81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0065 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_0065  hypothetical protein  100 
 
 
473 aa  915  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.701081  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1184  hypothetical protein  41.15 
 
 
465 aa  278  1e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1779  hypothetical protein  41.06 
 
 
474 aa  278  2e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0499  hypothetical protein  39.91 
 
 
442 aa  259  7e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0763  beta-lactamase domain-containing protein  34.79 
 
 
455 aa  254  3e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1687  FAD dependent oxidoreductase  41.15 
 
 
445 aa  250  4e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.434523  normal  0.201156 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2427  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  43.3 
 
 
455 aa  240  4e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.232176  normal  0.116693 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4618  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  39.32 
 
 
883 aa  232  9e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3118  hypothetical protein  39.61 
 
 
469 aa  232  1e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0412381  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1955  hypothetical protein  39.52 
 
 
470 aa  232  1e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2664  hypothetical protein  39 
 
 
466 aa  231  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3175  hypothetical protein  39 
 
 
466 aa  230  3e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.333375  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1413  hypothetical protein  39 
 
 
466 aa  230  3e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.451407  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2576  hypothetical protein  39 
 
 
466 aa  230  3e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2523  hypothetical protein  39 
 
 
466 aa  231  3e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3848  hypothetical protein  39.45 
 
 
469 aa  231  3e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1636  hypothetical protein  39 
 
 
466 aa  230  3e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.117479  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3530  hypothetical protein  36.58 
 
 
445 aa  230  3e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0759  hypothetical protein  38.28 
 
 
455 aa  229  6e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.786998  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5118  hypothetical protein  37.42 
 
 
444 aa  224  2e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.917814  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2506  hypothetical protein  41.5 
 
 
462 aa  221  2e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3286  hypothetical protein  36.03 
 
 
466 aa  220  4e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.694377  normal  0.162486 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3948  hypothetical protein  35.95 
 
 
473 aa  219  8e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16190  hypothetical protein  36.71 
 
 
470 aa  219  9e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.326397  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3307  hypothetical protein  35.56 
 
 
471 aa  214  2e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3458  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.74 
 
 
453 aa  213  6e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.436975  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3249  hypothetical protein  35.19 
 
 
467 aa  212  1e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6633  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  38.44 
 
 
468 aa  210  3e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0685536 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3468  hypothetical protein  34.48 
 
 
467 aa  205  1e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.343102  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2371  hydroxyacylglutathione hydrolase  37.37 
 
 
475 aa  204  4e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.447406  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3277  hydroxyacylglutathione hydrolase  36.17 
 
 
443 aa  200  4e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03362  putative secreted protein  37.13 
 
 
471 aa  197  2e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0229987  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3604  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family  38.01 
 
 
460 aa  196  9e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0606198  normal  0.410787 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2156  FAD dependent oxidoreductase  33.12 
 
 
480 aa  192  1e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1051  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family  33.47 
 
 
474 aa  190  6e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.169159 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1700  StAR  33.98 
 
 
479 aa  188  2e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.91604  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3720  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  36.3 
 
 
460 aa  185  1e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.481201  normal  0.0318368 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3411  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  36.3 
 
 
460 aa  185  1e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.574536 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03231  hypothetical protein  35.1 
 
 
464 aa  185  2e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2138  hypothetical protein  40.06 
 
 
1751 aa  182  8e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0771  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.54 
 
 
481 aa  179  1e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.13756 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2050  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  30.19 
 
 
482 aa  177  5e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.765527  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4518  FAD dependent oxidoreductase  33.77 
 
 
485 aa  175  2e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.42013 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5579  hypothetical protein  29.78 
 
 
456 aa  172  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5466  hypothetical protein  30.88 
 
 
499 aa  169  1e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.1846  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6552  hypothetical protein  29.33 
 
 
453 aa  167  3e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0462223  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6060  hypothetical protein  31.45 
 
 
454 aa  154  2e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4721  FAD dependent oxidoreductase  28.57 
 
 
523 aa  147  6e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.450266  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0311  putative FAD-dependent oxidoreductase protein  31.03 
 
 
478 aa  140  6e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0280  FAD dependent oxidoreductase  31.62 
 
 
478 aa  136  6e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4517  hypothetical protein  29.55 
 
 
466 aa  125  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.198903 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5540  hypothetical protein  24.03 
 
 
506 aa  119  1e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.621882  normal  0.230055 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7141  hypothetical protein  28.57 
 
 
468 aa  113  8e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4369  hypothetical protein  28.91 
 
 
458 aa  107  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.144671 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5992  hypothetical protein  27.12 
 
 
468 aa  105  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5543  hypothetical protein  29.27 
 
 
490 aa  90.9  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.107362 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3524  hypothetical protein  26.68 
 
 
633 aa  77  7e-13  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.284733  normal  0.8933 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11200  hypothetical protein  36.04 
 
 
593 aa  75.1  2e-12  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4223  hypothetical protein  39.45 
 
 
125 aa  74.7  3e-12  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.284789  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1824  hypothetical protein  20.96 
 
 
500 aa  72.8  1e-11  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1859  hypothetical protein  20.96 
 
 
500 aa  72.8  1e-11  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4122  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.15 
 
 
608 aa  71.6  3e-11  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3022  hypothetical protein  23.95 
 
 
507 aa  67  8e-10  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0268135  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1329  hypothetical protein  19.71 
 
 
494 aa  66.6  9e-10  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.230961  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2487  hypothetical protein  28.39 
 
 
477 aa  58.5  3e-07  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00182169 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0276  FAD dependent oxidoreductase  28.72 
 
 
479 aa  56.6  1e-06  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03600  hypothetical protein  31.69 
 
 
651 aa  49.7  0.0001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1782  hypothetical protein  24.62 
 
 
536 aa  50.1  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00432759 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0617  hypothetical protein  25.91 
 
 
624 aa  48.1  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.108776  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3372  hypothetical protein  44.44 
 
 
239 aa  47.8  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17770  hypothetical protein  30.64 
 
 
644 aa  47  0.0007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.413089  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41800  hypothetical protein  26.32 
 
 
615 aa  46.2  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1749  hypothetical protein  22.35 
 
 
534 aa  45.1  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  3.14791e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1963  hypothetical protein  22.35 
 
 
534 aa  45.1  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  3.0745e-07 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1205  hypothetical protein  27.5 
 
 
593 aa  45.1  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.721959  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13438  hypothetical protein  23.45 
 
 
533 aa  45.1  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.729599 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1974  conserved hypothetical protein  21.89 
 
 
534 aa  44.3  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000437192  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01637  conserved protein with FAD/NAD(P)-binding domain  21.89 
 
 
534 aa  44.3  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.395296  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01627  hypothetical protein  21.89 
 
 
534 aa  44.3  0.005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.373231  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4295  FAD dependent oxidoreductase  39.29 
 
 
417 aa  43.5  0.008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000269255  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0823  hypothetical protein  29.2 
 
 
651 aa  43.1  0.01  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>