59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0070 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_0070  hypothetical protein  100 
 
 
455 aa  877  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0139  hypothetical protein  63.01 
 
 
437 aa  495  1e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0119  hypothetical protein  53.27 
 
 
429 aa  317  2e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0243  putative integral membrane protein  41.83 
 
 
417 aa  254  3e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00155978 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12209  integral membrane protein  37.91 
 
 
427 aa  159  8e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3543  putative integral membrane protein  37.05 
 
 
428 aa  154  4e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.774005 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2968  putative integral membrane protein  36.81 
 
 
430 aa  152  2e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3338  putative integral membrane protein  34.12 
 
 
418 aa  150  4e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.153127 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3287  putative integral membrane protein  34.12 
 
 
418 aa  150  4e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.505534  normal  0.641522 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3276  putative integral membrane protein  34.12 
 
 
418 aa  150  4e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2502  Protein of unknown function DUF2029  33.74 
 
 
414 aa  143  8e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.567821  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5506  hypothetical protein  33.96 
 
 
395 aa  142  9e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.344164  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4234  sugar transporter superfamily protein  37.65 
 
 
402 aa  138  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.350034  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5329  hypothetical protein  33.96 
 
 
478 aa  137  3e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1385  hypothetical protein  36.14 
 
 
412 aa  132  2e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.488241  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1016  hypothetical protein  33.51 
 
 
419 aa  131  2e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4545  hypothetical protein  32.86 
 
 
477 aa  126  1e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.186558 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06020  Protein of unknown function (DUF2029)  35.2 
 
 
444 aa  122  1e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.179625 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4020  Protein of unknown function DUF2029  30.95 
 
 
426 aa  122  1e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.643753  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5055  hypothetical protein  33.91 
 
 
477 aa  121  3e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.020472 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5433  hypothetical protein  31.83 
 
 
420 aa  120  4e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.393195 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2916  hypothetical protein  36.39 
 
 
470 aa  119  1e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.189824  normal  0.294126 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2282  Protein of unknown function DUF2029  31.04 
 
 
469 aa  119  1e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.291881  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0455  mannosyltransferase  32.49 
 
 
422 aa  118  2e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0468  mannosyltransferase  32.49 
 
 
422 aa  118  2e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0479  mannosyltransferase  32.49 
 
 
422 aa  118  2e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2198  hypothetical protein  31.47 
 
 
408 aa  115  2e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11183  mannosyltransferase  30.53 
 
 
431 aa  114  2e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.55823e-08  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2153  mannosyltransferase  32.09 
 
 
369 aa  114  3e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0955915  normal  0.0100871 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4550  mannosyltransferase  31.85 
 
 
406 aa  108  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.637141  normal  0.185586 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1343  hypothetical protein  37.18 
 
 
410 aa  108  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  5.46373e-05 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4274  mannosyltransferase  31.65 
 
 
443 aa  107  3e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4045  mannosyltransferase  31.65 
 
 
443 aa  107  4e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265907  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4120  mannosyltransferase  31.65 
 
 
443 aa  107  4e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.703888 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3224  hypothetical protein  36.62 
 
 
378 aa  106  7e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0743  mannosyltransferase  31.33 
 
 
398 aa  105  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.186012  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0435  hypothetical protein  30.03 
 
 
417 aa  105  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.199454  normal  0.0441383 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0425  hypothetical protein  30.03 
 
 
417 aa  105  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21610  Protein of unknown function (DUF2029)  34.69 
 
 
421 aa  104  3e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0338543  normal  0.0110628 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1126  Protein of unknown function DUF2029  32.57 
 
 
425 aa  101  3e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3685  hypothetical protein  31.49 
 
 
420 aa  101  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.822994  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4322  mannosyltransferase  29.51 
 
 
417 aa  99  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6115  hypothetical protein  30.89 
 
 
479 aa  99.8  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.112096  normal  0.027736 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3057  hypothetical protein  31.53 
 
 
494 aa  98.6  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0467  mannosyltransferase  27.93 
 
 
428 aa  98.2  3e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0478  mannosyltransferase  27.93 
 
 
428 aa  98.2  3e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0454  mannosyltransferase  27.93 
 
 
428 aa  98.2  3e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3039  Protein of unknown function DUF2029  32.48 
 
 
570 aa  97.4  4e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0993  hypothetical protein  31.77 
 
 
411 aa  97.1  6e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1125  hypothetical protein  32.74 
 
 
408 aa  96.7  8e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.51418  normal  0.62159 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0453  mannosyltransferase  29.57 
 
 
438 aa  89.4  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.355546  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0466  mannosyltransferase  29.57 
 
 
438 aa  89.4  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0477  mannosyltransferase  29.57 
 
 
438 aa  89.4  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.771744 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3057  Protein of unknown function DUF2029  30.28 
 
 
455 aa  87  6e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0888832  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21600  Protein of unknown function (DUF2029)  30.46 
 
 
467 aa  83.6  6e-15  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0988113  hitchhiker  0.00696231 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3060  hypothetical protein  29.88 
 
 
434 aa  82.8  1e-14  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.647331  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4089  hypothetical protein  32.9 
 
 
408 aa  82.8  1e-14  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0942983  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2285  Protein of unknown function DUF2029  28.48 
 
 
463 aa  65.5  2e-09  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.467092  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3880  putative conserved membrane protein  29.94 
 
 
375 aa  60.8  5e-08  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00561968 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>