38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0033 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_0033  hypothetical protein  100 
 
 
551 aa  1030  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0137  hypothetical protein  67.47 
 
 
492 aa  364  2e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.788097  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4117  hypothetical protein  39.83 
 
 
519 aa  158  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0423597  normal  0.0290326 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0171  hypothetical protein  41.27 
 
 
473 aa  132  2e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.275729  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16110  hypothetical protein  34.87 
 
 
543 aa  65.5  3e-09  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.141341  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3034  carotene biosynthesis associated membrane protein  30.28 
 
 
505 aa  60.8  7e-08  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1675  hypothetical protein  33.1 
 
 
477 aa  59.3  2e-07  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5158  hypothetical protein  32.43 
 
 
527 aa  55.5  2e-06  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8285  glycosyl transferase family 2  31.75 
 
 
694 aa  54.7  4e-06  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.493669 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2511  hypothetical protein  35.81 
 
 
594 aa  54.3  6e-06  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.966942  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1398  hypothetical protein  32.28 
 
 
486 aa  54.3  6e-06  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2434  hypothetical protein  32.87 
 
 
579 aa  52.4  2e-05  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.347297  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4783  hypothetical protein  32.62 
 
 
557 aa  52.4  2e-05  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  3.50269e-05 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2479  hypothetical protein  32.87 
 
 
579 aa  52.4  2e-05  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0488444  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1555  hypothetical protein  37.63 
 
 
509 aa  51.6  4e-05  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2470  hypothetical protein  32.17 
 
 
579 aa  51.6  4e-05  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2731  hypothetical protein  32.17 
 
 
572 aa  51.2  5e-05  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.05746 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4153  hypothetical protein  35.95 
 
 
539 aa  50.4  7e-05  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5029  hypothetical protein  29.38 
 
 
498 aa  50.4  8e-05  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.220983 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3679  hypothetical protein  32.17 
 
 
551 aa  50.4  8e-05  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.374852  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2974  hypothetical protein  30.07 
 
 
527 aa  50.1  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.152809  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09690  hypothetical protein  30.26 
 
 
551 aa  49.3  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0679613  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2434  hypothetical protein  25 
 
 
518 aa  49.3  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.100673  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0205  hypothetical protein  24.03 
 
 
477 aa  48.9  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3270  hypothetical protein  31.29 
 
 
510 aa  48.1  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3281  hypothetical protein  31.29 
 
 
510 aa  48.1  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.250599  normal  0.624051 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3332  hypothetical protein  31.29 
 
 
510 aa  48.1  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.353009 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2184  hypothetical protein  26.95 
 
 
508 aa  48.1  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.78161e-06 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2274  hypothetical protein  31.4 
 
 
516 aa  48.1  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00405565  normal  0.161762 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09700  hypothetical protein  28.25 
 
 
575 aa  47.8  0.0006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.959759  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3537  hypothetical protein  28.09 
 
 
529 aa  47.4  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0111473  normal  0.391496 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0390  hypothetical protein  24.03 
 
 
485 aa  46.2  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11487  integral membrane protein  31.25 
 
 
591 aa  46.2  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.484043  normal  0.665574 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19870  hypothetical protein  26.94 
 
 
546 aa  44.7  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.000329069  hitchhiker  0.000517384 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12202  integral membrane protein  29.95 
 
 
516 aa  44.3  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0654  hypothetical protein  36.96 
 
 
522 aa  43.9  0.007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07440  hypothetical protein  28.97 
 
 
490 aa  43.9  0.008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.669228  normal  0.060097 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1679  hypothetical protein  26.81 
 
 
517 aa  43.5  0.009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>