61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0005 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_0005  hypothetical protein  100 
 
 
183 aa  348  3e-95  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0232127  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0006  Zn-ribbon-containing possibly RNA-binding protein and truncated derivatives-like protein  72.9 
 
 
206 aa  193  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.358663  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0005  protein of unknown function DUF721  62.75 
 
 
179 aa  165  3e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0005  hypothetical protein  53.7 
 
 
188 aa  141  4e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0005  hypothetical protein  54.36 
 
 
173 aa  132  4e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0499719  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0005  protein of unknown function DUF721  55.12 
 
 
217 aa  124  5e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00382214 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0005  protein of unknown function DUF721  49.19 
 
 
166 aa  117  6e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00040  predicted RNA-binding protein containing Zn ribbon  51.28 
 
 
187 aa  117  1e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0005  protein of unknown function DUF721  57.29 
 
 
117 aa  110  8e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00444406 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0005  hypothetical protein  40.72 
 
 
185 aa  109  2e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.342856  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0005  protein of unknown function DUF721  42.68 
 
 
185 aa  108  3e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.06889e-13 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0005  hypothetical protein  44.03 
 
 
273 aa  107  8e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0987513  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0005  hypothetical protein  50.5 
 
 
201 aa  105  3e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  unclonable  1.27236e-08 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00050  predicted RNA-binding protein containing Zn ribbon  40.45 
 
 
196 aa  105  4e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0006  hypothetical protein  48.62 
 
 
198 aa  105  5e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00159718  hitchhiker  0.00351653 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0005  hypothetical protein  46.55 
 
 
177 aa  103  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.40327 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0005  hypothetical protein  44.88 
 
 
134 aa  103  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.918474  normal  0.25905 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0005  protein of unknown function DUF721  49.57 
 
 
173 aa  102  3e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0005  protein of unknown function DUF721  51.45 
 
 
171 aa  102  3e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0005  protein of unknown function DUF721  50 
 
 
172 aa  102  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.44696  normal  0.799003 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10004  hypothetical protein  43.59 
 
 
187 aa  102  4e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00050  predicted RNA-binding protein containing Zn ribbon  44.78 
 
 
196 aa  101  5e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0005  hypothetical protein  39.41 
 
 
190 aa  101  6e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0013  hypothetical protein  39.41 
 
 
190 aa  101  6e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.104942 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0005  hypothetical protein  39.41 
 
 
190 aa  101  6e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.935209  normal  0.0649143 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0005  protein of unknown function DUF721  49.61 
 
 
207 aa  100  8e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0005  protein of unknown function DUF721  44.14 
 
 
188 aa  100  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0823  hypothetical protein  43.59 
 
 
188 aa  98.6  5e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0008  protein of unknown function DUF721  43.55 
 
 
180 aa  96.7  2e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0005  hypothetical protein  37.79 
 
 
185 aa  96.7  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.731239  normal  0.310544 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0004  hypothetical protein  43.17 
 
 
164 aa  92.4  3e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0005  protein of unknown function DUF721  48.72 
 
 
143 aa  92  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00151548  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00050  predicted RNA-binding protein containing Zn ribbon  46.15 
 
 
217 aa  91.3  6e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00080644  normal  0.335319 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0004  protein of unknown function DUF721  42.75 
 
 
184 aa  91.3  7e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0004  protein of unknown function DUF721  40.31 
 
 
171 aa  87  1e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00476655  normal  0.0907524 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00040  predicted RNA-binding protein containing Zn ribbon  39.05 
 
 
266 aa  86.7  2e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.221602  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0042  hypothetical protein  29.9 
 
 
155 aa  66.6  2e-10  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0638  hypothetical protein  32.32 
 
 
159 aa  54.7  7e-07  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.128267  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3498  protein of unknown function DUF721  28.44 
 
 
153 aa  54.7  7e-07  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.68574e-33 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1433  Zn-ribbon-containing RNA-binding protein  27.46 
 
 
156 aa  53.9  1e-06  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3436  hypothetical protein  28.44 
 
 
151 aa  53.1  2e-06  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00123738  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0005  hypothetical protein  24 
 
 
300 aa  52.8  3e-06  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0643796  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1548  protein of unknown function DUF721  27.27 
 
 
160 aa  51.2  8e-06  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0658767  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06201  hypothetical protein  28.57 
 
 
180 aa  50.4  1e-05  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0388112 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2875  hypothetical protein  32 
 
 
162 aa  50.1  2e-05  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0140441  hitchhiker  1.88483e-05 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3768  hypothetical protein  35.38 
 
 
152 aa  49.7  2e-05  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00373156  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1102  hypothetical protein  29.55 
 
 
155 aa  48.9  4e-05  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  5.65832e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2350  hypothetical protein  27.43 
 
 
153 aa  48.9  4e-05  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.000367866  normal  0.0123481 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3330  hypothetical protein  36.23 
 
 
149 aa  48.1  6e-05  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3502  protein of unknown function DUF721  35.82 
 
 
170 aa  47.8  9e-05  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.428989 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0164  hypothetical protein  42.86 
 
 
185 aa  47  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2226  hypothetical protein  29.49 
 
 
168 aa  45.8  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.16141e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0095  Zn-ribbon-containing protein  32.26 
 
 
101 aa  45.8  0.0004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00142092  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1258  hypothetical protein  31.71 
 
 
169 aa  44.7  0.0007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1595  protein of unknown function DUF721  36.54 
 
 
194 aa  43.5  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.279023  normal  0.215209 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0672  hypothetical protein  26.88 
 
 
100 aa  43.1  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1572  protein of unknown function DUF721  36.54 
 
 
194 aa  43.5  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2009  hypothetical protein  26.97 
 
 
97 aa  42.4  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0095  hypothetical protein  28.81 
 
 
101 aa  42.7  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.437017  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1613  protein of unknown function DUF721  38.46 
 
 
190 aa  42.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00599305 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0004  protein of unknown function DUF721  23.6 
 
 
286 aa  42.4  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000131484  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>