More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0284 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_1882  NADH dehydrogenase subunit D  70.05 
 
 		 442 aa  642    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.303191  normal  0.424323 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1601  NADH dehydrogenase subunit D  71.63 
 
 		 446 aa  635    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2692  NADH dehydrogenase subunit D  76.74 
 
 		 434 aa  692    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5056  NADH dehydrogenase I, D subunit  75.7 
 
 		 431 aa  682    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0587  NADH dehydrogenase (quinone)  84.49 
 
 		 441 aa  768    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4555  NADH dehydrogenase I, D subunit  73.38 
 
 		 443 aa  655    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4415  NADH dehydrogenase I, D subunit  79.45 
 
 		 449 aa  712    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7688  NADH dehydrogenase subunit D  71.62 
 
 		 445 aa  654    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.450459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0523  NADH dehydrogenase subunit D  70.78 
 
 		 446 aa  645    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0398  NADH dehydrogenase I, D subunit  71.95 
 
 		 446 aa  656    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1577  NADH dehydrogenase subunit D  71.63 
 
 		 446 aa  635    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1547  NADH dehydrogenase subunit D  71.63 
 
 		 446 aa  635    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.795023  normal  0.142178 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0284  NADH dehydrogenase I subunit D  100 
 
 		 438 aa  894    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0270  NADH dehydrogenase subunit D  70.86 
 
 		 440 aa  633  1e-180  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.877752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4460  NADH dehydrogenase subunit D  68.82 
 
 		 441 aa  626  1e-178  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13169  NADH dehydrogenase subunit D  69.77 
 
 		 440 aa  625  1e-178  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4484  NADH dehydrogenase subunit D  69.3 
 
 		 451 aa  627  1e-178  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00259323 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1277  NADH dehydrogenase I, D subunit  69.44 
 
 		 444 aa  625  1e-178  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.494921  normal  0.687145 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4062  NADH dehydrogenase subunit D  68.13 
 
 		 441 aa  621  1e-177  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.855736  normal  0.069193 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0541  NADH dehydrogenase subunit D  69.04 
 
 		 482 aa  612  9.999999999999999e-175  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.482391  normal  0.20204 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3171  NADH dehydrogenase I, D subunit  69.58 
 
 		 426 aa  612  9.999999999999999e-175  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6091  NADH dehydrogenase subunit D  68.58 
 
 		 457 aa  609  1e-173  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.489458  normal  0.0112827 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6679  NADH dehydrogenase subunit D  65.51 
 
 		 483 aa  591  1e-168  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0977  NADH dehydrogenase subunit D  64.07 
 
 		 459 aa  584  1.0000000000000001e-165  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2713  NADH dehydrogenase I, D subunit  65.11 
 
 		 448 aa  578  1e-164  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5629  NADH dehydrogenase subunit D  68.69 
 
 		 426 aa  575  1.0000000000000001e-163  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0649561 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03190  NADH dehydrogenase subunit D  63.89 
 
 		 460 aa  572  1.0000000000000001e-162  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.515319 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3226  NADH dehydrogenase subunit D  65.34 
 
 		 445 aa  572  1.0000000000000001e-162  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00372602 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0472  NADH dehydrogenase I, D subunit  62.61 
 
 		 447 aa  558  1e-158  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07410  NADH dehydrogenase subunit D  61.59 
 
 		 450 aa  552  1e-156  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.977582  normal  0.014911 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0542  NADH dehydrogenase subunit D  63.92 
 
 		 446 aa  549  1e-155  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.502265  normal  0.442373 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3675  NADH dehydrogenase I, D subunit  52.42 
 
 		 417 aa  448  1e-125  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0132867 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1321  NADH dehydrogenase I, D subunit  52.66 
 
 		 417 aa  446  1.0000000000000001e-124  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.735553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0366  NADH dehydrogenase I, D subunit  50.48 
 
 		 417 aa  427  1e-118  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1046  NADH dehydrogenase I, D subunit  51.47 
 
 		 411 aa  422  1e-117  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3082  NADH dehydrogenase I, D subunit  49.03 
 
 		 422 aa  418  1e-116  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1313  NADH dehydrogenase I, D subunit  49.04 
 
 		 401 aa  402  1e-111  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1152  NADH dehydrogenase I, D subunit  50.12 
 
 		 413 aa  399  9.999999999999999e-111  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1280  NADH dehydrogenase I, D subunit  49.26 
 
 		 414 aa  395  1e-109  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.658271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3135  NADH dehydrogenase I, D subunit  45.5 
 
 		 390 aa  385  1e-106  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0132145  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4241  NADH dehydrogenase I, D subunit  45.59 
 
 		 390 aa  387  1e-106  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0411944  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1874  NADH dehydrogenase I, D subunit  47.57 
 
 		 415 aa  387  1e-106  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.598165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0566  NADH dehydrogenase subunit D  46.29 
 
 		 388 aa  382  1e-105  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0912  NADH dehydrogenase I, D subunit  49.88 
 
 		 403 aa  385  1e-105  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3923  NADH dehydrogenase I, D subunit  45.34 
 
 		 389 aa  384  1e-105  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.587069  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0341  NADH dehydrogenase I, D subunit  45.59 
 
 		 390 aa  380  1e-104  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0211499  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3352  NADH dehydrogenase I, D subunit  45.59 
 
 		 390 aa  379  1e-104  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.131197  normal  0.0118999 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4007  NADH dehydrogenase I, D subunit  44.85 
 
 		 389 aa  381  1e-104  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.2044e-27 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1541  NADH dehydrogenase I, D subunit  46.72 
 
 		 400 aa  375  1e-103  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4129  NADH dehydrogenase I, D subunit  45.79 
 
 		 396 aa  375  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0924  NADH dehydrogenase subunit D  43.48 
 
 		 406 aa  372  1e-102  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0560  NADH dehydrogenase subunit D  44.33 
 
 		 390 aa  371  1e-101  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4393  NADH dehydrogenase I, D subunit  45.54 
 
 		 396 aa  369  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0182447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0616  NADH dehydrogenase subunit D  44.72 
 
 		 393 aa  370  1e-101  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0389154  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5799  NADH dehydrogenase I, D subunit  46.04 
 
 		 396 aa  367  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.143218  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0426  NADH dehydrogenase subunit D  43.84 
 
 		 393 aa  365  1e-100  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3331  NADH dehydrogenase subunit D  44.69 
 
 		 416 aa  367  1e-100  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.150101  normal  0.101451 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1025  NADH dehydrogenase subunit D  43.72 
 
 		 396 aa  364  2e-99  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1558  NADH dehydrogenase subunit D  45.19 
 
 		 392 aa  363  3e-99  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.970995  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1262  NADH dehydrogenase subunit D  45.79 
 
 		 396 aa  360  2e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5177  NADH dehydrogenase subunit D  42.89 
 
 		 417 aa  360  3e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.752973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1266  NADH dehydrogenase subunit D  42.66 
 
 		 417 aa  360  4e-98  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.26222 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3297  NADH dehydrogenase subunit D  44.09 
 
 		 402 aa  359  5e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1715  NADH dehydrogenase subunit D  44.66 
 
 		 396 aa  359  7e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2057  NADH dehydrogenase I, D subunit  43.45 
 
 		 396 aa  358  8e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.320233  normal  0.342596 
 
 
-
 
NC_004310  BR0805  NADH dehydrogenase subunit D  44.2 
 
 		 396 aa  358  9.999999999999999e-98  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0798929  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1354  NADH dehydrogenase subunit D  45.79 
 
 		 396 aa  358  9.999999999999999e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.937388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2420  NADH dehydrogenase subunit D  44.2 
 
 		 396 aa  357  1.9999999999999998e-97  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0800  NADH dehydrogenase subunit D  44.2 
 
 		 396 aa  357  1.9999999999999998e-97  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.331726  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3620  NADH dehydrogenase I, D subunit  44.18 
 
 		 404 aa  357  2.9999999999999997e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.761398  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0875  NADH dehydrogenase subunit D  43.12 
 
 		 417 aa  357  2.9999999999999997e-97  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.334972  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4630  NADH dehydrogenase I, D subunit  45.79 
 
 		 402 aa  357  2.9999999999999997e-97  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.193494 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0960  NADH dehydrogenase subunit D  43.12 
 
 		 417 aa  357  2.9999999999999997e-97  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000966275 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2404  NADH dehydrogenase subunit D  43.93 
 
 		 396 aa  357  2.9999999999999997e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00163945 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2921  NADH dehydrogenase I, D subunit  44.33 
 
 		 394 aa  355  7.999999999999999e-97  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2396  NADH dehydrogenase I, D subunit  44.09 
 
 		 396 aa  355  7.999999999999999e-97  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.213945  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1745  NADH dehydrogenase subunit D  42.66 
 
 		 417 aa  355  7.999999999999999e-97  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2627  NADH dehydrogenase subunit D  42.92 
 
 		 417 aa  355  7.999999999999999e-97  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2254  NADH dehydrogenase subunit D  42.92 
 
 		 417 aa  355  7.999999999999999e-97  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000154911 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1016  NADH dehydrogenase I, D subunit  42.75 
 
 		 396 aa  355  8.999999999999999e-97  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1427  NADH dehydrogenase subunit D  42.19 
 
 		 417 aa  354  1e-96  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.448612  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1082  NADH dehydrogenase I, D subunit  42.96 
 
 		 396 aa  355  1e-96  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.129082 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1885  NADH dehydrogenase subunit D  43.66 
 
 		 402 aa  355  1e-96  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.634993 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1211  NADH dehydrogenase I, D subunit  42.96 
 
 		 396 aa  355  1e-96  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2218  NADH dehydrogenase subunit D  43.41 
 
 		 402 aa  353  2.9999999999999997e-96  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.714071  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1504  NADH dehydrogenase subunit D  42.66 
 
 		 417 aa  353  5e-96  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00434712 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01290  NADH dehydrogenase subunit D  41.56 
 
 		 435 aa  352  5.9999999999999994e-96  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.191542  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0781  NADH dehydrogenase subunit D  43.81 
 
 		 396 aa  352  5.9999999999999994e-96  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.673005  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0820  NADH dehydrogenase subunit D  43.12 
 
 		 417 aa  351  1e-95  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.205502  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4560  NADH dehydrogenase subunit D  43.6 
 
 		 398 aa  350  2e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.17714 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3253  NADH dehydrogenase subunit D  41.96 
 
 		 417 aa  351  2e-95  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.626895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0891  NADH dehydrogenase subunit D  44.55 
 
 		 396 aa  350  2e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.984899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2833  NADH dehydrogenase subunit D  42.65 
 
 		 416 aa  350  3e-95  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.371933  normal  0.138606 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2575  NADH dehydrogenase subunit D  42.82 
 
 		 401 aa  350  3e-95  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0392469  normal  0.134645 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2884  NADH dehydrogenase subunit D  43.17 
 
 		 416 aa  350  3e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.736243  normal  0.115348 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3632  NADH dehydrogenase subunit D  42.65 
 
 		 397 aa  350  3e-95  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.638594 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1172  NADH dehydrogenase subunit D  43.69 
 
 		 396 aa  349  5e-95  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02414  hypothetical protein similar to NADH-ubiquinone oxidoreductase 49 kDa subunit, mitochondrial precursor (Eurofung)  42.82 
 
 		 475 aa  348  7e-95  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.151267 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1145  NADH dehydrogenase subunit D  41.96 
 
 		 417 aa  349  7e-95  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0197205  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1358  NADH dehydrogenase subunit D  43.35 
 
 		 402 aa  348  8e-95  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.121379  normal  0.0313197 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>