More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0394 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_0394  CBS domain-containing membrane protein  100 
 
 		 201 aa  389  1e-107  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.474769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2812  CBS domain containing membrane protein  55.84 
 
 		 201 aa  186  1e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000718769  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0393  CBS domain-containing membrane protein  45.54 
 
 		 193 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.464074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0991  CBS domain-containing protein  36.92 
 
 		 196 aa  96.7  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2997  signal-transduction protein  34.58 
 
 		 223 aa  95.5  4e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1365  signal-transduction protein  33.33 
 
 		 243 aa  92  6e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.831809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4725  putative signal transduction protein with CBS domains  32.42 
 
 		 243 aa  89.7  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1344  putative signal-transduction protein with CBS domains  32.42 
 
 		 243 aa  87.8  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2233  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 		 232 aa  86.7  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1912  signal-transduction protein  32.56 
 
 		 242 aa  84.7  8e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0206039  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1630  signal-transduction protein  35.08 
 
 		 233 aa  84.7  8e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5760  hypothetical protein  32.98 
 
 		 242 aa  84.3  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.594459 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1812  CBS domain containing membrane protein  36.76 
 
 		 132 aa  82  0.000000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1947  signal-transduction protein  35.32 
 
 		 226 aa  81.6  0.000000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.489577  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1873  hypothetical protein  31.94 
 
 		 229 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.994541 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4051  signal-transduction protein  31.51 
 
 		 242 aa  79.3  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6220  signal-transduction protein  29.36 
 
 		 230 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1902  CBS domain-containing protein  33.8 
 
 		 231 aa  77.8  0.0000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17480  predicted signal-transduction protein containing cAMP-binding and CBS domains  31.28 
 
 		 191 aa  76.6  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1649  CBS domain-containing membrane protein  32.56 
 
 		 234 aa  76.6  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0176167  normal  0.734042 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3596  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 		 241 aa  76.3  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.247468  normal  0.0301148 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1094  signal-transduction protein  31.96 
 
 		 230 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6307  putative signal transduction protein with CBS domains  31.92 
 
 		 229 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4814  CBS domain containing membrane protein  35.71 
 
 		 226 aa  74.7  0.0000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3833  putative signal transduction protein with CBS domains  31.47 
 
 		 201 aa  74.7  0.0000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0502745  normal  0.174348 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1023  hypothetical protein  31.88 
 
 		 243 aa  74.3  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5821  signal-transduction protein  35.53 
 
 		 231 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.12685 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1105  CBS domain containing membrane protein  32.84 
 
 		 228 aa  72.4  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.540911 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1028  CBS domain containing membrane protein  32.26 
 
 		 226 aa  72  0.000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0495705 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5546  CBS domain containing membrane protein  30.84 
 
 		 230 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.103522  normal  0.484256 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1032  putative signal transduction protein with CBS domains  31.72 
 
 		 149 aa  70.9  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0368077  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1799  putative signal transduction protein with CBS domains  33.33 
 
 		 202 aa  71.2  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0446245  normal  0.0519326 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2451  CBS domain containing membrane protein  35.38 
 
 		 141 aa  70.1  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000150568  normal  0.0113314 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3042  CBS  31.8 
 
 		 241 aa  69.7  0.00000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0610  signal-transduction protein  38.78 
 
 		 348 aa  68.9  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.909822  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2202  putative signal transduction protein with CBS domains  29.17 
 
 		 236 aa  68.6  0.00000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1933  CBS domain-containing protein  29.11 
 
 		 228 aa  68.2  0.00000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.316651  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3889  signal-transduction protein  36.24 
 
 		 217 aa  68.2  0.00000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1524  signal transduction protein  35.46 
 
 		 212 aa  67.4  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0592801 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1883  CBS domain-containing protein  32.17 
 
 		 154 aa  67.4  0.0000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0303  signal transduction protein  26.47 
 
 		 320 aa  67  0.0000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.123815  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0591  signal-transduction protein  35.29 
 
 		 155 aa  67  0.0000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0331315  normal  0.426072 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6174  CBS domain containing membrane protein  32.42 
 
 		 246 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0947  CBS domain containing protein  32.61 
 
 		 216 aa  66.2  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0017149 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4839  CBS domain containing membrane protein  32.41 
 
 		 232 aa  66.2  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0019  CBS domain-containing protein  31.43 
 
 		 410 aa  65.9  0.0000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1897  signal-transduction protein  31 
 
 		 231 aa  65.9  0.0000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2521  signal transduction protein  34.72 
 
 		 161 aa  65.9  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0680  hypothetical protein  28.84 
 
 		 249 aa  65.9  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.480825 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1703  CBS domain containing membrane protein  28.77 
 
 		 148 aa  65.5  0.0000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.311156  normal  0.0624027 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3300  CBS domain containing protein  32.61 
 
 		 216 aa  65.5  0.0000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.490249  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1289  signal transduction protein  32 
 
 		 153 aa  65.5  0.0000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2240  signal transduction protein  31.29 
 
 		 153 aa  64.7  0.0000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0675  signal transduction protein  31.33 
 
 		 153 aa  64.3  0.000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.302021  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1228  signal-transduction protein  33.12 
 
 		 339 aa  63.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2115  signal transduction protein  30.66 
 
 		 300 aa  64.3  0.000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.548765 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2667  CBS domain containing protein  29.45 
 
 		 313 aa  64.3  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.13324  normal  0.574702 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1395  signal transduction protein  31.33 
 
 		 153 aa  63.2  0.000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1421  polynucleotide adenylyltransferase region  29.55 
 
 		 909 aa  63.2  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5888  CBS domain-containing protein  36.23 
 
 		 242 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.361711  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0026  CBS domain containing membrane protein  35.16 
 
 		 382 aa  63.2  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2338  CBS domain containing membrane protein  33.33 
 
 		 247 aa  62.8  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3404  signal transduction protein  33.33 
 
 		 212 aa  62.8  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.843193  normal  0.543078 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0031  CBS domain containing membrane protein  35.16 
 
 		 382 aa  62.8  0.000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.668358 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2041  CBS domain containing membrane protein  33.52 
 
 		 227 aa  62  0.000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000255814  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2494  CBS domain-containing protein  36.55 
 
 		 427 aa  62  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00627763  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5476  signal-transduction protein  32.26 
 
 		 189 aa  62  0.000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.184871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5097  signal-transduction protein  32.26 
 
 		 189 aa  62  0.000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.158303  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5185  signal-transduction protein  32.26 
 
 		 189 aa  62  0.000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.254661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1614  CBS domain containing membrane protein  29.1 
 
 		 155 aa  61.6  0.000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.267585  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2287  CBS domain containing membrane protein  27.69 
 
 		 135 aa  61.6  0.000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.146345  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0615  protein of unknown function DUF190  27.63 
 
 		 426 aa  60.8  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1281  signal transduction protein  30 
 
 		 153 aa  60.8  0.00000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.366949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2388  Polynucleotide adenylyltransferase region  31.06 
 
 		 903 aa  60.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.991166 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2980  signal transduction protein  36.43 
 
 		 423 aa  60.5  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0675  signal transduction protein  28.67 
 
 		 147 aa  60.5  0.00000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3570  CBS domain-containing protein  31.31 
 
 		 246 aa  60.1  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.212334 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1708  phosphoesterase, RecJ-like  31.06 
 
 		 904 aa  59.7  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.833662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1134  signal transduction protein  29.45 
 
 		 151 aa  59.7  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1308  putative signal transduction protein with CBS domains  24.68 
 
 		 161 aa  58.9  0.00000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0302  signal transduction protein  29.93 
 
 		 282 aa  58.5  0.00000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.983478  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2805  CBS domain-containing membrane protein  28.87 
 
 		 155 aa  58.5  0.00000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4486  CBS domain-containing protein  32.84 
 
 		 373 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.16132  normal  0.433507 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2623  CBS domain containing protein  33.33 
 
 		 215 aa  58.5  0.00000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1006  HPP family protein+B94  27.74 
 
 		 383 aa  58.5  0.00000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0976  CBS  32.59 
 
 		 909 aa  57.4  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000281258  normal  0.107884 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0098  CBS domain-containing protein  31.11 
 
 		 150 aa  57.4  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3960  CBS domain containing protein  28.67 
 
 		 153 aa  57.8  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4005  CBS domain containing protein  28.67 
 
 		 153 aa  57.8  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1844  CBS domain-containing protein  32.52 
 
 		 688 aa  57.8  0.0000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0243  signal transduction protein  23.65 
 
 		 155 aa  57.4  0.0000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3742  Polynucleotide adenylyltransferase region  27.7 
 
 		 903 aa  57.4  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0269  signal transduction protein  32.52 
 
 		 688 aa  57.4  0.0000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2340  signal transduction protein  26.49 
 
 		 163 aa  57.8  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0098  CBS domain-containing protein  31.11 
 
 		 150 aa  57.4  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_8994  predicted protein  35.34 
 
 		 133 aa  57.4  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0833  CBS domain-containing protein  35.11 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1004  CBS domain-containing protein  31.43 
 
 		 149 aa  57.4  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00024412  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0383  putative signal transduction protein with CBS domains  31.85 
 
 		 149 aa  56.6  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0412615  normal  0.799719 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1851  CBS domain-containing protein  29.85 
 
 		 120 aa  57.4  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>