220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0132 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_0132  hypothetical protein  100 
 
 
545 aa  1075    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.326041 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3872  hypothetical protein  45.58 
 
 
493 aa  315  9.999999999999999e-85  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0053  protein of unknown function DUF195  40.12 
 
 
531 aa  313  3.9999999999999997e-84  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.783995  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1860  hypothetical protein  44.92 
 
 
448 aa  307  4.0000000000000004e-82  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0130  protein of unknown function DUF195  44.34 
 
 
474 aa  305  1.0000000000000001e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1093  protein of unknown function DUF195  45.88 
 
 
501 aa  305  2.0000000000000002e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.193289  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0527  hypothetical protein  44.16 
 
 
428 aa  302  1e-80  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.946618  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3063  hypothetical protein  46.54 
 
 
443 aa  300  5e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8270  protein of unknown function DUF195  47.35 
 
 
366 aa  297  3e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8478  hypothetical protein  45.96 
 
 
434 aa  296  4e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1528  hypothetical protein  42.2 
 
 
417 aa  296  4e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5536  hypothetical protein  44.57 
 
 
378 aa  296  9e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.183542 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0882  hypothetical protein  47.83 
 
 
386 aa  294  3e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1920  hypothetical protein  40.57 
 
 
525 aa  293  4e-78  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0785962  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3259  DNA recombination protein RmuC, putative  38 
 
 
486 aa  289  9e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2859  protein of unknown function DUF195  38.36 
 
 
512 aa  289  1e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1509  protein of unknown function DUF195  43.99 
 
 
442 aa  284  3.0000000000000004e-75  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.613289  normal  0.015225 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1078  hypothetical protein  46.98 
 
 
374 aa  280  4e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0571  hypothetical protein  37.31 
 
 
503 aa  280  4e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1010  protein of unknown function DUF195  46.73 
 
 
387 aa  278  1e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26410  hypothetical protein  41.81 
 
 
434 aa  279  1e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0823467  normal  0.277767 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0827  hypothetical protein  47.09 
 
 
403 aa  275  2.0000000000000002e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.208315  normal  0.172585 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0971  protein of unknown function DUF195  40.48 
 
 
479 aa  273  6e-72  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.766165  hitchhiker  0.000421648 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3697  protein of unknown function DUF195  44.66 
 
 
364 aa  269  1e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.111371  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1103  protein of unknown function DUF195  39.61 
 
 
523 aa  266  5e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.813753 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3209  hypothetical protein  35.68 
 
 
456 aa  265  2e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000788974  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4385  protein of unknown function DUF195  46.94 
 
 
398 aa  263  6e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1406  hypothetical protein  38.68 
 
 
459 aa  262  1e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0324522 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1288  hypothetical protein  36.44 
 
 
554 aa  261  2e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.624866  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0251  hypothetical protein  37.01 
 
 
443 aa  253  4.0000000000000004e-66  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3111  protein of unknown function DUF195  47.45 
 
 
361 aa  253  5.000000000000001e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.294839  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22950  hypothetical protein  43.75 
 
 
399 aa  250  4e-65  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0942  protein of unknown function DUF195  34.92 
 
 
494 aa  247  4e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0178  protein of unknown function DUF195  35.31 
 
 
417 aa  245  1.9999999999999999e-63  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.309141 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2404  hypothetical protein  33.94 
 
 
462 aa  235  2.0000000000000002e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20260  hypothetical protein  40 
 
 
390 aa  233  5e-60  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.140887  normal  0.2743 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5568  protein of unknown function DUF195  31.83 
 
 
473 aa  230  6e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110134  normal  0.0896714 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1210  hypothetical protein  40.29 
 
 
467 aa  229  1e-58  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0097  RmuC domain protein  40.45 
 
 
446 aa  227  5.0000000000000005e-58  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.186787 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3397  protein of unknown function DUF195  39.93 
 
 
391 aa  223  6e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.648521  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0396  hypothetical protein  36.15 
 
 
402 aa  222  9.999999999999999e-57  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000213037 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2055  hypothetical protein  38.33 
 
 
451 aa  223  9.999999999999999e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.655381  normal  0.223767 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2547  protein of unknown function DUF195  39.02 
 
 
428 aa  216  9.999999999999999e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000236422 
 
 
-
 
NC_002620  TC0212  hypothetical protein  32.41 
 
 
425 aa  214  2.9999999999999995e-54  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.828645  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2898  hypothetical protein  30.99 
 
 
504 aa  214  4.9999999999999996e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0232  hypothetical protein  38.21 
 
 
445 aa  212  1e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.169599  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12181  hypothetical protein  27.53 
 
 
531 aa  212  2e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.282455  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0691  hypothetical protein  27.55 
 
 
532 aa  208  2e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4571  hypothetical protein  37.58 
 
 
431 aa  207  5e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.775043 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2832  hypothetical protein  39.05 
 
 
403 aa  201  3e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16280  hypothetical protein  37.5 
 
 
419 aa  199  1.0000000000000001e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1614  DNA recombination protein rmuC  25.6 
 
 
535 aa  181  2.9999999999999997e-44  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1087  hypothetical protein  27.99 
 
 
630 aa  174  2.9999999999999996e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2033  RmuC domain-containing protein  29.11 
 
 
530 aa  171  3e-41  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0033  RmuC domain-containing protein  29.47 
 
 
432 aa  169  1e-40  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1980  hypothetical protein  26.6 
 
 
515 aa  162  1e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.981976 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2954  hypothetical protein  30.26 
 
 
500 aa  162  1e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.652449  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2620  hypothetical protein  29.85 
 
 
498 aa  159  9e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.27226  normal  0.225065 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0751  RmuC domain-containing protein  26.71 
 
 
510 aa  159  2e-37  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1659  hypothetical protein  29.22 
 
 
492 aa  158  3e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000440717  decreased coverage  0.00162326 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2528  hypothetical protein  27.51 
 
 
498 aa  157  4e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1291  hypothetical protein  33.84 
 
 
495 aa  156  1e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000719972  normal  0.7676 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2346  hypothetical protein  27.25 
 
 
522 aa  155  2e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1249  hypothetical protein  33.84 
 
 
495 aa  154  4e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0088018  normal  0.121564 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4026  hypothetical protein  32.39 
 
 
495 aa  154  4e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000512387  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1694  hypothetical protein  32.39 
 
 
495 aa  154  5e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.141195  normal  0.657549 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0237  hypothetical protein  25.27 
 
 
626 aa  153  7e-36  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0705649  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2040  hypothetical protein  27.41 
 
 
548 aa  153  7e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.706062  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0145  protein of unknown function DUF195  31.34 
 
 
420 aa  152  1e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000549267  normal  0.154744 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51000  hypothetical protein  31.32 
 
 
453 aa  152  2e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000148678  hitchhiker  0.000000161097 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0614  hypothetical protein  29.61 
 
 
640 aa  152  2e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0286081 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0133  hypothetical protein  31.34 
 
 
424 aa  151  2e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000273434  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3666  hypothetical protein  29.32 
 
 
492 aa  151  3e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000475221  normal  0.0538787 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1724  hypothetical protein  29.23 
 
 
492 aa  150  5e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0000410334  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2104  hypothetical protein  29.17 
 
 
518 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.607769  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2995  DNA recombination protein RumC  28.14 
 
 
506 aa  149  1.0000000000000001e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0441  hypothetical protein  29.74 
 
 
527 aa  149  2.0000000000000003e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.870826  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2284  protein of unknown function DUF195  27.94 
 
 
519 aa  148  3e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0239912  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2101  hypothetical protein  27.94 
 
 
519 aa  148  3e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.399402  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2054  hypothetical protein  27.94 
 
 
518 aa  147  3e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0154477  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4558  hypothetical protein  27.7 
 
 
519 aa  147  7.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2272  hypothetical protein  27.7 
 
 
519 aa  147  7.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.86353  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2235  hypothetical protein  28.12 
 
 
521 aa  146  8.000000000000001e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0248668  normal  0.25441 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0140  hypothetical protein  25.96 
 
 
407 aa  146  1e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2110  hypothetical protein  28.12 
 
 
521 aa  146  1e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.664501  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1864  hypothetical protein  28.12 
 
 
521 aa  146  1e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.940274  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2422  hypothetical protein  26.88 
 
 
639 aa  145  2e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1894  hypothetical protein  26.4 
 
 
520 aa  144  4e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2041  hypothetical protein  26.8 
 
 
537 aa  143  7e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2414  hypothetical protein  27.65 
 
 
507 aa  143  9.999999999999999e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0018  RmuC domain-containing protein  25.06 
 
 
494 aa  142  9.999999999999999e-33  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2124  hypothetical protein  29.86 
 
 
491 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4070  hypothetical protein  30.3 
 
 
504 aa  142  1.9999999999999998e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.73657 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1993  protein of unknown function DUF195  32.23 
 
 
479 aa  142  1.9999999999999998e-32  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4177  DNA recombination protein RmuC  28.26 
 
 
476 aa  140  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.608265  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4356  DNA recombination protein RmuC  28.26 
 
 
476 aa  140  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.881162  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4249  DNA recombination protein RmuC  28.19 
 
 
476 aa  140  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4296  DNA recombination protein RmuC  28.26 
 
 
476 aa  140  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4200  DNA recombination protein RmuC  28.26 
 
 
476 aa  140  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0646  hypothetical protein  24.51 
 
 
480 aa  140  4.999999999999999e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.932654  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>