39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0087 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_0087  hypothetical protein  100 
 
 
345 aa  706  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.955525  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0245  hypothetical protein  62.57 
 
 
346 aa  416  1e-115  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0250  hypothetical protein  52.7 
 
 
310 aa  263  3e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1993  P-loop ATPase protein  35.29 
 
 
205 aa  89.7  6e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1537  hypothetical protein  38.46 
 
 
205 aa  89.7  7e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.516137 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2079  hypothetical protein  37.91 
 
 
206 aa  89  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2135  hypothetical protein  37.91 
 
 
206 aa  89  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2268  shikimate kinase  37.91 
 
 
206 aa  89  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.597105  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1242  hypothetical protein  36.6 
 
 
222 aa  87  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0904  hypothetical protein  33.33 
 
 
223 aa  87  4e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2267  P-loop ATPase protein  34.64 
 
 
205 aa  86.7  6e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2309  hypothetical protein  36.6 
 
 
206 aa  86.3  8e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2639  P-loop ATPase  26.46 
 
 
196 aa  85.9  1e-15  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.291525 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0210  hypothetical protein  33.56 
 
 
197 aa  85.5  1e-15  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2634  hypothetical protein  32.6 
 
 
190 aa  84.7  2e-15  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  9.75527e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1644  hypothetical protein  35.9 
 
 
205 aa  84.3  3e-15  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.931717 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1722  hypothetical protein  35.26 
 
 
205 aa  84.3  3e-15  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1644  hypothetical protein  35.26 
 
 
248 aa  83.6  5e-15  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1736  hypothetical protein  32.69 
 
 
205 aa  83.2  7e-15  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.679061 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0720  putative ATP-ase  32.9 
 
 
198 aa  81.3  2e-14  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0586  hypothetical protein  30.11 
 
 
197 aa  81.3  2e-14  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.883676  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5015  hypothetical protein  35.1 
 
 
201 aa  80.5  4e-14  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.549407  normal  0.103433 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3695  hypothetical protein  37.43 
 
 
186 aa  79.7  7e-14  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2484  hypothetical protein  30.81 
 
 
212 aa  79  1e-13  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0290842 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2638  putative ATP-ase  33.12 
 
 
192 aa  79.3  1e-13  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0819  putative ATP-ase  33.75 
 
 
192 aa  78.2  2e-13  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.131239  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0977  hypothetical protein  38.58 
 
 
180 aa  78.6  2e-13  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.518817  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3737  hypothetical protein  44.05 
 
 
149 aa  76.6  6e-13  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.890664 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6356  hypothetical protein  36.15 
 
 
179 aa  75.1  1e-12  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3392  twin-arginine translocation pathway signal  40.22 
 
 
479 aa  72.8  9e-12  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4819  hypothetical protein  28.24 
 
 
202 aa  72  2e-11  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2099  tetratricopeptide TPR_4  36.94 
 
 
470 aa  68.9  1e-10  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2547  hypothetical protein  32.93 
 
 
545 aa  48.9  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.441995  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7352  hypothetical protein  31.82 
 
 
518 aa  46.2  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1232  hypothetical protein  28.66 
 
 
525 aa  45.8  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.100547 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1249  kinase-like  27.33 
 
 
195 aa  44.7  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0514  hypothetical protein  21.13 
 
 
520 aa  44.7  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0345862  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_9914  kinase  25.34 
 
 
175 aa  44.3  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.697691  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1115  hypothetical protein  29.17 
 
 
579 aa  43.9  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.136038  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>