75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0125 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_0125  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 
412 aa  796  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.49068  normal  0.97143 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0512  transcriptional regulator, XRE family  52.74 
 
 
401 aa  345  8e-94  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2638  hypothetical protein  35.86 
 
 
526 aa  170  5e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.316802  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1653  XRE family transcriptional regulator  44.05 
 
 
397 aa  169  7e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0453749  normal  0.0870716 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1710  transcriptional regulator, XRE family  30.75 
 
 
420 aa  124  4e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.371639  normal  0.199479 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6440  hypothetical protein  33.2 
 
 
311 aa  111  2e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.401535 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1195  putative transcriptional regulator  29.05 
 
 
441 aa  104  3e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0264  hypothetical protein  29.6 
 
 
411 aa  103  5e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0751  helix-turn-helix domain protein  31.71 
 
 
414 aa  99.8  9e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0466  tetratricopeptide TPR_2  27.97 
 
 
449 aa  97.8  3e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.924549  normal  0.198291 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0013  hypothetical protein  26.29 
 
 
418 aa  97.1  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7489  hypothetical protein  27.75 
 
 
400 aa  95.5  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0882714  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6151  putative transcriptional regulator  28.7 
 
 
449 aa  95.1  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0764047  normal  0.610732 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6883  putative transcriptional regulator  25.63 
 
 
429 aa  87.8  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0592787  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4805  hypothetical protein  28.81 
 
 
478 aa  88.2  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0850035  normal  0.646806 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3968  hypothetical protein  26.76 
 
 
457 aa  85.1  2e-15  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0256959  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8297  hypothetical protein  27.31 
 
 
452 aa  85.5  2e-15  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.512635  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07960  Helix-turn-helix protein  28.72 
 
 
444 aa  82.8  9e-15  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7319  putative DNA-binding protein  28.57 
 
 
432 aa  82.4  1e-14  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000491826  decreased coverage  3.76274e-09 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5210  transcriptional regulator, XRE family  27.98 
 
 
530 aa  82  2e-14  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.035838  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1224  regulator  26.64 
 
 
453 aa  82  2e-14  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.483288  normal  0.967223 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2889  putative DNA-binding protein  27.84 
 
 
477 aa  81.3  3e-14  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0241549  normal  0.497135 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8777  transcriptional regulator  28.33 
 
 
469 aa  80.5  5e-14  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.756748 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4484  hypothetical protein  26.29 
 
 
447 aa  78.6  2e-13  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2005  transcriptional regulator, XRE family  25.68 
 
 
388 aa  70.5  5e-11  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.445906  normal  0.114252 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0037  transcriptional regulator, XRE family  21.96 
 
 
460 aa  70.5  5e-11  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3334  hypothetical protein  28.29 
 
 
524 aa  70.5  5e-11  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.176126  hitchhiker  0.000765121 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1959  XRE family transcriptional regulator  26.55 
 
 
461 aa  69.7  8e-11  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.24175 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2422  hypothetical protein  28.36 
 
 
510 aa  68.2  2e-10  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0414042  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1073  hypothetical protein  28.91 
 
 
579 aa  68.6  2e-10  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.542041  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3660  putative transcriptional regulator  27.72 
 
 
463 aa  68.9  2e-10  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2899  hypothetical protein  30.79 
 
 
467 aa  67.4  5e-10  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.285709  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00560  Helix-turn-helix protein  24.57 
 
 
456 aa  66.6  8e-10  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.95745 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1244  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  27.27 
 
 
515 aa  64.3  3e-09  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2498  XRE family transcriptional regulator  29.56 
 
 
474 aa  62.8  1e-08  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.153795 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1662  hypothetical protein  30.1 
 
 
403 aa  62.8  1e-08  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.387756  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3992  putative regulatory protein  35.04 
 
 
249 aa  61.6  2e-08  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3448  hypothetical protein  26.18 
 
 
413 aa  62  2e-08  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8001  hypothetical protein  26.64 
 
 
487 aa  62  2e-08  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5136  XRE family transcriptional regulator  28.87 
 
 
488 aa  60.1  8e-08  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.033803 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4607  hypothetical protein  29.86 
 
 
369 aa  59.7  9e-08  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1270  hypothetical protein  31.65 
 
 
497 aa  59.7  1e-07  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.404033  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4608  hypothetical protein  26.51 
 
 
363 aa  59.3  1e-07  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1067  hypothetical protein  25.33 
 
 
473 aa  58.9  2e-07  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.119168  hitchhiker  0.00309173 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4090  twin-arginine translocation pathway signal  25.16 
 
 
503 aa  58.5  2e-07  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3080  hypothetical protein  28.27 
 
 
398 aa  58.5  2e-07  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000201414 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0895  putative DNA-binding protein  28.62 
 
 
503 aa  58.2  2e-07  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2377  hypothetical protein  27.61 
 
 
437 aa  58.2  2e-07  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.169867 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1107  hypothetical protein  28.03 
 
 
468 aa  57.8  3e-07  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.551011  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1672  transcriptional regulator, XRE family  41.56 
 
 
442 aa  58.2  3e-07  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000955969  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2729  transcriptional regulator, XRE family  28.86 
 
 
431 aa  55.1  2e-06  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  8.09201e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0952  hypothetical protein  43.02 
 
 
444 aa  53.5  7e-06  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1379  XRE family transcriptional regulator  28.42 
 
 
507 aa  52.8  1e-05  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.464445  normal  0.0167147 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3948  hypothetical protein  36.11 
 
 
419 aa  52.8  1e-05  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4641  helix-turn-helix protein  31.58 
 
 
331 aa  52.4  2e-05  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.640764 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1813  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  28.93 
 
 
444 aa  50.8  4e-05  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4655  hypothetical protein  35.79 
 
 
455 aa  50.4  5e-05  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2802  hypothetical protein  23.59 
 
 
537 aa  50.8  5e-05  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4654  helix-turn-helix domain protein  35.48 
 
 
431 aa  50.1  8e-05  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0340  tetratricopeptide domain-containing protein  30.37 
 
 
418 aa  49.7  9e-05  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.469664  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1827  hypothetical protein  24.12 
 
 
484 aa  49.7  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0309  hypothetical protein  26.58 
 
 
315 aa  48.9  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2626  hypothetical protein  23.13 
 
 
519 aa  48.9  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2538  putative DNA-binding protein  24.67 
 
 
434 aa  48.5  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01940  hypothetical protein  27.67 
 
 
360 aa  48.5  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.705916 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4891  hypothetical protein  38.82 
 
 
444 aa  48.5  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0702  hypothetical protein  30.41 
 
 
405 aa  47.4  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.554394 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2840  hypothetical protein  25.09 
 
 
503 aa  45.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.43612  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1829  hypothetical protein  22.64 
 
 
519 aa  44.7  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.790785  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1064  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  35.29 
 
 
1226 aa  44.3  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2698  hypothetical protein  28.76 
 
 
514 aa  44.3  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.570232 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3490  LuxR family transcriptional regulator  39.13 
 
 
950 aa  44.3  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.123756  normal  0.368778 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0731  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  26.81 
 
 
418 aa  44.3  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00340964  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0051  hypothetical protein  26.34 
 
 
565 aa  43.9  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6698  transcriptional regulator, XRE family  27.27 
 
 
412 aa  43.1  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.142695 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>