12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0088 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_0088  hypothetical protein  100 
 
 
208 aa  422  1e-117  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0246  hypothetical protein  56 
 
 
205 aa  202  3e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2155  guanylate kinase  33.72 
 
 
221 aa  46.2  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000431933  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1956  guanylate kinase  33.72 
 
 
221 aa  44.3  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.414906 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2276  guanylate kinase  33.72 
 
 
221 aa  44.7  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0318334  normal  0.859222 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2411  guanylate kinase  29.44 
 
 
198 aa  43.1  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4162  guanylate kinase  27.57 
 
 
194 aa  43.1  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.13383  normal  0.396618 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2417  guanylate kinase  28.57 
 
 
198 aa  42.4  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.391978 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3936  guanylate kinase  31.82 
 
 
212 aa  42.4  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2370  guanylate kinase  28.57 
 
 
198 aa  42.4  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0470056  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02367  guanylate kinase  25.34 
 
 
203 aa  42  0.006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3097  guanylate kinase  32.82 
 
 
195 aa  42  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>