More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0086 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_0086  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 
126 aa  249  1e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.266832  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8668  putative transcriptional regulator, GntR family  56.25 
 
 
111 aa  120  8e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4270  GntR family transcriptional regulator  52.05 
 
 
254 aa  74.7  4e-13  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  2.12772e-06  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0033  GntR family transcriptional regulator  49.32 
 
 
264 aa  74.3  6e-13  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.146741  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2941  GntR family transcriptional regulator  48.57 
 
 
259 aa  73.6  9e-13  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.994772  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6358  transcriptional regulator, GntR family  48.48 
 
 
127 aa  73.6  1e-12  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2167  putative transcriptional regulator, GntR family  47.14 
 
 
241 aa  72  3e-12  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.984897  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2477  GntR family transcriptional regulator  46.27 
 
 
244 aa  69.3  2e-11  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.698104  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0152  GntR family transcriptional regulator  47.76 
 
 
237 aa  68.6  3e-11  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000117397 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14010  transcriptional regulator  43.59 
 
 
253 aa  68.2  4e-11  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.646916  normal  0.765571 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0145  GntR family transcriptional regulator  47.76 
 
 
237 aa  68.2  4e-11  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3598  transcriptional regulator, GntR family  50 
 
 
251 aa  67.8  5e-11  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0590  transcriptional regulator, GntR family  46.03 
 
 
254 aa  67.4  6e-11  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000490216  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3372  GntR domain-containing protein  40.45 
 
 
299 aa  67  8e-11  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1108  transcriptional regulator, GntR family  36.27 
 
 
126 aa  66.2  1e-10  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.645052  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3880  transcriptional regulator, GntR family  44 
 
 
239 aa  65.5  3e-10  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  6.82902e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3509  GntR family transcriptional regulator  37.36 
 
 
276 aa  65.5  3e-10  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.393643  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0917  transcriptional regulator, GntR family  47.06 
 
 
280 aa  65.1  3e-10  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3895  putative transcriptional regulator  39.76 
 
 
249 aa  64.7  4e-10  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.221719  normal  0.3606 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4811  transcriptional regulator, GntR family  48.48 
 
 
247 aa  64.7  4e-10  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4875  transcriptional regulator, GntR family  49.25 
 
 
139 aa  65.1  4e-10  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2930  transcriptional regulator, GntR family  45.59 
 
 
259 aa  64.3  5e-10  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000160523  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0255  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  37.78 
 
 
234 aa  64.3  6e-10  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2570  transcriptional regulator, GntR family  44.93 
 
 
241 aa  64.3  6e-10  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  4.48817e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0426  regulatory protein GntR HTH  45.31 
 
 
243 aa  64.3  6e-10  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0249  GntR family transcriptional regulator  37.78 
 
 
234 aa  64.3  6e-10  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0632  transcriptional regulator, GntR family  48.57 
 
 
261 aa  63.2  1e-09  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2024  transcriptional regulator, GntR family  52.94 
 
 
290 aa  62.8  1e-09  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.205752  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1446  transcriptional regulator, GntR family  52.94 
 
 
290 aa  62.8  1e-09  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0154  putative transcriptional regulator, GntR family  43.84 
 
 
245 aa  63.2  1e-09  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0299  regulatory protein GntR, HTH  47.14 
 
 
79 aa  63.5  1e-09  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33520  transcriptional regulator  49.21 
 
 
263 aa  62.8  1e-09  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.422261  normal  0.208572 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1078  GntR family transcriptional regulator  43.28 
 
 
245 aa  63.2  1e-09  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.358733  hitchhiker  0.00355085 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0126  regulatory protein GntR HTH  31.78 
 
 
251 aa  62  2e-09  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0616081  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0121  regulatory protein GntR, HTH  31.78 
 
 
251 aa  62  2e-09  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  4.30087e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3757  GntR domain-containing protein  50.79 
 
 
235 aa  62.4  2e-09  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.560097  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1119  GntR family transcriptional regulator  39.73 
 
 
257 aa  62.4  2e-09  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.196429 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9121  putative transcriptional regulator, GntR family  45.59 
 
 
244 aa  61.6  3e-09  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0740  GntR family transcriptional regulator  34.74 
 
 
245 aa  61.6  3e-09  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  2.68297e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0344  GntR family transcriptional regulator  45.71 
 
 
79 aa  61.6  3e-09  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.392311  hitchhiker  0.0019697 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1606  transcriptional regulator, GntR family  42.42 
 
 
241 aa  62  3e-09  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  2.25231e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8675  putative transcriptional regulator, GntR family  51.56 
 
 
157 aa  62  3e-09  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1357  regulatory protein GntR, HTH  31.31 
 
 
120 aa  61.2  4e-09  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3400  transcriptional regulator  43.28 
 
 
442 aa  61.2  4e-09  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.167973  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1995  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
256 aa  61.6  4e-09  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.795702  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0087  transcriptional regulator, GntR family  37 
 
 
241 aa  61.2  4e-09  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0530436  normal  0.993095 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1857  transcriptional regulator, GntR family  47.69 
 
 
242 aa  61.6  4e-09  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.457102  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0960  transcriptional regulator, GntR family  30.08 
 
 
120 aa  60.8  6e-09  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1971  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
256 aa  60.5  7e-09  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1665  GntR family transcriptional regulator  44.78 
 
 
132 aa  60.8  7e-09  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.244402  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6106  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
256 aa  60.5  7e-09  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.744386  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1299  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
258 aa  60.5  8e-09  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0859375 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1959  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
256 aa  60.5  8e-09  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.622516  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04760  predicted transcriptional regulator  40.3 
 
 
130 aa  59.7  1e-08  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0506039  normal  0.467802 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5286  GntR family transcriptional regulator  38.67 
 
 
256 aa  59.7  1e-08  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0794477 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1886  GntR family transcriptional regulator  36.54 
 
 
256 aa  60.1  1e-08  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.255199  normal  0.682445 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4653  transcriptional regulator, GntR family  43.28 
 
 
145 aa  60.1  1e-08  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1312  GntR family transcriptional regulator  45.59 
 
 
243 aa  59.7  1e-08  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.483973 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4518  GntR family transcriptional regulator  34.38 
 
 
234 aa  59.7  1e-08  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0724  transcriptional regulator, GntR family  35.62 
 
 
244 aa  58.9  2e-08  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1624  GntR domain-containing protein  36.84 
 
 
238 aa  58.9  2e-08  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.276308  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2575  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  41.1 
 
 
243 aa  58.9  2e-08  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2215  transcriptional regulator, GntR family  41.89 
 
 
270 aa  59.3  2e-08  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.587929  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1572  GntR family transcriptional regulator  50.75 
 
 
288 aa  59.3  2e-08  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00289458 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5082  GntR domain-containing protein  39.77 
 
 
250 aa  59.3  2e-08  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.992616  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1410  GntR domain protein  48.28 
 
 
237 aa  58.9  2e-08  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.531658 
 
 
-
 
NC_013596  Sros_9402  putative transcriptional regulator, GntR family  44.44 
 
 
259 aa  58.9  2e-08  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1877  GntR domain protein  39.77 
 
 
236 aa  58.5  3e-08  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.380896  normal  0.264595 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4179  regulatory protein GntR HTH  33.03 
 
 
243 aa  58.5  3e-08  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0156  putative transcriptional regulator, GntR family  42.03 
 
 
261 aa  58.5  3e-08  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0046  transcriptional regulator, GntR family  42.42 
 
 
244 aa  58.5  3e-08  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15050  regulatory protein GntR HTH  41.33 
 
 
368 aa  58.5  3e-08  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.34825  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0374  GntR family transcriptional regulator  38.03 
 
 
118 aa  58.2  4e-08  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0541  regulatory protein GntR HTH  33.33 
 
 
125 aa  58.2  4e-08  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  3.36324e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0124  transcriptional regulator, GntR family  45.16 
 
 
257 aa  57.8  4e-08  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00905495  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4331  regulatory protein GntR, HTH  47.69 
 
 
83 aa  58.2  4e-08  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.157834  normal  0.0446909 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0239  transcriptional regulator, GntR family  34.62 
 
 
242 aa  57.8  5e-08  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3960  regulatory protein GntR, HTH  40 
 
 
75 aa  57.8  6e-08  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1251  GntR family transcriptional regulator  33.64 
 
 
245 aa  57.4  6e-08  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.116745  normal  0.0613053 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2815  GntR domain-containing protein  34.17 
 
 
264 aa  57.4  7e-08  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.336695  normal  0.311573 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2171  GntR family transcriptional regulator  46.15 
 
 
258 aa  57.4  7e-08  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.233669 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0791  putative transcriptional regulator  39.73 
 
 
124 aa  57.4  7e-08  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1284  transcriptional regulator, GntR family  40 
 
 
255 aa  57.4  7e-08  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1691  GntR domain protein  39.77 
 
 
236 aa  57.4  7e-08  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.148925  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0303  GntR family transcriptional regulator  43.06 
 
 
249 aa  57  8e-08  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0972  GntR family transcriptional regulator  35.62 
 
 
245 aa  57  9e-08  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0769  transcriptional regulator, GntR family  44.62 
 
 
272 aa  56.6  1e-07  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0072  regulatory protein GntR, HTH  49.23 
 
 
288 aa  56.6  1e-07  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.476491  normal  0.750222 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2866  GntR family transcriptional regulator  44.12 
 
 
251 aa  56.6  1e-07  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1638  GntR family transcriptional regulator  41.1 
 
 
239 aa  56.2  1e-07  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2822  transcriptional regulator, GntR family  43.66 
 
 
259 aa  57  1e-07  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1903  GntR family transcriptional regulator  41.1 
 
 
239 aa  56.2  1e-07  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.629939  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0345  regulatory protein GntR HTH  38.03 
 
 
78 aa  56.6  1e-07  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.631612  hitchhiker  0.0060004 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4518  transcriptional regulator, GntR family  44.62 
 
 
272 aa  56.6  1e-07  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2197  GntR family transcriptional regulator  39.13 
 
 
256 aa  56.6  1e-07  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.6507  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4773  regulatory protein GntR HTH  46.15 
 
 
86 aa  56.2  2e-07  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0230746  decreased coverage  1.99602e-05 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2101  transcriptional regulator, GntR family  41.18 
 
 
254 aa  55.8  2e-07  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.608039  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3664  GntR family transcriptional regulator  41.79 
 
 
249 aa  55.8  2e-07  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.514259  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3599  GntR family transcriptional regulator  44.62 
 
 
256 aa  55.5  2e-07  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.310006 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1061  phosphonate metabolism transcriptional regulator PhnF  36.23 
 
 
253 aa  55.8  2e-07  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.488956  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>