217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0098 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_0098  hypothetical protein  100 
 
 
277 aa  560  1e-159  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.080433  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3111  hypothetical protein  51.7 
 
 
295 aa  281  1e-74  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4707  hypothetical protein  49.03 
 
 
282 aa  265  5e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.161538  normal  0.483905 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3083  hypothetical protein  53.46 
 
 
266 aa  261  7e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00986459 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2585  protein Pfam: Lactamase_B  50 
 
 
268 aa  259  2e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4915  putative Zn-dependent hydrolase of beta- lactamase fold family  50.19 
 
 
272 aa  252  6e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.260692  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5715  hypothetical protein  40.07 
 
 
307 aa  248  5e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10421  conserved hypothetical protein  42 
 
 
338 aa  221  8e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.876476 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03400  hypothetical protein  40.42 
 
 
366 aa  203  2e-51  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03523  conserved hypothetical protein  39 
 
 
340 aa  197  1e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.077158  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1482  hypothetical protein  43.28 
 
 
201 aa  174  1e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0910  hypothetical protein  34.33 
 
 
261 aa  110  2e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3659  hypothetical protein  32.59 
 
 
265 aa  102  5e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4668  hypothetical protein  31.69 
 
 
266 aa  102  7e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0065  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  33.6 
 
 
264 aa  100  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1256  hypothetical protein  30.6 
 
 
258 aa  90.5  3e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5751  hypothetical protein  27.91 
 
 
258 aa  85.9  7e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.56742 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2243  beta-lactamase fold-like Zn-dependent hydrolase  30.04 
 
 
262 aa  85.5  8e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.241494  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1631  beta-lactamase fold-like Zn-dependent hydrolase  29.85 
 
 
262 aa  84  2e-15  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.995531  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2782  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  32.33 
 
 
256 aa  83.2  4e-15  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.674441  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1704  beta-lactamase fold-like Zn-dependent hydrolase  28.74 
 
 
262 aa  81.3  1e-14  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.332773  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0743  hypothetical protein  29.15 
 
 
257 aa  79.7  5e-14  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.848227  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9016  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  26.05 
 
 
259 aa  76.3  5e-13  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.53633  normal  0.212694 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2809  hypothetical protein  31.86 
 
 
335 aa  76.3  5e-13  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2447  hypothetical protein  30.74 
 
 
261 aa  73.2  4e-12  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0935429  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05497  hypothetical protein  31.63 
 
 
362 aa  73.2  5e-12  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.428676 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2358  hypothetical protein  26.7 
 
 
324 aa  72.8  6e-12  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  9.48775e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2823  beta-lactamase domain-containing protein  26.86 
 
 
332 aa  72  9e-12  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00166686  hitchhiker  0.00150789 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3864  outer membrane protein RomA  27.97 
 
 
369 aa  71.6  1e-11  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1801  beta-lactamase  31.16 
 
 
244 aa  70.5  3e-11  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.204896  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2247  hypothetical protein  26.8 
 
 
324 aa  69.3  6e-11  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0231046  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2092  hypothetical protein  26.8 
 
 
324 aa  69.3  6e-11  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0491509  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2032  hypothetical protein  26.8 
 
 
324 aa  69.3  6e-11  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  5.09701e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2273  hypothetical protein  26.8 
 
 
324 aa  68.9  7e-11  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.79645e-45 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2030  hypothetical protein  26.8 
 
 
423 aa  68.6  1e-10  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.746583  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1615  hypothetical protein  27.52 
 
 
388 aa  67.8  2e-10  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0725  beta-lactamase domain-containing protein  26.11 
 
 
255 aa  67.4  3e-10  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.340687  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4259  zinc-dependent hydrolase  28.02 
 
 
363 aa  66.6  4e-10  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  2.54189e-08  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2916  hypothetical protein  25.43 
 
 
336 aa  66.6  5e-10  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2277  hypothetical protein  25.77 
 
 
324 aa  65.5  9e-10  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00343587  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0016  hypothetical protein  28.79 
 
 
356 aa  65.1  1e-09  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.439945  hitchhiker  0.00397116 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1122  Beta-lactamase-like  35.43 
 
 
325 aa  65.5  1e-09  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6668  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  32.12 
 
 
374 aa  64.7  1e-09  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.253593  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12530  hypothetical protein  26.33 
 
 
361 aa  65.1  1e-09  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1544  hypothetical protein  30.13 
 
 
266 aa  65.1  1e-09  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.678836  normal  0.133061 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3291  beta-lactamase domain-containing protein  25.37 
 
 
292 aa  64.7  1e-09  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.841788 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1532  beta-lactamase fold-like Zn-dependent hydrolase  30.38 
 
 
254 aa  65.1  1e-09  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.828451 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6189  Zn-dependent hydrolases of the beta-lactamase fold-like protein  31.61 
 
 
374 aa  64.3  2e-09  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.613218  normal  0.612228 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1044  hypothetical protein  25 
 
 
296 aa  63.9  2e-09  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.228114  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5824  Zn-dependent hydrolases of the beta-lactamase fold-like  31.61 
 
 
374 aa  64.3  2e-09  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2347  putative outer membrane protein  27.34 
 
 
357 aa  64.3  2e-09  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0404317  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3741  hypothetical protein  28.95 
 
 
363 aa  62.8  5e-09  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0499981  normal  0.188301 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3459  hypothetical protein  25.25 
 
 
252 aa  63.2  5e-09  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0233834 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0626  beta-lactamase domain protein  29.79 
 
 
353 aa  62.8  6e-09  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2649  hypothetical protein  26.52 
 
 
376 aa  62.4  7e-09  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3326  putative lipoprotein  20.97 
 
 
335 aa  62.4  8e-09  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0341  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  27.44 
 
 
291 aa  62.4  8e-09  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6159  Zn-dependent hydrolases of the beta-lactamase fold-like protein  29.21 
 
 
374 aa  62  1e-08  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.749982  normal  0.0786159 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1139  hypothetical protein  25.86 
 
 
362 aa  61.2  2e-08  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7735  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like  30.57 
 
 
374 aa  60.8  2e-08  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1520  hypothetical protein  30.4 
 
 
308 aa  61.2  2e-08  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2071  hypothetical protein  23.68 
 
 
324 aa  61.2  2e-08  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0338371  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8446  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  26.41 
 
 
335 aa  60.8  2e-08  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1886  hypothetical protein  30.89 
 
 
380 aa  61.2  2e-08  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.31105  normal  0.111326 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1708  hypothetical protein  27.16 
 
 
358 aa  61.2  2e-08  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2834  beta-lactamase domain-containing protein  26.78 
 
 
329 aa  60.5  3e-08  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3601  beta-lactamase domain-containing protein  26.2 
 
 
353 aa  60.1  3e-08  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.572189  normal  0.0110578 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1685  hypothetical protein  27.37 
 
 
303 aa  60.1  3e-08  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.000226604  hitchhiker  5.86595e-06 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4235  beta-lactamase-like protein  24.44 
 
 
257 aa  60.5  3e-08  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0793  outer membrane protein RomA  25.09 
 
 
358 aa  60.5  3e-08  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04440  metallo hydrolase  28.69 
 
 
358 aa  60.8  3e-08  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0190916  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1451  hypothetical protein  26.78 
 
 
342 aa  60.1  4e-08  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0112394  normal  0.158925 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2754  metallo-beta-lactamase family protein  26.78 
 
 
342 aa  60.1  4e-08  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000143801  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1221  hypothetical protein  30.89 
 
 
376 aa  59.7  4e-08  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0516  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  26.94 
 
 
590 aa  59.7  5e-08  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1649  beta-lactamase domain-containing protein  24.87 
 
 
324 aa  59.3  7e-08  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000196619  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3548  hypothetical protein  25.55 
 
 
366 aa  58.2  1e-07  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0298  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  28.5 
 
 
362 aa  58.5  1e-07  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0136  metal-dependent hydrolase  28.22 
 
 
237 aa  58.2  2e-07  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.609022  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2597  beta-lactamase-like protein  27.23 
 
 
299 aa  57.4  2e-07  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.900625 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0647  hypothetical protein  27.39 
 
 
353 aa  58.2  2e-07  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.151729 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1076  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  26.09 
 
 
419 aa  58.2  2e-07  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0658  hypothetical protein  27.39 
 
 
353 aa  58.2  2e-07  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.149707 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3185  hypothetical protein  26.37 
 
 
258 aa  57.4  2e-07  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5759  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  30.05 
 
 
374 aa  57.8  2e-07  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.177661  normal  0.774373 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0785  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  26.64 
 
 
368 aa  57.4  3e-07  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0602  hypothetical protein  33.56 
 
 
336 aa  57  3e-07  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.17819  normal  0.329897 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0952  hypothetical protein  27.95 
 
 
332 aa  57  3e-07  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.47256  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6004  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  29.53 
 
 
374 aa  57.4  3e-07  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.829765  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1187  hypothetical protein  33.6 
 
 
795 aa  57  3e-07  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2256  Zn-dependent hydrolase  22.56 
 
 
348 aa  56.6  4e-07  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1659  outer membrane protein  23.74 
 
 
376 aa  57  4e-07  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.276517  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1193  hypothetical protein  33.6 
 
 
795 aa  57  4e-07  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3095  hypothetical protein  25.77 
 
 
324 aa  56.6  5e-07  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  1.59672e-05  hitchhiker  7.43882e-22 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4305  hypothetical protein  26.01 
 
 
357 aa  56.6  5e-07  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3323  hypothetical protein  24.67 
 
 
363 aa  55.8  7e-07  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.992369  normal  0.0935261 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2230  hypothetical protein  25.26 
 
 
324 aa  55.8  7e-07  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00325578  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1038  hypothetical protein  26.91 
 
 
403 aa  55.8  7e-07  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4430  hypothetical protein  25.79 
 
 
372 aa  55.8  7e-07  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3371  hypothetical protein  26.94 
 
 
259 aa  55.8  7e-07  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.515704  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>