More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0071 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_0071  prephenate dehydratase  100 
 
 
324 aa  658  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0141  Prephenate dehydratase  76.8 
 
 
306 aa  453  1e-126  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.341146  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3053  prephenate dehydratase  61.09 
 
 
315 aa  369  1e-101  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5270  Prephenate dehydratase  61.41 
 
 
315 aa  367  1e-100  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.271199  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0121  Prephenate dehydratase  57.52 
 
 
305 aa  318  8e-86  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0282  Prephenate dehydratase  52.44 
 
 
326 aa  303  2e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.209842 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2105  prephenate dehydratase  54.58 
 
 
318 aa  297  1e-79  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.547731 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0268  Prephenate dehydratase  53.55 
 
 
311 aa  296  3e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0138  prephenate dehydratase  53.14 
 
 
327 aa  296  4e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2485  prephenate dehydratase  52.94 
 
 
349 aa  295  6e-79  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.402692 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0097  Prephenate dehydratase  55.45 
 
 
314 aa  289  4e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0315701 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3187  Prephenate dehydratase  52.58 
 
 
322 aa  284  2e-75  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.32144  normal  0.019372 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4522  prephenate dehydratase  50.63 
 
 
318 aa  280  2e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1594  prephenate dehydratase  50.49 
 
 
317 aa  277  1e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0572712  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6401  Prephenate dehydratase  51.16 
 
 
305 aa  271  2e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01130  prephenate dehydratase  48.28 
 
 
316 aa  267  1e-70  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0377  Prephenate dehydratase  49.68 
 
 
335 aa  268  1e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.461559 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5032  prephenate dehydratase  50.32 
 
 
318 aa  256  5e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0575455 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0245  Prephenate dehydratase  49.68 
 
 
314 aa  251  1e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00775166  hitchhiker  0.00464716 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0100  Prephenate dehydratase  47.9 
 
 
300 aa  231  2e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.863601  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13872  prephenate dehydratase  43.81 
 
 
321 aa  229  7e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01190  prephenate dehydratase  47.06 
 
 
301 aa  221  1e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.70392  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5662  prephenate dehydratase  45.31 
 
 
312 aa  220  2e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.963646  normal  0.0943658 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1779  prephenate dehydratase  45.99 
 
 
277 aa  214  2e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.490374  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1145  prephenate dehydratase  42.01 
 
 
309 aa  213  3e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0149983  normal  0.0340431 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2061  Prephenate dehydratase  45.26 
 
 
277 aa  210  2e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.152541  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2153  Prephenate dehydratase  45.26 
 
 
277 aa  210  2e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0218  Prephenate dehydratase  48.57 
 
 
314 aa  210  2e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5415  prephenate dehydratase  43.35 
 
 
315 aa  209  6e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5034  prephenate dehydratase  43.35 
 
 
315 aa  208  1e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.431184  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5122  prephenate dehydratase  43.35 
 
 
315 aa  208  1e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.348107  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06790  prephenate dehydratase  39.3 
 
 
325 aa  202  6e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.299471  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0937  prephenate dehydratase  41.54 
 
 
272 aa  201  1e-50  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0097  Prephenate dehydratase  45.36 
 
 
306 aa  200  2e-50  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0905  Prephenate dehydratase  42.4 
 
 
386 aa  199  5e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  6.7938e-09  hitchhiker  6.00467e-09 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0145  Prephenate dehydratase  41.43 
 
 
311 aa  190  3e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1153  Prephenate dehydratase  41.61 
 
 
276 aa  189  7e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01900  Prephenate dehydratase  36.33 
 
 
303 aa  185  9e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2260  prephenate dehydratase  38.41 
 
 
278 aa  185  9e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2039  prephenate dehydratase  43.96 
 
 
275 aa  184  1e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00402041 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0078  prephenate dehydratase  39.27 
 
 
280 aa  182  8e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0545378  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0121  prephenate dehydratase  36.36 
 
 
356 aa  181  2e-44  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2535  prephenate dehydratase  38.85 
 
 
282 aa  181  2e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08570  prephenate dehydratase  38.52 
 
 
286 aa  180  3e-44  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.2468 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2150  chorismate mutase  40 
 
 
358 aa  179  7e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1887  chorismate mutase-P and prephenate dehydratase  41.88 
 
 
360 aa  177  1e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.92693e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1244  prephenate dehydratase / chorismate mutase  42.75 
 
 
371 aa  176  5e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0482068  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1552  prephenate dehydratase  39.05 
 
 
279 aa  176  5e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0248162  normal  0.310445 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0990  chorismate mutase  39.05 
 
 
359 aa  176  7e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1904  prephenate dehydratase  38.41 
 
 
372 aa  175  1e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0916421  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1244  Prephenate dehydratase  38.27 
 
 
283 aa  174  1e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3260  chorismate mutase  38.69 
 
 
359 aa  174  2e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2608  chorismate mutase/prephenate dehydratase  40.79 
 
 
358 aa  174  2e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1418  chorismate mutase/prephenate dehydratase  40.29 
 
 
362 aa  174  3e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3051  Prephenate dehydratase  37.85 
 
 
286 aa  173  3e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1594  prephenate dehydratase  33.69 
 
 
311 aa  172  5e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1964  prephenate dehydratase  39.27 
 
 
279 aa  172  6e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.221167 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0008  Prephenate dehydratase  41.01 
 
 
279 aa  172  8e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1345  chorismate mutase  40.79 
 
 
359 aa  171  2e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3149  prephenate dehydratase  37.05 
 
 
283 aa  171  2e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.286294  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1334  prephenate dehydratase  40.14 
 
 
280 aa  171  2e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000128945  normal  0.202615 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0862  prephenate dehydratase / chorismate mutase  40.43 
 
 
368 aa  169  4e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1336  chorismate mutase  38.96 
 
 
413 aa  169  5e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0914  prephenate dehydratase  39.64 
 
 
282 aa  166  6e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4280  prephenate dehydratase  37.05 
 
 
283 aa  166  7e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  3.19515e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1930  prephenate dehydratase  34.77 
 
 
311 aa  165  1e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.898282 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1462  prephenate dehydratase  37.55 
 
 
358 aa  164  1e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000293484  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1207  chorismate mutase  38.1 
 
 
371 aa  163  3e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.196084  normal  0.0297935 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4168  prephenate dehydratase  36.69 
 
 
283 aa  162  5e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4514  prephenate dehydratase  36.69 
 
 
283 aa  162  5e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.682816 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0682  prephenate dehydratase  36.69 
 
 
283 aa  162  7e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000690128  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4552  prephenate dehydratase  36.69 
 
 
283 aa  162  7e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.115026  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1850  prephenate dehydratase  36.86 
 
 
364 aa  162  8e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0140857  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4179  prephenate dehydratase  36.69 
 
 
283 aa  161  1e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.409752  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0665  prephenate dehydratase  36.82 
 
 
293 aa  160  2e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.27815  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2192  chorismate mutase  39.49 
 
 
355 aa  160  2e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4525  prephenate dehydratase  37.05 
 
 
283 aa  161  2e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.802903  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4331  prephenate dehydratase  36.33 
 
 
283 aa  160  3e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.662649  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4666  prephenate dehydratase  36.33 
 
 
283 aa  160  3e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1067  Prephenate dehydratase  38.99 
 
 
288 aa  160  3e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2166  chorismate mutase / prephenate dehydratase  36.26 
 
 
373 aa  160  4e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0178196  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0951  chorismate mutase / prephenate dehydratase  35.51 
 
 
365 aa  159  4e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.356586  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1096  Prephenate dehydratase  38.99 
 
 
288 aa  159  4e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1424  prephenate dehydratase  35.51 
 
 
274 aa  159  7e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  3.68391e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0926  chorismate mutase / prephenate dehydratase  39.42 
 
 
367 aa  158  1e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15830  chorismate mutase  36.52 
 
 
365 aa  158  1e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.351764  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4445  prephenate dehydratase  37 
 
 
274 aa  158  2e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4567  prephenate dehydratase  36.69 
 
 
283 aa  157  2e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1792  chorismate mutase / prephenate dehydratase  37.91 
 
 
360 aa  157  2e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00027177 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3022  chorismate mutase  37.68 
 
 
360 aa  157  3e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.123559  normal  0.97386 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1360  chorismate mutase  35.77 
 
 
364 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0302882 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3945  chorismate mutase  35.77 
 
 
364 aa  156  4e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.117888  normal  0.0191313 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1376  chorismate mutase  35.77 
 
 
364 aa  156  4e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1769  chorismate mutase  35.77 
 
 
367 aa  156  4e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.653886  normal  0.431896 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4087  prephenate dehydratase  34.93 
 
 
290 aa  156  6e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.885152  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1538  chorismate mutase  39.78 
 
 
362 aa  155  7e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23280  chorismate mutase  35.77 
 
 
365 aa  155  1e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.110273 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1023  chorismate mutase  38.04 
 
 
365 aa  155  1e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0176  chorismate mutase / prephenate dehydratase  40.29 
 
 
368 aa  155  1e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  1.65847e-05  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4076  prephenate dehydratase  35.77 
 
 
364 aa  154  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000787581  normal  0.246318 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>