More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0052 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_0052  cell cycle protein  100 
 
 
460 aa  894    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  decreased coverage  0.00121731  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0114  cell division protein FtsW  73.1 
 
 
459 aa  648    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.469585  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0025  cell cycle protein  52.75 
 
 
468 aa  465  9.999999999999999e-131  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0066  cell cycle protein  51.26 
 
 
517 aa  459  9.999999999999999e-129  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5249  cell cycle protein  52.54 
 
 
469 aa  457  1e-127  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.168107 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0028  cell cycle protein  56.42 
 
 
533 aa  451  1e-125  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0173  cell cycle protein  53.38 
 
 
563 aa  448  1e-125  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.821251 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00210  cell elongation-specific peptidoglycan biosynthesis regulator RodA  51.95 
 
 
517 aa  445  1.0000000000000001e-124  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.545954  normal  0.347866 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0021  cell cycle protein  55.05 
 
 
459 aa  441  9.999999999999999e-123  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4433  cell cycle protein  50.74 
 
 
498 aa  432  1e-120  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.552399 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0021  cell cycle protein  51.56 
 
 
496 aa  429  1e-119  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0038  cell cycle protein  54.92 
 
 
473 aa  421  1e-116  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0036  cell cycle protein  49.07 
 
 
659 aa  419  1e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0137  cell cycle protein  50.32 
 
 
493 aa  420  1e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.882839  decreased coverage  0.000566285 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10017  cell division protein rodA  49.89 
 
 
469 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.222067  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0045  cell cycle protein  54.37 
 
 
496 aa  415  9.999999999999999e-116  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.380495  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0050  cell cycle protein  50.31 
 
 
496 aa  412  1e-114  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0074  cell cycle protein  53.19 
 
 
457 aa  413  1e-114  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.206263  normal  0.526199 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0026  cell cycle protein  48.84 
 
 
470 aa  413  1e-114  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0080  cell cycle protein  52.16 
 
 
487 aa  410  1e-113  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00390  cell elongation-specific peptidoglycan biosynthesis regulator RodA  51.29 
 
 
543 aa  411  1e-113  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.476273 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0028  cell cycle protein  49.33 
 
 
476 aa  403  1e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0018  cell cycle protein  52.88 
 
 
470 aa  400  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0026  cell cycle protein  52.88 
 
 
470 aa  400  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.462099  hitchhiker  0.00956397 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0018  cell cycle protein  52.88 
 
 
470 aa  400  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0785065  normal  0.605241 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00210  cell elongation-specific peptidoglycan biosynthesis regulator RodA  50.46 
 
 
463 aa  392  1e-108  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0029  cell cycle protein  55.29 
 
 
494 aa  392  1e-108  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0023  cell cycle protein  47.36 
 
 
486 aa  391  1e-107  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0809  cell cycle protein  51.07 
 
 
470 aa  382  1e-105  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00780  cell division protein RodA  53.54 
 
 
474 aa  384  1e-105  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0023  cell cycle protein  49.74 
 
 
462 aa  380  1e-104  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000166651 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0024  cell cycle protein  47.32 
 
 
487 aa  372  1e-101  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0545169  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0033  cell cycle protein, FtsW/RodA/SpoVE family  44.27 
 
 
493 aa  356  5e-97  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26960  cell elongation-specific peptidoglycan biosynthesis regulator RodA  46.17 
 
 
463 aa  355  1e-96  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.538184  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1380  cell division membrane protein  46.21 
 
 
519 aa  354  2e-96  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6474  cell cycle protein  48.64 
 
 
529 aa  353  5e-96  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0132298 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0030  cell cycle protein  45.73 
 
 
475 aa  332  1e-89  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.36129  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3063  FtsW/RodA/SpoVE family cell cycle protein  44.99 
 
 
480 aa  321  1.9999999999999998e-86  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00913088  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0427  cell division membrane protein  42.89 
 
 
481 aa  298  1e-79  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0023  cell cycle protein  41.9 
 
 
429 aa  294  2e-78  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2306  cell cycle protein  40.93 
 
 
426 aa  273  7e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.186468  hitchhiker  0.000727648 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0015  cell cycle protein  43.16 
 
 
435 aa  270  2.9999999999999997e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1003  cell cycle protein  43.49 
 
 
444 aa  248  2e-64  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3042  Peptidoglycan glycosyltransferase  37.18 
 
 
924 aa  246  4.9999999999999997e-64  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03310  cell division membrane protein  40.39 
 
 
921 aa  243  7e-63  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1344  Peptidoglycan glycosyltransferase  36 
 
 
954 aa  239  8e-62  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.0271008 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27060  cell division membrane protein  36.38 
 
 
933 aa  231  3e-59  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.358527  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0910  cell cycle protein  36.28 
 
 
405 aa  223  4.9999999999999996e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.32654  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0044  cell cycle protein  37.53 
 
 
472 aa  223  7e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3846  cell cycle protein  37.8 
 
 
428 aa  223  8e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.57616  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1055  cell cycle protein  32.33 
 
 
414 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000372052  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1377  cell cycle protein  38.4 
 
 
439 aa  219  6e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3844  cell cycle protein  35.32 
 
 
443 aa  213  4.9999999999999996e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.090229  hitchhiker  0.000109873 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1306  cell cycle protein  33.83 
 
 
472 aa  210  4e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3046  cell cycle protein  34.92 
 
 
422 aa  210  4e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000270462  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1712  cell cycle protein  36.72 
 
 
441 aa  208  1e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0339  cell cycle protein FtsW  33.68 
 
 
409 aa  207  4e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2477  cell cycle protein  35.38 
 
 
399 aa  205  1e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1647  cell cycle protein  37.07 
 
 
480 aa  204  2e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.393395  hitchhiker  0.00916142 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0331  cell cycle protein FtsW  33.68 
 
 
409 aa  204  3e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0578  cell cycle protein  34.77 
 
 
443 aa  204  3e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.212162 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1449  cell cycle protein  35.79 
 
 
463 aa  203  6e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.769758  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0875  cell cycle protein  34.07 
 
 
422 aa  195  2e-48  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1096  cell division protein FtsW  32.18 
 
 
420 aa  159  1e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3785  cell division protein FtsW  34.13 
 
 
423 aa  156  9e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2851  cell division protein FtsW  32.9 
 
 
424 aa  152  1e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1337  penicillin-binding protein transpeptidase  36.88 
 
 
972 aa  151  2e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000416244  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3332  rod shape-determining protein RodA  31.67 
 
 
380 aa  147  5e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00191901  normal  0.82399 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3524  cell division protein FtsW  32.19 
 
 
501 aa  143  6e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.336809  normal  0.579081 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0484  cell cycle protein  31.69 
 
 
509 aa  143  8e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3257  cell division protein FtsW  29.41 
 
 
511 aa  142  9e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.19497  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3319  cell division protein FtsW  29.41 
 
 
511 aa  142  9e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.40135  normal  0.193679 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3268  cell division protein FtsW  29.41 
 
 
511 aa  142  9e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.162204  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3925  cell division protein FtsW  31.83 
 
 
543 aa  142  9.999999999999999e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0424202  normal  0.252874 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2987  cell division protein FtsW  30.45 
 
 
506 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0447497 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1054  cell division protein FtsW  31.58 
 
 
371 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1437  stage V sporulation protein E  32.53 
 
 
367 aa  141  3e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0490  cell division protein FtsW  27.32 
 
 
368 aa  140  7e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.846166  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7278  rod shape-determining protein  33.89 
 
 
387 aa  139  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.161316 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1303  cell division protein FtsW  32.75 
 
 
365 aa  139  1e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09080  stage V sporulation protein E  29.74 
 
 
365 aa  139  2e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.861786  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0842  cell cycle protein  32.89 
 
 
364 aa  137  4e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0411  cell cycle protein  31.47 
 
 
375 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3975  cell division protein FtsW  32.07 
 
 
359 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0507  cell division protein FtsW  26.75 
 
 
368 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2647  cell division protein FtsW  31.75 
 
 
539 aa  135  1.9999999999999998e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4344  rod shape-determining protein RodA  30.56 
 
 
387 aa  133  6e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000124977  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1611  rod shape-determining protein RodA  31.99 
 
 
377 aa  131  3e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.749237  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1389  cell division protein FtsW  33.89 
 
 
385 aa  130  4.0000000000000003e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08840  cell division membrane protein  34.83 
 
 
479 aa  130  4.0000000000000003e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  unclonable  0.00000000221813 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0674  stage V sporulation protein E  29.95 
 
 
367 aa  130  5.0000000000000004e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2127  rod shape-determining protein RodA  30.73 
 
 
365 aa  130  6e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000937002  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3738  stage V sporulation protein E  33.33 
 
 
363 aa  130  7.000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.29605  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1432  cell division protein FtsW  33.56 
 
 
385 aa  129  1.0000000000000001e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2541  rod shape-determining protein RodA  31.25 
 
 
412 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1827  stage V sporulation protein E  28.35 
 
 
374 aa  128  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.914762  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2368  cell cycle protein  26.89 
 
 
389 aa  127  3e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0217329  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3290  cell division protein FtsW  31.01 
 
 
374 aa  127  3e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4012  stage V sporulation protein E  33.33 
 
 
363 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000045407  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1743  cell division protein FtsW  33.11 
 
 
386 aa  127  4.0000000000000003e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0466348  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>