118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0025 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_0025  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  100 
 
 
226 aa  450  1e-126  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5629  putative signal transduction histidine kinase  44.44 
 
 
167 aa  112  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.56187 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1968  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  38.55 
 
 
216 aa  103  3e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.075139  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7294  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  41.74 
 
 
161 aa  84.7  1e-15  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0874  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  39.23 
 
 
205 aa  83.6  2e-15  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2307  putative regulator  34.34 
 
 
181 aa  80.1  2e-14  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1173  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  35.86 
 
 
180 aa  79.3  4e-14  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5311  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  38.89 
 
 
952 aa  77.8  1e-13  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2480  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  40.52 
 
 
159 aa  74.3  1e-12  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.252056 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2511  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  40.18 
 
 
130 aa  74.3  2e-12  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.55888  normal  0.653712 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1228  putative signal transduction histidine kinase  40.71 
 
 
169 aa  73.2  3e-12  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.141602 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1752  protein phosphatase 2C-like  37.39 
 
 
591 aa  70.5  2e-11  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4080  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  36.51 
 
 
738 aa  70.1  3e-11  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.32388  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3110  putative PAS/PAC sensor protein  39.52 
 
 
697 aa  69.7  3e-11  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.63551  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1003  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  39.67 
 
 
549 aa  69.7  3e-11  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00204881 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4151  putative signal transduction histidine kinase  38.6 
 
 
183 aa  68.6  9e-11  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1263  response regulator receiver  36.09 
 
 
282 aa  67.4  2e-10  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0593741  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4163  putative PAS/PAC sensor protein  36.64 
 
 
1039 aa  67.4  2e-10  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0226672 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6225  putative PAS/PAC sensor protein  39.09 
 
 
713 aa  67  2e-10  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0400  putative signal transduction histidine kinase  36.91 
 
 
203 aa  65.9  4e-10  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7300  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  36.61 
 
 
573 aa  64.7  1e-09  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1989  putative PAS/PAC sensor protein  33.86 
 
 
722 aa  63.9  2e-09  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.965966  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0519  putative signal transduction histidine kinase  35.65 
 
 
165 aa  63.2  3e-09  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0743  putative PAS/PAC sensor protein  40.57 
 
 
855 aa  62.8  4e-09  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.565533 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6003  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  38.58 
 
 
616 aa  62.4  5e-09  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.697266  normal  0.4865 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4668  ATP-binding region ATPase domain protein  35.71 
 
 
148 aa  62.4  5e-09  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0104  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  37.7 
 
 
141 aa  62  7e-09  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.141556  normal  0.0323603 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4098  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  38 
 
 
1045 aa  62  8e-09  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.108116 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7826  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  34.59 
 
 
152 aa  61.2  1e-08  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8367  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  35.07 
 
 
251 aa  60.1  3e-08  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0892  hypothetical protein  35.71 
 
 
195 aa  59.7  4e-08  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3236  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  39.36 
 
 
137 aa  58.9  6e-08  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0346  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  35.83 
 
 
122 aa  58.2  1e-07  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.108962  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0164  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  36.72 
 
 
174 aa  58.2  1e-07  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4499  ATP-binding region ATPase domain protein  38.53 
 
 
365 aa  57  2e-07  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.000991404  normal  0.031146 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2892  putative serine/threonine kinase anti-sigma factor  31.58 
 
 
202 aa  57.8  2e-07  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.679484 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1739  PAS/protein phosphatase 2C-like  34.38 
 
 
817 aa  57.4  2e-07  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1542  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  40 
 
 
355 aa  56.6  3e-07  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0477003  hitchhiker  0.00647646 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5093  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.64 
 
 
132 aa  56.2  4e-07  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.738847  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35220  PAS domain S-box  36.07 
 
 
771 aa  56.2  4e-07  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8305  putative PAS/PAC sensor protein  39.09 
 
 
528 aa  55.1  9e-07  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.817018 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32040  histidine kinase  33.6 
 
 
156 aa  53.9  2e-06  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.3856  normal  0.302354 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2744  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  32.79 
 
 
155 aa  53.5  3e-06  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.813583  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2379  putative serine/threonine kinaseanti-sigma factor  31.86 
 
 
197 aa  52.8  4e-06  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.084958 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4104  stage II sporulation E family protein  31.17 
 
 
694 aa  52.4  5e-06  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3140  protein serine/threonine phosphatase  33.9 
 
 
745 aa  52.8  5e-06  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.444013  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4051  putative serine/threonine kinase anti-sigma factor  35.51 
 
 
281 aa  52.4  5e-06  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.932154  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1327  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  38.53 
 
 
211 aa  52.4  5e-06  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1833  putative serine/threonine kinase anti-sigma factor  30.94 
 
 
234 aa  51.2  1e-05  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1779  putative signal transduction histidine kinase  34.21 
 
 
214 aa  51.2  1e-05  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.144417 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0121  putative PAS/PAC sensor protein  35.4 
 
 
470 aa  51.2  1e-05  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.660456  normal  0.370084 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2634  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  28.86 
 
 
227 aa  51.2  1e-05  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0287  protein phosphatase 2C-like protein  29.37 
 
 
743 aa  50.4  2e-05  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.575817  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4531  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  32.73 
 
 
135 aa  50.1  3e-05  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.556785  normal  0.468222 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4524  protein serine/threonine phosphatase  32.79 
 
 
693 aa  50.1  3e-05  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00280283 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3501  putative PAS/PAC sensor protein  35.24 
 
 
1225 aa  50.1  3e-05  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.480314  normal  0.404449 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0664  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.64 
 
 
147 aa  49.7  4e-05  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.535186 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6631  putative signal transduction histidine kinase  32.74 
 
 
135 aa  49.3  4e-05  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0674873 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3638  protein serine/threonine phosphatase  36.36 
 
 
693 aa  49.7  4e-05  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.718947  normal  0.379759 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6464  ATP-binding region ATPase domain-containing protein  30 
 
 
164 aa  49.7  4e-05  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.675812 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2641  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.04 
 
 
122 aa  49.3  5e-05  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  1.59202e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0976  hypothetical protein  36.11 
 
 
158 aa  49.3  5e-05  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2843  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  29.32 
 
 
356 aa  49.3  5e-05  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.65443  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7843  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  29.84 
 
 
137 aa  49.3  5e-05  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5414  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7237  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  37.07 
 
 
579 aa  48.5  7e-05  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8758  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  31.3 
 
 
192 aa  48.9  7e-05  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2880  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 
142 aa  48.5  8e-05  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0493061  normal  0.177095 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2536  putative serine/threonine kinase anti-sigma factor  32 
 
 
199 aa  47.8  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5025  putative signal transduction histidine kinase  34.17 
 
 
166 aa  48.1  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.239464  normal  0.0584008 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4515  hypothetical protein  31.93 
 
 
176 aa  48.1  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1945  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  31.45 
 
 
142 aa  47.8  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00291504  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1503  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  31.51 
 
 
192 aa  48.1  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.941649 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0192  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  36.94 
 
 
177 aa  47.4  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.513716 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0838  putative PAS/PAC sensor protein  42.86 
 
 
754 aa  47.8  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0250  PAS containing protein phosphatase 2C-like  27.45 
 
 
753 aa  47.4  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.337993  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2418  protein serine/threonine phosphatase  33.03 
 
 
746 aa  47  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.724517 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1570  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  34.86 
 
 
135 aa  47.4  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.196284  normal  0.153025 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3463  ATP-binding region ATPase domain protein  37.5 
 
 
188 aa  46.6  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.218355 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2966  protein serine/threonine phosphatase  33.03 
 
 
716 aa  46.6  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.451872  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1009  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  27.21 
 
 
743 aa  46.2  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0014  putative signal transduction histidine kinase  36.09 
 
 
160 aa  46.2  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5624  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  30.6 
 
 
143 aa  46.2  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000415643  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1233  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  31.2 
 
 
151 aa  46.2  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.226283  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2138  putative serine/threonine kinase anti-sigma factor  30.83 
 
 
155 aa  45.8  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0220396  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2800  putative signal transduction histidine kinase  32.17 
 
 
135 aa  45.8  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.366639  normal  0.788147 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4525  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  34.41 
 
 
130 aa  45.8  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8587  putative signal transduction histidine kinase  33.85 
 
 
158 aa  45.8  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00197112  normal  0.613164 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0918  putative serine/threonine kinase anti-sigma factor  28.78 
 
 
142 aa  45.8  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.283269  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0429  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 
196 aa  45.8  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2541  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  37.25 
 
 
156 aa  45.8  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.7405  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0097  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  32.74 
 
 
155 aa  45.4  0.0007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0115417  normal  0.062689 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0586  signal transduction histidine kinase, LytS  32.14 
 
 
123 aa  45.1  0.0009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0183303  hitchhiker  0.00998812 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2543  hypothetical protein  32.28 
 
 
155 aa  44.7  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000143777  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2108  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  35.45 
 
 
151 aa  45.1  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.262944 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0391  hypothetical protein  34.83 
 
 
136 aa  44.7  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3782  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  31.4 
 
 
146 aa  44.7  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5201  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  36.52 
 
 
728 aa  44.3  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.171311  normal  0.162808 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0489  putative signal transduction histidine kinase  32.77 
 
 
145 aa  43.5  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2643  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  34.92 
 
 
688 aa  43.9  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  4.25716e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0109  putative PAS/PAC sensor protein  46.15 
 
 
776 aa  44.3  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.310164  normal  0.141702 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>