More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0066 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_0066  chromate transporter  100 
 
 
382 aa  727  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4579  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  70.18 
 
 
379 aa  495  1e-139  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.294433 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1382  chromate transporter  69.41 
 
 
376 aa  476  1e-133  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.237324  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2663  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  57.84 
 
 
386 aa  374  1e-102  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  1.35911e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2855  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  52.25 
 
 
404 aa  347  2e-94  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.694049 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0728  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  50 
 
 
387 aa  339  4e-92  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.318998  normal  0.0943546 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0699  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  49.61 
 
 
387 aa  339  6e-92  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2688  chromate transporter  56.35 
 
 
378 aa  338  7e-92  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1321  chromate transporter  51.89 
 
 
379 aa  337  2e-91  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4416  chromate transporter  45.07 
 
 
376 aa  323  4e-87  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3048  chromate transporter  47.63 
 
 
393 aa  321  1e-86  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2467  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  51.18 
 
 
391 aa  320  3e-86  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3318  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  47.78 
 
 
393 aa  312  6e-84  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.966219 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3947  chromate transporter, chromate ion transporter family  48.67 
 
 
389 aa  312  6e-84  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.222583  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2996  chromate transporter  44.88 
 
 
376 aa  308  1e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.000942409  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3775  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  40.54 
 
 
352 aa  199  5e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.555488 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3378  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  32.89 
 
 
392 aa  190  4e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0084  chromate ion transporter protein ChrA  35.99 
 
 
396 aa  189  6e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1563  chromate resistance transport protein  35.99 
 
 
396 aa  188  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0067  chromate ion transporter protein ChrA  35.99 
 
 
396 aa  188  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2155  chromate transporter, permease component  33.16 
 
 
385 aa  186  5e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0073  chromate resistance transport protein  37.85 
 
 
396 aa  186  6e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2447  chromate transporter  34.22 
 
 
397 aa  185  1e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3865  chromate transporter  35.71 
 
 
390 aa  185  1e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0842  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  32.89 
 
 
395 aa  184  3e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.530668  normal  0.664708 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5053  chromate transporter  36.34 
 
 
392 aa  183  5e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.568452  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3198  chromate transporter  34.88 
 
 
392 aa  182  1e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0390  chromate transporter  39.4 
 
 
383 aa  179  7e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.780475  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5139  chromate transporter  34.47 
 
 
394 aa  177  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.396318  normal  0.758776 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6202  chromate transporter  35.38 
 
 
401 aa  177  3e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0320947 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2533  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  44.15 
 
 
348 aa  177  4e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2826  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  34.85 
 
 
382 aa  175  1e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2622  chromate transporter  31.28 
 
 
393 aa  174  2e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3251  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  35.36 
 
 
390 aa  174  3e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1521  chromate transporter  35.66 
 
 
401 aa  172  6e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.404287  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1206  chromate transporter  33.07 
 
 
398 aa  172  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.405124  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3574  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  35.65 
 
 
390 aa  171  3e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.851055 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0555  chromate transporter  34.77 
 
 
401 aa  166  5e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0311274 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0924  chromate transporter  39.21 
 
 
358 aa  162  6e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.376436 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1803  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  34.55 
 
 
400 aa  162  7e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5590  chromate transporter  33.86 
 
 
390 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5954  chromate transporter  33.86 
 
 
390 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0766957 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6455  chromate transporter  34.12 
 
 
390 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0092  chromate transporter  32.32 
 
 
428 aa  157  4e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  unclonable  1.19825e-05 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2503  chromate transporter  31.94 
 
 
399 aa  154  2e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.124594 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2247  chromate transporter  32.79 
 
 
453 aa  151  1e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0538278  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3911  chromate transporter  34.17 
 
 
388 aa  150  2e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00929243  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5157  chromate transporter  31.9 
 
 
456 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3384  chromate transporter  31.54 
 
 
456 aa  150  4e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00295991 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3820  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  36.73 
 
 
395 aa  149  9e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0284197  normal  0.135489 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11551  chromate transporter  31.47 
 
 
412 aa  146  7e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0167365 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0443  chromate transporter  31.1 
 
 
412 aa  144  2e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4365  chromate transporter  31.78 
 
 
455 aa  142  8e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.6524  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2144  chromate transporter  29.31 
 
 
447 aa  142  8e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2460  chromate transporter  34.63 
 
 
388 aa  142  1e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  4.03685e-05 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1938  chromate transporter  32.46 
 
 
430 aa  142  1e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.275877  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2556  chromate transporter  29.59 
 
 
450 aa  141  2e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0100116 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5371  chromate ion transporter  29.52 
 
 
393 aa  140  4e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0754  chromate transporter  33.6 
 
 
403 aa  140  5e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.442695  normal  0.163948 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2526  CHR transporter  30.91 
 
 
445 aa  139  7e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0316  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  34.87 
 
 
447 aa  139  7e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0450  chromate transporter  30.37 
 
 
456 aa  139  7e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5759  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  30.46 
 
 
457 aa  139  8e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.628575  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3159  chromate transporter  29 
 
 
450 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.896141  normal  0.125861 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3555  chromate transporter  30.97 
 
 
454 aa  138  1e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2178  chromate transporter  32.57 
 
 
415 aa  138  2e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.177453  normal  0.0225164 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1796  chromate transporter  33.16 
 
 
396 aa  137  3e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2590  chromate transporter  34.41 
 
 
425 aa  137  3e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.215414  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5873  chromate transporter  33.82 
 
 
403 aa  135  1e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.201334  normal  0.305808 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4100  chromate transporter  31.12 
 
 
454 aa  134  2e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.343432 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0797  chromate transporter  32.46 
 
 
451 aa  134  3e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.755683 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4664  chromate transporter  33.16 
 
 
407 aa  134  3e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4771  chromate transporter  33.16 
 
 
407 aa  134  3e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2172  chromate transporter  31.73 
 
 
398 aa  133  5e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.960962  normal  0.873685 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0672  putative chromate transporter  30.72 
 
 
383 aa  133  5e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.33895  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12381  chromate transporter  27.46 
 
 
408 aa  133  6e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2241  chromate transporter  32.53 
 
 
401 aa  132  7e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.132853  hitchhiker  0.00439089 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1891  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  30.17 
 
 
469 aa  132  1e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.861826 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1226  chromate transporter  30.72 
 
 
418 aa  131  2e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.904057 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3160  chromate transporter  28.64 
 
 
383 aa  131  2e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.24892  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4045  chromate transporter  34.01 
 
 
405 aa  131  2e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0092  chromate transporter  32.12 
 
 
412 aa  130  3e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5828  chromate transport protein chrA  30.77 
 
 
463 aa  130  3e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.42625  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0937  chromate transporter  32.75 
 
 
401 aa  130  4e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0890  chromate transporter  30.73 
 
 
402 aa  130  4e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2144  chromate transporter  32.75 
 
 
401 aa  130  4e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2267  chromate transport protein  32.75 
 
 
401 aa  130  4e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5633  chromate ion transporter  28.91 
 
 
393 aa  130  5e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  4.31811e-11 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5295  chromate ion transporter  28.5 
 
 
393 aa  129  9e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01188e-09 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0588  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  30.08 
 
 
407 aa  128  1e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.263065  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5439  chromate ion transporter  29.26 
 
 
393 aa  129  1e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5054  chromate ion transporter  29.26 
 
 
393 aa  129  1e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4899  chromate ion transporter  29.26 
 
 
393 aa  128  2e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1633  chromate transporter  27.7 
 
 
432 aa  127  3e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2674  chromate transporter  26.7 
 
 
416 aa  127  3e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.249269  normal  0.430846 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3067  chromate transporter  30.29 
 
 
452 aa  127  3e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0932406  normal  0.975583 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4665  putative chromate transporter  28.69 
 
 
463 aa  127  4e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.154177  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2332  putative chromate transport protein  30.64 
 
 
417 aa  127  4e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00115086  normal  0.80205 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1753  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  27.75 
 
 
467 aa  127  5e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2449  chromate transporter  32.01 
 
 
411 aa  126  5e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0292465  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>