More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0408 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_0408  ABC transporter-like protein  100 
 
 		 237 aa  463  1e-129  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.314132  normal  0.281925 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5998  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  82.83 
 
 		 235 aa  378  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.355908  normal  0.0594228 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0572  ABC transporter related  59.23 
 
 		 239 aa  295  5e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000129058  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2236  ABC transporter related  54.51 
 
 		 234 aa  288  6e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0732075  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2552  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  57.51 
 
 		 234 aa  282  3.0000000000000004e-75  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2654  ABC transporter-like protein  55.08 
 
 		 237 aa  281  8.000000000000001e-75  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00480746  hitchhiker  0.00390953 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1127  ABC transporter related  59.05 
 
 		 235 aa  281  9e-75  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.674727  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0262  ATPase  60.68 
 
 		 238 aa  280  1e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2498  ABC transporter related  57.94 
 
 		 235 aa  277  9e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0405923  normal  0.181063 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3053  ABC transporter related protein  56.65 
 
 		 235 aa  276  2e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1896  ABC transporter related  56.17 
 
 		 237 aa  276  2e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.02479 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1859  ABC transporter related  56.78 
 
 		 238 aa  273  1.0000000000000001e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1384  ABC transporter related  55.79 
 
 		 234 aa  273  1.0000000000000001e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1724  ABC transporter related  55.6 
 
 		 235 aa  272  3e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2979  ABC transporter related  55.32 
 
 		 237 aa  271  8.000000000000001e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1672  ABC transporter related  54.27 
 
 		 239 aa  269  2e-71  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1473  ABC transporter related  51.91 
 
 		 236 aa  270  2e-71  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1261  ABC transporter related  52.99 
 
 		 235 aa  269  2.9999999999999997e-71  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3532  ABC transporter related  53.19 
 
 		 236 aa  268  5.9999999999999995e-71  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.10442  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0615  ABC transporter related  54.94 
 
 		 234 aa  268  7e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.109789  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0589  ABC transporter related protein  54.74 
 
 		 259 aa  267  1e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1606  ABC transporter related  53.85 
 
 		 239 aa  267  1e-70  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3204  ABC transporter related  57.08 
 
 		 237 aa  265  4e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0731  ABC transporter related  56.36 
 
 		 236 aa  265  5e-70  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.346803 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1209  ABC transporter related  53.62 
 
 		 256 aa  265  7e-70  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.093328  normal  0.473951 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2754  ABC transporter related  56.84 
 
 		 238 aa  263  1e-69  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4257  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  57.69 
 
 		 238 aa  263  1e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.309186  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3391  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.74 
 
 		 234 aa  263  2e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0476  ABC transporter related  55.93 
 
 		 236 aa  263  2e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4412  ABC transporter related  57.69 
 
 		 238 aa  263  2e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4391  ABC transporter-related protein  57.69 
 
 		 238 aa  263  2e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4922  ABC transporter related  54.08 
 
 		 233 aa  262  3e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104533  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3291  hypothetical protein  57.81 
 
 		 237 aa  262  4e-69  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0150426 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0838  ABC transporter related  54.66 
 
 		 239 aa  261  4.999999999999999e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1215  ABC transporter related  54.47 
 
 		 236 aa  261  6e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3002  ABC transporter related  53.45 
 
 		 235 aa  261  6e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0639  ABC transporter related protein  54.08 
 
 		 234 aa  261  8.999999999999999e-69  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.384075  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0473  ABC transporter-like  53.45 
 
 		 260 aa  260  1e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.492847  normal  0.175391 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2028  ABC transporter related  55.32 
 
 		 235 aa  261  1e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2250  ABC transporter related  57.08 
 
 		 238 aa  260  1e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0345  ABC transporter related  59.48 
 
 		 242 aa  259  2e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.636106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2931  ABC transporter related  51.9 
 
 		 237 aa  259  2e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0866  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.51 
 
 		 233 aa  259  3e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.173602  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3627  ABC transporter related  53.65 
 
 		 233 aa  259  4e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2432  ABC transporter related protein  48.1 
 
 		 237 aa  258  4e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00198447  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0776  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.08 
 
 		 233 aa  258  5.0000000000000005e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.704387  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3169  ABC transporter related  53.88 
 
 		 238 aa  258  7e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0892288  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2496  ABC transporter related protein  53.22 
 
 		 235 aa  258  7e-68  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.558412  normal  0.0682574 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1835  ABC transporter  54.08 
 
 		 233 aa  257  1e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.020378  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3373  ABC transporter related  56.03 
 
 		 236 aa  257  1e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.710585  normal  0.0235657 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2476  ABC transporter-related protein  52.79 
 
 		 233 aa  257  1e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.865811  normal  0.164056 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4943  ABC transporter related  53.22 
 
 		 233 aa  256  2e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0655  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  53.22 
 
 		 233 aa  256  2e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.279613 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4428  ABC transporter related  53.22 
 
 		 233 aa  256  2e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000693118 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1086  ABC transporter related  59.15 
 
 		 237 aa  256  2e-67  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0710157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1874  ABC transporter related  53.65 
 
 		 233 aa  256  3e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.363302  normal  0.184488 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5272  ABC transporter related  53.22 
 
 		 233 aa  256  3e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5015  ABC transporter related  53.22 
 
 		 233 aa  256  3e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.828723 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7087  ABC transporter, ATP-binding protein  57.02 
 
 		 241 aa  255  5e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.657304 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2315  ABC transporter related  51.93 
 
 		 233 aa  254  6e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1388  ABC transporter related  50 
 
 		 236 aa  254  6e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1730  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.43 
 
 		 247 aa  254  8e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1946  ABC transporter related protein  51.72 
 
 		 233 aa  254  9e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.987949  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1473  ABC transporter-like protein  53.42 
 
 		 238 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5682  ABC transporter related  55.56 
 
 		 258 aa  253  2.0000000000000002e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3352  ABC transporter related  52.79 
 
 		 233 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2363  high-affinity branched chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.64 
 
 		 235 aa  253  3e-66  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3251  ABC transporter related  52.59 
 
 		 244 aa  253  3e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.409865  normal  0.293601 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0356  ABC transporter related  55.93 
 
 		 240 aa  251  5.000000000000001e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2705  ABC transporter related  51.29 
 
 		 238 aa  252  5.000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.663286  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2315  ABC transporter related  51.29 
 
 		 238 aa  252  5.000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.129419  hitchhiker  0.000435411 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0936  ABC transporter related  52.36 
 
 		 234 aa  251  5.000000000000001e-66  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000438141  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1654  ABC transporter related protein  55.13 
 
 		 243 aa  251  5.000000000000001e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.10025  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1748  ABC transporter component  54.24 
 
 		 240 aa  251  6e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.644006  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0484  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  51.5 
 
 		 237 aa  251  7e-66  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2310  ABC transporter related protein  52.54 
 
 		 237 aa  251  9.000000000000001e-66  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1578  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 		 236 aa  251  9.000000000000001e-66  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0882  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  49.57 
 
 		 238 aa  250  1e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  unclonable  0.000000000000026853  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0992  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  49.57 
 
 		 238 aa  250  1e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00134652  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1146  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  49.57 
 
 		 238 aa  250  1e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.000313887  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0986  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  49.57 
 
 		 238 aa  250  1e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.0000000350992  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0800  ABC transporter related  49.57 
 
 		 238 aa  250  1e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.595603 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1883  ABC transporter related  50 
 
 		 238 aa  250  1e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0266  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  49.57 
 
 		 238 aa  250  1e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  unclonable  0.0000000214299  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2102  ABC transporter related  52.59 
 
 		 265 aa  250  1e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0943  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  49.57 
 
 		 238 aa  250  1e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00876691  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2855  ABC transporter related protein  54.51 
 
 		 245 aa  249  2e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000134885  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1970  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  49.57 
 
 		 234 aa  250  2e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.000000796203  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0788  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  49.57 
 
 		 238 aa  249  2e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6115  ABC transporter related  50 
 
 		 238 aa  250  2e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2863  ABC transporter-related protein  51.72 
 
 		 238 aa  249  2e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.113573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2519  ABC transporter related  49.57 
 
 		 238 aa  249  2e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.644805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2494  ABC transporter related  49.57 
 
 		 238 aa  249  2e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5535  ABC transporter related  52.36 
 
 		 234 aa  250  2e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1291  ABC transporter related  52.16 
 
 		 264 aa  249  2e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2269  ABC transporter related  51.29 
 
 		 233 aa  249  2e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2412  ABC transporter related  50 
 
 		 238 aa  250  2e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0329519 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2009  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.86 
 
 		 234 aa  249  3e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.378013  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3793  ABC transporter related  52.16 
 
 		 238 aa  249  3e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2541  ABC transporter related  49.57 
 
 		 238 aa  249  3e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>