More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0370 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_0370  periplasmic solute binding protein  100 
 
 		 309 aa  626  1e-178  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7253  periplasmic solute binding protein  60.07 
 
 		 346 aa  347  1e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518447  normal  0.0520295 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2064  periplasmic solute binding protein  41.9 
 
 		 325 aa  231  1e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4830  periplasmic solute binding protein  38.33 
 
 		 294 aa  203  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0843  periplasmic solute-binding protein  35.83 
 
 		 344 aa  201  9.999999999999999e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.620273  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1532  periplasmic solute binding protein  39.94 
 
 		 346 aa  200  1.9999999999999998e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0030  periplasmic solute binding protein  39.03 
 
 		 313 aa  198  9e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3532  periplasmic solute binding protein  37.67 
 
 		 292 aa  198  9e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4557  periplasmic solute binding protein  35.83 
 
 		 304 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.667309  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2483  periplasmic solute binding protein  36.45 
 
 		 317 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2875  periplasmic solute binding protein  37.38 
 
 		 309 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.279263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3101  periplasmic solute binding protein  37.06 
 
 		 309 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624143  normal  0.191751 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3218  periplasmic solute binding protein  37.46 
 
 		 371 aa  196  4.0000000000000005e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0863891  normal  0.580114 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3681  periplasmic solute binding protein  37.67 
 
 		 292 aa  196  6e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0534  periplasmic solute binding protein  36.43 
 
 		 293 aa  195  8.000000000000001e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1601  periplasmic solute binding protein  36.07 
 
 		 325 aa  195  1e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.298891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3625  periplasmic solute binding protein  37.06 
 
 		 326 aa  194  1e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2043  periplasmic solute binding protein  38.33 
 
 		 353 aa  192  6e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000010108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0180  periplasmic solute binding protein  36.27 
 
 		 301 aa  192  6e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.946938  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0928  periplasmic solute binding protein  36.05 
 
 		 305 aa  191  1e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.664518  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2784  periplasmic solute binding protein  39.63 
 
 		 301 aa  190  2.9999999999999997e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.199172  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2368  periplasmic solute binding protein  38.46 
 
 		 298 aa  189  4e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000358992  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5737  periplasmic solute binding protein  36.65 
 
 		 302 aa  189  4e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3176  periplasmic solute binding protein  38.55 
 
 		 292 aa  186  3e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2635  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  38.46 
 
 		 298 aa  186  4e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0828517  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1062  ABC transporter substrate binding protein  36.63 
 
 		 298 aa  186  4e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.861783  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0653  periplasmic solute binding protein  36.63 
 
 		 292 aa  185  8e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0703  periplasmic solute binding protein  37.36 
 
 		 292 aa  185  9e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.326839  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0916  periplasmic solute binding protein  39.21 
 
 		 307 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.357489  normal  0.451592 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2998  periplasmic solute binding protein  37.62 
 
 		 311 aa  182  6e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0528665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3392  periplasmic solute binding protein  41 
 
 		 320 aa  181  9.000000000000001e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00563427  normal  0.0658085 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2575  Mn transporter MntC  36.54 
 
 		 313 aa  181  1e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5324  periplasmic solute binding protein  36.54 
 
 		 302 aa  181  1e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1123  periplasmic solute binding protein  34.29 
 
 		 292 aa  180  2e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000244311  unclonable  0.0000000116493 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2553  periplasmic solute binding protein  35.07 
 
 		 319 aa  179  8e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3634  periplasmic solute binding protein  33.66 
 
 		 311 aa  178  1e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2898  periplasmic solute binding protein  37.29 
 
 		 301 aa  178  1e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.910422  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0678  periplasmic solute binding protein  36.67 
 
 		 299 aa  177  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0630556 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0845  periplasmic solute binding protein  38.1 
 
 		 289 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0688938 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3426  periplasmic solute binding protein  35.87 
 
 		 313 aa  177  2e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.525736  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2656  periplasmic solute binding protein  38.13 
 
 		 301 aa  177  2e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.149358 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1341  ABC transporter substrate-binding protein  36.69 
 
 		 291 aa  177  3e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.328207 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0623  periplasmic solute binding protein  37 
 
 		 299 aa  177  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.917925 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1278  periplasmic solute binding protein  38.71 
 
 		 315 aa  176  6e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2846  periplasmic solute binding protein  33.23 
 
 		 335 aa  175  9e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1215  periplasmic solute binding protein  35.02 
 
 		 309 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2472  periplasmic solute binding protein  34.81 
 
 		 311 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5661  periplasmic solute binding protein  33.77 
 
 		 291 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203291 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3553  periplasmic solute binding protein  38.11 
 
 		 306 aa  173  2.9999999999999996e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00157548  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0220  periplasmic solute binding protein  35.71 
 
 		 333 aa  173  2.9999999999999996e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.732372  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3624  periplasmic solute binding protein  38.49 
 
 		 303 aa  173  3.9999999999999995e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1142  periplasmic solute binding protein  35.16 
 
 		 307 aa  172  6.999999999999999e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.987303  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3728  periplasmic solute binding protein  37.85 
 
 		 303 aa  171  1e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02035  zinc ABC transporter, periplasmic zinc-binding protein  36.92 
 
 		 303 aa  171  1e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0036  adhesion lipoprotein  31.7 
 
 		 311 aa  169  4e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0129637  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1316  Mn transporter MntC  32.93 
 
 		 345 aa  169  6e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.832277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3560  periplasmic solute binding protein  35.48 
 
 		 307 aa  167  1e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.24573 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4709  periplasmic solute binding protein  34.9 
 
 		 321 aa  167  1e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.150845 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1164  periplasmic solute binding protein  37 
 
 		 321 aa  168  1e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.231796 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2051  periplasmic solute binding protein  30.23 
 
 		 303 aa  167  2e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0478383  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2227  periplasmic solute binding protein  34.72 
 
 		 327 aa  167  2e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.82387 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0350  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  31.83 
 
 		 315 aa  167  2e-40  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1533  manganese ABC transporter, manganese-binding adhesion liprotein  32.37 
 
 		 308 aa  166  2.9999999999999998e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000021133  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3046  periplasmic solute binding protein  35.29 
 
 		 336 aa  167  2.9999999999999998e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0205239  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1972  periplasmic solute binding protein  31.21 
 
 		 303 aa  166  2.9999999999999998e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0845  periplasmic solute binding family protein  30.25 
 
 		 393 aa  165  1.0000000000000001e-39  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3704  periplasmic solute binding protein  36.55 
 
 		 316 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.474771  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0953  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  30.95 
 
 		 313 aa  164  1.0000000000000001e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4030  periplasmic solute binding protein  34.13 
 
 		 305 aa  163  3e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0298524  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1226  zinc ABC transporter, periplasmic zinc-binding protein  33.22 
 
 		 312 aa  163  4.0000000000000004e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2067  manganese ABC transporter substrate-binding lipoprotein  31.7 
 
 		 311 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1312  periplasmic solute binding protein  36.82 
 
 		 306 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2964  adhesion lipoprotein  31.7 
 
 		 311 aa  162  6e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00274739  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3189  adhesion lipoprotein  31.7 
 
 		 311 aa  162  6e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1102  periplasmic solute binding protein  34.88 
 
 		 282 aa  160  2e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1597  periplasmic solute binding protein  38.38 
 
 		 309 aa  160  2e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0467055 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1794  hypothetical protein  34.11 
 
 		 311 aa  160  4e-38  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2645  periplasmic solute binding protein  33.12 
 
 		 317 aa  159  6e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5591  periplasmic solute binding protein  36.19 
 
 		 339 aa  159  6e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.462365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1655  periplasmic solute binding protein  30.77 
 
 		 306 aa  158  9e-38  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2856  periplasmic solute binding protein  37.68 
 
 		 325 aa  158  9e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1591  periplasmic solute binding protein  44.38 
 
 		 497 aa  157  3e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3980  periplasmic solute binding protein  28.53 
 
 		 354 aa  156  4e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.749936 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0222  periplasmic solute binding protein  32.9 
 
 		 306 aa  156  5.0000000000000005e-37  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0773  periplasmic solute binding protein  31.21 
 
 		 335 aa  156  5.0000000000000005e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1258  periplasmic solute binding protein  41.87 
 
 		 494 aa  155  6e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00438687  decreased coverage  0.000164305 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1141  periplasmic solute binding protein  35.89 
 
 		 310 aa  155  6e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0800  periplasmic solute binding protein  31.21 
 
 		 335 aa  155  9e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.043708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0328  periplasmic solute binding protein  35.21 
 
 		 323 aa  154  1e-36  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3282  periplasmic solute binding protein  34.2 
 
 		 311 aa  154  2e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1397  periplasmic solute binding protein  31.35 
 
 		 299 aa  154  2e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.682117  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0822  periplasmic solute binding protein  29.97 
 
 		 356 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000237297  normal  0.0439411 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0688  periplasmic solute binding protein  35.99 
 
 		 314 aa  154  2.9999999999999998e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000152738  normal  0.0354959 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04310  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  31.68 
 
 		 349 aa  153  2.9999999999999998e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2998  periplasmic solute binding protein  31.04 
 
 		 328 aa  153  2.9999999999999998e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000688581  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4184  periplasmic solute binding protein  33.12 
 
 		 307 aa  152  5e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0757118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0491  periplasmic solute binding protein  35.17 
 
 		 318 aa  152  8.999999999999999e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1724  periplasmic solute binding protein  34.9 
 
 		 309 aa  152  1e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.147475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0282  periplasmic solute binding protein  30.89 
 
 		 346 aa  151  1e-35  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000440667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1128  periplasmic solute binding protein  29.72 
 
 		 296 aa  150  4e-35  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.29041 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>