193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0234 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_0234  helix-turn-helix domain-containing protein  100 
 
 		 285 aa  572  1.0000000000000001e-162  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6481  putative transcriptional regulator, XRE family  41.61 
 
 		 291 aa  209  4e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.787196  normal  0.247273 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7552  hypothetical protein  41.16 
 
 		 287 aa  207  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4270  helix-turn-helix domain protein  44.71 
 
 		 290 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2072  hypothetical protein  41.4 
 
 		 282 aa  188  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.255323  normal  0.752202 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4696  helix-turn-helix domain protein  38.16 
 
 		 285 aa  186  4e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1328  helix-turn-helix domain-containing protein  39.79 
 
 		 289 aa  185  7e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6648  helix-turn-helix domain-containing protein  42.29 
 
 		 287 aa  179  2.9999999999999997e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.754069  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24740  Helix-turn-helix protein  39.72 
 
 		 283 aa  179  4e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0041  XRE family transcriptional regulator  40.37 
 
 		 293 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0229  XRE family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 301 aa  172  5e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.981725 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0715  transcriptional regulator, XRE family  37.19 
 
 		 287 aa  172  7.999999999999999e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0036  helix-turn-helix domain-containing protein  40.15 
 
 		 289 aa  170  3e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0907  helix-turn-helix domain-containing protein  38.6 
 
 		 291 aa  170  3e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.960814  normal  0.106337 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3446  XRE family transcriptional regulator  40.15 
 
 		 288 aa  168  8e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1293  helix-turn-helix domain-containing protein  37.94 
 
 		 288 aa  168  8e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.663558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0036  helix-turn-helix domain-containing protein  39.63 
 
 		 293 aa  166  5e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.254759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2306  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  38.43 
 
 		 292 aa  166  5.9999999999999996e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0398  putative DNA-binding protein  35.99 
 
 		 296 aa  165  5.9999999999999996e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1229  helix-turn-helix domain-containing protein  39.1 
 
 		 290 aa  166  5.9999999999999996e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.282504 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4247  helix-turn-helix domain-containing protein  38.03 
 
 		 410 aa  164  2.0000000000000002e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.710263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2512  hypothetical protein  39.1 
 
 		 288 aa  161  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.164807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5680  transcriptional regulator, XRE family  39.93 
 
 		 282 aa  160  2e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1780  XRE family transcriptional regulator  38.11 
 
 		 292 aa  159  4e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.154146 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0566  hypothetical protein  37.77 
 
 		 294 aa  159  7e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1172  helix-turn-helix domain-containing protein  39.26 
 
 		 296 aa  157  2e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1746  helix-turn-helix domain-containing protein  40.66 
 
 		 280 aa  157  2e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.600914  normal  0.883752 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7827  putative transcriptional regulator, XRE family  35.87 
 
 		 291 aa  157  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3500  transcriptional regulator, XRE family  36.69 
 
 		 287 aa  156  3e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3623  helix-turn-helix domain-containing protein  38.43 
 
 		 290 aa  156  4e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0875  helix-turn-helix domain protein  37.23 
 
 		 292 aa  156  5.0000000000000005e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1729  helix-turn-helix domain-containing protein  40.36 
 
 		 280 aa  155  6e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.095212  normal  0.0102473 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1502  XRE family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 296 aa  154  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0392  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  34.41 
 
 		 281 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0974  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  33.69 
 
 		 284 aa  151  8.999999999999999e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4123  helix-turn-helix domain-containing protein  36.95 
 
 		 326 aa  151  1e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.54391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1518  helix-turn-helix domain-containing protein  40.71 
 
 		 278 aa  150  2e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.606963  normal  0.022428 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6214  helix-turn-helix domain protein  34.81 
 
 		 303 aa  150  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0199858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2091  hypothetical protein  38.02 
 
 		 295 aa  150  3e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.222911  normal  0.0505226 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3742  helix-turn-helix domain-containing protein  36.95 
 
 		 326 aa  150  3e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.466202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1598  hypothetical protein  36.27 
 
 		 283 aa  150  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2232  hypothetical protein  35.94 
 
 		 295 aa  150  3e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0989029  normal  0.199583 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2479  helix-turn-helix domain-containing protein  36.33 
 
 		 285 aa  148  8e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.292547 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1305  transcriptional regulator, XRE family  37.05 
 
 		 278 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0383802  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2968  XRE family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 278 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000227824 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1963  helix-turn-helix domain protein  37.5 
 
 		 288 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00297567  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2702  XRE family transcriptional regulator  36.88 
 
 		 282 aa  147  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2659  helix-turn-helix domain protein  36.62 
 
 		 300 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000121562  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4152  helix-turn-helix domain protein  34.74 
 
 		 302 aa  146  4.0000000000000006e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2126  transcriptional regulator, XRE family  32.85 
 
 		 284 aa  145  5e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000982759  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0442  helix-turn-helix domain protein  35.44 
 
 		 284 aa  145  6e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0512  helix-turn-helix domain-containing protein  38.93 
 
 		 270 aa  144  2e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.89469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5627  hypothetical protein  35.71 
 
 		 301 aa  144  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.596158 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6121  transcriptional regulator, XRE family  35.84 
 
 		 285 aa  144  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3103  helix-turn-helix domain-containing protein  37.32 
 
 		 284 aa  142  5e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.28133  normal  0.182055 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7488  hypothetical protein  35.25 
 
 		 303 aa  142  5e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.151706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7293  hypothetical protein  36.72 
 
 		 288 aa  142  7e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.805915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1349  hypothetical protein  35.44 
 
 		 293 aa  141  9.999999999999999e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.426132  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1296  transcriptional regulator, XRE family  37.81 
 
 		 286 aa  141  9.999999999999999e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5395  transcriptional regulator, XRE family  35.11 
 
 		 282 aa  140  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.128681  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1300  helix-turn-helix domain-containing protein  35.79 
 
 		 293 aa  140  3e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.61958  normal  0.109038 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0089  hypothetical protein  41.37 
 
 		 276 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3762  helix-turn-helix domain protein  35.59 
 
 		 284 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1970  helix-turn-helix domain protein  37.59 
 
 		 299 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00381006  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2449  helix-turn-helix domain-containing protein  35.09 
 
 		 293 aa  139  4.999999999999999e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.17027  normal  0.257338 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5737  helix-turn-helix domain-containing protein  34.55 
 
 		 276 aa  138  7.999999999999999e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.598241 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37910  hypothetical protein  33.33 
 
 		 308 aa  138  1e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.281107 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4058  hypothetical protein  34.46 
 
 		 287 aa  137  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.174475 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0373  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 287 aa  137  2e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1160  helix-turn-helix domain-containing protein  34.07 
 
 		 281 aa  137  2e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.190961  unclonable  0.0000000484081 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2207  transcriptional regulator, XRE family  31.25 
 
 		 328 aa  136  4e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.693665  normal  0.596706 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4681  transcriptional regulator, XRE family  34.93 
 
 		 278 aa  135  9.999999999999999e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.52911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1277  helix-turn-helix domain protein  36.78 
 
 		 301 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.525262  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2602  helix-turn-helix domain-containing protein  33.1 
 
 		 295 aa  135  9.999999999999999e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0577635  normal  0.0482464 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4987  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 285 aa  134  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.815997  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0579  transcriptional regulator, XRE family  40.91 
 
 		 290 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0574085  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5762  helix-turn-helix domain-containing protein  32.18 
 
 		 291 aa  131  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0216  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  37.5 
 
 		 278 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1270  helix-turn-helix domain-containing protein  34.44 
 
 		 281 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4415  helix-turn-helix domain-containing protein  32.51 
 
 		 283 aa  129  5.0000000000000004e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.241665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4578  transcriptional regulator, XRE family  34.71 
 
 		 290 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1351  putative DNA-binding protein  32.39 
 
 		 299 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.298494  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3365  helix-turn-helix domain-containing protein  36.64 
 
 		 286 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00818505 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0090  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  37.37 
 
 		 283 aa  125  1e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1803  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  35.34 
 
 		 279 aa  124  2e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0632  helix-turn-helix domain-containing protein  33.57 
 
 		 285 aa  124  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1944  transcriptional regulator, XRE family  32.27 
 
 		 279 aa  123  3e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6313  hypothetical protein  35.94 
 
 		 294 aa  122  6e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.637076  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1547  helix-turn-helix domain-containing protein  35.14 
 
 		 286 aa  122  8e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0178303  normal  0.0304655 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1005  transcriptional regulator, XRE family  35.12 
 
 		 309 aa  121  9.999999999999999e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1587  helix-turn-helix domain-containing protein  35.14 
 
 		 286 aa  120  3e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.678881  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0520  helix-turn-helix domain protein  30.14 
 
 		 285 aa  119  3.9999999999999996e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5053  helix-turn-helix domain protein  32.63 
 
 		 310 aa  119  4.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.983736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0644  helix-turn-helix domain-containing protein  30.66 
 
 		 297 aa  119  7e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1835  helix-turn-helix domain protein  31.32 
 
 		 284 aa  119  7.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.660299  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2091  hypothetical protein  34.13 
 
 		 273 aa  117  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.167193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8469  transcriptional regulator, XRE family  37.14 
 
 		 319 aa  117  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.487946 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20620  Helix-turn-helix protein  35.84 
 
 		 281 aa  117  3e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0588198  normal  0.440077 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4245  transcriptional regulator, XRE family  29.45 
 
 		 288 aa  115  6e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.116487 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2430  transcriptional regulator, XRE family  30.58 
 
 		 276 aa  115  6.9999999999999995e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>