More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0345 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_0345  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 127 aa  256  8e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0435  ArsR family transcriptional regulator  76.24 
 
 		 123 aa  168  2e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02010  transcriptional regulator, ArsR family  67.65 
 
 		 125 aa  153  9e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4155  transcriptional regulator, ArsR family  74.74 
 
 		 104 aa  153  1e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4967  putative transcriptional regulator, ArsR family  68.69 
 
 		 115 aa  145  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.968943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0222  transcriptional regulator, ArsR family  60 
 
 		 116 aa  141  4e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5422  transcriptional regulator, ArsR family  63.73 
 
 		 112 aa  140  5e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.424313 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8609  transcriptional regulator, ArsR family  62.14 
 
 		 118 aa  140  7e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.498066 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3423  transcriptional regulator, ArsR family  57.14 
 
 		 119 aa  137  4.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2695  regulatory protein ArsR  59.6 
 
 		 123 aa  137  6e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.260827  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1556  ArsR family transcriptional regulator  57.85 
 
 		 125 aa  134  3.0000000000000003e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.157609  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2949  regulatory protein, ArsR  60.38 
 
 		 126 aa  130  7.999999999999999e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.394398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4496  putative transcriptional regulator, ArsR family  54.46 
 
 		 113 aa  125  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.698258  normal  0.92567 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5418  transcriptional regulator, ArsR family  56.19 
 
 		 124 aa  123  7e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.697465 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8614  transcriptional regulator, ArsR family  58.59 
 
 		 123 aa  123  7e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00781131  normal  0.130567 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2685  regulatory protein ArsR  56.25 
 
 		 120 aa  119  9.999999999999999e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0240981  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1658  regulatory protein, ArsR  60 
 
 		 183 aa  119  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.214352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1441  ArsR family transcriptional regulator  51.35 
 
 		 120 aa  118  3e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.541049 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1722  transcriptional regulator, ArsR family  57.84 
 
 		 116 aa  117  3.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.416614 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3175  ArsR family transcriptional regulator  61.68 
 
 		 126 aa  117  6e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.164371  hitchhiker  0.000124748 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0563  ArsR family transcriptional regulator  50.41 
 
 		 132 aa  116  9e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0794  regulatory protein ArsR  54.17 
 
 		 120 aa  115  1.9999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3223  regulatory protein, ArsR  54.9 
 
 		 122 aa  115  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.741691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4499  putative transcriptional regulator, ArsR family  67.5 
 
 		 105 aa  115  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12660  ArsR family transcriptional regulator  52.83 
 
 		 126 aa  115  3e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000762014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0501  regulatory protein ArsR  55.34 
 
 		 127 aa  114  3.9999999999999997e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0567681  normal  0.0228507 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0126  regulatory protein, ArsR  51.92 
 
 		 125 aa  114  5e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3239  ArsR family transcriptional regulator  52.88 
 
 		 136 aa  113  8.999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.366453 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4723  transcriptional regulator, ArsR family  50.5 
 
 		 131 aa  111  3e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.383157  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0131  ArsR family transcriptional regulator  50.96 
 
 		 125 aa  111  3e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000212185 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4523  ArsR family transcriptional regulator  52.58 
 
 		 125 aa  110  8.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4610  ArsR family transcriptional regulator  52.58 
 
 		 125 aa  110  8.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4906  ArsR family transcriptional regulator  52.58 
 
 		 125 aa  110  8.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6418  transcriptional regulator, ArsR family  47.57 
 
 		 124 aa  109  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2665  transcriptional regulator, ArsR family  46.67 
 
 		 127 aa  105  2e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.374254  normal  0.232487 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0211  ArsR family transcriptional regulator  50.5 
 
 		 125 aa  105  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14660  protein-tyrosine-phosphatase  48 
 
 		 336 aa  104  5e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3742  ArsR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 116 aa  103  7e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.102941  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14690  transcriptional regulator, ArsR family  48.62 
 
 		 116 aa  103  9e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3375  transcriptional regulator, ArsR family  44.23 
 
 		 129 aa  103  1e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0206443  hitchhiker  0.00373778 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0384  transcriptional regulator, ArsR family  51 
 
 		 127 aa  103  1e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0590  transcriptional regulator, ArsR family  43 
 
 		 117 aa  102  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.506747 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4613  ArsR family transcriptional regulator  46.53 
 
 		 120 aa  101  3e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.296682 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1856  transcriptional regulator, ArsR family  46.3 
 
 		 137 aa  101  4e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3653  transcriptional regulator, ArsR family  52.94 
 
 		 347 aa  101  4e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0388  transcriptional regulator, ArsR family  52.94 
 
 		 349 aa  99.4  1e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3657  transcriptional regulator, ArsR family  47.17 
 
 		 127 aa  99  2e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18440  predicted transcriptional regulator  51.58 
 
 		 108 aa  97.1  7e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.347123 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2310  ArsR family transcriptional regulator  46.23 
 
 		 121 aa  96.7  9e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2662  transcriptional regulator, ArsR family  53.57 
 
 		 337 aa  95.9  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.459906 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3217  regulatory protein, ArsR  51.81 
 
 		 95 aa  95.5  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3347  transcriptional regulator, ArsR family  49.48 
 
 		 120 aa  94.7  4e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0103  transcriptional regulator, ArsR family  47.62 
 
 		 124 aa  93.2  9e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3014  ArsR family transcriptional regulator  44.86 
 
 		 119 aa  93.2  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0824395  normal  0.0135705 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2579  transcriptional regulator, ArsR family  47.12 
 
 		 120 aa  93.2  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2999  ArsR family transcriptional regulator  44.86 
 
 		 130 aa  92.4  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3045  ArsR family transcriptional regulator  44.86 
 
 		 119 aa  92.8  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0367  transcriptional regulator, ArsR family  43 
 
 		 337 aa  91.7  3e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0788  regulatory protein ArsR  44 
 
 		 120 aa  91.3  4e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1223  regulatory protein, ArsR  39.67 
 
 		 131 aa  91.3  4e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0337905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12658  ArsR family transcriptional regulator  41.12 
 
 		 119 aa  90.5  7e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000059483  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20610  transcriptional regulator, ArsR family  43.14 
 
 		 121 aa  89.7  1e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2679  regulatory protein ArsR  42.45 
 
 		 120 aa  89.7  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00320886  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0112  ArsR family transcriptional regulator  41.75 
 
 		 119 aa  88.6  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0492  transcriptional regulator, ArsR family  49.52 
 
 		 123 aa  87.8  5e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.483938  hitchhiker  0.00309358 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26420  transcriptional regulator, ArsR family  41 
 
 		 109 aa  85.9  2e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.169574 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1652  regulatory protein, ArsR  39.25 
 
 		 119 aa  85.1  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.000800297  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31180  transcriptional regulator, ArsR family  39.39 
 
 		 121 aa  85.5  3e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3471  regulatory protein, ArsR  40.19 
 
 		 135 aa  83.2  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.508363 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4825  regulatory protein, ArsR  36.45 
 
 		 128 aa  80.1  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.114611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3638  regulatory protein, ArsR  45.78 
 
 		 134 aa  79.7  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0532  ArsR family transcriptional regulator  46.59 
 
 		 114 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5239  transcriptional regulator, ArsR family  48.1 
 
 		 97 aa  78.2  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0441839  normal  0.647362 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0822  ArsR family transcriptional regulator  38.32 
 
 		 118 aa  77.8  0.00000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0493  transcriptional regulator  51.28 
 
 		 117 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3499  ArsR family transcriptional regulator  45.98 
 
 		 114 aa  76.6  0.00000000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0532  ArsR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 114 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2151  ArsR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 109 aa  74.7  0.0000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2670  transcriptional regulator, ArsR family  51.43 
 
 		 120 aa  74.7  0.0000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00021786  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13920  transcriptional regulator, ArsR family  49.35 
 
 		 124 aa  74.7  0.0000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.836501  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1925  putative transcriptional regulator, ArsR family  49.3 
 
 		 117 aa  74.7  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.26024  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1211  transcriptional regulator, ArsR family  44.16 
 
 		 117 aa  74.3  0.0000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0936  regulator of arsenical resistance  36.49 
 
 		 113 aa  73.9  0.0000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0872  regulatory protein ArsR  40.24 
 
 		 95 aa  73.9  0.0000000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.633689  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0687  regulatory protein ArsR  37.36 
 
 		 95 aa  73.6  0.0000000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3326  transcriptional regulator, ArsR family  45.45 
 
 		 115 aa  73.6  0.0000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0136  ArsR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 95 aa  73.6  0.0000000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0753  regulatory protein ArsR  37.78 
 
 		 95 aa  73.6  0.0000000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1231  ArsR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 95 aa  73.6  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11041  regulatory proteins, ArsR family protein  47.95 
 
 		 92 aa  73.2  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.74054 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1433  ArsR family transcriptional regulator  45 
 
 		 105 aa  73.2  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.662802 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0468  regulatory protein, ArsR  44.94 
 
 		 113 aa  72  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3960  ArsR family transcriptional regulator  50.7 
 
 		 114 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3834  regulatory protein ArsR  50.7 
 
 		 114 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6661  putative transcriptional regulator, ArsR family  45.12 
 
 		 93 aa  72  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.500493  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3777  transcriptional regulator, ArsR family  50.7 
 
 		 114 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0576  transcriptional regulator, ArsR family  41.89 
 
 		 108 aa  72  0.000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00300248  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0491  regulatory protein, ArsR  50.7 
 
 		 114 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0417  ArsR family transcriptional regulator  47.89 
 
 		 115 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3189  arsenical resistance operon repressor  45 
 
 		 101 aa  72  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>