More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0076 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_0076  NAD(P)H quinone oxidoreductase  100 
 
 
320 aa  632  1e-180  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0146  hypothetical protein  73.04 
 
 
318 aa  439  1e-122  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.639279  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0072  putative quinone oxidoreductase  66.26 
 
 
328 aa  414  1e-114  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.419686  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5274  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  65.12 
 
 
324 aa  414  1e-114  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.315369  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01620  putative NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  65.22 
 
 
324 aa  402  1e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.452683  normal  0.18049 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0180  alcohol dehydrogenase  61.42 
 
 
325 aa  397  1e-110  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0290  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  62.69 
 
 
329 aa  395  1e-109  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0139  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  64.29 
 
 
324 aa  389  1e-107  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.85612  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2101  alcohol dehydrogenase  63.27 
 
 
353 aa  381  1e-105  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.692182 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0076  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  62.85 
 
 
333 aa  378  1e-104  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0308  Quinone oxidoreductase putative PIG3  63.16 
 
 
329 aa  370  1e-101  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.166873  normal  0.0546383 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1189  alcohol dehydrogenase  61.08 
 
 
324 aa  369  1e-101  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0796506  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5369  alcohol dehydrogenase  58.9 
 
 
327 aa  365  1e-100  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4988  zinc-binding alcohol dehydrogenase  58.9 
 
 
327 aa  365  1e-100  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5076  alcohol dehydrogenase  58.9 
 
 
327 aa  365  1e-100  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.857188 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4983  quinone oxidoreductase putative PIG3  63.27 
 
 
325 aa  365  1e-100  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000828974 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0827  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  59.33 
 
 
327 aa  363  2e-99  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4470  alcohol dehydrogenase  64.09 
 
 
325 aa  360  2e-98  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0103957 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0679  alcohol dehydrogenase  59.33 
 
 
327 aa  358  7e-98  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5615  alcohol dehydrogenase  62.06 
 
 
325 aa  352  3e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.582743 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0289  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  58.9 
 
 
343 aa  351  8e-96  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04120  putative NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  58.2 
 
 
326 aa  349  3e-95  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0587726 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0286  quinone oxidoreductase putative PIG3  60.26 
 
 
316 aa  350  3e-95  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13811  oxidoreductase  57.06 
 
 
328 aa  348  7e-95  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.334281 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5622  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  53.89 
 
 
323 aa  347  2e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.915578 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4094  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  59.01 
 
 
325 aa  340  2e-92  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4322  zinc-binding alcohol dehydrogenase  59.62 
 
 
316 aa  338  9e-92  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0261  NAD(P)H quinone oxidoreductase PIG3 family  56.17 
 
 
324 aa  337  2e-91  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3889  zinc-binding alcohol dehydrogenase  55 
 
 
327 aa  330  1e-89  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0106783 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3406  zinc-binding alcohol dehydrogenase  53.87 
 
 
335 aa  325  6e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1490  zinc-binding alcohol dehydrogenase  53.21 
 
 
333 aa  323  3e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.020741  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0282  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  55.02 
 
 
317 aa  321  1e-86  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.221318  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1371  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  52.16 
 
 
331 aa  317  1e-85  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.544729  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2012  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  51.8 
 
 
338 aa  317  2e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00591835  normal  0.606221 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2290  alcohol dehydrogenase  51.35 
 
 
339 aa  315  6e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  1.96833e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2169  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  51.35 
 
 
339 aa  315  6e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0111433  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0716  NADPH/quinone reductase and related Zn-dependent oxidoreductase  51.56 
 
 
328 aa  315  8e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.655261  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1628  NAD(P)H quinone oxidoreductase PIG3 family protein  49.85 
 
 
336 aa  315  8e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.91592  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1737  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  49.85 
 
 
336 aa  315  8e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1697  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  53.54 
 
 
336 aa  315  9e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01790  putative NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  57.4 
 
 
332 aa  314  2e-84  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2435  alcohol dehydrogenase  51.25 
 
 
333 aa  313  2e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.953157  normal  0.115745 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2517  zinc-binding alcohol dehydrogenase  55 
 
 
334 aa  313  3e-84  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2371  alcohol dehydrogenase  51.56 
 
 
328 aa  313  3e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.603906  normal  0.87569 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2835  NAD(P)H quinone oxidoreductase PIG3 family protein  49.54 
 
 
336 aa  313  3e-84  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.548678  normal  0.0828757 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0840  quinone oxidoreductase putative PIG3  53.7 
 
 
341 aa  312  4e-84  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1156  quinone oxidoreductase  49.54 
 
 
389 aa  312  4e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1546  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  53.23 
 
 
336 aa  312  5e-84  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.383857  normal  0.0877098 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0924  zinc-binding alcohol dehydrogenase  48.05 
 
 
334 aa  311  9e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.734202  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1826  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  53.23 
 
 
336 aa  311  1e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.448305 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0958  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  49.25 
 
 
334 aa  310  2e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.761885  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1260  alcohol dehydrogenase  51.68 
 
 
334 aa  309  3e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.105782 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1025  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  51.65 
 
 
339 aa  309  4e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0042079  normal  0.442339 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1056  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  50.77 
 
 
334 aa  309  5e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.691912  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2092  quinone oxidoreductase putative PIG3  49.07 
 
 
332 aa  308  6e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.187867  hitchhiker  0.000106437 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2065  putative NADPH quinone oxidoreductase protein  51.51 
 
 
334 aa  308  6e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.465224  normal  0.69391 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1286  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  51.35 
 
 
339 aa  308  1e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1400  putative oxidoreductase  50.46 
 
 
328 aa  307  1e-82  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.250698  normal  0.859158 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1126  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  51.35 
 
 
339 aa  308  1e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.793035  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0409  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  51.35 
 
 
339 aa  308  1e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1421  alcohol dehydrogenase  51.23 
 
 
328 aa  307  1e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.329705  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2269  alcohol dehydrogenase  52.19 
 
 
325 aa  307  1e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.609363  normal  0.353515 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0741  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  51.35 
 
 
339 aa  308  1e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.413421  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1833  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  51.35 
 
 
339 aa  308  1e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1431  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  51.35 
 
 
360 aa  307  1e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2252  alcohol dehydrogenase  51.35 
 
 
339 aa  307  2e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0476734  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2276  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  51.35 
 
 
339 aa  307  2e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  9.17722e-05  normal  0.165873 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5183  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  52.74 
 
 
333 aa  306  2e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.641373  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1640  zinc-binding alcohol dehydrogenase  51.35 
 
 
339 aa  307  2e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00037111  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5580  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  50.75 
 
 
339 aa  306  2e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0129924  normal  0.0834641 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3217  putative NADPH quinone oxidoreductase  52.11 
 
 
338 aa  306  4e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00040728  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3513  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  49.85 
 
 
332 aa  305  6e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1340  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  52.41 
 
 
338 aa  305  6e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00600285  normal  0.0548785 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1054  alcohol dehydrogenase  47.73 
 
 
332 aa  305  8e-82  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1295  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  51.05 
 
 
360 aa  305  1e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0519873  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3245  quinone oxidoreductase putative PIG3  50.46 
 
 
326 aa  304  1e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0885817  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2217  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  52.41 
 
 
334 aa  303  2e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.573138 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3259  zinc-binding alcohol dehydrogenase  50.15 
 
 
340 aa  303  3e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3056  quinone oxidoreductase putative PIG3  49.07 
 
 
335 aa  301  8e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0100  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  52.16 
 
 
328 aa  301  1e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1894  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  51.81 
 
 
334 aa  300  2e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0103733  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1057  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  50.75 
 
 
339 aa  300  2e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0287283  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0894  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  49.23 
 
 
332 aa  300  2e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.637354 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6946  putative NADPH quinone oxidoreductase  48.92 
 
 
332 aa  297  1e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0337  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  49.69 
 
 
338 aa  296  4e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0782  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  48.92 
 
 
338 aa  295  5e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.793313  normal  0.107326 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0248  quinone oxidoreductase putative PIG3  49.69 
 
 
328 aa  294  1e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0170  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  49.38 
 
 
322 aa  294  1e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1738  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  50.46 
 
 
326 aa  293  2e-78  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0679708  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0464  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  49.23 
 
 
335 aa  293  2e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.34246  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1679  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  50.46 
 
 
334 aa  293  2e-78  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0869  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  49.54 
 
 
334 aa  294  2e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1245  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  47.24 
 
 
338 aa  293  3e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.490679  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2750  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  47.84 
 
 
332 aa  292  4e-78  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.204833  normal  0.0529878 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1621  quinone oxidoreductase putative PIG3  47.68 
 
 
336 aa  292  4e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.463823  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4494  alcohol dehydrogenase  47.84 
 
 
332 aa  291  8e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.218287  normal  0.353288 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1174  quinone oxidoreductase putative PIG3  50.31 
 
 
334 aa  291  9e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0954  alcohol dehydrogenase  49.24 
 
 
334 aa  291  1e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000352815 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1952  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  50.31 
 
 
332 aa  290  2e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2003  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  49.54 
 
 
335 aa  290  2e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.05102  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>