More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_2795 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_2795  outer membrane protein  100 
 
 		 266 aa  538  9.999999999999999e-153  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2454  outer membrane protein  49.74 
 
 		 402 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  46.63 
 
 		 294 aa  161  1e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  47.24 
 
 		 429 aa  159  5e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2377  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)proteins  44.06 
 
 		 427 aa  158  1e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.07612e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  43 
 
 		 319 aa  149  4e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  45.55 
 
 		 447 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0181  OmpA/MotB domain protein  41.67 
 
 		 428 aa  143  3e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000218101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0547  hypothetical protein  35.58 
 
 		 420 aa  142  8e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1423  OmpA/MotB domain-containing protein  43.88 
 
 		 244 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0509995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  48.17 
 
 		 240 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03195  Thrombospondin type 3 repeat:OmpA/MotB  40.31 
 
 		 478 aa  133  3e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.889374  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4294  OmpA/MotB domain-containing protein  46.34 
 
 		 239 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4033  OmpA/MotB domain protein  38.78 
 
 		 374 aa  123  4e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0441  OmpA/MotB domain-containing protein  36.76 
 
 		 417 aa  122  8e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000726931  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1802  OmpA/MotB domain-containing protein  45.83 
 
 		 375 aa  121  9.999999999999999e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000000252189  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1880  outer membrane protein  45.83 
 
 		 375 aa  121  9.999999999999999e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000687097  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0800  OmpA/MotB domain protein  47.13 
 
 		 362 aa  120  1.9999999999999998e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.193954  normal  0.0761778 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02523  OmpA family outer membrane protein  46.24 
 
 		 365 aa  120  3e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.654383  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3804  OmpA/MotB domain protein  38.46 
 
 		 543 aa  119  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3591  HAD family hydrolase  38.86 
 
 		 380 aa  119  6e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000168113  normal  0.23721 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1122  OmpA/MotB domain protein  45.73 
 
 		 264 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0205488  hitchhiker  0.00000560377 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1731  OmpA/MotB domain protein  40.1 
 
 		 623 aa  117  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3656  OmpA/MotB domain-containing protein  36.41 
 
 		 401 aa  117  1.9999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0655983  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3770  OmpA/MotB domain-containing protein  37.57 
 
 		 440 aa  116  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2299  outer membrane porin OprF  39.76 
 
 		 344 aa  115  6e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000300566  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3888  OmpA/MotB domain protein  37.8 
 
 		 544 aa  115  6e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.457406  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1811  OmpA/MotB domain-containing protein  36.73 
 
 		 322 aa  115  8.999999999999998e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000000728339  normal  0.835393 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2436  outer membrane protein  38.46 
 
 		 320 aa  115  8.999999999999998e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2097  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  39.16 
 
 		 344 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.000000182424  decreased coverage  0.00163672 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1143  OmpA/MotB domain-containing protein  40.24 
 
 		 237 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.667913 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1777  OmpF  39.76 
 
 		 344 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000465517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1947  OmpA/MotB domain protein  36 
 
 		 490 aa  114  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.323456  normal  0.0242284 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0154  OmpA/MotB domain protein  40.99 
 
 		 445 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.436369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1607  OmpF family protein  39.76 
 
 		 345 aa  112  6e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00000281488  decreased coverage  0.0000000000176342 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3747  OmpA/MotB family outer membrane protein  36.84 
 
 		 542 aa  112  6e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598443  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2089  OmpF family protein  39.16 
 
 		 344 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437855  normal  0.0407434 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23330  major outer membrane porin OprF  39.16 
 
 		 351 aa  111  1.0000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0169824  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3651  OmpF family protein  39.16 
 
 		 344 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000349757  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1600  OmpF family protein  39.16 
 
 		 344 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000517848  decreased coverage  0.00289016 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1284  OmpA/MotB domain protein  38.62 
 
 		 456 aa  110  3e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1158  OmpA/MotB domain-containing protein  43.9 
 
 		 239 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.112434  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1091  OmpA/MotB domain protein  40.61 
 
 		 375 aa  108  1e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4812  OmpA/MotB domain protein  38.07 
 
 		 1755 aa  107  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2087  OmpA/MotB  46.53 
 
 		 217 aa  107  2e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0313  OmpA/MotB domain-containing protein  45.61 
 
 		 537 aa  107  2e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0125359  hitchhiker  0.00574347 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0697  OmpA/MotB domain-containing protein  37.31 
 
 		 487 aa  107  3e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1805  OmpA/OmpF family outer membrane protein  46.53 
 
 		 217 aa  106  4e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3118  OmpA/MotB domain-containing protein  45.6 
 
 		 242 aa  105  6e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0113937 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3529  outer membrane protein OprF precursor  38.75 
 
 		 350 aa  105  8e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41570  major porin and structural outer membrane porin OprF precursor  38.75 
 
 		 350 aa  105  8e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000484221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0019  OmpA/MotB domain-containing protein  38.31 
 
 		 510 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0746655  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3730  OmpA/MotB domain protein  39.38 
 
 		 440 aa  103  3e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.331233  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4901  hypothetical protein  38.07 
 
 		 1987 aa  103  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.958107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1995  OmpA/MotB domain-containing protein  34.92 
 
 		 388 aa  103  3e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000205838  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1814  OmpA/MotB domain protein  39.41 
 
 		 376 aa  103  4e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000102046  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4718  OmpA/MotB domain-containing protein  51.96 
 
 		 219 aa  103  4e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790715 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2463  OmpA/MotB domain-containing protein  50 
 
 		 218 aa  102  5e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.249955 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1397  OmpA/MotB domain protein  50 
 
 		 218 aa  102  5e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0070  OmpA/MotB domain protein  35.32 
 
 		 458 aa  102  6e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.870169 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0307  OmpA/MotB  41.23 
 
 		 533 aa  101  1e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3279  OmpA/MotB domain-containing protein  50 
 
 		 219 aa  100  2e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.209932  normal  0.606856 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2321  OmpA/MotB domain-containing protein  37.06 
 
 		 727 aa  100  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1157  OmpA/MotB domain-containing protein  41.27 
 
 		 506 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.729214 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1901  OmpA/MotB domain protein  34.22 
 
 		 335 aa  100  3e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000028398  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1220  OmpA/MotB  41.45 
 
 		 231 aa  100  3e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5477  OmpA/MotB domain protein  33.67 
 
 		 637 aa  100  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.650705  normal  0.203536 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0547  OmpA/MotB domain protein  44.25 
 
 		 671 aa  99.8  4e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0210  OmpA/MotB  32.54 
 
 		 314 aa  99.8  4e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0586  OmpA domain-containing protein  33.51 
 
 		 381 aa  99.8  4e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000977039  normal  0.0156715 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2237  putative signal peptide protein  50.98 
 
 		 219 aa  99.4  5e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.237192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1599  outer membrane fibronectin-binding protein  37.06 
 
 		 333 aa  99.4  6e-20  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  unclonable  0.00000000197596  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0280  OmpA family outer membrane protein  41.23 
 
 		 533 aa  99  7e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4295  OmpA/MotB domain-containing protein  38.61 
 
 		 230 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.331314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6431  OmpA/MotB domain protein  31.98 
 
 		 449 aa  97.8  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2146  OmpA/MotB domain-containing protein  41.75 
 
 		 218 aa  97.4  2e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.47635  normal  0.386424 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0127  outer membrane protein  46.72 
 
 		 415 aa  97.8  2e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.017735  normal  0.0709429 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1572  OmpA/MotB  49.02 
 
 		 212 aa  97.4  2e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00161285  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0127  OmpA/MotB domain protein  44.95 
 
 		 364 aa  96.7  3e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1563  OmpA/MotB domain protein  45.1 
 
 		 231 aa  96.7  4e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.398665  normal  0.301983 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2789  OmpA/MotB domain-containing protein  46.08 
 
 		 210 aa  95.9  5e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.000000026968  hitchhiker  0.00127263 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2166  outer membrane protein  41.18 
 
 		 224 aa  95.9  6e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000706819  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2080  OmpA/MotB  31.28 
 
 		 366 aa  95.9  6e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4338  hypothetical protein  45.61 
 
 		 210 aa  95.9  7e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.288471  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50880  hypothetical protein  45.61 
 
 		 210 aa  95.9  7e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000407187 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0310  Type I secretion outer membrane protein, TolC  39.13 
 
 		 607 aa  95.5  8e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120997  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1796  OmpA/MotB  46.08 
 
 		 214 aa  95.5  8e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0221039  unclonable  0.00000303101 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0175  OmpA/MotB family outer membrane protein  42.86 
 
 		 584 aa  95.5  9e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  45.1 
 
 		 230 aa  95.1  1e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0913  outer membrane fibronectin-binding protein  39.51 
 
 		 337 aa  95.1  1e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3151  OmpA/MotB domain-containing protein  41.55 
 
 		 243 aa  94.7  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.857054  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1376  OmpA/MotB domain protein  42.25 
 
 		 468 aa  94.4  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000480584  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  50.96 
 
 		 321 aa  94.4  2e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0675  OmpA  44.95 
 
 		 212 aa  94.4  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0739  outer membrane fibronectin-binding protein  38.27 
 
 		 337 aa  94  2e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.306148  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4115  OmpA/MotB domain protein  43.93 
 
 		 525 aa  94.4  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6364  OmpA/MotB domain-containing protein  43.12 
 
 		 231 aa  94  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.1144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1196  OmpA/MotB domain-containing protein  44.55 
 
 		 459 aa  94.4  2e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2008  outer membrane protein  39.69 
 
 		 509 aa  94.4  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.206588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1654  OmpA/MotB domain-containing protein  43.22 
 
 		 344 aa  94.4  2e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00000122259  normal  0.141809 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>