More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0019 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_0019  transport system permease protein  100 
 
 
344 aa  657  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34420  ABC-type enterochelin transport system, permease component  67.31 
 
 
331 aa  386  1e-106  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3799  transport system permease protein  51.17 
 
 
317 aa  294  1e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0634  iron compound ABC transporter, permease protein  51.01 
 
 
317 aa  292  6e-78  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0360  transport system permease protein  46.06 
 
 
323 aa  291  9e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.166825  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0677  iron compound ABC transporter, permease protein  51.01 
 
 
317 aa  291  1e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2402  transport system permease protein  50.6 
 
 
333 aa  289  4e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0334561  hitchhiker  0.00465255 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5026  transport system permease protein  60.98 
 
 
326 aa  283  4e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.337084  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2368  transport system permease protein  51.3 
 
 
335 aa  281  1e-74  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0419043 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0298  transport system permease protein  50.86 
 
 
319 aa  261  9e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3785  transport system permease protein  51.72 
 
 
345 aa  259  5e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1930  transport system permease protein  41.03 
 
 
336 aa  248  1e-64  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.276463  normal  0.0688299 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1007  transport system permease protein  46.1 
 
 
332 aa  244  2e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2625  transport system permease protein  49.06 
 
 
316 aa  243  4e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.544933  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06133  hypothetical protein  43.96 
 
 
316 aa  242  6e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4145  iron chelate ABC transporter permease  44.05 
 
 
335 aa  237  2e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.116139  normal  0.0126806 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0069  transport system permease protein  43.73 
 
 
335 aa  236  4e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4093  iron chelate ABC transporter, permease protein  43.73 
 
 
335 aa  236  4e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.842143  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000330  iron(III) ABC transporter permease protein  41.4 
 
 
316 aa  236  6e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  9.47678e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0659  transport system permease protein  43.45 
 
 
369 aa  234  2e-60  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1352  enterochelin ABC transporter, permease protein  40.19 
 
 
312 aa  230  2e-59  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4398  transport system permease protein  48.43 
 
 
316 aa  230  3e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.210595 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1542  enterochelin ABC transporter, permease protein  39.87 
 
 
312 aa  229  6e-59  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.644944  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1909  transport system permease protein  40.63 
 
 
355 aa  225  8e-58  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.318272  normal  0.0548852 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1395  transport system permease protein  43.4 
 
 
346 aa  224  2e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.587032  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1009  iron compound ABC transporter, permease protein  41.9 
 
 
324 aa  223  3e-57  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0108445  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1765  transport system permease protein  43.96 
 
 
335 aa  222  7e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0506654  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0999  vibriobactin and enterobactin ABC transporter, permease protein  45.3 
 
 
316 aa  219  8e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  3.08675e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4266  hypothetical protein  51.19 
 
 
314 aa  218  9e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2037  transport system permease protein  46.94 
 
 
335 aa  216  4e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0732  transport system permease protein  37.58 
 
 
322 aa  207  2e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0398177  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1113  iron chelate ABC transporter, permease protein  37.38 
 
 
316 aa  204  3e-51  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3704  transport system permease protein  43.37 
 
 
350 aa  202  1e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.287102  normal  0.653673 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2665  transport system permease protein  43.4 
 
 
344 aa  201  1e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30520  ABC-type enterochelin transport system, permease component  40.41 
 
 
415 aa  200  2e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2661  transport system permease protein  36.66 
 
 
352 aa  199  5e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3960  transport system permease protein  46.03 
 
 
314 aa  199  5e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3221  ABC ferric siderophore transporter, inner membrane subunit  46.01 
 
 
314 aa  199  6e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0401  iron compound ABC transporter, permease protein  35.92 
 
 
317 aa  193  4e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1628  transport system permease protein  34.25 
 
 
316 aa  187  2e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.453837  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2914  transport system permease protein  34.04 
 
 
354 aa  184  2e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  6.03005e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5195  iron compound ABC transporter, permease protein  37.5 
 
 
354 aa  184  2e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0009  iron compound ABC transporter, permease protein  37.13 
 
 
354 aa  184  2e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5245  iron compound ABC transporter, permease protein  36.59 
 
 
354 aa  184  3e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5232  iron compound ABC transporter, permease protein  37.5 
 
 
354 aa  184  3e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4793  iron compound ABC transporter, permease  37.5 
 
 
354 aa  183  3e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000230814  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4813  iron compound ABC transporter, permease  37.5 
 
 
354 aa  184  3e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.436223  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4951  iron compound ABC transporter permease  37.5 
 
 
354 aa  183  4e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.489666  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5328  iron compound ABC transporter permease protein  37.5 
 
 
354 aa  183  4e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0636  transport system permease protein  33.54 
 
 
333 aa  182  7e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0103144  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04600  ABC-type enterochelin transport system, permease component  41.08 
 
 
356 aa  182  7e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.28276  normal  0.299561 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0775  transport system permease protein  39.1 
 
 
318 aa  180  3e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.800341  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0758  transport system permease protein  39.1 
 
 
318 aa  180  3e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5224  iron compound ABC transporter, permease protein  35.66 
 
 
354 aa  176  6e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25330  ABC-type enterochelin transport system, permease component  37.61 
 
 
366 aa  171  2e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4916  transport system permease protein  37.45 
 
 
354 aa  167  3e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02107  hypothetical protein  29.41 
 
 
317 aa  162  6e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2593  ferric siderophore ABC transporter, permease protein  34.92 
 
 
313 aa  161  2e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.510431  normal  0.118224 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16580  ABC-type enterochelin transport system, permease component  37.5 
 
 
362 aa  161  2e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3668  transport system permease protein  34.35 
 
 
301 aa  158  1e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3342  transport system permease protein  34.69 
 
 
316 aa  156  4e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00135825  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3469  transport system permease protein  34.35 
 
 
316 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0102454 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1027  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  29.87 
 
 
322 aa  147  3e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00946746  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06008  hypothetical protein  29.69 
 
 
338 aa  74.7  2e-12  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5560  iron compound ABC transporter, permease protein  28.08 
 
 
338 aa  69.7  7e-11  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0154  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  28.99 
 
 
351 aa  69.7  7e-11  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5505  iron compound ABC transporter, permease protein  28.08 
 
 
338 aa  69.3  9e-11  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5079  iron compound ABC transporter, permease  28.42 
 
 
338 aa  69.3  9e-11  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5511  iron compound ABC transporter, permease protein  28.08 
 
 
338 aa  69.3  9e-11  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5474  iron compound ABC transporter, permease protein  28.08 
 
 
338 aa  68.6  1e-10  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5630  iron compound ABC transporter permease protein  28.08 
 
 
338 aa  68.6  1e-10  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5231  iron compound ABC transporter permease  28.08 
 
 
338 aa  68.6  1e-10  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5062  iron compound ABC transporter, permease  28.08 
 
 
338 aa  68.6  1e-10  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1104  iron-hydroxamate transporter permease subunit  29.75 
 
 
694 aa  68.2  2e-10  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1943  transport system permease protein  26.06 
 
 
338 aa  68.6  2e-10  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5446  iron compound ABC transporter, permease protein  27.74 
 
 
338 aa  68.2  2e-10  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2261  iron(III) ABC transporter, permease protein  29.28 
 
 
343 aa  68.6  2e-10  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.618819 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24720  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  25.39 
 
 
362 aa  67.8  3e-10  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0691  iron-dicitrate transporter subunit FecD  28.92 
 
 
318 aa  67.4  3e-10  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0796  ferrichrome transport system, permease protein  25.7 
 
 
337 aa  67.4  3e-10  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.228796  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000331  iron(III) ABC transporter permease protein  24.67 
 
 
289 aa  67.8  3e-10  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  5.24649e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3903  transport system permease protein  32.06 
 
 
338 aa  67  4e-10  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2812  iron-hydroxamate transporter permease subunit  30.15 
 
 
672 aa  67.4  4e-10  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3085  transport system permease protein  28.83 
 
 
346 aa  67  4e-10  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.543898  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0809  putative ferrichrome ABC transporter, permease protein FhuG  25.7 
 
 
337 aa  67  4e-10  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0901321  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1462  transport system permease protein  27.9 
 
 
339 aa  66.6  6e-10  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.868  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1075  putative iron transporter, membrane component  35.66 
 
 
347 aa  66.6  6e-10  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.803098  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3036  transport system permease protein  28.83 
 
 
346 aa  66.2  7e-10  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0278  transport system permease protein  33.86 
 
 
360 aa  65.9  1e-09  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0561654  normal  0.124671 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2408  transport system permease protein  26.78 
 
 
335 aa  65.5  1e-09  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00436362  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1284  transport system permease protein  38.02 
 
 
319 aa  65.9  1e-09  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.348049  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1000  vibriobactin and enterobactin ABC transporter, permease protein  24.18 
 
 
312 aa  65.5  1e-09  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  3.21439e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0415  transport system permease protein  37.5 
 
 
357 aa  65.9  1e-09  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.920967 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4371  transport system permease protein  29.62 
 
 
358 aa  64.7  2e-09  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3505  transport system permease protein  26.76 
 
 
335 aa  64.7  2e-09  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3915  transport system permease protein  32.65 
 
 
360 aa  65.1  2e-09  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.045675  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5747  transport system permease protein  27.56 
 
 
353 aa  64.3  3e-09  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1463  iron compound ABC transporter, permease protein  26.76 
 
 
335 aa  64.3  3e-09  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  3.36086e-05 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3770  iron compound ABC transporter, permease protein  27 
 
 
335 aa  64.3  3e-09  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0552  transport system permease protein  27.46 
 
 
326 aa  64.3  3e-09  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>