More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0330 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_0330  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 173 aa  348  2e-95  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1458  MarR family transcriptional regulator  44.3 
 
 		 172 aa  137  7.999999999999999e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00644177  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1460  transcriptional regulator, MarR family  46.98 
 
 		 174 aa  136  2e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000303133 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4803  transcriptional regulator, MarR family  46.81 
 
 		 154 aa  126  2.0000000000000002e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.833375  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3511  transcriptional regulator, MarR family  50 
 
 		 142 aa  116  9.999999999999999e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0295  transcriptional regulator, MarR family  43.94 
 
 		 161 aa  99  3e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2822  transcriptional regulator, MarR family  45.8 
 
 		 166 aa  92.8  2e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00330926 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6069  transcriptional regulator, MarR family  34.85 
 
 		 146 aa  78.2  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.683287 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1718  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 162 aa  72  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.106363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1623  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 162 aa  71.6  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.347087  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1037  transcriptional regulator, MarR family  34.31 
 
 		 174 aa  71.2  0.000000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1659  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 162 aa  70.5  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1651  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 162 aa  70.1  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2777  transcriptional regulator, MarR family  30.22 
 
 		 158 aa  69.7  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.158506  normal  0.392987 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2263  transcriptional regulator, MarR family  39.42 
 
 		 164 aa  69.3  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000218689  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00720  transcriptional regulator  31.94 
 
 		 153 aa  69.7  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.322851  normal  0.322899 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3047  MarR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 161 aa  69.3  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5432  transcriptional regulator, MarR family  37.93 
 
 		 157 aa  68.9  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.933752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9227  transcriptional regulator  35.58 
 
 		 165 aa  68.2  0.00000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.429964  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01480  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 169 aa  68.2  0.00000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0435  MarR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 150 aa  68.2  0.00000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4025  regulatory protein MarR  37.72 
 
 		 160 aa  67.4  0.00000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.895224  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0663  transcriptional regulator, MarR family  33.83 
 
 		 165 aa  67.4  0.00000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1861  transcriptional regulator, MarR family  35.58 
 
 		 174 aa  67.4  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.172751  normal  0.486159 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0220  MarR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 143 aa  67  0.0000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0218  MarR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 143 aa  66.2  0.0000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1889  MarR family transcriptional regulator  36.44 
 
 		 192 aa  66.2  0.0000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.882763 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0411  transcriptional regulator, MarR family  40.5 
 
 		 139 aa  65.9  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418684  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1639  transcriptional regulator, MarR family  28.67 
 
 		 161 aa  65.1  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1657  transcriptional regulator, MarR family  34.62 
 
 		 157 aa  65.1  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.384015  normal  0.405999 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0774  regulatory protein, MarR  31.06 
 
 		 155 aa  65.1  0.0000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.957348  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0305  transcriptional regulator, MarR family  36.07 
 
 		 172 aa  63.5  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0649  transcriptional regulator, MarR family  30.82 
 
 		 152 aa  63.2  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.827556  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0465  transcriptional regulator, MarR family  41.3 
 
 		 201 aa  63.2  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.203979  normal  0.101553 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0111  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 142 aa  63.2  0.000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.238503  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2935  transcriptional regulator, MarR family  37.14 
 
 		 154 aa  62.4  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00693661  hitchhiker  0.00247077 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0110  MarR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 142 aa  61.6  0.000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4619  regulatory protein MarR  35 
 
 		 143 aa  61.6  0.000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.466071  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4204  MarR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 158 aa  61.2  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.880784 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1342  transcriptional regulator, MarR family  47.3 
 
 		 156 aa  61.2  0.000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000398816 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4091  MarR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 161 aa  60.5  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.294504 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4671  transcriptional regulator, MarR family  34.43 
 
 		 173 aa  60.1  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.172842  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2171  regulatory protein, MarR  36.04 
 
 		 132 aa  60.5  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0312  MarR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 146 aa  60.5  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0516  transcriptional regulator, MarR family  28.89 
 
 		 171 aa  59.7  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.398648 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3184  transcriptional regulator, MarR family  39.36 
 
 		 162 aa  59.7  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.824605 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3512  transcriptional regulator, MarR family  32.74 
 
 		 188 aa  59.3  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0223  transcriptional regulator, MarR family  38.37 
 
 		 169 aa  59.3  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.504687  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0762  transcriptional regulator, MarR family  34.15 
 
 		 178 aa  58.9  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0549  transcriptional regulator, MarR family  34.68 
 
 		 157 aa  58.5  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0503  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 171 aa  58.2  0.00000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.554707 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1797  transcriptional regulator, MarR family  28.81 
 
 		 187 aa  58.2  0.00000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.109893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0969  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 		 165 aa  58.2  0.00000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0075  transcriptional regulator, MarR family  34.51 
 
 		 175 aa  57.8  0.00000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9024  Transcriptional regulators-like protein  41.38 
 
 		 154 aa  56.6  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2632  MarR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 161 aa  56.6  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.256033  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34620  transcriptional regulator  37.86 
 
 		 149 aa  56.6  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.106002  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0565  MarR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 193 aa  55.8  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1655  transcriptional regulator, MarR family  33.71 
 
 		 155 aa  55.8  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0540  MarR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 171 aa  55.8  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30420  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 159 aa  55.5  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.147448  normal  0.274535 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4242  MarR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 172 aa  55.8  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.594533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2533  MarR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 139 aa  55.8  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.491693  normal  0.727231 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6435  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 178 aa  55.1  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.414411 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5323  MarR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0489  transcriptional regulator, MarR family  31.16 
 
 		 148 aa  55.5  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5412  MarR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.945092 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5702  MarR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0742  transcriptional regulator  27.07 
 
 		 292 aa  54.3  0.0000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0590  putative transcription regulator protein  34.31 
 
 		 178 aa  53.9  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3635  MarR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 158 aa  53.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0286016 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3432  MarR family transcriptional regulator  38.53 
 
 		 155 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.262117  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2524  transcriptional regulator, MarR family  32 
 
 		 161 aa  53.9  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0637  transcriptional regulator, MarR family  33.1 
 
 		 170 aa  53.9  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3495  MarR family transcriptional regulator  38.53 
 
 		 155 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.144178  normal  0.175021 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7275  MarR family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 151 aa  53.5  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.430156  normal  0.0802572 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5097  transcriptional regulator, MarR family  39.76 
 
 		 151 aa  53.9  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12350  hypothetical protein  35.58 
 
 		 163 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02870  transcriptional regulator  35.11 
 
 		 157 aa  52.8  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4001  MarR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 149 aa  52.8  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1596  MarR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 157 aa  53.5  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3443  MarR family transcriptional regulator  38.53 
 
 		 155 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.361785 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1078  MarR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 307 aa  52.4  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.273595 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3696  MarR family transcriptional regulator  37.72 
 
 		 151 aa  52.4  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.134225  normal  0.172711 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3289  MarR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 147 aa  52.4  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.131138 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1059  transcriptional regulator, TrmB  45.07 
 
 		 153 aa  52.4  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0495893  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26700  transcriptional regulator, MarR family  32.8 
 
 		 162 aa  52.4  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.297674 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2639  transcriptional regulator, MarR family  26.27 
 
 		 150 aa  52  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1245  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 176 aa  52  0.000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.868936  normal  0.145982 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4203  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 161 aa  52  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1619  transcriptional regulator  27.83 
 
 		 158 aa  52  0.000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00285215  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0598  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 159 aa  52  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0802  MarR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 160 aa  51.6  0.000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0707582  normal  0.338446 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0190  transcriptional regulator, MarR family  26.87 
 
 		 172 aa  51.6  0.000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0419  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 160 aa  51.2  0.000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9192  transcriptional regulator  28.28 
 
 		 165 aa  51.6  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3155  hypothetical protein  33.61 
 
 		 292 aa  51.6  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2790  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 170 aa  51.2  0.000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0776  transcriptional regulator, MarR family  37.37 
 
 		 187 aa  51.2  0.000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.216692  normal  0.214261 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0853  HxlR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 159 aa  50.8  0.000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.841358  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>