104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0384 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_0384  DoxX family protein  100 
 
 		 150 aa  293  4e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.762474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0104  putative integral membrane protein  69.13 
 
 		 147 aa  205  2e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.489951  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1219  DoxX family protein  65.07 
 
 		 156 aa  195  2.0000000000000003e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.901202  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0010  DoxX family protein  46.85 
 
 		 143 aa  129  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4945  DoxX family protein  52.34 
 
 		 153 aa  125  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0341702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3593  DoxX family protein  47.45 
 
 		 148 aa  123  7e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306915 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3606  DoxX family protein  50.75 
 
 		 143 aa  122  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.142156  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7016  DoxX family protein  50 
 
 		 153 aa  114  5e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00519262 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0094  DoxX family protein  46.03 
 
 		 130 aa  107  4.0000000000000004e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1342  DoxX family protein  43.7 
 
 		 145 aa  105  3e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4811  DoxX family protein  41.98 
 
 		 161 aa  103  8e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13081  integral membrane protein  47.01 
 
 		 141 aa  101  4e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2914  DoxX family protein  43.05 
 
 		 185 aa  100  8e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0156425  normal  0.195478 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3322  DoxX  41.26 
 
 		 180 aa  98.2  3e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3384  DoxX family protein  41.26 
 
 		 180 aa  98.2  3e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0241193  normal  0.0518004 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3333  DoxX family protein  41.26 
 
 		 180 aa  98.2  3e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.671485  normal  0.176308 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3338  DoxX family protein  43.38 
 
 		 133 aa  97.4  6e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0428  DoxX family protein  42.74 
 
 		 133 aa  93.6  7e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0401173  normal  0.859055 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0462  DoxX family protein  41.88 
 
 		 133 aa  92.8  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0742916 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2820  hypothetical protein  43.2 
 
 		 130 aa  91.7  3e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.161166  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2878  DoxX  41.8 
 
 		 132 aa  90.1  9e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0499  DoxX family protein  41.88 
 
 		 134 aa  89.4  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0660687 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0934  DoxX  38.57 
 
 		 140 aa  87.4  5e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0230  DoxX  42.97 
 
 		 136 aa  86.3  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00162868  unclonable  3.19876e-23 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4829  DoxX family protein  38.17 
 
 		 133 aa  85.5  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.37965 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8175  DoxX family protein  37.3 
 
 		 135 aa  85.5  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.700179  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3702  DoxX family protein  40.65 
 
 		 134 aa  84.3  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.955639 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2062  DoxX  41.6 
 
 		 125 aa  82  0.000000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.495511 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3404  DoxX family protein  38.46 
 
 		 134 aa  82.4  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.246337 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2754  DoxX family protein  36.64 
 
 		 131 aa  81.6  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0175423  hitchhiker  0.00133286 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2081  DoxX family protein  39.06 
 
 		 130 aa  80.9  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0953416  normal  0.292835 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3509  DoxX family protein  38.46 
 
 		 130 aa  79.7  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1630  DoxX family protein  42.06 
 
 		 140 aa  77.8  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0370029  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0684  DoxX  40 
 
 		 137 aa  77.8  0.00000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  unclonable  0.000000000773987  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0038  DoxX family protein  36.51 
 
 		 131 aa  77.4  0.00000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00373258 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3841  DoxX family protein  35.61 
 
 		 136 aa  77  0.00000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1514  DoxX  38.64 
 
 		 135 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.525721 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2451  hypothetical protein  42.74 
 
 		 132 aa  75.5  0.0000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.599241 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6801  hypothetical protein  36.96 
 
 		 134 aa  73.6  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.800614 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2244  DoxX  41.18 
 
 		 140 aa  71.2  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.201845  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0868  DoxX  35.38 
 
 		 136 aa  71.6  0.000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0839  DoxX family protein  34.65 
 
 		 144 aa  69.3  0.00000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.496413 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0576  DoxX family protein  39.1 
 
 		 143 aa  70.1  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.468844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1455  DoxX  36.15 
 
 		 136 aa  69.3  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1879  DoxX family protein  37.5 
 
 		 130 aa  68.6  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0371947 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4607  DoxX family protein  36.03 
 
 		 136 aa  66.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.238315  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1755  DoxX family protein  39.06 
 
 		 144 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000356426 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1915  DoxX family protein  38.28 
 
 		 145 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0302074  hitchhiker  0.0000000000182197 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0907  DoxX family protein  34.38 
 
 		 147 aa  56.2  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3456  DoxX family protein  37.5 
 
 		 145 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000181472 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1174  DoxX family protein  33.6 
 
 		 149 aa  55.8  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2313  DoxX family protein  37.5 
 
 		 145 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332195  hitchhiker  0.000213237 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1774  DoxD-like family protein  35.71 
 
 		 148 aa  55.5  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1770  DoxD-like family protein  32.8 
 
 		 148 aa  54.7  0.0000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4019  DoxX  31.5 
 
 		 144 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.394883  normal  0.482629 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02099  putative membrane DoxD-like family protein  33.86 
 
 		 151 aa  53.1  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0678079  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3012  DoxX family protein  34.65 
 
 		 147 aa  50.1  0.000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1677  DoxX  34.92 
 
 		 149 aa  50.1  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.14324  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2086  DoxX family protein  32.03 
 
 		 149 aa  50.1  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2997  DoxX family protein  34.38 
 
 		 147 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1366  DoxX family protein  34.38 
 
 		 147 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00676152 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3155  DoxX family protein  33.59 
 
 		 147 aa  47.8  0.00005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00658945 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3399  putative inner membrane protein YqjF  29.37 
 
 		 160 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4416  putative inner membrane protein YqjF  29.37 
 
 		 160 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.260448 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0138  DoxX family protein  34.07 
 
 		 147 aa  47.8  0.00006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02970  predicted quinol oxidase subunit  29.37 
 
 		 130 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0600  DoxX family protein  29.37 
 
 		 130 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3289  putative inner membrane protein YqjF  29.37 
 
 		 130 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0595  DoxX family protein  29.37 
 
 		 130 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02921  hypothetical protein  29.37 
 
 		 130 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01610  hypothetical protein  30.51 
 
 		 123 aa  46.6  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.186029  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1503  DoxX family protein  28.69 
 
 		 130 aa  46.2  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.5261 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3319  hypothetical protein  33.07 
 
 		 147 aa  45.8  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1221  DoxX family protein  33.86 
 
 		 147 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.806219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1292  DoxX family protein  33.86 
 
 		 147 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0246117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1222  DoxX family protein  33.86 
 
 		 147 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0467  DoxX family protein  28.47 
 
 		 148 aa  45.4  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3260  putative inner membrane protein YqjF  28.57 
 
 		 130 aa  45.4  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3555  DoxX family protein  28.57 
 
 		 130 aa  45.1  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.453371 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3574  putative inner membrane protein YqjF  28.57 
 
 		 130 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3051  DoxX family protein  27.5 
 
 		 136 aa  45.1  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.127697 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2062  DoxD-like family protein  31.25 
 
 		 144 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.697173 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1426  hypothetical protein  28.8 
 
 		 149 aa  44.3  0.0006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.165574 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0945  DoxX family protein  29.1 
 
 		 136 aa  43.9  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1627  DoxX  29.51 
 
 		 134 aa  43.5  0.0009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.109453  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3423  hypothetical protein  28.57 
 
 		 161 aa  43.5  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.318649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27070  hypothetical protein  29.69 
 
 		 144 aa  42.7  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.814369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1389  hypothetical protein  33.86 
 
 		 146 aa  43.5  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0236091 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2441  DoxX family protein  31.78 
 
 		 144 aa  43.5  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.630068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3493  hypothetical protein  28.57 
 
 		 161 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3527  hypothetical protein  28.57 
 
 		 161 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0510711 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3420  putative inner membrane protein YqjF  28.57 
 
 		 161 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0096  DoxX  30.25 
 
 		 131 aa  43.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2257  DoxD-like family protein  32.03 
 
 		 144 aa  42.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.418604  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1621  DoxX family protein  33.33 
 
 		 138 aa  42.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000382951  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3268  DoxX family protein  29.8 
 
 		 198 aa  42.4  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0206  DoxX family protein  34.13 
 
 		 148 aa  42  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2290  hypothetical protein  30.71 
 
 		 144 aa  41.6  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3589  putative inner membrane protein YqjF  28.57 
 
 		 161 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.24023 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2328  DoxX family protein  29.06 
 
 		 137 aa  40.8  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.380358 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>