More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0091 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_0091  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 
139 aa  272  1e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4875  transcriptional regulator, GntR family  50.36 
 
 
139 aa  136  1e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4653  transcriptional regulator, GntR family  50.39 
 
 
145 aa  112  2e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14010  transcriptional regulator  45.21 
 
 
253 aa  68.2  3e-11  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.646916  normal  0.765571 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1841  putative transcriptional regulator, GntR family  44.74 
 
 
83 aa  65.9  2e-10  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0164679 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4876  transcriptional regulator, GntR family  50.79 
 
 
100 aa  65.1  3e-10  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1312  GntR family transcriptional regulator  40.62 
 
 
243 aa  63.5  8e-10  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.483973 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0717  transcriptional regulator, GntR family  48.44 
 
 
285 aa  63.5  9e-10  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4270  GntR family transcriptional regulator  47.69 
 
 
254 aa  62.4  2e-09  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  2.12772e-06  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0156  putative transcriptional regulator, GntR family  42.47 
 
 
261 aa  62.8  2e-09  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0129  UbiC transcription regulator-associated domain protein  38.46 
 
 
579 aa  62.4  2e-09  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.625714 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7288  putative transcriptional regulator, GntR family  34.15 
 
 
249 aa  62  3e-09  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.767574 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0632  transcriptional regulator, GntR family  46.58 
 
 
261 aa  61.2  4e-09  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3318  transcriptional regulator, GntR family  42.19 
 
 
252 aa  61.2  5e-09  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  6.5866e-05  hitchhiker  0.00380995 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0740  GntR family transcriptional regulator  36.25 
 
 
245 aa  60.8  6e-09  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  2.68297e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9128  putative transcriptional regulator, GntR family  50 
 
 
250 aa  60.8  6e-09  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.783412  normal  0.482238 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2575  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  46.97 
 
 
243 aa  60.5  8e-09  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0505  histidine utilization repressor  45.9 
 
 
301 aa  60.1  9e-09  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0628  GntR family transcriptional regulator  35.85 
 
 
251 aa  59.7  1e-08  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1426  GntR domain-containing protein  36.13 
 
 
253 aa  59.7  1e-08  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3874  GntR family regulatory protein  40.98 
 
 
239 aa  59.3  2e-08  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4179  regulatory protein GntR HTH  52.73 
 
 
243 aa  59.3  2e-08  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4443  GntR domain-containing protein  37.61 
 
 
253 aa  58.9  2e-08  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.552946  hitchhiker  0.00102346 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3916  GntR family regulatory protein  40.98 
 
 
239 aa  59.3  2e-08  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1284  transcriptional regulator, GntR family  39.73 
 
 
255 aa  58.9  2e-08  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1575  GntR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
85 aa  58.2  3e-08  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00299545 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2581  GntR family transcriptional regulator  43.66 
 
 
247 aa  58.2  3e-08  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.544021 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2142  transcriptional regulator, GntR family  37.96 
 
 
260 aa  58.2  3e-08  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4767  GntR domain protein  48.39 
 
 
252 aa  57.8  4e-08  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.821835  normal  0.117848 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5249  regulatory protein GntR HTH  39.47 
 
 
255 aa  57.8  5e-08  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3332  regulatory protein GntR, HTH  39.47 
 
 
255 aa  57.8  5e-08  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.326019  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3808  GntR family regulatory protein  40.98 
 
 
239 aa  57.8  5e-08  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5035  regulatory protein GntR, HTH  39.47 
 
 
255 aa  57.8  5e-08  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.87866  normal  0.851882 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1165  histidine utilization repressor  45.16 
 
 
236 aa  57.4  6e-08  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4955  putative transcriptional regulator, GntR family  46.43 
 
 
248 aa  57.4  6e-08  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.203243  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2547  transcriptional regulator, GntR family  31.75 
 
 
123 aa  57.4  6e-08  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.136131  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3796  GntR family regulatory protein  40.98 
 
 
239 aa  57.4  6e-08  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3397  GntR family transcriptional regulator  45.95 
 
 
250 aa  57.4  6e-08  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3977  GntR family regulatory protein  40.98 
 
 
239 aa  57.4  6e-08  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2477  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
244 aa  57.4  7e-08  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.698104  normal 
 
 
-
 
NC_013596  Sros_9402  putative transcriptional regulator, GntR family  45.07 
 
 
259 aa  57.4  7e-08  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2215  transcriptional regulator, GntR family  44.64 
 
 
270 aa  57.4  7e-08  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.587929  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3472  transcriptional regulator, GntR family  40.62 
 
 
238 aa  57  8e-08  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00483129  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4963  GntR domain-containing protein  42.19 
 
 
253 aa  57  8e-08  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0466274  normal  0.472298 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3644  histidine utilization repressor  49.09 
 
 
256 aa  57  9e-08  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2941  GntR family transcriptional regulator  40.54 
 
 
259 aa  57  9e-08  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.994772  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2239  GntR family transcriptional regulator  43.48 
 
 
243 aa  57  9e-08  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0718  putative transcriptional regulator, GntR family  42.17 
 
 
238 aa  57  9e-08  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8675  putative transcriptional regulator, GntR family  50.91 
 
 
157 aa  56.6  1e-07  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1971  GntR family transcriptional regulator  40.98 
 
 
256 aa  56.2  1e-07  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6605  GntR domain protein  50.94 
 
 
246 aa  56.6  1e-07  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00449422 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2101  transcriptional regulator, GntR family  46.67 
 
 
254 aa  56.2  1e-07  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.608039  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1959  GntR family transcriptional regulator  40.98 
 
 
256 aa  56.6  1e-07  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.622516  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1995  GntR family transcriptional regulator  40.98 
 
 
256 aa  56.2  1e-07  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.795702  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6106  GntR family transcriptional regulator  40.98 
 
 
256 aa  56.2  1e-07  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.744386  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1898  GntR family transcriptional regulator  41.18 
 
 
263 aa  56.2  1e-07  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  1.97182e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3979  transcriptional regulator, GntR family with LacI sensor  39.53 
 
 
366 aa  55.5  2e-07  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.562885  normal  0.577756 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6337  GntR domain-containing protein  36.46 
 
 
226 aa  56.2  2e-07  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.0092025  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0700  putative transcriptional regulator, GntR family  40.96 
 
 
238 aa  55.8  2e-07  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.516841 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2738  GntR family transcriptional regulator  32.65 
 
 
239 aa  55.5  2e-07  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3603  GntR domain-containing protein  39.02 
 
 
253 aa  55.8  2e-07  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.550725  normal  0.904969 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1299  GntR family transcriptional regulator  40.98 
 
 
258 aa  55.8  2e-07  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0859375 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0482  GntR family transcriptional regulator  37.1 
 
 
105 aa  55.1  3e-07  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4817  GntR domain protein  46.77 
 
 
252 aa  55.1  3e-07  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.454673  normal  0.999229 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1321  regulatory protein GntR HTH  40.91 
 
 
240 aa  55.5  3e-07  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.57427e-29 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1076  GntR family transcriptional regulator  47.37 
 
 
151 aa  55.1  3e-07  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0019673 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1012  regulatory protein GntR, HTH  34.72 
 
 
342 aa  55.5  3e-07  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2822  transcriptional regulator, GntR family  45.16 
 
 
259 aa  55.1  3e-07  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7034  putative transcriptional regulator, GntR family  43.75 
 
 
280 aa  55.1  3e-07  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.444008 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0024  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  32.71 
 
 
473 aa  54.7  4e-07  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0173306 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0165  GntR family transcriptional regulator  30.68 
 
 
234 aa  54.7  4e-07  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.899806  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2930  transcriptional regulator, GntR family  41.27 
 
 
259 aa  54.7  4e-07  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000160523  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5664  GntR domain protein  51.92 
 
 
248 aa  54.7  4e-07  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.0098751  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0977  GntR family transcriptional regulator  47.89 
 
 
219 aa  54.7  4e-07  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1166  GntR family transcriptional regulator  41.98 
 
 
261 aa  54.7  4e-07  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.448437  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5286  GntR family transcriptional regulator  39.06 
 
 
256 aa  54.7  4e-07  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0794477 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5082  GntR domain-containing protein  44.64 
 
 
250 aa  54.7  4e-07  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.992616  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1813  histidine utilization repressor  37.31 
 
 
234 aa  55.1  4e-07  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.167757 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2745  GntR family transcriptional regulator  39.19 
 
 
240 aa  54.3  5e-07  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1100  GntR family transcriptional regulator  40.35 
 
 
253 aa  54.7  5e-07  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1262  GntR family transcriptional regulator  36.96 
 
 
244 aa  54.3  5e-07  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1061  phosphonate metabolism transcriptional regulator PhnF  40.35 
 
 
253 aa  54.7  5e-07  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.488956  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0478  GntR family transcriptional regulator  44.26 
 
 
244 aa  54.3  5e-07  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0696996  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3963  GntR family transcriptional regulator  39.76 
 
 
269 aa  54.3  5e-07  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1886  GntR family transcriptional regulator  39.34 
 
 
256 aa  54.7  5e-07  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.255199  normal  0.682445 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5243  histidine utilization repressor  39.62 
 
 
245 aa  54.3  5e-07  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.846899  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04070  transcriptional regulator, GntR family  31.63 
 
 
234 aa  54.3  5e-07  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5616  histidine utilization repressor  39.62 
 
 
245 aa  54.3  5e-07  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.321981  normal  0.0803951 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4612  histidine utilization repressor  39.62 
 
 
245 aa  54.3  5e-07  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0980762  hitchhiker  0.00350601 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1572  GntR family transcriptional regulator  40.62 
 
 
288 aa  54.3  5e-07  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00289458 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3882  GntR family transcriptional regulator  31.25 
 
 
243 aa  54.3  6e-07  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207693  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3410  transcriptional regulator, GntR family  28.78 
 
 
245 aa  54.3  6e-07  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  4.05117e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4272  GntR family transcriptional regulator  31.25 
 
 
243 aa  54.3  6e-07  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0075  histidine utilization repressor  39.62 
 
 
245 aa  54.3  6e-07  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.510846  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1013  GntR family transcriptional regulator  45.07 
 
 
232 aa  54.3  6e-07  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.475037  normal  0.972264 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0426  regulatory protein GntR HTH  41.38 
 
 
243 aa  54.3  6e-07  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1280  transcriptional regulator, GntR family  42.19 
 
 
233 aa  54.3  6e-07  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0887  GntR family transcriptional regulator  39.68 
 
 
253 aa  54.3  6e-07  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3809  GntR family transcriptional regulator  31.25 
 
 
243 aa  54.3  6e-07  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.467203  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3794  GntR family transcriptional regulator  31.25 
 
 
243 aa  54.3  6e-07  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>