More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0327 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_0327  ABC transporter-like protein  100 
 
 
246 aa  498  1e-140  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.246598  normal  0.811269 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2964  ABC transporter related protein  79.34 
 
 
253 aa  405  1.0000000000000001e-112  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.194601  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38820  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  76.03 
 
 
251 aa  382  1e-105  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1400  ABC transporter related protein  75.52 
 
 
257 aa  372  1e-102  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0590  ABC transporter related protein  72.2 
 
 
257 aa  366  1e-100  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6988  ABC transporter related  72.31 
 
 
265 aa  365  1e-100  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.741907  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2831  ABC transporter related  70.95 
 
 
262 aa  356  1.9999999999999998e-97  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.563862 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24330  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  71.43 
 
 
273 aa  356  1.9999999999999998e-97  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0478381  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3012  ABC transporter related  67.21 
 
 
244 aa  351  8e-96  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.197193  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11340  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  66.67 
 
 
258 aa  347  1e-94  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.571361  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3136  ABC transporter related  69.29 
 
 
269 aa  346  2e-94  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0959  ABC transporter related  68.57 
 
 
260 aa  345  5e-94  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0685  ABC transporter related  70.9 
 
 
255 aa  342  2.9999999999999997e-93  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18720  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  70.04 
 
 
267 aa  334  5.999999999999999e-91  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1128  ABC transporter related  63.64 
 
 
242 aa  325  3e-88  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.989355 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  63.33 
 
 
244 aa  324  1e-87  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  64.32 
 
 
244 aa  323  2e-87  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1473  ABC transporter related  62.5 
 
 
243 aa  320  9.999999999999999e-87  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0234902  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1072  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  63.6 
 
 
240 aa  320  9.999999999999999e-87  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.244358  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2298  ABC transporter related  62.24 
 
 
247 aa  320  1.9999999999999998e-86  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000478919  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1229  ABC transporter related  62.5 
 
 
243 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2369  ABC transporter related  62.76 
 
 
246 aa  319  3e-86  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0470  ABC transporter related  60.67 
 
 
240 aa  319  3e-86  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000946147  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2587  ABC transporter related  60.25 
 
 
240 aa  318  3.9999999999999996e-86  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.163007  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0569  glutamine transport protein glnQ  61.51 
 
 
240 aa  318  3.9999999999999996e-86  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.909339  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0729  ABC transporter related  64.41 
 
 
240 aa  318  5e-86  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000155428  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1920  ABC transporter related  65.55 
 
 
249 aa  317  1e-85  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0726  ABC transporter related  62.08 
 
 
243 aa  317  1e-85  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.019566  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  64.2 
 
 
244 aa  316  2e-85  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2453  ABC transporter related protein  59.58 
 
 
242 aa  316  2e-85  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0583  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60.67 
 
 
240 aa  316  2e-85  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2233  ABC transporter related  62.5 
 
 
246 aa  316  2e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.693391  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  61.32 
 
 
244 aa  315  3e-85  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  61.25 
 
 
242 aa  314  9.999999999999999e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4750  ABC transporter related  62.76 
 
 
239 aa  313  9.999999999999999e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000409698  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  60 
 
 
242 aa  313  9.999999999999999e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1467  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein, GlnQ putative  61.67 
 
 
246 aa  313  1.9999999999999998e-84  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2588  ABC transporter-like protein  62.4 
 
 
247 aa  312  1.9999999999999998e-84  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.0000779589  normal  0.524801 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1596  ABC transporter related  63.07 
 
 
249 aa  312  2.9999999999999996e-84  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.655057  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3165  ABC transporter related  64.05 
 
 
257 aa  311  5.999999999999999e-84  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.127499  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1053  ABC transporter related  59.17 
 
 
242 aa  311  6.999999999999999e-84  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1462  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  59.58 
 
 
246 aa  311  6.999999999999999e-84  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.837039  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3519  ABC transporter related protein  61.92 
 
 
240 aa  311  9e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3164  ABC transporter-related protein  61.51 
 
 
241 aa  310  1e-83  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.195167  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1866  ABC transporter related protein  58.75 
 
 
242 aa  310  1e-83  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000046676  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1977  glutamate ABC transporter ATP-binding protein  60.67 
 
 
244 aa  310  1e-83  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2806  ABC transporter related protein  61.16 
 
 
247 aa  310  1e-83  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.237976 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1028  ABC transporter related  61.18 
 
 
240 aa  310  2e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3809  ABC transporter related  62.76 
 
 
240 aa  309  2.9999999999999997e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0652  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  60.17 
 
 
244 aa  308  4e-83  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.219749  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0239  ABC transporter related  62.55 
 
 
256 aa  308  5e-83  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4704  ABC transporter-related protein  63.11 
 
 
257 aa  308  5.9999999999999995e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.874551  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1137  ABC transporter related  60.67 
 
 
240 aa  308  6.999999999999999e-83  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0546952  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3499  ABC transporter related  60.16 
 
 
254 aa  308  6.999999999999999e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.114372  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0099  ABC transporter related  59.17 
 
 
247 aa  307  9e-83  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000131657  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3404  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  64.44 
 
 
240 aa  307  1.0000000000000001e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0452934  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0396  ABC transporter related  61.67 
 
 
253 aa  307  1.0000000000000001e-82  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000127447  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0417  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  61.67 
 
 
253 aa  306  2.0000000000000002e-82  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00684125  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1924  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  59.5 
 
 
247 aa  306  2.0000000000000002e-82  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.467603  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0492  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  61.92 
 
 
244 aa  305  3e-82  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00185587  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_360  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  62.08 
 
 
284 aa  305  3e-82  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000584312  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2152  ABC transporter related  58.26 
 
 
242 aa  305  5.0000000000000004e-82  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.104649 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0861  ATPase  57.56 
 
 
363 aa  304  7e-82  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.528651 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1038  ATPase  57.56 
 
 
363 aa  304  7e-82  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.396319 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3762  ABC transporter-related protein  61.09 
 
 
241 aa  304  7e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000558421  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2727  ABC transporter related  60.67 
 
 
243 aa  304  8.000000000000001e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1048  ABC transporter-like protein  61.67 
 
 
245 aa  304  9.000000000000001e-82  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2289  ABC transporter related  59 
 
 
240 aa  304  9.000000000000001e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000025555  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1871  ABC transporter related protein  62.55 
 
 
240 aa  304  9.000000000000001e-82  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000629259  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0713  ABC transporter related protein  60.33 
 
 
245 aa  304  1.0000000000000001e-81  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0161092  normal  0.0156766 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2303  ABC transporter related protein  60.42 
 
 
246 aa  303  1.0000000000000001e-81  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000265903  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0335  ABC transporter related  62.13 
 
 
249 aa  303  2.0000000000000002e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.739682  normal  0.0719591 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3399  ABC transporter related  59.83 
 
 
241 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0166  ATPase  61.76 
 
 
244 aa  303  2.0000000000000002e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3688  ABC transporter related protein  63.97 
 
 
273 aa  303  2.0000000000000002e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.540911 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0916  ABC transporter related  57.85 
 
 
242 aa  303  2.0000000000000002e-81  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2057  ABC transporter related  61.09 
 
 
243 aa  303  2.0000000000000002e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1222  ABC transporter related  61.75 
 
 
258 aa  301  4.0000000000000003e-81  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.757141  hitchhiker  0.00582014 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0984  ABC transporter related  59.41 
 
 
241 aa  301  7.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0949  ABC transporter related  59.41 
 
 
241 aa  301  7.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1342  ABC transporter related  62.18 
 
 
243 aa  301  8.000000000000001e-81  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.494343 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3394  ABC transporter related  59.41 
 
 
241 aa  301  8.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00476356  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0822  ABC transporter-related protein  59.83 
 
 
240 aa  301  8.000000000000001e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.483351 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3681  ABC transporter related protein  60.96 
 
 
267 aa  300  1e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4861  ABC transporter related  60.43 
 
 
241 aa  300  1e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.62154 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0540  ABC transporter-related protein  59.58 
 
 
243 aa  300  1e-80  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.453027  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2763  ATPase  59.17 
 
 
243 aa  299  2e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3151  ABC transporter related  57.02 
 
 
242 aa  299  3e-80  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0859723 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1801  ABC transporter related  58.82 
 
 
250 aa  299  3e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0322586 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0468  ABC transporter related  60.25 
 
 
240 aa  298  4e-80  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0917  ABC transporter related  59 
 
 
241 aa  298  4e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0970  ABC transporter related  59.41 
 
 
241 aa  298  4e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.805871  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0880  ABC transporter related  59 
 
 
241 aa  298  4e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.152128  normal  0.31511 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3993  ABC transporter related  59 
 
 
240 aa  298  5e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.107157  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3029  ABC transporter related  59 
 
 
241 aa  298  5e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1042  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59 
 
 
241 aa  298  6e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3416  ABC transporter related  59.09 
 
 
251 aa  298  7e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1394  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  59.41 
 
 
240 aa  297  9e-80  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4950  ABC transporter related  61.29 
 
 
259 aa  296  1e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3055  ABC transporter related  58.58 
 
 
241 aa  297  1e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00427883  hitchhiker  0.00805011 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>