116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0038 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_0038  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  100 
 
 
151 aa  301  2e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.536506  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0095  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  62.02 
 
 
174 aa  154  3e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3056  putative regulatory protein  48.15 
 
 
160 aa  103  9e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5266  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  41.56 
 
 
204 aa  101  3e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6464  ATP-binding region ATPase domain-containing protein  42.62 
 
 
164 aa  86.3  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.675812 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5025  putative signal transduction histidine kinase  39.52 
 
 
166 aa  82.4  2e-15  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.239464  normal  0.0584008 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0238  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  43.09 
 
 
295 aa  80.9  5e-15  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.112494 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2108  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  42.74 
 
 
151 aa  79  2e-14  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.262944 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4515  hypothetical protein  37.7 
 
 
176 aa  77.4  6e-14  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0168  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  41.53 
 
 
149 aa  72.4  2e-12  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.129671  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6480  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  35.48 
 
 
134 aa  57.8  5e-08  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.903724  normal  0.217215 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1263  response regulator receiver  37.7 
 
 
282 aa  56.6  1e-07  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0593741  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6631  putative signal transduction histidine kinase  40.23 
 
 
135 aa  56.2  2e-07  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0674873 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3501  putative PAS/PAC sensor protein  41.03 
 
 
1225 aa  55.5  3e-07  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.480314  normal  0.404449 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2800  putative signal transduction histidine kinase  41.86 
 
 
135 aa  54.3  5e-07  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.366639  normal  0.788147 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1448  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  45.68 
 
 
164 aa  54.7  5e-07  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0047791  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4605  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  38.46 
 
 
155 aa  54.3  6e-07  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4531  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 
135 aa  53.1  1e-06  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.556785  normal  0.468222 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0104  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  36.36 
 
 
141 aa  52.4  2e-06  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.141556  normal  0.0323603 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1570  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  35.29 
 
 
135 aa  52.4  2e-06  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.196284  normal  0.153025 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0346  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  36.26 
 
 
122 aa  52.8  2e-06  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.108962  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2138  putative serine/threonine kinase anti-sigma factor  34.91 
 
 
155 aa  52.4  2e-06  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0220396  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0374  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  35.58 
 
 
248 aa  52.4  2e-06  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0287  protein phosphatase 2C-like protein  33.85 
 
 
743 aa  51.6  3e-06  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.575817  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4098  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  33.05 
 
 
1045 aa  51.6  3e-06  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.108116 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8587  putative signal transduction histidine kinase  34.44 
 
 
158 aa  51.2  4e-06  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00197112  normal  0.613164 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0014  putative signal transduction histidine kinase  34.51 
 
 
160 aa  51.6  4e-06  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3148  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  31.67 
 
 
146 aa  51.2  4e-06  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00947281  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3607  hypothetical protein  36.13 
 
 
159 aa  51.2  5e-06  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2074  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  36.54 
 
 
136 aa  50.4  7e-06  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148055  normal  0.91426 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8367  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.61 
 
 
251 aa  50.1  1e-05  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5201  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  34.62 
 
 
728 aa  49.3  2e-05  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.171311  normal  0.162808 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0519  putative signal transduction histidine kinase  38.89 
 
 
165 aa  48.9  2e-05  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3632  ATP-binding region ATPase domain protein  32.14 
 
 
161 aa  49.3  2e-05  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  37.66 
 
 
3706 aa  48.5  3e-05  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0429  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  37.89 
 
 
196 aa  48.5  3e-05  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3236  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  34.69 
 
 
137 aa  48.5  3e-05  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2086  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  41.67 
 
 
134 aa  48.9  3e-05  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.019454  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0019  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  35.79 
 
 
255 aa  48.5  3e-05  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2776  hypothetical protein  32.43 
 
 
137 aa  48.9  3e-05  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0097  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 
155 aa  48.1  4e-05  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0115417  normal  0.062689 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4080  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  36.07 
 
 
738 aa  48.1  4e-05  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.32388  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0400  putative signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
203 aa  47.8  5e-05  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1416  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  43.37 
 
 
151 aa  47.8  5e-05  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.034656  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3955  ATP-binding region ATPase domain protein  34.51 
 
 
135 aa  47.8  6e-05  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1067  serine-protein kinase RsbW  19.01 
 
 
160 aa  47  8e-05  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.13388e-38 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0991  serine-protein kinase RsbW  19.01 
 
 
160 aa  47  8e-05  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0927  serine-protein kinase RsbW  19.01 
 
 
160 aa  47  8e-05  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2295  hypothetical protein  34.29 
 
 
200 aa  47.4  8e-05  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.147419  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1158  serine-protein kinase RsbW  19.01 
 
 
160 aa  47  9e-05  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1739  PAS/protein phosphatase 2C-like  34.75 
 
 
817 aa  47  9e-05  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5311  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  32.17 
 
 
952 aa  46.2  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2480  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  39.09 
 
 
159 aa  46.6  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.252056 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2744  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  36.07 
 
 
155 aa  46.6  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.813583  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0912  serine-protein kinase RsbW  19.01 
 
 
160 aa  46.6  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.81084e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0895  serine-protein kinase RsbW  19.01 
 
 
160 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8758  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  30.25 
 
 
192 aa  46.6  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3929  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  34.21 
 
 
176 aa  46.2  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0862817  hitchhiker  0.00846982 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4130  histidine kinase  32.69 
 
 
832 aa  45.4  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1085  serine-protein kinase RsbW  18.31 
 
 
160 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0192  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  32.63 
 
 
177 aa  45.8  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.513716 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2474  hypothetical protein  34.19 
 
 
132 aa  45.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1233  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  41.38 
 
 
151 aa  45.1  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.226283  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1919  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  35.87 
 
 
150 aa  45.1  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5413  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  29.32 
 
 
159 aa  45.1  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0902  serine-protein kinase RsbW  18.31 
 
 
160 aa  44.7  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.954937  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4276  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  28.93 
 
 
180 aa  45.1  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0915518  normal  0.326932 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4348  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  34.48 
 
 
119 aa  44.3  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00391365  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7294  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.86 
 
 
161 aa  44.7  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4668  ATP-binding region ATPase domain protein  29.91 
 
 
148 aa  44.7  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7843  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  32.26 
 
 
137 aa  44.3  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5414  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6225  putative PAS/PAC sensor protein  32.63 
 
 
713 aa  43.9  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1003  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  36.75 
 
 
549 aa  43.9  0.0007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00204881 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4555  signal transduction histidine kinase  31.63 
 
 
369 aa  43.9  0.0008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4271  serine-protein kinase RsbW  17.61 
 
 
160 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0304057  hitchhiker  0.00223112 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1032  serine-protein kinase RsbW  17.61 
 
 
160 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4135  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  30.58 
 
 
188 aa  43.9  0.0009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4525  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  34.17 
 
 
130 aa  43.5  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0777  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  32.2 
 
 
130 aa  43.5  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0574046  hitchhiker  0.00140169 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3058  hypothetical protein  33.04 
 
 
134 aa  43.5  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  5.40346e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2643  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  28.32 
 
 
688 aa  43.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  4.25716e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2297  hypothetical protein  31.86 
 
 
134 aa  43.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  2.00107e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0969  hypothetical protein  34.78 
 
 
144 aa  43.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.645052  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4051  putative serine/threonine kinase anti-sigma factor  26.28 
 
 
281 aa  42.4  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.932154  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34940  fused histidine kinase with GAF domain/SpoIIE-like protein  26.32 
 
 
537 aa  42.4  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.24735  normal  0.897834 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4034  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  31.03 
 
 
129 aa  42.7  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0664  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  31.09 
 
 
147 aa  42.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.535186 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4246  putative signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 
164 aa  42  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.103074 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2844  histidine kinase  31.46 
 
 
794 aa  42  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.27066  normal  0.363063 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0194  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  29.63 
 
 
136 aa  41.6  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4524  protein serine/threonine phosphatase  29.92 
 
 
693 aa  42  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00280283 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4370  putative signal transduction histidine kinase  31.52 
 
 
134 aa  41.6  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1173  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  37.89 
 
 
180 aa  41.2  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0979  hypothetical protein  29.13 
 
 
201 aa  41.2  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.454512  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1779  putative signal transduction histidine kinase  31.37 
 
 
214 aa  41.2  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.144417 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1989  putative PAS/PAC sensor protein  32.32 
 
 
722 aa  41.2  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.965966  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2379  putative serine/threonine kinaseanti-sigma factor  32.08 
 
 
197 aa  41.2  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.084958 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4563  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  26.13 
 
 
286 aa  41.2  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6003  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  30.77 
 
 
616 aa  41.2  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.697266  normal  0.4865 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0743  putative PAS/PAC sensor protein  30.17 
 
 
855 aa  40.8  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.565533 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>