More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0021 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_0021  periplasmic binding protein  100 
 
 		 321 aa  649    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.36429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34400  ABC-type enterochelin transport system, periplasmic component  56.11 
 
 		 302 aa  349  4e-95  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5028  periplasmic binding protein  55.17 
 
 		 316 aa  335  5.999999999999999e-91  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.690796  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0632  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein  52.88 
 
 		 309 aa  301  1e-80  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2404  periplasmic binding protein  51.34 
 
 		 315 aa  295  5e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0899785  hitchhiker  0.00440693 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3797  periplasmic binding protein  53.85 
 
 		 309 aa  285  5e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0675  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein  51.81 
 
 		 315 aa  285  5e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0362  periplasmic binding protein  43.22 
 
 		 315 aa  283  4.0000000000000003e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3787  periplasmic binding protein  52.82 
 
 		 314 aa  279  4e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2366  periplasmic binding protein  46.8 
 
 		 318 aa  260  3e-68  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.203034  normal  0.10704 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1005  periplasmic binding protein  46.04 
 
 		 341 aa  253  3e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0071  periplasmic binding protein  43.69 
 
 		 317 aa  245  6e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4143  iron chelate ABC transporter periplasmic iron-binding protein  43.69 
 
 		 317 aa  245  6e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0242829  normal  0.0341564 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4091  iron chelate ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  43.69 
 
 		 317 aa  245  6e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1763  periplasmic binding protein  42.9 
 
 		 316 aa  244  9.999999999999999e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.361737  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2035  periplasmic binding protein  42.27 
 
 		 316 aa  241  2e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1354  enterochelin ABC transporter, periplasmic enterochelin-binding protein, authentic frameshift  38.05 
 
 		 330 aa  228  1e-58  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1111  iron chelate ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  39.5 
 
 		 307 aa  225  9e-58  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1928  periplasmic binding protein  39.86 
 
 		 307 aa  208  9e-53  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.967613  normal  0.0105947 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0734  periplasmic binding protein  41.24 
 
 		 348 aa  207  2e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0661  periplasmic binding protein  38.85 
 
 		 354 aa  207  2e-52  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4264  transport system permease protein  44.93 
 
 		 293 aa  205  8e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3079  ABC Fe+3 siderophore transporter, periplasmic substrate-binding protein  43.88 
 
 		 312 aa  202  9e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0300  periplasmic binding protein  40.93 
 
 		 301 aa  200  1.9999999999999998e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1393  periplasmic binding protein  38.99 
 
 		 340 aa  200  3e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0393092  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4396  periplasmic binding protein  40.36 
 
 		 325 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1907  periplasmic binding protein  36.16 
 
 		 350 aa  196  4.0000000000000005e-49  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.217732  normal  0.206334 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2627  periplasmic binding protein  40.91 
 
 		 301 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.358639  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3806  periplasmic binding protein  45.59 
 
 		 297 aa  191  2e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.17678 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2591  ferric siderophore ABC transporter, periplasmic siderophore-binding protein  34.89 
 
 		 340 aa  186  3e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.619611  normal  0.118224 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000332  ferric vibriobactin enterobactin transport system substrate-binding protein VctP  35.23 
 
 		 302 aa  184  1.0000000000000001e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000938047  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1001  vibriobactin and enterobactin ABC transporter, periplasmic vibriobactin/enterobactin-binding protein  34.55 
 
 		 333 aa  185  1.0000000000000001e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000270207  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06135  ABC-type enterochelin transport system periplasmic protein  35.94 
 
 		 302 aa  183  4.0000000000000006e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02106  hypothetical protein  33.23 
 
 		 327 aa  178  1e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3666  periplasmic binding protein  29.47 
 
 		 333 aa  167  2e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.500239  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1626  periplasmic binding protein  29.28 
 
 		 322 aa  166  5.9999999999999996e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3467  periplasmic binding protein  28.53 
 
 		 339 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.010551 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3340  periplasmic binding protein  27.59 
 
 		 339 aa  160  3e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.002385  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0760  periplasmic binding protein  28.4 
 
 		 342 aa  155  1e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0777  periplasmic binding protein  28.4 
 
 		 342 aa  155  1e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0403  transferrin receptor  34.98 
 
 		 347 aa  154  2e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.400692  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1025  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  30.09 
 
 		 348 aa  153  2.9999999999999998e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0273694  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1007  iron-compound ABC transporter, iron-compound-binding protein  33.09 
 
 		 342 aa  140  3e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00224248  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0949  transferrin receptor  27.67 
 
 		 336 aa  131  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0298481  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0634  periplasmic binding protein  28.44 
 
 		 353 aa  124  2e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000010772  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25350  ABC-type enterochelin transport system, periplasmic component  30.03 
 
 		 335 aa  123  4e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5247  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  28.39 
 
 		 337 aa  123  4e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5226  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  28.39 
 
 		 337 aa  123  5e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4953  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  29.94 
 
 		 337 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00660828  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5330  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  27.92 
 
 		 333 aa  120  3e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00008609  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2916  periplasmic binding protein  29.34 
 
 		 337 aa  120  3e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.421383  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4795  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  29.62 
 
 		 337 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000034871  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4815  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  29.62 
 
 		 337 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000198288  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5197  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  29.62 
 
 		 337 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5234  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  27.65 
 
 		 338 aa  117  3e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.153829  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4918  periplasmic binding protein  26.77 
 
 		 337 aa  113  5e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000189068  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0007  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  27.71 
 
 		 339 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2663  periplasmic binding protein  28.39 
 
 		 340 aa  111  2.0000000000000002e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3702  periplasmic binding protein  30.74 
 
 		 329 aa  104  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.312071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1770  periplasmic binding protein  30.69 
 
 		 288 aa  102  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16600  ABC-type enterochelin transport system, periplasmic component  30.45 
 
 		 354 aa  98.2  2e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04580  ABC-type enterochelin transport system, periplasmic component  32 
 
 		 334 aa  97.1  4e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.398248  normal  0.0567003 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0652  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  28.09 
 
 		 322 aa  92  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000476646  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3293  periplasmic binding protein  30.04 
 
 		 288 aa  90.1  4e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.543229  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4685  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  27.78 
 
 		 322 aa  89.4  7e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0132289  hitchhiker  2.7045999999999996e-21 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0581  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  28.09 
 
 		 321 aa  88.6  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000673134  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0615  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  28.09 
 
 		 321 aa  88.6  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000282355  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2011  periplasmic binding protein  29.23 
 
 		 662 aa  88.6  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00756421  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0778  lipoprotein  26.62 
 
 		 316 aa  89  1e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.662712  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30540  ABC-type enterochelin transport system, periplasmic component  29.41 
 
 		 335 aa  87.4  3e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2663  periplasmic binding protein  28.08 
 
 		 330 aa  87  3e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1777  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  27.22 
 
 		 331 aa  86.3  6e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3087  putative iron compound-binding protein  28.94 
 
 		 320 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.32473  hitchhiker  9.18537e-17 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4356  periplasmic binding protein  31.94 
 
 		 324 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.200584  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5173  periplasmic binding protein  27.84 
 
 		 312 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1987  periplasmic binding protein  25.56 
 
 		 324 aa  84  0.000000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000125239  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2264  periplasmic binding protein  26.32 
 
 		 324 aa  83.6  0.000000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4269  periplasmic binding protein  26.21 
 
 		 314 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0364817  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5503  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  27.15 
 
 		 312 aa  83.2  0.000000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5448  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  26.8 
 
 		 312 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3525  periplasmic binding protein  30.2 
 
 		 310 aa  81.6  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.476755  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0743  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  28.67 
 
 		 321 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000897265  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4155  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  25.42 
 
 		 314 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000676883  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5558  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  26.8 
 
 		 311 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0694  putative iron compound-binding protein  25.08 
 
 		 314 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00869259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2078  periplasmic binding protein  27.16 
 
 		 320 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0923581  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5229  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  26.8 
 
 		 314 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0529  periplasmic binding protein  27.33 
 
 		 322 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00029355  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5060  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  26.8 
 
 		 314 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.320975  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5077  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  26.8 
 
 		 314 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5628  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  26.8 
 
 		 314 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0599  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  30.89 
 
 		 324 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.717603  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2237  putative iron compound-binding protein  28.38 
 
 		 305 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0793747  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5472  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  26.8 
 
 		 314 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0683  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  28.33 
 
 		 321 aa  80.1  0.00000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4264  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  30.89 
 
 		 324 aa  80.1  0.00000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2422  periplasmic binding protein  28.11 
 
 		 300 aa  79.7  0.00000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5509  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  26.8 
 
 		 314 aa  79.7  0.00000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0525  iron(III) dicitrate ABC transporter, periplasmic protein  28 
 
 		 321 aa  79.3  0.00000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000268482  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4317  substrate-binding family protein  25.08 
 
 		 314 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000712566  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>