860  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase  24.72 
 
 		 445 aa  84.7  0.000000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.934196  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1231  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase  34.66 
 
 		 490 aa  82.4  0.00000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.661721  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09480  UDP-N-acetylmuramate--alanine ligase  28.25 
 
 		 471 aa  53.1  0.000009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0452016  normal  0.0351394 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2195  UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanyl-D-glutamate synthetase  25.4 
 
 		 449 aa  52  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.253495  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0493  UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanyl-D-glutamate synthetase  26.46 
 
 		 460 aa  51.2  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2192  UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanyl-D-glutamate synthetase  31.39 
 
 		 466 aa  48.5  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0779  UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanyl-D-glutamate synthetase  29.14 
 
 		 465 aa  47.4  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.230521  normal  0.687569 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2616  UDP-N-acetylmuramoylalanine--D-glutamate ligase  30.43 
 
 		 449 aa  47.4  0.0005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000660263 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2103  UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanyl-D-glutamate synthetase  29.14 
 
 		 465 aa  47.4  0.0005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.188407  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0690  UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanyl-D-glutamate synthetase  29.14 
 
 		 465 aa  46.6  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.451277 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3631  UDP-N-acetylmuramoylalanine--D-glutamate ligase  27.4 
 
 		 453 aa  46.6  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.916376 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0589  UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanyl-D-glutamate synthetase  29.25 
 
 		 466 aa  46.2  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.561941 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1435  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  24.37 
 
 		 455 aa  44.7  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1685  UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanyl-D-glutamate synthetase  26.38 
 
 		 460 aa  45.1  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.500264 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2613  UDP-N-acetylmuramate--alanine ligase  24.11 
 
 		 473 aa  44.3  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00649562  unclonable  0.00000000000596507 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3483  UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanyl-D-glutamate synthetase  26.74 
 
 		 461 aa  44.3  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3458  UDP-N-acetylmuramoylalanyl-D-glutamate--2, 6-diaminopimelate ligase  25.55 
 
 		 488 aa  44.3  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.040004 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3528  UDP-N-acetylmuramoylalanyl-D-glutamate--2, 6-diaminopimelate ligase  35.9 
 
 		 497 aa  44.3  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.176869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1011  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  30.66 
 
 		 477 aa  44.3  0.005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0600582 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2431  UDP-N-acetylmuramoylalanine--D-glutamate ligase  27.54 
 
 		 459 aa  43.9  0.005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1335  UDP-N-acetylmuramoylalanine/D-glutamate ligase  29.03 
 
 		 444 aa  43.9  0.006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3669  UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanyl-D-glutamate synthetase  28.19 
 
 		 469 aa  43.9  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00445508  normal  0.10958 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3016  UDP-N-acetylmuramate/alanine ligase  29.82 
 
 		 529 aa  43.9  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.688365  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1492  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  31.82 
 
 		 447 aa  43.5  0.006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.125156  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1049  UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanyl-D-glutamate synthetase  31.5 
 
 		 466 aa  43.5  0.007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0148666  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0849  UDP-N-acetylmuramoylalanine--D-glutamate ligase  26.56 
 
 		 509 aa  43.5  0.007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.106849  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1114  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  23.86 
 
 		 457 aa  43.5  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.713448  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2989  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  28.37 
 
 		 475 aa  43.5  0.008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0256473 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05211  UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanyl-D-glutamate synthetase  23.42 
 
 		 460 aa  43.5  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3323  UDP-N-acetylmuramoylalanyl-D-glutamate--2, 6-diaminopimelate ligase  37.18 
 
 		 508 aa  43.1  0.009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0599558  normal  0.0375637 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3261  UDP-N-acetylmuramoylalanyl-D-glutamate--2, 6-diaminopimelate ligase  37.18 
 
 		 508 aa  43.1  0.009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>