21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0045 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_0045  hypothetical protein  100 
 
 
218 aa  421  1e-117  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0121  hypothetical protein  62.5 
 
 
219 aa  259  3e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0298502  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0084  hypothetical protein  44.83 
 
 
217 aa  119  4e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3204  hypothetical protein  38.27 
 
 
220 aa  112  5e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.20809  unclonable  1.40296e-11 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14460  hypothetical protein  36.92 
 
 
226 aa  96.3  4e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12250  hypothetical protein  36.99 
 
 
228 aa  96.3  4e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0784  hypothetical protein  34.5 
 
 
211 aa  94.4  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0401  hypothetical protein  34.15 
 
 
216 aa  93.2  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0267  hypothetical protein  34.6 
 
 
238 aa  90.1  3e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.202879  normal  0.132358 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5845  hypothetical protein  37.21 
 
 
215 aa  85.5  5e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1385  hypothetical protein  38.24 
 
 
229 aa  83.2  3e-15  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.107247  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3619  hypothetical protein  29.74 
 
 
257 aa  82.8  4e-15  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3587  hypothetical protein  28.7 
 
 
245 aa  70.9  1e-11  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0430  hypothetical protein  31.96 
 
 
227 aa  66.2  4e-10  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.119408 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3324  hypothetical protein  29.05 
 
 
241 aa  66.2  4e-10  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_67545  predicted protein  27.43 
 
 
348 aa  60.1  2e-08  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.301787 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5815  hypothetical protein  31.95 
 
 
215 aa  60.1  2e-08  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.726682  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4823  hypothetical protein  30.85 
 
 
242 aa  57.8  1e-07  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  8.42276e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02330  protein-vacuolar targeting-related protein, putative  31.33 
 
 
386 aa  56.6  3e-07  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05705  Golgi phosphoprotein 3 (GPP34) domain containing protein (AFU_orthologue; AFUA_1G06630)  26.55 
 
 
353 aa  54.7  1e-06  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5198  hypothetical protein  36.56 
 
 
275 aa  49.7  3e-05  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0646774  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>