116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0099 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_0099  NUDIX hydrolase  100 
 
 
291 aa  575  1e-163  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.474769  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0188  hypothetical protein  67.47 
 
 
287 aa  365  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.626289  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3604  NUDIX hydrolase  51.92 
 
 
292 aa  260  2e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.763493  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24850  ADP-ribose pyrophosphatase  46.39 
 
 
305 aa  188  1e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.203973  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1136  NUDIX hydrolase  44.31 
 
 
335 aa  177  3e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.472078  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0097  hypothetical protein  35.89 
 
 
299 aa  153  3e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10418  mutator protein mutT3  50 
 
 
217 aa  140  3e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0449167  normal  0.708231 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0543  NUDIX hydrolase  47.24 
 
 
174 aa  131  1e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.643343  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0533  NUDIX hydrolase  47.24 
 
 
174 aa  131  1e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0555  NUDIX hydrolase  47.24 
 
 
174 aa  131  1e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.51062  normal  0.852901 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4360  NUDIX hydrolase  48.34 
 
 
153 aa  130  2e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.11563  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25510  ADP-ribose pyrophosphatase  47.68 
 
 
165 aa  130  4e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0162353  normal  0.120334 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0199  NUDIX hydrolase  51.59 
 
 
180 aa  129  8e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0706  NUDIX hydrolase  49.37 
 
 
179 aa  124  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0747129 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1010  NUDIX hydrolase  45.68 
 
 
181 aa  123  4e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4393  NUDIX hydrolase  45.51 
 
 
160 aa  121  2e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1033  NUDIX hydrolase  43.05 
 
 
161 aa  118  1e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.997989 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2308  NUDIX hydrolase  45.83 
 
 
167 aa  115  1e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.000433057  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3752  NUDIX hydrolase  45.95 
 
 
156 aa  113  4e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5298  NUDIX hydrolase  39.87 
 
 
170 aa  112  6e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0837  NUDIX hydrolase  43.42 
 
 
176 aa  112  7e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.172365  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2056  NUDIX hydrolase  45.27 
 
 
165 aa  111  1e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.28394e-10 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1229  septum formation protein Maf  37.34 
 
 
475 aa  107  2e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.55715e-08 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1609  Nucleotide-binding protein  40.13 
 
 
484 aa  106  4e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2026  NUDIX hydrolase  44.44 
 
 
152 aa  92.8  6e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0458229  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3731  hypothetical protein  47.73 
 
 
132 aa  82.4  8e-15  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.612226  normal  0.022429 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3265  hypothetical protein  41.18 
 
 
122 aa  76.6  4e-13  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0757172  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6968  hypothetical protein  43.85 
 
 
122 aa  73.9  3e-12  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.151467  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2307  hypothetical protein  44.93 
 
 
134 aa  72  1e-11  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00447064 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2787  hypothetical protein  41.54 
 
 
129 aa  71.6  1e-11  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.502157  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3635  hypothetical protein  41.61 
 
 
130 aa  69.7  6e-11  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1244  hypothetical protein  36.52 
 
 
197 aa  67.8  2e-10  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.214862  decreased coverage  0.000603891 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2155  hypothetical protein  38.97 
 
 
163 aa  66.6  4e-10  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.995978  normal  0.94891 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3499  hypothetical protein  37.2 
 
 
183 aa  64.7  2e-09  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.555316 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1414  hypothetical protein  42.14 
 
 
137 aa  62.4  8e-09  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.234715  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3121  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  33.63 
 
 
156 aa  56.6  4e-07  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.508496 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1420  Mutator protein MutT  27.34 
 
 
134 aa  55.1  2e-06  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1564  Mutator protein MutT  28.97 
 
 
134 aa  54.7  2e-06  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0833  hypothetical protein  41.79 
 
 
135 aa  52.4  8e-06  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.567086  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1556  NUDIX hydrolase  37.14 
 
 
206 aa  52  1e-05  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1523  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
158 aa  50.4  3e-05  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3170  NUDIX hydrolase  34.23 
 
 
155 aa  50.4  3e-05  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3232  NUDIX hydrolase  34.23 
 
 
155 aa  50.4  3e-05  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.402794  normal  0.822465 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3182  NUDIX hydrolase  34.23 
 
 
155 aa  50.4  3e-05  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5996  NUDIX hydrolase  34.23 
 
 
155 aa  50.1  4e-05  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  2.45318e-06 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5595  NUDIX hydrolase  34.23 
 
 
155 aa  50.1  4e-05  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2973  putative mutT-like protein  32.67 
 
 
158 aa  49.7  5e-05  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1901  NUDIX hydrolase  46.88 
 
 
231 aa  49.7  5e-05  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.576777  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3031  NUDIX hydrolase  32.43 
 
 
155 aa  49.7  6e-05  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2447  NUDIX hydrolase  30.3 
 
 
129 aa  49.3  7e-05  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  6.52481e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5262  NUDIX hydrolase  35.16 
 
 
240 aa  49.3  7e-05  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5641  NUDIX hydrolase  35.16 
 
 
239 aa  49.3  8e-05  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5351  NUDIX hydrolase  35.16 
 
 
239 aa  49.3  8e-05  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0131  NUDIX hydrolase  31.53 
 
 
156 aa  48.5  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5787  NUDIX hydrolase  35.16 
 
 
238 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4299  NUDIX hydrolase  36.7 
 
 
165 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.687324  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3789  mutator MutT protein  27.87 
 
 
131 aa  48.9  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4253  NUDIX hydrolase  31.19 
 
 
160 aa  47.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103812  normal  0.749922 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2084  hypothetical protein  28.7 
 
 
319 aa  47.4  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.498942 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1043  NUDIX hydrolase  34.07 
 
 
238 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12007  hypothetical protein  32.52 
 
 
135 aa  47  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  9.40488e-13  normal  0.526902 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2002  hypothetical protein  33.83 
 
 
124 aa  46.2  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.549907 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8967  NUDIX hydrolase  30.63 
 
 
155 aa  45.8  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.035368  normal  0.614637 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3444  mutator MutT protein  28.46 
 
 
129 aa  45.8  0.0007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.013842 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0863  NUDIX hydrolase  28.12 
 
 
153 aa  46.2  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.522755 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0157  hydrolase, NUDIX family  34.04 
 
 
149 aa  45.4  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4064  NUDIX hydrolase  38.71 
 
 
206 aa  45.4  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.305578  normal  0.120697 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0922  NUDIX hydrolase  34.68 
 
 
136 aa  45.4  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4857  NUDIX hydrolase  32.98 
 
 
158 aa  45.4  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1950  NUDIX hydrolase  35.58 
 
 
255 aa  45.4  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.666959  hitchhiker  0.00341622 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4668  NUDIX hydrolase  35 
 
 
161 aa  45.4  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.271048 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0715  NUDIX hydrolase  30.53 
 
 
299 aa  45.1  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4313  NUDIX hydrolase  44.44 
 
 
153 aa  45.4  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1476  NUDIX hydrolase  34.51 
 
 
155 aa  45.1  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5012  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 
208 aa  45.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.615251  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0833  NUDIX hydrolase  39.66 
 
 
155 aa  45.4  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0297624  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4817  NUDIX hydrolase  35.78 
 
 
159 aa  45.4  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.688995  normal  0.147337 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5852  NUDIX hydrolase  35.05 
 
 
122 aa  44.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0529  NUDIX hydrolase  37.65 
 
 
150 aa  44.3  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.803448  normal  0.536642 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2890  NUDIX hydrolase  42.65 
 
 
199 aa  44.7  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1716  NUDIX hydrolase  42.31 
 
 
223 aa  44.3  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.37682 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8400  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  31.9 
 
 
139 aa  44.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.24066 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5598  NUDIX hydrolase  32.03 
 
 
165 aa  43.9  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0176  NUDIX hydrolase  36.11 
 
 
196 aa  43.9  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2940  mutT-like protein  32.94 
 
 
155 aa  43.9  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.703961  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0419  mutator MutT protein  40.32 
 
 
129 aa  43.9  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293063 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4221  NUDIX hydrolase  26.87 
 
 
315 aa  43.5  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.292609  normal  0.0178702 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0775  NUDIX hydrolase  35.62 
 
 
177 aa  43.5  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3145  ADP-ribose pyrophosphatase  29.41 
 
 
251 aa  43.5  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.087939  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2094  mutT/nudix family protein  27.72 
 
 
153 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  2.67721e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4650  NUDIX hydrolase  30.43 
 
 
163 aa  43.5  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3984  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
167 aa  43.9  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.99462  decreased coverage  0.00100111 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03600  probable 8-oxo-dGTPase, MutT-like protein, NUDIX hydrolase family protein  37.5 
 
 
137 aa  43.1  0.005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0165  NUDIX hydrolase  37.14 
 
 
196 aa  43.1  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8672  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  30.19 
 
 
158 aa  43.5  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3429  mutator MutT protein  32.32 
 
 
134 aa  43.1  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31180  ADP-ribose pyrophosphatase  31.93 
 
 
133 aa  43.1  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.3856  normal  0.753153 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3062  A/G-specific adenine glycosylase  28.41 
 
 
352 aa  43.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.839676  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3464  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 
188 aa  43.1  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.918471  hitchhiker  0.00303424 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0997  NUDIX hydrolase  46.43 
 
 
153 aa  42.7  0.006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.665088  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>