More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0059 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_0059  peptidylprolyl isomerase  100 
 
 
176 aa  362  2e-99  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.958253  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0105  Peptidylprolyl isomerase  70.86 
 
 
178 aa  261  3e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.268329  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0124  peptidylprolyl isomerase  64.2 
 
 
175 aa  223  1e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.671624  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4444  peptidylprolyl isomerase  64.77 
 
 
175 aa  223  1e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.925229  normal  0.482225 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0045  Peptidylprolyl isomerase  62.09 
 
 
193 aa  213  1e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3069  peptidylprolyl isomerase  61.4 
 
 
174 aa  213  1e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00667109  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0028  Peptidylprolyl isomerase  61.63 
 
 
177 aa  207  6e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.189916  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4996  peptidylprolyl isomerase  65.17 
 
 
176 aa  202  2e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.120878  hitchhiker  0.000125843 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5243  Peptidylprolyl isomerase  60.36 
 
 
174 aa  202  3e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0323546  hitchhiker  0.0050054 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1946  hypothetical protein  56.32 
 
 
188 aa  198  3e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02090  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (rotamase) - cyclophilin family  61.45 
 
 
184 aa  198  4e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.499869  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0057  Peptidylprolyl isomerase  64.97 
 
 
176 aa  197  6e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00710  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (rotamase) - cyclophilin family  57.06 
 
 
176 aa  196  1e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4482  peptidylprolyl isomerase  62.36 
 
 
176 aa  196  2e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0108931 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00260  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (rotamase) - cyclophilin family  65.71 
 
 
182 aa  194  6e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.06558 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1936  hypothetical protein  55.75 
 
 
188 aa  194  8e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0019  Peptidylprolyl isomerase  56.8 
 
 
173 aa  193  1e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.567765  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0022  Peptidylprolyl isomerase  61.27 
 
 
177 aa  192  2e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.721658  normal  0.0469829 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0018  Peptidylprolyl isomerase  56.74 
 
 
179 aa  191  3e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0817  peptidylprolyl isomerase  56.9 
 
 
181 aa  191  5e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.104667  normal  0.714543 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2561  peptidylprolyl isomerase  54.75 
 
 
176 aa  190  7e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0013  Peptidylprolyl isomerase  56 
 
 
181 aa  189  2e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.77678e-13 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0017  peptidylprolyl isomerase  56.9 
 
 
187 aa  188  3e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.516433 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0012  peptidylprolyl isomerase  55.43 
 
 
181 aa  187  5e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0508371  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00130  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (rotamase) - cyclophilin family  53.93 
 
 
179 aa  185  2e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0109  Peptidylprolyl isomerase  61.85 
 
 
182 aa  181  4e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0893  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin-type  54.65 
 
 
178 aa  180  8e-45  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0010  peptidylprolyl isomerase  58.05 
 
 
175 aa  179  2e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0018  peptidylprolyl isomerase  58.05 
 
 
175 aa  179  2e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.381111  normal  0.019468 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0010  peptidylprolyl isomerase  58.05 
 
 
175 aa  179  2e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.121951 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2820  peptidylprolyl isomerase  57.89 
 
 
206 aa  176  1e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.400749  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0294  Peptidylprolyl isomerase  59.65 
 
 
170 aa  176  2e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4763  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2912  Peptidylprolyl isomerase  49.71 
 
 
172 aa  174  4e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.530558  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0012  peptidylprolyl isomerase  60.12 
 
 
180 aa  174  7e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0068  Peptidylprolyl isomerase  58.14 
 
 
178 aa  173  1e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0020  Peptidylprolyl isomerase  58.58 
 
 
173 aa  173  1e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0518  Peptidylprolyl isomerase  50.29 
 
 
172 aa  171  3e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0013  Peptidylprolyl isomerase  56.65 
 
 
182 aa  171  4e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0011  Peptidylprolyl isomerase  58.43 
 
 
179 aa  171  6e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10009  iron-regulated peptidyl-prolyl-cis-trans-isomerase A ppiA  56.65 
 
 
182 aa  170  7e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1668  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  49.15 
 
 
201 aa  168  4e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00512404  normal  0.631105 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1652  peptidylprolyl isomerase  56 
 
 
168 aa  168  4e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2294  Peptidylprolyl isomerase  60.78 
 
 
168 aa  167  6e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0333378  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6492  Peptidylprolyl isomerase  50.88 
 
 
287 aa  166  1e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0164  Peptidylprolyl isomerase  56.74 
 
 
179 aa  166  1e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.299152 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2206  Peptidylprolyl isomerase  60.13 
 
 
168 aa  166  1e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00140  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (rotamase) - cyclophilin family  58.08 
 
 
172 aa  166  2e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.439146  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2157  peptidylprolyl isomerase  56.57 
 
 
168 aa  164  5e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.177975 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0319  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  56.5 
 
 
189 aa  162  3e-39  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.63935  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3601  Peptidylprolyl isomerase  50.29 
 
 
241 aa  162  3e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.840173  hitchhiker  0.00334322 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1854  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  50.29 
 
 
376 aa  162  3e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2580  peptidylprolyl isomerase  48.85 
 
 
266 aa  161  5e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0022  Peptidylprolyl isomerase  55.88 
 
 
177 aa  157  1e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.424958  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0017  peptidylprolyl isomerase  56.65 
 
 
170 aa  152  3e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0498338  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3780  Peptidylprolyl isomerase  55.81 
 
 
228 aa  150  8e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.685255 
 
 
-
 
NC_006684  CNB01790  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, putative  47.95 
 
 
657 aa  149  2e-35  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1444  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  51.63 
 
 
310 aa  148  4e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10708  probable peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  46.55 
 
 
378 aa  144  7e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.11224  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2158  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  45 
 
 
218 aa  142  2e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.130314 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07190  probable peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  50.98 
 
 
310 aa  142  3e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.301434  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2191  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  49.67 
 
 
310 aa  140  7e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00827429  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39722  predicted protein  45.29 
 
 
571 aa  139  3e-32  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.184646 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1852  Peptidylprolyl isomerase  46.67 
 
 
181 aa  135  3e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1591  Peptidylprolyl isomerase  47.16 
 
 
179 aa  131  4e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1165  peptidylprolyl isomerase  45.66 
 
 
156 aa  131  5e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_38525  predicted protein  44.44 
 
 
665 aa  130  1e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2368  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  47.8 
 
 
357 aa  128  3e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0638959  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40159  Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin-type  42.35 
 
 
629 aa  128  5e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.152782  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE00680  conserved hypothetical protein  46.54 
 
 
155 aa  128  5e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.310644  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2367  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  43.86 
 
 
372 aa  127  7e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.153158  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1651  peptidylprolyl isomerase  42.46 
 
 
223 aa  127  8e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.321717  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02546  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  49.02 
 
 
164 aa  125  2e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3653  Peptidylprolyl isomerase  44 
 
 
247 aa  125  3e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  1.57501e-07  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2216  peptidylprolyl isomerase  48.67 
 
 
254 aa  125  4e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  5.98862e-05 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1740  peptidylprolyl isomerase  42.29 
 
 
158 aa  124  6e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1981  Peptidylprolyl isomerase  45.51 
 
 
222 aa  124  9e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.34689 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2433  peptidylprolyl isomerase  43.45 
 
 
174 aa  124  9e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00223401  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0105  Peptidylprolyl isomerase  43.2 
 
 
172 aa  123  1e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0551  peptidylprolyl isomerase  46.47 
 
 
164 aa  123  1e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1482  peptidylprolyl isomerase  42.86 
 
 
376 aa  123  1e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0486  peptidylprolyl isomerase  46.47 
 
 
164 aa  123  2e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC01490  cyclophilin-like peptidyl prolyl cis-trans isomerase, putative  44.38 
 
 
174 aa  122  2e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1136  Peptidylprolyl isomerase  46.05 
 
 
161 aa  122  2e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0175391 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0789  Peptidylprolyl isomerase  47.13 
 
 
163 aa  121  4e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.191731  normal  0.0671641 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00200  conserved hypothetical protein  41.62 
 
 
573 aa  121  5e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0125915  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2219  peptidylprolyl isomerase  43.02 
 
 
254 aa  121  5e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2997  Peptidylprolyl isomerase  42.68 
 
 
169 aa  121  6e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  5.54367e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2207  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  40.22 
 
 
230 aa  121  6e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.554867  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2295  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  40.22 
 
 
230 aa  121  6e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.211892  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1485  peptidylprolyl isomerase  47.3 
 
 
141 aa  120  8e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_18195  Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin-type  41.62 
 
 
160 aa  120  9e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.896835  normal  0.71444 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00380  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G01750)  43.53 
 
 
629 aa  119  2e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.156652 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2391  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  54.36 
 
 
322 aa  119  2e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.820387  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14434  predicted protein  43.2 
 
 
533 aa  118  3e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.191518  normal  0.369132 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04583  Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase D (PPIase D)(Rotamase D)(EC 5.2.1.8) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B4E7]  44.44 
 
 
372 aa  119  3e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0519322  normal  0.28877 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1711  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  41.12 
 
 
195 aa  118  5e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.756281  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1004  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  40.2 
 
 
195 aa  117  7e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00627317  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1982  Peptidylprolyl isomerase  45.51 
 
 
155 aa  117  8e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.336344 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0613  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  47.1 
 
 
202 aa  117  9e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0308143  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0676  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  38.5 
 
 
468 aa  117  1e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00095762  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>