More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0062 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_0062  major facilitator superfamily protein  100 
 
 
431 aa  810  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.378864  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0062  putative membrane transport protein  74.15 
 
 
418 aa  578  1e-164  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.640827  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1864  major facilitator transporter  38.21 
 
 
417 aa  238  2e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.436032 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3679  major facilitator superfamily MFS_1  39.07 
 
 
410 aa  230  4e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.709991  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0805  major facilitator superfamily MFS_1  35.12 
 
 
459 aa  221  1e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0885  major facilitator transporter  34.16 
 
 
415 aa  192  1e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5208  major facilitator superfamily MFS_1  38.12 
 
 
432 aa  191  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377398  normal  0.900425 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4138  major facilitator superfamily MFS_1  35.54 
 
 
435 aa  177  3e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.496821  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3061  major facilitator superfamily MFS_1  34.46 
 
 
429 aa  171  2e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00310805  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0534  hypothetical protein  33.67 
 
 
412 aa  167  4e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4528  major facilitator superfamily MFS_1  33.09 
 
 
409 aa  155  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.392098 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5551  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 
420 aa  141  2e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.138486  normal  0.597938 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4585  putative membrane transport protein  30.94 
 
 
403 aa  140  4e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00668253  normal  0.163129 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4617  major facilitator superfamily MFS_1  33.1 
 
 
455 aa  134  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.117227  hitchhiker  0.000601374 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0801  major facilitator superfamily MFS_1  30.91 
 
 
442 aa  127  3e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.469185 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0532  major facilitator superfamily MFS_1  30.46 
 
 
428 aa  116  9e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0210  major facilitator superfamily MFS_1  28.88 
 
 
476 aa  115  2e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1486  major facilitator transporter  28.99 
 
 
420 aa  114  3e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.467645  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4887  major facilitator superfamily MFS_1  32.81 
 
 
424 aa  112  1e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1062  major facilitator superfamily MFS_1  30.3 
 
 
423 aa  111  3e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.264864  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4147  H+ antiporter protein  31.4 
 
 
424 aa  106  8e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4301  H+ antiporter protein  31.4 
 
 
424 aa  106  8e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.100469  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0310  major facilitator transporter  28.87 
 
 
443 aa  104  4e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4580  H+ antiporter protein  30.32 
 
 
443 aa  99  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.120622 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4530  major facilitator superfamily MFS_1  29.95 
 
 
444 aa  97.4  4e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2819  major facilitator superfamily MFS_1  30.52 
 
 
462 aa  96.3  9e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  6.30163e-05  hitchhiker  0.00437395 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21930  major facilitator superfamily MFS_1  25.97 
 
 
432 aa  91.7  3e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0427  transporter, putative  22.94 
 
 
412 aa  89.4  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1000  hypothetical protein  28.03 
 
 
418 aa  87.4  5e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00447157 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5069  putative transporter  24.7 
 
 
415 aa  85.9  1e-15  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5073  putative transporter  25.18 
 
 
415 aa  85.1  2e-15  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0684  major facilitator transporter  26.68 
 
 
412 aa  85.1  2e-15  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00476606  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0174  putative transporter  24.28 
 
 
415 aa  84.7  3e-15  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1630  transporter  25.74 
 
 
420 aa  84  5e-15  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1864  putative transporter  25.37 
 
 
420 aa  83.6  6e-15  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.42079e-47 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5040  putative transporter  24.94 
 
 
415 aa  83.6  6e-15  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4800  transporter  24.94 
 
 
415 aa  83.6  6e-15  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5163  transporter  24.94 
 
 
415 aa  83.6  6e-15  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4661  transporter  24.94 
 
 
415 aa  83.6  6e-15  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1940  putative transporter  25.74 
 
 
420 aa  83.6  7e-15  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  5.31086e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4642  transporter  24.94 
 
 
415 aa  83.2  9e-15  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4370  transporter, major facilitator family  22.13 
 
 
410 aa  82.4  1e-14  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  5.0053e-22 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0867  putative membrane transport protein  32.1 
 
 
321 aa  82.8  1e-14  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0875  major facilitator superfamily MFS_1  28.5 
 
 
441 aa  82.8  1e-14  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00780765  normal  0.0882707 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1684  transporter  25.12 
 
 
420 aa  82  2e-14  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1819  transporter  25.12 
 
 
420 aa  82  2e-14  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000952932  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4750  major facilitator transporter  25.18 
 
 
415 aa  80.5  6e-14  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1625  major facilitator transporter  26.53 
 
 
417 aa  80.5  6e-14  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.568704  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1892  transporter, putative  25.25 
 
 
420 aa  80.1  7e-14  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0166254  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2440  major facilitator superfamily MFS_1  32.85 
 
 
424 aa  80.1  8e-14  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.293743  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3024  putative permease  23.97 
 
 
406 aa  79.3  1e-13  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0823  major facilitator superfamily MFS_1  29.44 
 
 
418 aa  79.7  1e-13  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3486  major facilitator transporter  29.41 
 
 
450 aa  78.2  3e-13  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.719238  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3575  major facilitator superfamily MFS_1  30.5 
 
 
416 aa  77.8  3e-13  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4177  major facilitator superfamily MFS_1  26.87 
 
 
476 aa  78.2  3e-13  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.192321  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4222  major facilitator transporter  29.32 
 
 
432 aa  78.2  3e-13  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.399211  hitchhiker  0.00102981 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5067  transporter, putative  24.94 
 
 
415 aa  77.8  4e-13  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2514  major facilitator superfamily MFS_1  27.17 
 
 
439 aa  77  6e-13  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0053  transporter, putative  30.81 
 
 
431 aa  77  7e-13  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1827  putative transporter  24.27 
 
 
420 aa  76.6  8e-13  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1904  amino acid adenylation domain-containing protein  18.26 
 
 
1833 aa  75.9  1e-12  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2206  major facilitator transporter  27.23 
 
 
447 aa  76.3  1e-12  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0087  major facilitator transporter  30.89 
 
 
436 aa  75.5  2e-12  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14790  Major Facilitator Superfamily transporter  30.72 
 
 
464 aa  75.5  2e-12  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.13794 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11210  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 
433 aa  75.5  2e-12  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0476  major facilitator transporter  27.89 
 
 
474 aa  75.1  2e-12  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8887  hypothetical protein  27.38 
 
 
413 aa  75.1  2e-12  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.889317 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4354  major facilitator superfamily MFS_1  26.37 
 
 
431 aa  75.5  2e-12  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.95952  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2435  putative ABC transporter, permease protein  23.86 
 
 
414 aa  75.1  3e-12  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.70932  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3515  putative transporter  24.12 
 
 
420 aa  74.3  3e-12  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2475  major facilitator superfamily MFS_1  29.67 
 
 
494 aa  74.3  4e-12  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.495662  normal  0.811847 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2814  major facilitator superfamily MFS_1  27.86 
 
 
402 aa  74.3  4e-12  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3025  permease, putative  23.79 
 
 
406 aa  74.3  4e-12  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.076608  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0242  putative integral membrane efflux protein  27.06 
 
 
424 aa  74.3  4e-12  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.305732  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2297  putative membrane transport protein  43.4 
 
 
163 aa  73.9  5e-12  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.09765  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4777  major facilitator superfamily MFS_1  30.93 
 
 
414 aa  73.6  6e-12  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.881248  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  26.14 
 
 
440 aa  73.6  7e-12  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0418  major facilitator transporter  26.75 
 
 
426 aa  73.2  8e-12  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.752628 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2380  major facilitator transporter  26.06 
 
 
474 aa  73.2  9e-12  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1224  major facilitator superfamily MFS_1  27.04 
 
 
440 aa  72.4  1e-11  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2576  putative ABC transporter, permease protein  23.47 
 
 
415 aa  72.4  1e-11  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00174173  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1259  major facilitator transporter  30.89 
 
 
491 aa  72.8  1e-11  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0884652  normal  0.0333983 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0692  major facilitator transporter  21.87 
 
 
439 aa  72.8  1e-11  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0395  permease  23.23 
 
 
430 aa  72.8  1e-11  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0177527  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2305  ABC transporter permease  23.39 
 
 
417 aa  72.8  1e-11  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0193471  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0752  transporter, putative  28.84 
 
 
446 aa  72.8  1e-11  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2480  ABC transporter permease  23.39 
 
 
415 aa  72.4  1e-11  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0926781  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2511  ABC transporter, permease protein, putative  24.2 
 
 
414 aa  72.8  1e-11  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00150223  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2679  major facilitator superfamily MFS_1  28.09 
 
 
453 aa  72  2e-11  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  3.22743e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3926  major facilitator transporter  28.12 
 
 
457 aa  72.4  2e-11  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1250  major facilitator superfamily MFS_1  29.51 
 
 
378 aa  71.6  3e-11  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0490  major facilitator superfamily MFS_1  29.6 
 
 
461 aa  71.6  3e-11  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0371  major facilitator transporter  22.44 
 
 
405 aa  71.2  4e-11  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1327  major facilitator superfamily MFS_1  25.12 
 
 
433 aa  71.2  4e-11  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2707  macrolide efflux protein  23.24 
 
 
406 aa  71.2  4e-11  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0968867  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4005  major facilitator superfamily MFS_1  28.8 
 
 
442 aa  70.9  5e-11  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.0701044 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1221  major facilitator transporter  28.77 
 
 
451 aa  70.1  7e-11  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0719879 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1991  major facilitator superfamily MFS_1  24.44 
 
 
450 aa  70.1  8e-11  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.762129  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2255  putative permease  23.54 
 
 
404 aa  70.1  8e-11  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.134353 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0091  major facilitator superfamily MFS_1  29.38 
 
 
442 aa  70.1  8e-11  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>