61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0414 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_0414  NHL repeat containing protein  100 
 
 		 803 aa  1623    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.316951  normal  0.387155 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  23.18 
 
 		 930 aa  84  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0423  NHL repeat containing protein  23.5 
 
 		 831 aa  80.9  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0378567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1474  NHL repeat containing protein  23.77 
 
 		 668 aa  78.6  0.0000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0914572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2074  NHL repeat containing protein  26.41 
 
 		 522 aa  78.2  0.0000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.614793 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2986  PA14 domain-containing protein  24.79 
 
 		 1293 aa  75.1  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0416  hypothetical protein  27.21 
 
 		 346 aa  68.6  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0322809  normal  0.695963 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1395  NHL repeat containing protein  26.2 
 
 		 391 aa  66.6  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1378  hypothetical protein  23.82 
 
 		 1030 aa  65.5  0.000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.872311  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1345  NHL repeat containing protein  24.12 
 
 		 676 aa  63.5  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1389  periplasmic copper-binding  26.35 
 
 		 709 aa  61.2  0.00000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0136597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2265  NHL repeat-containing protein  27.72 
 
 		 963 aa  57.4  0.0000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.397951  normal  0.439164 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2369  NHL repeat containing protein  26.89 
 
 		 579 aa  55.8  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.547997 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1047  fibronectin type III domain-containing protein  25 
 
 		 903 aa  55.1  0.000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0355  NHL repeat-containing protein  27.74 
 
 		 1030 aa  55.1  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64892  normal  0.0641589 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4185  serine/threonine protein kinase  32.75 
 
 		 719 aa  53.5  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  23.48 
 
 		 930 aa  53.9  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  23.53 
 
 		 752 aa  53.1  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1601  NHL repeat-containing protein  26.22 
 
 		 491 aa  53.5  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0447928  normal  0.136115 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7287  serine/threonine protein kinase  26.72 
 
 		 892 aa  52.8  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0443497  normal  0.301808 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1869  NHL repeat containing protein  24.07 
 
 		 307 aa  52  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0840  NHL repeat containing protein  24.14 
 
 		 390 aa  52  0.00004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0361513  normal  0.0920788 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1273  NHL repeat containing protein  29.22 
 
 		 387 aa  51.6  0.00005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.349999  normal  0.851657 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3475  NHL repeat protein  40.79 
 
 		 1140 aa  51.6  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3865  NHL repeat-containing protein  29.27 
 
 		 1177 aa  52  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1861  Phage tail protein  27.72 
 
 		 747 aa  51.2  0.00007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  25.81 
 
 		 1750 aa  51.2  0.00008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2854  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  24.86 
 
 		 1292 aa  50.1  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0274394  normal  0.093276 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4089  serine/threonine protein kinase  30.51 
 
 		 772 aa  49.7  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.205571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0477  NHL repeat-containing protein  25 
 
 		 525 aa  49.7  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.176502 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0755  Carbohydrate binding family 6  36.45 
 
 		 627 aa  48.9  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.40711 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1591  NHL repeat containing protein  32.98 
 
 		 686 aa  48.9  0.0004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.24269  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4088  serine/threonine protein kinase  28.28 
 
 		 850 aa  48.5  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.527089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1611  Fibronectin type III domain protein  27.61 
 
 		 805 aa  48.5  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  unclonable  0.000457229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0258  NHL repeat-containing protein  24.89 
 
 		 343 aa  48.5  0.0005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3229  NHL repeat containing protein  26.1 
 
 		 380 aa  48.1  0.0006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.657691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4723  NHL repeat containing protein  30.12 
 
 		 1079 aa  48.1  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.645184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1358  NHL repeat containing protein  29.21 
 
 		 646 aa  48.1  0.0007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.967304 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2500  leucine-rich repeat-containing protein  26.46 
 
 		 1351 aa  47.8  0.0007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4618  NHL repeat-containing protein  27.33 
 
 		 1026 aa  47.8  0.0008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4124  NHL repeat-containing protein  25.64 
 
 		 359 aa  47.8  0.0008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.640446 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0242  NHL repeat-containing protein  35.9 
 
 		 1146 aa  47.8  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00900908 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1379  NHL repeat-containing protein  29.28 
 
 		 319 aa  47.4  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0368543 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1718  NHL repeat-containing protein  25.7 
 
 		 487 aa  47.8  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0408  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  25.08 
 
 		 693 aa  46.6  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.785735  normal  0.15039 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7126  serine/threonine protein kinase  29.21 
 
 		 770 aa  46.6  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1472  NHL/RHS/YD repeat-containing protein  24.14 
 
 		 1834 aa  45.8  0.003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3681  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  32 
 
 		 299 aa  45.8  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1359  NHL repeat containing protein  25.76 
 
 		 439 aa  46.2  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.666477 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  23 
 
 		 786 aa  46.2  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10949  transmembrane serine/threonine-protein kinase D pknD  28.65 
 
 		 664 aa  45.8  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2272  glycoside hydrolase family 26  24.71 
 
 		 711 aa  45.4  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.738347  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0357  NHL repeat containing protein  22.11 
 
 		 700 aa  45.1  0.005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  3.18335e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0293  NHL repeat-containing protein  39.39 
 
 		 1163 aa  44.7  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.368653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13808  predicted protein  25.12 
 
 		 1675 aa  44.7  0.007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0947447  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1920  NHL repeat-containing protein  23.51 
 
 		 343 aa  44.3  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00542747  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3838  NHL repeat-containing protein  23.81 
 
 		 360 aa  44.3  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000127539  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2818  hypothetical protein  26.58 
 
 		 392 aa  44.7  0.008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.587259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7086  serine/threonine protein kinase  27.52 
 
 		 732 aa  44.7  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4135  NHL repeat-containing protein  25.27 
 
 		 368 aa  44.3  0.008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1869  NHL repeat-containing protein  24.08 
 
 		 353 aa  44.3  0.009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0563587 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>