More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0072 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_0123  seryl-tRNA synthetase  79.47 
 
 
418 aa  678  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0031  seryl-tRNA synthetase  78.15 
 
 
422 aa  640  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0072  seryl-tRNA synthetase  100 
 
 
421 aa  852  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0142  Serine--tRNA ligase  79.71 
 
 
420 aa  701  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.116437  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5272  seryl-tRNA synthetase  75.3 
 
 
436 aa  630  1e-179  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0719173  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01270  seryl-tRNA synthetase  72.38 
 
 
421 aa  623  1e-177  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.380237  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0118  seryl-tRNA synthetase  70.81 
 
 
416 aa  597  1e-169  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0249  seryl-tRNA synthetase  68.32 
 
 
431 aa  570  1e-161  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00955912  hitchhiker  0.00110837 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6170  seryl-tRNA synthetase  70 
 
 
422 aa  568  1e-161  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0245  seryl-tRNA synthetase  66.82 
 
 
425 aa  565  1e-160  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.259189 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2104  seryl-tRNA synthetase  67.78 
 
 
420 aa  562  1e-159  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.433049 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0140  seryl-tRNA synthetase  65.73 
 
 
426 aa  563  1e-159  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3242  seryl-tRNA synthetase  67.54 
 
 
424 aa  560  1e-158  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0285  seryl-tRNA synthetase  66.67 
 
 
426 aa  556  1e-157  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.125117 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3184  seryl-tRNA synthetase  66.9 
 
 
426 aa  553  1e-156  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.568965  normal  0.0407515 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0265  seryl-tRNA synthetase  65.41 
 
 
426 aa  550  1e-155  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.540225  normal  0.498344 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0231  seryl-tRNA synthetase  68.33 
 
 
420 aa  549  1e-155  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01720  seryl-tRNA synthetase  67.22 
 
 
422 aa  546  1e-154  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.147645  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5117  seryl-tRNA synthetase  67.7 
 
 
417 aa  541  1e-153  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5029  seryl-tRNA synthetase  67.7 
 
 
417 aa  541  1e-153  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.88851  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5410  seryl-tRNA synthetase  67.94 
 
 
417 aa  542  1e-153  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.192116  normal  0.729439 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0278  seryl-tRNA synthetase  64.76 
 
 
433 aa  538  1e-152  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.494659  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0180  seryl-tRNA synthetase  65.87 
 
 
419 aa  538  1e-152  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0379  seryl-tRNA synthetase  67.47 
 
 
423 aa  536  1e-151  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.490455 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0149  seryl-tRNA synthetase  64.83 
 
 
417 aa  535  1e-151  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1150  seryl-tRNA synthetase  66.03 
 
 
445 aa  538  1e-151  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.113089  normal  0.0626526 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01150  seryl-tRNA synthetase  64.76 
 
 
427 aa  533  1e-150  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13868  seryl-tRNA synthetase  65.24 
 
 
419 aa  531  1e-149  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.458781  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5659  seryl-tRNA synthetase  66.75 
 
 
419 aa  528  1e-149  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.466733  normal  0.143562 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01690  seryl-tRNA synthetase  64.55 
 
 
426 aa  526  1e-148  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.335303 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0174  seryl-tRNA synthetase  61.79 
 
 
424 aa  520  1e-146  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06830  seryl-tRNA synthetase  64.13 
 
 
423 aa  509  1e-143  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.623726  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0357  serine--tRNA ligase  58.96 
 
 
428 aa  507  1e-142  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1760  seryl-tRNA synthetase  56.6 
 
 
428 aa  493  1e-138  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.683795  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1382  seryl-tRNA synthetase  42.79 
 
 
425 aa  374  1e-102  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.346171  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1145  seryl-tRNA synthetase  50.97 
 
 
411 aa  363  4e-99  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.579917  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1195  seryl-tRNA synthetase  42.93 
 
 
417 aa  362  9e-99  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.877064  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0011  seryl-tRNA synthetase  44.26 
 
 
427 aa  354  2e-96  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0824317  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0013  seryl-tRNA synthetase  43.06 
 
 
424 aa  353  2e-96  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00217945  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5302  seryl-tRNA synthetase  43.06 
 
 
424 aa  352  6e-96  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  1.49119e-06  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0016  seryl-tRNA synthetase  43.06 
 
 
424 aa  352  8e-96  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0012  seryl-tRNA synthetase  43.06 
 
 
424 aa  352  8e-96  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  7.51386e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0015  seryl-tRNA synthetase  43.06 
 
 
424 aa  352  8e-96  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0013  seryl-tRNA synthetase  43.06 
 
 
424 aa  352  8e-96  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.15266  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0018  seryl-tRNA synthetase  43.06 
 
 
424 aa  352  1e-95  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  2.12252e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0016  seryl-tRNA synthetase  42.82 
 
 
424 aa  351  1e-95  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00101457  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0013  seryl-tRNA synthetase  43.06 
 
 
424 aa  351  1e-95  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  1.83486e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1870  seryl-tRNA synthetase  42.45 
 
 
423 aa  349  4e-95  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.961379  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1086  seryl-tRNA synthetase  44.6 
 
 
424 aa  349  5e-95  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0012  seryl-tRNA synthetase  42.58 
 
 
424 aa  348  7e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0448744  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1518  seryl-tRNA synthetase  42.12 
 
 
426 aa  347  2e-94  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2740  seryl-tRNA synthetase  43.78 
 
 
424 aa  345  1e-93  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.697108 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1511  seryl-tRNA synthetase  39.57 
 
 
421 aa  344  2e-93  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0147208 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1404  seryl-tRNA synthetase  44.34 
 
 
425 aa  343  3e-93  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0506465  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0014  seryl-tRNA synthetase  41.63 
 
 
424 aa  342  9e-93  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  3.07933e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1006  seryl-tRNA synthetase  43.49 
 
 
427 aa  338  1e-91  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.224003  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0102  seryl-tRNA synthetase  39.48 
 
 
424 aa  338  1e-91  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.133347  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2381  seryl-tRNA synthetase  42.11 
 
 
423 aa  337  3e-91  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0872  seryl-tRNA synthetase  41.47 
 
 
420 aa  336  5e-91  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000202567  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0089  seryl-tRNA synthetase  42.86 
 
 
422 aa  335  6e-91  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.55791e-12 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0012  seryl-tRNA synthetase  40.91 
 
 
424 aa  335  8e-91  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  3.27784e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21060  seryl-tRNA synthetase  39.72 
 
 
422 aa  335  8e-91  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0108  seryl-tRNA synthetase  42.62 
 
 
422 aa  335  1e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0253  seryl-tRNA synthetase  41.09 
 
 
425 aa  334  1e-90  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0037  seryl-tRNA synthetase  43.41 
 
 
422 aa  332  8e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0368  seryl-tRNA synthetase  40.77 
 
 
425 aa  331  1e-89  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0028  seryl-tRNA synthetase  41.13 
 
 
423 aa  331  2e-89  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  3.46844e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0356  seryl-tRNA synthetase  40.33 
 
 
425 aa  330  2e-89  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2507  seryl-tRNA synthetase  41.67 
 
 
425 aa  330  3e-89  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.781035 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0097  seryl-tRNA synthetase  38.31 
 
 
435 aa  329  4e-89  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  1.7376e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1450  seryl-tRNA synthetase  43.87 
 
 
425 aa  330  4e-89  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0014  seryl-tRNA synthetase  40.67 
 
 
426 aa  330  4e-89  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.192456  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0231  seryl-tRNA synthetase  39.86 
 
 
425 aa  329  4e-89  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1433  seryl-tRNA synthetase  42.14 
 
 
425 aa  329  5e-89  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.00416248  decreased coverage  7.98458e-05 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1338  seryl-tRNA synthetase  41.63 
 
 
427 aa  328  1e-88  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00311598 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0022  seryl-tRNA synthetase  39.57 
 
 
422 aa  327  2e-88  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3528  seryl-tRNA synthetase  42.93 
 
 
423 aa  327  2e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1830  seryl-tRNA synthetase  44.26 
 
 
423 aa  327  3e-88  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.436445  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0380  seryl-tRNA synthetase  44.52 
 
 
421 aa  326  5e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.241897  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0550  seryl-tRNA synthetase  44.52 
 
 
421 aa  326  5e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0012144  hitchhiker  5.82933e-05 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0013  seryl-tRNA synthetase  42.34 
 
 
424 aa  325  9e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0372  seryl-tRNA synthetase  39.95 
 
 
421 aa  325  1e-87  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2307  seryl-tRNA synthetase  40.24 
 
 
422 aa  325  1e-87  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  2.41726e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0013  seryl-tRNA synthetase  42.82 
 
 
425 aa  324  2e-87  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0287  seryl-tRNA synthetase  43.3 
 
 
422 aa  323  3e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  7.36944e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0196  seryl-tRNA synthetase  42.14 
 
 
427 aa  323  3e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3236  seryl-tRNA synthetase  40.57 
 
 
423 aa  323  4e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2031  seryl-tRNA synthetase  39.71 
 
 
423 aa  321  1e-86  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.19968  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0009  seryl-tRNA synthetase  38.76 
 
 
428 aa  321  2e-86  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0009  seryl-tRNA synthetase  38.76 
 
 
428 aa  321  2e-86  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4339  seryl-tRNA synthetase  38.85 
 
 
423 aa  321  2e-86  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.619806  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2745  seryl-tRNA synthetase  40.77 
 
 
425 aa  321  2e-86  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2224  seryl-tRNA synthetase  40.91 
 
 
425 aa  320  3e-86  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0182  seryl-tRNA synthetase  38.71 
 
 
435 aa  320  3e-86  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.38997  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2626  seryl-tRNA synthetase  39.39 
 
 
427 aa  320  4e-86  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3636  seryl-tRNA synthetase  42.17 
 
 
413 aa  319  5e-86  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000529029 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0391  seryl-tRNA synthetase  40.52 
 
 
432 aa  319  5e-86  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.405433  normal  0.944422 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3466  seryl-tRNA synthetase  43.97 
 
 
424 aa  319  6e-86  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00344693 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2545  seryl-tRNA synthetase  38.28 
 
 
428 aa  318  8e-86  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0979  seryl-tRNA synthetase  41.35 
 
 
423 aa  318  1e-85  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>