72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0012 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_0012  PilT protein domain-containing protein  100 
 
 
133 aa  274  3e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.948131 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4425  PilT domain-containing protein  32.54 
 
 
134 aa  73.6  9e-13  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00042868 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2617  nucleic acid binding protein  29.63 
 
 
134 aa  63.5  8e-10  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.243477 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0505  PilT protein domain protein  32.58 
 
 
131 aa  60.5  8e-09  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1138  PilT domain-containing protein  32.79 
 
 
133 aa  58.2  3e-08  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3905  PilT domain-containing protein  34.07 
 
 
134 aa  58.2  4e-08  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.646522  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2472  virulence associated protein C  28.24 
 
 
133 aa  58.2  4e-08  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00148493  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0602  PilT protein domain protein  32.09 
 
 
135 aa  56.6  1e-07  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.191075  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2936  PilT domain-containing protein  36.43 
 
 
130 aa  55.5  3e-07  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.203821 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0827  PilT protein domain protein  27.64 
 
 
133 aa  55.5  3e-07  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00471695 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1067  PilT protein domain protein  31.3 
 
 
134 aa  54.3  5e-07  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1868  PilT domain-containing protein  25.95 
 
 
133 aa  53.9  8e-07  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  2.12984e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6255  PilT domain-containing protein  32.99 
 
 
135 aa  53.1  1e-06  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0358672  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2557  PilT protein domain protein  30.43 
 
 
135 aa  51.6  3e-06  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.308124  normal  0.19537 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1337  PilT protein domain protein  31.01 
 
 
129 aa  52  3e-06  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.1325  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0478  virulence-associated protein, putative  29.85 
 
 
134 aa  50.1  9e-06  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6878  PilT domain-containing protein  32.63 
 
 
136 aa  50.1  1e-05  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.425666  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3773  hypothetical protein  27.94 
 
 
137 aa  50.1  1e-05  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1484  hypothetical protein  32 
 
 
141 aa  50.1  1e-05  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.174904  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1325  nucleic acid binding protein  26.92 
 
 
133 aa  49.7  1e-05  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  3.54508e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3846  hypothetical protein  28.03 
 
 
139 aa  49.3  2e-05  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.828285 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0638  PilT protein domain protein  29.1 
 
 
136 aa  48.9  3e-05  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1213  virulence associated protein C  34 
 
 
138 aa  48.9  3e-05  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3939  PilT protein domain protein  26.56 
 
 
133 aa  47.8  4e-05  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2412  PilT domain-containing protein  29.55 
 
 
140 aa  47.8  5e-05  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.697673  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0414  PilT protein domain protein  26.06 
 
 
135 aa  47.8  5e-05  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0420  PilT protein domain protein  25.74 
 
 
137 aa  47.4  6e-05  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3732  nucleic acid-binding protein  28.36 
 
 
132 aa  47.8  6e-05  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3988  PilT protein domain protein  26.56 
 
 
133 aa  47.4  7e-05  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0532731 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0926  hypothetical protein  33.33 
 
 
207 aa  46.2  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.437058  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0898  PilT protein domain protein  30.6 
 
 
131 aa  46.6  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.185586  normal  0.0272728 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0688  PilT domain-containing protein  29.29 
 
 
132 aa  46.6  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.442109  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10638  hypothetical protein  30 
 
 
135 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.94146e-14  normal  0.603416 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0795  PilT protein-like protein  34.44 
 
 
95 aa  45.8  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0091  PilT domain-containing protein  30.3 
 
 
132 aa  45.4  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8106  PilT protein domain protein  29.67 
 
 
138 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2719  PilT protein-like  25.37 
 
 
151 aa  45.4  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.116591 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2777  PilT protein domain protein  26.52 
 
 
134 aa  45.8  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2127  vapC protein, putative  22.31 
 
 
133 aa  45.8  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3269  PilT protein-like  27.69 
 
 
133 aa  44.7  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.159462  hitchhiker  0.00995267 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1509  PilT domain-containing protein  28.83 
 
 
147 aa  44.3  0.0006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.203613  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2951  PilT domain-containing protein  29.32 
 
 
136 aa  44.3  0.0006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4147  PilT domain-containing protein  29.6 
 
 
134 aa  43.9  0.0007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.448502  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1461  PilT protein domain protein  33.33 
 
 
134 aa  43.9  0.0008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1063  PilT protein domain protein  27.13 
 
 
139 aa  42.7  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.471234  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2669  PilT protein-like  24.41 
 
 
132 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0691561  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0728  PilT protein domain protein  26.56 
 
 
132 aa  43.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.741529  hitchhiker  8.01582e-05 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2339  PilT protein domain protein  30.88 
 
 
141 aa  43.5  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1433  NtrR protein  27.07 
 
 
140 aa  43.5  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36180  PilT domain-containing protein  27.01 
 
 
136 aa  42  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0154  PilT domain-containing protein  26.81 
 
 
133 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0091  PilT protein-like  36.73 
 
 
144 aa  42.7  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0442  nitrogen regulatory protein NtrR  30 
 
 
134 aa  42.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.315733  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1533  PilT protein domain protein  27.61 
 
 
132 aa  42.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0497484  hitchhiker  0.000597174 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0058  PilT protein domain protein  27.48 
 
 
148 aa  42.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5055  PilT domain-containing protein  27.17 
 
 
133 aa  42.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4437  PilT protein-like  30.88 
 
 
134 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2204  PilT protein domain protein  28.26 
 
 
136 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3757  PilT domain-containing protein  28.46 
 
 
135 aa  42  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00272094  normal  0.0228653 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2061  PilT protein-like  29.17 
 
 
137 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.464796 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0038  PilT domain-containing protein  30.48 
 
 
146 aa  41.2  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3680  PilT protein domain protein  33.33 
 
 
134 aa  41.6  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3320  PilT protein-like  27.74 
 
 
133 aa  41.6  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3729  PilT protein-like  28.15 
 
 
133 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.294534  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0138  PilT domain-containing protein  26.87 
 
 
133 aa  41.2  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12568  hypothetical protein  45.76 
 
 
125 aa  41.2  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.724019  normal  0.141761 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2391  PIN (PilT N terminus) domain  30.77 
 
 
95 aa  40.8  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4624  PilT domain-containing protein  28.91 
 
 
136 aa  40.8  0.007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.723585  normal  0.112001 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1127  PilT domain-containing protein  28.15 
 
 
133 aa  40.4  0.008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.539233 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0151  PilT protein domain protein  28.69 
 
 
137 aa  40.4  0.008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.85559  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1848  PilT protein domain protein  26.72 
 
 
129 aa  40.4  0.009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2366  PilT protein domain protein  26.45 
 
 
137 aa  40  0.009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>