More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0043 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_0043  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  100 
 
 
292 aa  571  1e-162  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1400  DNA-formamidopyrimidine glycosylase  61.64 
 
 
286 aa  332  3e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.610741  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4501  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  58.56 
 
 
288 aa  323  1e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.352275  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0157  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / formamidopyrimidine-DNA glycosylase  57.34 
 
 
288 aa  318  6e-86  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0158  DNA-formamidopyrimidine glycosylase  55.07 
 
 
295 aa  298  8e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.40669  normal  0.175272 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0214  DNA-formamidopyrimidine glycosylase  55.93 
 
 
284 aa  295  6e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.478341  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1205  DNA-formamidopyrimidine glycosylase  56.44 
 
 
298 aa  294  1e-78  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.218553  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1504  DNA-formamidopyrimidine glycosylase  56.62 
 
 
296 aa  292  5e-78  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.873039  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4883  DNA-formamidopyrimidine glycosylase  52 
 
 
297 aa  290  2e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1539  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / formamidopyrimidine-DNA glycosylase  52.19 
 
 
316 aa  287  1e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0751871  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5005  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  55.29 
 
 
286 aa  286  2e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.952143  hitchhiker  2.88771e-05 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4336  DNA-formamidopyrimidine glycosylase  52.74 
 
 
287 aa  285  8e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0274442  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4716  DNA-formamidopyrimidine glycosylase  52.74 
 
 
287 aa  285  8e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4422  DNA-formamidopyrimidine glycosylase  52.74 
 
 
287 aa  285  8e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.584231 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1852  DNA-formamidopyrimidine glycosylase  52.4 
 
 
287 aa  283  2e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1540  DNA-formamidopyrimidine glycosylase  52.4 
 
 
289 aa  283  3e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000257905 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2873  DNA-formamidopyrimidine glycosylase  54.1 
 
 
302 aa  279  4e-74  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0469723 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4491  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  54.24 
 
 
286 aa  279  5e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.20817 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3349  DNA-formamidopyrimidine glycosylase  49.66 
 
 
290 aa  263  4e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0210  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  48.84 
 
 
294 aa  259  4e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1323  DNA-formamidopyrimidine glycosylase  47.35 
 
 
295 aa  250  2e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01140  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  43.26 
 
 
314 aa  227  1e-58  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0505  DNA-formamidopyrimidine glycosylase  39.87 
 
 
313 aa  150  2e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.520915 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1629  DNA-formamidopyrimidine glycosylase  37.71 
 
 
301 aa  148  9e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4070  DNA-formamidopyrimidine glycosylase  39.73 
 
 
321 aa  147  2e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10961  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  53.54 
 
 
166 aa  145  5e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.339126 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4038  DNA-formamidopyrimidine glycosylase  39.39 
 
 
321 aa  145  7e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1111  DNA-formamidopyrimidine glycosylase  39.73 
 
 
281 aa  145  8e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0985  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / formamidopyrimidine-DNA glycosylase  37.25 
 
 
299 aa  144  2e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000818098 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3929  formamidopyrimidine-DNA glycosylase / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  38.38 
 
 
320 aa  138  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.143589  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1023  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  31.56 
 
 
269 aa  119  8e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3094  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  32.29 
 
 
284 aa  116  5e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.566843  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0997  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  33.45 
 
 
271 aa  115  1e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1598  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  30.21 
 
 
277 aa  115  1e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.234596  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2672  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  29.97 
 
 
274 aa  112  6e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  8.21198e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0399  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  27.34 
 
 
272 aa  112  9e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4416  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  28.82 
 
 
276 aa  109  7e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.192339  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1584  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  34.38 
 
 
275 aa  108  8e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.364573  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4711  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  29.07 
 
 
276 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0250584  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4717  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  29.07 
 
 
276 aa  107  3e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.816439  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1891  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  25.76 
 
 
295 aa  107  3e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4696  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  29.07 
 
 
276 aa  106  4e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0105721  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2416  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  28.18 
 
 
275 aa  106  4e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0238736 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0542  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  29.07 
 
 
276 aa  106  5e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.149234  hitchhiker  3.0206e-14 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4701  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  29.07 
 
 
276 aa  105  6e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.00822e-32 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2433  formamidopyrimidine-DNA glycosylase / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  31.42 
 
 
278 aa  106  6e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.255932  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4316  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  29.07 
 
 
276 aa  105  6e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.703186  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4481  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  29.07 
 
 
276 aa  105  6e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04870  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  29.02 
 
 
274 aa  105  6e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.75141e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4830  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  29.07 
 
 
276 aa  105  6e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0261944  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4327  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  29.07 
 
 
276 aa  105  6e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1840  formamidopyrimidine-DNA glycosylase / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  30.88 
 
 
274 aa  105  9e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.649087  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0616  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  28.32 
 
 
274 aa  105  1e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4191  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  31.94 
 
 
282 aa  104  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0450  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  31.23 
 
 
270 aa  104  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12939  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  32.43 
 
 
289 aa  104  2e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.598328  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5102  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  28.18 
 
 
277 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5429  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  31.51 
 
 
276 aa  104  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1266  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  30.24 
 
 
272 aa  104  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00278648  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2469  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  30.34 
 
 
273 aa  104  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  3.27901e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04670  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  31.23 
 
 
270 aa  104  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1158  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  25.26 
 
 
271 aa  103  3e-21  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.384452  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1140  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  34.12 
 
 
291 aa  103  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.182904  normal  0.0110455 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4028  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  33.66 
 
 
292 aa  103  4e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0334  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  25.08 
 
 
293 aa  102  6e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1206  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / formamidopyrimidine-DNA glycosylase  31.34 
 
 
267 aa  102  7e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000328954  normal  0.0411335 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3271  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  29.55 
 
 
276 aa  102  7e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00866988  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0599  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  28.32 
 
 
274 aa  102  8e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1178  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  33.91 
 
 
287 aa  101  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.437814  hitchhiker  5.09999e-05 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1198  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / formamidopyrimidine-DNA glycosylase  29.76 
 
 
270 aa  102  1e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1246  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  26.67 
 
 
276 aa  101  1e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  3.22623e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0788  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  30.42 
 
 
274 aa  101  1e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03541  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  23.86 
 
 
292 aa  100  3e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1170  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  29.76 
 
 
270 aa  100  4e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  2.20394e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1946  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  32.3 
 
 
273 aa  99.8  5e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0582  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  28.57 
 
 
272 aa  99.8  5e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.985563  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0129  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  27.03 
 
 
282 aa  99.8  5e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.999896  hitchhiker  0.00383485 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1489  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  27.11 
 
 
273 aa  99.8  5e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0461196  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3072  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  30.07 
 
 
271 aa  99  7e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0078  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  27.92 
 
 
271 aa  99.4  7e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0492  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  29.59 
 
 
278 aa  99  8e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.504515  normal  0.245902 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3957  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  29.18 
 
 
269 aa  99  8e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.109519  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3429  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  28.77 
 
 
278 aa  99  8e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4839  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  29.18 
 
 
269 aa  98.2  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  5.2182e-05  hitchhiker  3.79227e-05 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3280  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  35.76 
 
 
295 aa  98.6  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3836  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  31.89 
 
 
283 aa  98.2  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.149309 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4178  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  30 
 
 
293 aa  98.2  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.30748  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1389  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  29.37 
 
 
270 aa  98.6  1e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.316679  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1404  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  30.53 
 
 
276 aa  97.4  2e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2073  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  30.54 
 
 
295 aa  98.2  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.309894  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5289  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  31.94 
 
 
280 aa  97.4  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0955  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  31.4 
 
 
273 aa  97.4  3e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3623  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  31.49 
 
 
272 aa  96.7  4e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0414  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  30.18 
 
 
270 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0162  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  27.62 
 
 
269 aa  96.7  4e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.433253  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03551  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  25.16 
 
 
292 aa  96.7  4e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.669063  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4197  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  30.45 
 
 
270 aa  96.3  5e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2023  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  30.82 
 
 
281 aa  95.9  8e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  5.8867e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1930  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  29.43 
 
 
296 aa  95.5  9e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.20568  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1884  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  30.51 
 
 
285 aa  95.1  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0177136  normal  0.0421989 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>