104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0260 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_0260  CoA-binding domain-containing protein  100 
 
 
242 aa  483  1e-135  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0547  redox-sensing transcriptional repressor REX  81.97 
 
 
235 aa  381  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.176234  normal  0.347518 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2734  redox-sensing transcriptional repressor Rex  80.09 
 
 
230 aa  340  2e-92  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4441  CoA-binding domain protein  77.06 
 
 
273 aa  335  5.999999999999999e-91  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4373  CoA-binding domain protein  73.39 
 
 
231 aa  321  8e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8327  redox-sensing transcriptional repressor Rex  75 
 
 
279 aa  321  8e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.670988  normal  0.432921 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0239  redox-sensing transcriptional repressor Rex  71.22 
 
 
290 aa  300  2e-80  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.148262  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0493  redox-sensing transcriptional repressor Rex  70.28 
 
 
225 aa  297  1e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0355  redox-sensing transcriptional repressor Rex  72.2 
 
 
256 aa  277  1e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02840  redox-sensing transcriptional repressor Rex  66.35 
 
 
290 aa  272  3e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.841191 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0425  redox-sensing transcriptional repressor Rex  71.22 
 
 
256 aa  272  4.0000000000000004e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.346833  hitchhiker  0.0060004 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6132  redox-sensing transcriptional repressor Rex  71.92 
 
 
310 aa  269  2.9999999999999997e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.249873 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6731  redox-sensing transcriptional repressor Rex  63.16 
 
 
256 aa  266  2e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0484  redox-sensing transcriptional repressor Rex  66.82 
 
 
380 aa  257  1e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0616  redox-sensing transcriptional repressor Rex  65.69 
 
 
260 aa  253  1.0000000000000001e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0515217  normal  0.0490105 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5695  CoA-binding domain-containing protein  64.45 
 
 
229 aa  253  1.0000000000000001e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.298917  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3297  redox-sensing transcriptional repressor Rex  63.24 
 
 
231 aa  253  2.0000000000000002e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3096  redox-sensing transcriptional repressor Rex  62.75 
 
 
234 aa  249  4e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0919  redox-sensing transcriptional repressor Rex  60.77 
 
 
252 aa  233  2.0000000000000002e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2738  CoA-binding domain protein  58.85 
 
 
231 aa  229  2e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.119335  normal  0.0962881 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07160  AT-rich DNA-binding protein  56.67 
 
 
233 aa  219  1.9999999999999999e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.160551 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4581  CoA-binding domain protein  59.11 
 
 
221 aa  219  3e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0440  CoA-binding domain protein  60 
 
 
216 aa  213  1.9999999999999998e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4356  redox-sensing transcriptional repressor Rex  49.75 
 
 
210 aa  202  4e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000118319  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1603  redox-sensing transcriptional repressor Rex  48.5 
 
 
210 aa  197  1.0000000000000001e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1392  redox-sensing transcriptional repressor Rex  46.67 
 
 
220 aa  194  7e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1645  redox-sensing transcriptional repressor Rex  47.74 
 
 
210 aa  192  3e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.301525  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4103  redox-sensing transcriptional repressor Rex  44.61 
 
 
220 aa  189  4e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2551  redox-sensing transcriptional repressor Rex  46.73 
 
 
210 aa  188  5.999999999999999e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0157  redox-sensing transcriptional repressor Rex  44.61 
 
 
212 aa  186  2e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.496465  normal  0.0812213 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1308  redox-sensing transcriptional repressor Rex  46.73 
 
 
220 aa  185  6e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.727677  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2257  redox-sensing transcriptional repressor Rex  43.63 
 
 
213 aa  179  4.999999999999999e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.320604  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1040  CoA-binding domain protein  41.79 
 
 
226 aa  176  3e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0394  CoA-binding domain-containing protein  44.5 
 
 
213 aa  176  4e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000948355  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0534  redox-sensing transcriptional repressor Rex  45.73 
 
 
215 aa  175  5e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.793002 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2702  redox-sensing transcriptional repressor Rex  43.35 
 
 
213 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.597426  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1260  redox-sensing transcriptional repressor Rex  43.22 
 
 
215 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.262472  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1585  redox-sensing transcriptional repressor Rex  47.24 
 
 
214 aa  173  1.9999999999999998e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0413652  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20290  redox-sensing transcriptional repressor Rex  44 
 
 
215 aa  173  2.9999999999999996e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.252712  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1390  redox-sensing transcriptional repressor Rex  42.86 
 
 
215 aa  169  3e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4427  redox-sensing transcriptional repressor Rex  41.87 
 
 
219 aa  169  4e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00746984  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2068  redox-sensing transcriptional repressor Rex  42.36 
 
 
214 aa  168  6e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.109834 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0779  redox-sensing transcriptional repressor Rex  42.16 
 
 
208 aa  166  2e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2085  redox-sensing transcriptional repressor Rex  45.73 
 
 
217 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000180446  normal  0.93166 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0756  redox-sensing transcriptional repressor Rex  41.26 
 
 
208 aa  165  6.9999999999999995e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2793  redox-sensing transcriptional repressor Rex  44.22 
 
 
214 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2288  redox-sensing transcriptional repressor Rex  37.13 
 
 
212 aa  163  3e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.307621  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1501  CoA-binding domain protein  44.95 
 
 
213 aa  163  3e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0373612 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0423  redox-sensing transcriptional repressor Rex  39.9 
 
 
211 aa  162  4.0000000000000004e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2586  redox-sensing transcriptional repressor Rex  37.13 
 
 
212 aa  162  6e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0129291  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1863  redox-sensing transcriptional repressor Rex  39.71 
 
 
219 aa  161  7e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.488203  normal  0.0196422 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02990  redox-sensing transcriptional repressor Rex  42.5 
 
 
214 aa  161  1e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1219  CoA-binding domain protein  43.72 
 
 
209 aa  160  1e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000061208  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1657  redox-sensing transcriptional repressor Rex  37.81 
 
 
211 aa  158  8e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.043522  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1209  redox-sensing transcriptional repressor Rex  36.59 
 
 
209 aa  157  1e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0403  redox-sensing transcriptional repressor Rex  40.2 
 
 
214 aa  157  2e-37  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.0351476 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0224  redox-sensing transcriptional repressor Rex  40.91 
 
 
215 aa  157  2e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.110787  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1103  redox-sensing transcriptional repressor Rex  41.92 
 
 
213 aa  155  7e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1636  redox-sensing transcriptional repressor Rex  39.2 
 
 
222 aa  153  2e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.339954 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2083  redox-sensing transcriptional repressor Rex  38.89 
 
 
211 aa  152  2.9999999999999998e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000159118  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2120  redox-sensing transcriptional repressor Rex  38.89 
 
 
211 aa  152  2.9999999999999998e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.00014689  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0343  redox-sensing transcriptional repressor Rex  39 
 
 
211 aa  152  4e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.35069  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0352  redox-sensing transcriptional repressor Rex  39.8 
 
 
214 aa  150  2e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0213465  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1468  redox-sensing transcriptional repressor Rex  36.32 
 
 
214 aa  150  2e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02100  redox-sensing transcriptional repressor Rex  37.21 
 
 
217 aa  148  7e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1774  redox-sensing transcriptional repressor Rex  39.2 
 
 
216 aa  147  2.0000000000000003e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3182  redox-sensing transcriptional repressor Rex  43.01 
 
 
216 aa  146  3e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000464351  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0248  redox-sensing transcriptional repressor Rex  39 
 
 
209 aa  146  3e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1012  Rex DNA-binding domain protein  43.38 
 
 
277 aa  146  3e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.555008  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0561  redox-sensing transcriptional repressor Rex  40.93 
 
 
208 aa  144  1e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000211824  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0313  redox-sensing transcriptional repressor Rex  38.5 
 
 
209 aa  144  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000245173  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0285  redox-sensing transcriptional repressor Rex  38.5 
 
 
209 aa  142  3e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.268042  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0249  redox-sensing transcriptional repressor Rex  38.5 
 
 
209 aa  142  3e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000876436  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0235  redox-sensing transcriptional repressor Rex  38.5 
 
 
209 aa  142  3e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000262256  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0237  redox-sensing transcriptional repressor Rex  38.5 
 
 
209 aa  143  3e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00797494  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0263  redox-sensing transcriptional repressor Rex  38.5 
 
 
209 aa  142  3e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00423826  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0630  redox-sensing transcriptional repressor Rex  45.2 
 
 
231 aa  142  3e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.529498  normal  0.840606 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0242  redox-sensing transcriptional repressor Rex  38.5 
 
 
209 aa  142  3e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0131845  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0294  redox-sensing transcriptional repressor Rex  38.5 
 
 
209 aa  142  3e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.141801  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5030  redox-sensing transcriptional repressor Rex  38.5 
 
 
209 aa  142  3e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00139563  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0289  redox-sensing transcriptional repressor Rex  38.5 
 
 
209 aa  142  3e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2882  redox-sensing transcriptional repressor Rex  38.05 
 
 
212 aa  141  9.999999999999999e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.712978  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2902  CoA-binding domain protein  39.36 
 
 
219 aa  141  9.999999999999999e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.586678  normal  0.272447 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1798  redox-sensing transcriptional repressor Rex  34.93 
 
 
217 aa  139  4.999999999999999e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0654  redox-sensing transcriptional repressor Rex  38.16 
 
 
217 aa  139  6e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000627046  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0901  redox-sensing transcriptional repressor Rex  37.62 
 
 
215 aa  138  7e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1398  redox-sensing transcriptional repressor Rex  36.41 
 
 
221 aa  138  7.999999999999999e-32  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.675292  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1156  redox-sensing transcriptional repressor Rex  35.1 
 
 
216 aa  135  4e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1100  redox-sensing transcriptional repressor Rex  36.36 
 
 
210 aa  130  2.0000000000000002e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0422  redox-sensing transcriptional repressor Rex  36.67 
 
 
227 aa  128  7.000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0756  redox-sensing transcriptional repressor Rex  36.27 
 
 
216 aa  125  6e-28  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.264339  hitchhiker  0.0000000000012736 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0496  redox-sensing transcriptional repressor Rex  35.38 
 
 
224 aa  123  3e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0153428  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0374  CoA-binding domain protein  35.1 
 
 
222 aa  123  3e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1428  redox-sensing transcriptional repressor Rex  34.12 
 
 
219 aa  121  9.999999999999999e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0224  redox-sensing transcriptional repressor Rex  32.98 
 
 
227 aa  120  1.9999999999999998e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0024  redox-sensing transcriptional repressor Rex  34.67 
 
 
218 aa  113  2.0000000000000002e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0489  redox-sensing transcriptional repressor Rex  34.01 
 
 
209 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1912  redox-sensing transcriptional repressor Rex  33.87 
 
 
210 aa  109  3e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0633376  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1396  CoA-binding domain protein  30.81 
 
 
220 aa  105  5e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000587659  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1593  redox-sensing transcriptional repressor Rex  33.87 
 
 
215 aa  101  1e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>