226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_2813 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_2813  hypothetical protein  100 
 
 		 257 aa  508  1e-143  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.893374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3032  allophanate hydrolase subunit 1  53.49 
 
 		 218 aa  169  6e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2948  allophanate hydrolase subunit 1  52.87 
 
 		 218 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.564581 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3082  hypothetical protein  52.87 
 
 		 218 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2423  hypothetical protein  53.11 
 
 		 218 aa  164  9e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3037  hypothetical protein  53.11 
 
 		 218 aa  164  9e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.998817  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6384  hypothetical protein  53.11 
 
 		 218 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3056  allophanate hydrolase subunit 1  53.11 
 
 		 218 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0256997 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0835  hypothetical protein  49.71 
 
 		 218 aa  156  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.473252  hitchhiker  0.00249119 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0820  hypothetical protein  49.71 
 
 		 218 aa  156  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0023  hypothetical protein  54.33 
 
 		 220 aa  156  4e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00309648 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0759  hypothetical protein  49.71 
 
 		 218 aa  156  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0869  hypothetical protein  49.71 
 
 		 218 aa  156  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.360014 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0772  hypothetical protein  49.71 
 
 		 218 aa  156  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.984819 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0008  allophanate hydrolase subunit 1  41.71 
 
 		 228 aa  155  6e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00137026 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3311  hypothetical protein  47.51 
 
 		 218 aa  151  8.999999999999999e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2981  hypothetical protein  47.51 
 
 		 218 aa  151  8.999999999999999e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.78206  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2111  hypothetical protein  47.51 
 
 		 218 aa  151  8.999999999999999e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3367  putative allophanate hydrolase, subunit 1  47.51 
 
 		 218 aa  151  8.999999999999999e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0449  hypothetical protein  47.19 
 
 		 256 aa  151  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2903  allophanate hydrolase subunit 1  59.84 
 
 		 217 aa  150  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.282421 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0266  putative allophanate hydrolase, subunit 1  47.19 
 
 		 256 aa  151  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.251765  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1226  Allophanate hydrolase subunit 1  46.51 
 
 		 218 aa  150  2e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0230  hypothetical protein  46.99 
 
 		 259 aa  150  2e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0254  putative allophanate hydrolase, subunit 1  46.63 
 
 		 256 aa  150  2e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3110  Allophanate hydrolase subunit 1  46.51 
 
 		 218 aa  149  4e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2374  Allophanate hydrolase subunit 1  48.26 
 
 		 215 aa  149  5e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.635342 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1214  allophanate hydrolase subunit 1  46.78 
 
 		 218 aa  149  6e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.491442  normal  0.0321852 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00671  predicted enzyme subunit  46.2 
 
 		 218 aa  148  8e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2925  Allophanate hydrolase subunit 1  46.2 
 
 		 218 aa  148  8e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.401511  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0736  allophanate hydrolase, subunit 1  46.2 
 
 		 218 aa  148  8e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0628  allophanate hydrolase, subunit 1  46.2 
 
 		 218 aa  148  8e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0801  allophanate hydrolase, subunit 1  46.2 
 
 		 218 aa  148  8e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0935394  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00660  hypothetical protein  46.2 
 
 		 218 aa  148  8e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0759  allophanate hydrolase, subunit 1  46.2 
 
 		 218 aa  148  8e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1974  Allophanate hydrolase subunit 1  47.67 
 
 		 215 aa  148  9e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2944  allophanate hydrolase subunit 1  46.2 
 
 		 218 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3741  Allophanate hydrolase subunit 1  56.69 
 
 		 217 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.456378 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0726  allophanate hydrolase, subunit 1  45.61 
 
 		 218 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.385331  normal  0.445001 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2171  hypothetical protein  49.71 
 
 		 215 aa  146  4.0000000000000006e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.452484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0195  hypothetical protein  55.91 
 
 		 217 aa  145  9e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1957  Allophanate hydrolase subunit 1  44.12 
 
 		 218 aa  144  9e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.360214  hitchhiker  0.00204684 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0087  hypothetical protein  49.7 
 
 		 216 aa  144  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.595386  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4367  Allophanate hydrolase subunit 1  55.88 
 
 		 215 aa  142  6e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0012  hypothetical protein  43.35 
 
 		 228 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000230689 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2224  allophanate hydrolase subunit 1  36.73 
 
 		 231 aa  140  1.9999999999999998e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1136  Allophanate hydrolase subunit 1  44.19 
 
 		 218 aa  139  4.999999999999999e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.742505  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2922  Allophanate hydrolase subunit 1  44.51 
 
 		 219 aa  138  8.999999999999999e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.820056  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0478  allophanate hydrolase, subunit 1  42.16 
 
 		 229 aa  136  4e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0062  hypothetical protein  47.93 
 
 		 216 aa  135  6.0000000000000005e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1115  hypothetical protein  42.11 
 
 		 218 aa  135  8e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000190238  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1167  allophanate hydrolase subunit 1  42.11 
 
 		 218 aa  135  8e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000046539  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0010  allophanate hydrolase subunit 1  42.44 
 
 		 226 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000602904 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1255  allophanate hydrolase subunit 1  53.78 
 
 		 218 aa  134  9.999999999999999e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0342486  normal  0.816656 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1100  allophanate hydrolase subunit 1  43.06 
 
 		 217 aa  130  2.0000000000000002e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.724491  normal  0.149569 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2790  Allophanate hydrolase subunit 1  46.86 
 
 		 239 aa  130  2.0000000000000002e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2874  allophanate hydrolase subunit 1  50.42 
 
 		 237 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.480079  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2977  allophanate hydrolase subunit 1  56.52 
 
 		 203 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.358004  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4576  allophanate hydrolase subunit 1  42.78 
 
 		 229 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.179191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0899  Allophanate hydrolase subunit 1  53.42 
 
 		 221 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.605422  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3121  hypothetical protein  48.74 
 
 		 237 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.785464  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2148  hypothetical protein TIGR00370  48.74 
 
 		 237 aa  128  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2882  hypothetical protein  48.74 
 
 		 237 aa  128  9.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0696288  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3097  hypothetical protein  48.74 
 
 		 237 aa  128  9.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.12026  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3102  conserved hypothetical protein TIGR00370  48.74 
 
 		 237 aa  128  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0869  hypothetical protein  42.08 
 
 		 549 aa  128  9.000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3876  allophanate hydrolase subunit 1  41.9 
 
 		 231 aa  128  9.000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.348545  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2849  hypothetical protein  48.74 
 
 		 237 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2810  hypothetical protein  48.74 
 
 		 237 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3120  conserved hypothetical protein TIGR00370  48.74 
 
 		 237 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000284554  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2336  Allophanate hydrolase subunit 1  41.49 
 
 		 230 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3088  conserved hypothetical protein TIGR00370  48.74 
 
 		 237 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1313  allophanate hydrolase subunit 1  42.78 
 
 		 228 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.837273  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5727  allophanate hydrolase subunit 2  43.09 
 
 		 531 aa  126  3e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.506367  normal  0.818149 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4097  allophanate hydrolase subunit 1  42.25 
 
 		 228 aa  127  3e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0199778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0710  Allophanate hydrolase subunit 1  38.69 
 
 		 246 aa  126  3e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00179377  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1801  hypothetical protein  44.07 
 
 		 205 aa  126  3e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.145263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0178  Allophanate hydrolase subunit 1  52.1 
 
 		 242 aa  125  6e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1378  Allophanate hydrolase subunit 1  44.05 
 
 		 222 aa  124  1e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.239875  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2450  allophanate hydrolase subunit 2  42.62 
 
 		 553 aa  123  3e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.76901  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4346  allophanate hydrolase subunit 1  40.59 
 
 		 201 aa  123  4e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6350  Allophanate hydrolase subunit 1  41.12 
 
 		 204 aa  122  6e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1595  allophanate hydrolase subunit 1  46.4 
 
 		 243 aa  122  6e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0025  allophanate hydrolase, subunit 1  47.97 
 
 		 215 aa  121  9e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3511  allophanate hydrolase subunit 2  42.08 
 
 		 539 aa  121  9.999999999999999e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.80956  normal  0.701023 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2062  allophanate hydrolase subunit 1  47.9 
 
 		 233 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.206067  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02000  conserved hypothetical protein TIGR00370  49.58 
 
 		 242 aa  120  3e-26  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.620258 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1700  hypothetical protein  33.72 
 
 		 244 aa  118  9.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1666  hypothetical protein  33.72 
 
 		 244 aa  118  9.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.947071  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0988  allophanate hydrolase subunit 1  40.48 
 
 		 238 aa  117  1.9999999999999998e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0659374  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00390  allophanate hydrolase subunit 1  41 
 
 		 203 aa  117  1.9999999999999998e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.543027 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5847  hypothetical protein  40.22 
 
 		 541 aa  117  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0879773  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1406  allophanate hydrolase subunit 1  41.07 
 
 		 234 aa  117  3e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6832  Allophanate hydrolase subunit 1  44.64 
 
 		 200 aa  116  3e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7657  hypothetical protein  36.78 
 
 		 236 aa  116  3.9999999999999997e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1950  Allophanate hydrolase subunit 1  42.93 
 
 		 233 aa  115  5e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000391255  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1270  Allophanate hydrolase subunit 1  37.72 
 
 		 221 aa  115  6.9999999999999995e-25  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0499  Urea amidolyase-related protein  40 
 
 		 534 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2974  allophanate hydrolase subunit 1  50.89 
 
 		 248 aa  115  7.999999999999999e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0811525  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0521  Allophanate hydrolase subunit 1  48.74 
 
 		 253 aa  115  7.999999999999999e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>