144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0009 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_0009  hypothetical protein  100 
 
 
110 aa  211  3e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0815  hypothetical protein  82.57 
 
 
111 aa  181  4e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0715  hypothetical protein  79.82 
 
 
109 aa  177  5e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4423  hypothetical protein  79.09 
 
 
117 aa  177  6e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05280  hypothetical protein  80.91 
 
 
110 aa  174  5e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.53643  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4957  hypothetical protein  77.98 
 
 
111 aa  172  2e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.0343479 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4238  hypothetical protein  78.18 
 
 
112 aa  171  4e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.12468  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14640  hypothetical protein  78.18 
 
 
111 aa  170  7e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.702088  normal  0.333944 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7600  membrane protein  78.18 
 
 
110 aa  168  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0769625  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2805  hypothetical protein  78.9 
 
 
111 aa  169  2e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5385  hypothetical protein  74.31 
 
 
110 aa  168  2e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3406  hypothetical protein  76.64 
 
 
108 aa  167  4e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.679363  normal  0.282544 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4718  protein of unknown function UPF0060  83.64 
 
 
110 aa  167  5e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0666  hypothetical protein  77.06 
 
 
111 aa  166  1e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.254156  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12657  hypothetical protein  77.78 
 
 
110 aa  165  2e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.62308e-15  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19950  hypothetical protein  74.31 
 
 
112 aa  163  7e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0102643 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3474  protein of unknown function UPF0060  77.06 
 
 
111 aa  162  1e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.395847  normal  0.288197 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3127  hypothetical protein  76.64 
 
 
108 aa  162  2e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.247319  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0931  protein of unknown function UPF0060  75.23 
 
 
109 aa  160  6e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.159877  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3114  hypothetical protein  72.48 
 
 
111 aa  159  1e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0138946 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2786  hypothetical protein  75.7 
 
 
113 aa  157  5e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3233  hypothetical protein  71.3 
 
 
119 aa  157  6e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2550  hypothetical protein  81.72 
 
 
131 aa  154  3e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.201615  normal  0.61856 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2513  hypothetical protein  78.5 
 
 
113 aa  153  1e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.811146  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2558  hypothetical protein  78.5 
 
 
113 aa  153  1e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.743036 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2204  hypothetical protein  68.81 
 
 
110 aa  152  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2162  protein of unknown function UPF0060  72.48 
 
 
113 aa  152  1e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.800491  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0852  protein of unknown function UPF0060  65.05 
 
 
107 aa  135  2e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.990746 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2216  hypothetical protein  62.5 
 
 
103 aa  115  3e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.160487  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1184  hypothetical protein  50.46 
 
 
110 aa  106  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.45839e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3546  protein of unknown function UPF0060  49.52 
 
 
108 aa  105  3e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0982  protein of unknown function UPF0060  51.43 
 
 
112 aa  103  7e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.236233  normal  0.293859 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1681  hypothetical protein  53.85 
 
 
121 aa  101  3e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1507  hypothetical protein  47.75 
 
 
111 aa  99  2e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0118428  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2364  hypothetical protein  50.49 
 
 
108 aa  98.2  3e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2408  hypothetical protein  50.49 
 
 
108 aa  98.2  3e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.130394  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2546  protein of unknown function UPF0060  47.66 
 
 
118 aa  95.5  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.465405 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1682  hypothetical protein  45.87 
 
 
109 aa  94.7  3e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1798  hypothetical protein  46.36 
 
 
110 aa  94.7  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4073  protein of unknown function UPF0060  50.46 
 
 
122 aa  93.6  9e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2715  hypothetical protein  43.93 
 
 
109 aa  92.8  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.858893  normal  0.216037 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0701  hypothetical protein  45.54 
 
 
107 aa  92.8  1e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2942  protein of unknown function UPF0060  41.67 
 
 
109 aa  91.7  4e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.255383  hitchhiker  0.00264399 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1757  hypothetical protein  46.36 
 
 
109 aa  90.5  8e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2845  hypothetical protein  46.36 
 
 
111 aa  90.1  8e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.215126  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1733  hypothetical protein  46.36 
 
 
109 aa  90.5  8e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45111  predicted protein  44.55 
 
 
126 aa  89  2e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.977587  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1139  hypothetical protein  42.86 
 
 
110 aa  87.4  7e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.798922  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3084  hypothetical protein  38.68 
 
 
107 aa  85.9  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.662192  normal  0.35717 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2545  protein of unknown function UPF0060  51.14 
 
 
108 aa  84  6e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.462566 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4363  protein of unknown function UPF0060  44.76 
 
 
110 aa  83.2  1e-15  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.313348  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2533  protein of unknown function UPF0060  48.6 
 
 
108 aa  83.2  1e-15  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  1.16156e-06  normal  0.0524259 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41111  predicted protein  42.59 
 
 
115 aa  82.4  2e-15  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.330048  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2955  hypothetical protein  40.95 
 
 
110 aa  82.8  2e-15  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1018  protein of unknown function UPF0060  37.14 
 
 
106 aa  82  2e-15  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.357312  normal  0.312122 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1170  protein of unknown function UPF0060  39.05 
 
 
106 aa  82.4  2e-15  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.540258  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1498  hypothetical protein  40 
 
 
110 aa  81.3  4e-15  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0278138  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1341  hypothetical protein  39.62 
 
 
126 aa  79.7  1e-14  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.43803 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2087  hypothetical protein  42.45 
 
 
110 aa  79.7  1e-14  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.752744 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2632  hypothetical protein  46 
 
 
112 aa  79.7  1e-14  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.673518 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1668  protein of unknown function UPF0060  41.51 
 
 
110 aa  79  2e-14  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0196  hypothetical protein  36.89 
 
 
107 aa  78.2  4e-14  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.511333  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0916  hypothetical protein  36.36 
 
 
110 aa  78.2  4e-14  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.201272  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5052  hypothetical protein  41.9 
 
 
106 aa  77.4  6e-14  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.597089 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2837  protein of unknown function UPF0060  41.67 
 
 
109 aa  76.3  2e-13  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.578312  normal  0.331063 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25900  hypothetical protein  42.45 
 
 
222 aa  75.9  2e-13  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3077  protein of unknown function UPF0060  45.16 
 
 
109 aa  74.7  4e-13  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0586655 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2554  hypothetical protein  36.79 
 
 
110 aa  74.3  5e-13  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2302  putative transmembrane protein  40.86 
 
 
99 aa  73.9  7e-13  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2004  hypothetical protein  46 
 
 
130 aa  73.9  7e-13  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0347623  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1975  hypothetical protein  38.53 
 
 
108 aa  73.6  9e-13  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1837  hypothetical protein  39.45 
 
 
111 aa  73.2  1e-12  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.39802 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1326  hypothetical protein  39.05 
 
 
105 aa  73.2  1e-12  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.685047  normal  0.260826 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6500  protein of unknown function UPF0060  48.57 
 
 
107 aa  72.4  2e-12  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.813001  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1473  hypothetical protein  38.89 
 
 
111 aa  72.4  2e-12  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2230  hypothetical protein  37.14 
 
 
106 aa  72  2e-12  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2511  hypothetical protein  34.31 
 
 
106 aa  72.4  2e-12  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0462845  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0485  hypothetical protein  35.78 
 
 
108 aa  72.4  2e-12  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.376985  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3331  hypothetical protein  35.58 
 
 
106 aa  72.4  2e-12  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05320  hypothetical protein  42.2 
 
 
110 aa  72.4  2e-12  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0866851  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1656  hypothetical protein  41.18 
 
 
141 aa  71.6  3e-12  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.110388  normal  0.226472 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2370  hypothetical protein  40.57 
 
 
107 aa  71.2  4e-12  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.458203  normal  0.777163 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0232  hypothetical protein  37.61 
 
 
117 aa  71.2  4e-12  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0929  hypothetical protein  42.55 
 
 
106 aa  70.5  7e-12  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.775144 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4032  hypothetical protein  38.1 
 
 
105 aa  70.5  8e-12  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.581742 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4944  hypothetical protein  40.37 
 
 
110 aa  70.1  9e-12  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.194262  normal  0.300598 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3679  hypothetical protein  37.14 
 
 
105 aa  68.9  2e-11  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4105  hypothetical protein  36.7 
 
 
113 aa  68.9  2e-11  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0351  hypothetical protein  36.19 
 
 
110 aa  68.2  4e-11  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1160  hypothetical protein  43.14 
 
 
110 aa  68.2  4e-11  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.760553  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1172  hypothetical protein  43.14 
 
 
110 aa  68.2  4e-11  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0240568  normal  0.121257 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4776  protein of unknown function UPF0060  37.14 
 
 
106 aa  67.8  5e-11  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0366686  hitchhiker  0.00123631 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0587  hypothetical protein  35.29 
 
 
110 aa  67.4  6e-11  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1996  hypothetical protein  37.14 
 
 
106 aa  66.6  1e-10  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.550248  normal  0.0123851 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4131  protein of unknown function UPF0060  39.09 
 
 
110 aa  65.5  3e-10  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.344067  normal  0.23278 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4243  protein of unknown function UPF0060  39.09 
 
 
110 aa  65.5  3e-10  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3409  hypothetical protein  42.31 
 
 
107 aa  64.7  4e-10  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2268  hypothetical protein  39.81 
 
 
111 aa  64.7  4e-10  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.108701  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1247  hypothetical protein  42.31 
 
 
110 aa  64.7  4e-10  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.288271 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4425  hypothetical protein  41.49 
 
 
110 aa  64.3  5e-10  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00189805  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>