More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0063 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_0063  major facilitator superfamily protein  100 
 
 
419 aa  798  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.586585  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1007  hypothetical protein  69.93 
 
 
415 aa  538  1e-152  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.767675  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0836  major facilitator superfamily MFS_1  62.59 
 
 
443 aa  404  1e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0425  major facilitator transporter  54.33 
 
 
430 aa  360  4e-98  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0513  major facilitator transporter  54.69 
 
 
430 aa  351  2e-95  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.629333  decreased coverage  0.000815548 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2608  major facilitator superfamily MFS_1  48.33 
 
 
426 aa  327  3e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.669442  normal  0.388396 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4706  major facilitator superfamily MFS_1  47.09 
 
 
445 aa  326  4e-88  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.93667 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3555  major facilitator superfamily MFS_1  46.06 
 
 
449 aa  311  1e-83  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.194127  normal  0.458265 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33800  Major Facilitator Superfamily transporter  47.46 
 
 
505 aa  308  1e-82  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.714924  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1264  major facilitator superfamily MFS_1  44.15 
 
 
422 aa  300  4e-80  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.62642  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0499  major facilitator superfamily MFS_1  45.61 
 
 
436 aa  293  5e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0294365  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4653  major facilitator superfamily MFS_1  43.6 
 
 
438 aa  287  2e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.689399  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0261  major facilitator superfamily MFS_1  46.4 
 
 
438 aa  286  7e-76  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0905059 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0850  major facilitator superfamily MFS_1  47.06 
 
 
408 aa  285  8e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.427056  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1719  major facilitator superfamily MFS_1  41.4 
 
 
447 aa  285  1e-75  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4774  major facilitator transporter  44.01 
 
 
443 aa  281  1e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4618  major facilitator transporter  45.09 
 
 
426 aa  280  4e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2780  major facilitator superfamily MFS_1  43.13 
 
 
423 aa  278  2e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.018642 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0832  major facilitator superfamily MFS_1  46.6 
 
 
443 aa  267  3e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.533006  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10460  Major Facilitator Superfamily transporter  44.66 
 
 
450 aa  262  8e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.283421  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3197  major facilitator superfamily MFS_1  45.97 
 
 
427 aa  241  2e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  decreased coverage  3.92196e-07 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3075  major facilitator transporter  43.75 
 
 
423 aa  231  2e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0830  major facilitator superfamily MFS_1  36.1 
 
 
422 aa  211  3e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0559019  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2356  major facilitator superfamily MFS_1  36.03 
 
 
426 aa  203  4e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4356  major facilitator superfamily MFS_1  38.29 
 
 
388 aa  194  3e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.510834  normal  0.27139 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4368  major facilitator superfamily permease  37.63 
 
 
431 aa  191  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1693  major facilitator superfamily MFS_1  37.56 
 
 
422 aa  191  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00531073  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6079  hypothetical protein  34.41 
 
 
420 aa  184  2e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.533874  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1572  major facilitator transporter  35.24 
 
 
415 aa  181  3e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.58248  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2863  major facilitator superfamily MFS_1  37.62 
 
 
445 aa  169  6e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.147146 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0098  major facilitator superfamily MFS_1  28.77 
 
 
428 aa  168  1e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2647  major facilitator transporter  33.99 
 
 
524 aa  168  2e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1388  hypothetical protein  33.08 
 
 
404 aa  160  3e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1608  hypothetical protein  33.08 
 
 
404 aa  158  1e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4246  major facilitator transporter  33.66 
 
 
415 aa  157  3e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000179551  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49890  membrame protein  29.81 
 
 
454 aa  140  4e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17670  protein of unknown function (DUF894)  36.9 
 
 
343 aa  139  9e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2972  major facilitator transporter  29.38 
 
 
415 aa  136  7e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0069  major facilitator superfamily MFS_1  29.56 
 
 
406 aa  130  3e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4337  major facilitator transporter  29.5 
 
 
414 aa  129  7e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4288  hypothetical protein  28.35 
 
 
433 aa  128  2e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1342  major facilitator superfamily MFS_1  28.02 
 
 
401 aa  128  2e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  hitchhiker  2.456e-07 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3705  major facilitator superfamily MFS_1  27.62 
 
 
411 aa  124  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.224607  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4656  hypothetical protein  27.79 
 
 
427 aa  123  6e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61170  putative transmembrane protein  28.37 
 
 
403 aa  122  1e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0309  drug:proton antiporter  26.8 
 
 
414 aa  120  4e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2733  major facilitator superfamily MFS_1  27.36 
 
 
415 aa  120  5e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.862267  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2622  major facilitator transporter  26.05 
 
 
411 aa  119  7e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4026  major facilitator superfamily MFS_1  28.03 
 
 
416 aa  119  8e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.557727  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0124  major facilitator transporter  29.04 
 
 
403 aa  119  8e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.137137  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3145  major facilitator superfamily MFS_1  26.45 
 
 
440 aa  119  1e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.985088  normal  0.131643 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3776  major facilitator superfamily MFS_1  29.26 
 
 
412 aa  117  3e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0980  major facilitator transporter  30.19 
 
 
413 aa  117  5e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0279  major facilitator transporter  27.27 
 
 
418 aa  116  6e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5268  MFS family transporter  28.77 
 
 
403 aa  116  8e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3228  hypothetical protein  27.99 
 
 
405 aa  115  1e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.65431  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0743  major facilitator transporter  28.87 
 
 
410 aa  115  1e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5333  hypothetical protein  27.37 
 
 
415 aa  115  2e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5212  major facilitator superfamily MFS_1  29.06 
 
 
408 aa  115  2e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0948922  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0424  drug:proton antiporter  27.59 
 
 
407 aa  114  3e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0752  transporter, putative  28.82 
 
 
446 aa  114  4e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00357  drug:proton antiporter  26.82 
 
 
410 aa  112  1e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.018305  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2812  hypothetical protein  25.45 
 
 
399 aa  112  1e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.287004  normal  0.40248 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0591  major facilitator transporter  27.42 
 
 
427 aa  111  2e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.584321  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2285  major facilitator superfamily transporter  28.4 
 
 
455 aa  112  2e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00827549  hitchhiker  0.000379074 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1861  enterobactin exporter EntS  30.81 
 
 
443 aa  112  2e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3729  enterobactin exporter EntS  25.12 
 
 
426 aa  111  2e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.818592  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4151  MFS permease  27.07 
 
 
410 aa  111  3e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10048  putative transporter  26.42 
 
 
424 aa  110  4e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1498  enterobactin exporter EntS  27.35 
 
 
432 aa  110  5e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.201643  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1046  major facilitator transporter  26.92 
 
 
437 aa  110  6e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.340511  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4894  hypothetical protein  26.69 
 
 
412 aa  109  7e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4201  major facilitator superfamily MFS_1  28.78 
 
 
432 aa  109  8e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4311  major facilitator superfamily MFS_1  28.78 
 
 
432 aa  109  8e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.204415  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2480  major facilitator transporter  26.6 
 
 
457 aa  109  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.553694 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3460  major facilitator transporter  26.3 
 
 
421 aa  109  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0454626  hitchhiker  0.00919031 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4751  major facilitator superfamily protein  24.66 
 
 
421 aa  108  2e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.092373  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05067  hypothetical protein  29.5 
 
 
424 aa  108  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.400424 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1327  enterobactin exporter EntS  26.54 
 
 
424 aa  107  3e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00590508  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2101  major facilitator superfamily MFS_1  26.91 
 
 
479 aa  107  5e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3371  major facilitator transporter  30.59 
 
 
413 aa  106  6e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1810  putative transporter  30.31 
 
 
412 aa  106  6e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.923423  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2940  major facilitator superfamily MFS_1  23.7 
 
 
422 aa  104  2e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4652  major facilitator superfamily MFS_1  26.39 
 
 
406 aa  104  3e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4514  major facilitator transporter  26.39 
 
 
406 aa  104  4e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4646  major facilitator transporter  26.11 
 
 
409 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4386  major facilitator transporter  28.29 
 
 
411 aa  103  4e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.291842 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0786  major facilitator transporter  26.67 
 
 
406 aa  103  7e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0472  major facilitator transporter  27.53 
 
 
401 aa  103  8e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.618831  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3952  major facilitator transporter  27.32 
 
 
413 aa  102  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2160  major facilitator superfamily permease  24.16 
 
 
427 aa  102  1e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.797788 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4653  major facilitator superfamily MFS_1  28.15 
 
 
427 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.366185 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1221  major facilitator transporter  24.63 
 
 
451 aa  102  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0719879 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0091  major facilitator superfamily MFS_1  26.6 
 
 
442 aa  101  2e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5805  putative major facilitator superfamily (MFS) transporter  26.12 
 
 
419 aa  101  3e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.774942 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0652  major facilitator transporter  26.37 
 
 
423 aa  101  3e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0291479  normal  0.182714 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2206  major facilitator transporter  27 
 
 
447 aa  100  4e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1952  major facilitator superfamily MFS_1  26.75 
 
 
418 aa  99.8  7e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  25.31 
 
 
440 aa  100  7e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2685  major facilitator superfamily MFS_1  26.36 
 
 
406 aa  99.8  8e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.188987  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>