More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_2782 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_0573  arginyl-tRNA synthetase  66.05 
 
 		 569 aa  724    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2831  arginyl-tRNA synthetase  64.04 
 
 		 593 aa  701    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0153  arginyl-tRNA synthetase  68.28 
 
 		 561 aa  740    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0287  arginyl-tRNA synthetase  60 
 
 		 600 aa  672    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0430  arginyl-tRNA synthetase  63.33 
 
 		 594 aa  717    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0084  arginyl-tRNA synthetase  63.33 
 
 		 594 aa  718    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.72933  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0127  arginyl-tRNA synthetase  65.19 
 
 		 595 aa  724    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2782  arginyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 557 aa  1135    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.535695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1686  arginyl-tRNA synthetase  57.05 
 
 		 575 aa  652    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3099  arginyl-tRNA synthetase  63.33 
 
 		 594 aa  718    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0592  arginyl-tRNA synthetase  63.33 
 
 		 594 aa  718    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.597736  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6262  arginyl-tRNA synthetase  64.06 
 
 		 593 aa  700    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0669  arginyl-tRNA synthetase  65.07 
 
 		 565 aa  734    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2291  arginyl-tRNA synthetase  63.33 
 
 		 594 aa  718    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4230  arginyl-tRNA synthetase  67.16 
 
 		 561 aa  740    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.228794 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0355  arginyl-tRNA synthetase  63.86 
 
 		 594 aa  718    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0137  arginyl-tRNA synthetase  60.91 
 
 		 596 aa  686    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0473  arginyl-tRNA synthetase  62.92 
 
 		 596 aa  701    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.274692 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0773  arginyl-tRNA synthetase  68.38 
 
 		 565 aa  761    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0343  arginyl-tRNA synthetase  64.42 
 
 		 577 aa  721    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.401675  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0385  arginyl-tRNA synthetase  64.22 
 
 		 598 aa  717    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.603012  normal  0.077689 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2673  arginyl-tRNA synthetase  61.96 
 
 		 556 aa  722    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4490  arginyl-tRNA synthetase  68.28 
 
 		 561 aa  776    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.703488 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4245  arginyl-tRNA synthetase  62.24 
 
 		 596 aa  704    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.240551 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2934  arginyl-tRNA synthetase  63.86 
 
 		 593 aa  698    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0602  arginyl-tRNA synthetase  57.65 
 
 		 561 aa  639    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.154913  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0096  arginyl-tRNA synthetase  63.1 
 
 		 602 aa  722    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2305  arginyl-tRNA synthetase  63.86 
 
 		 593 aa  698    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0145  arginyl-tRNA synthetase  60.74 
 
 		 596 aa  684    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1997  arginyl-tRNA synthetase  63.33 
 
 		 594 aa  718    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0410  arginyl-tRNA synthetase  63.33 
 
 		 594 aa  717    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.987717  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2968  arginyl-tRNA synthetase  64.58 
 
 		 593 aa  706    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2919  arginyl-tRNA synthetase  63.86 
 
 		 593 aa  698    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0188  arginyl-tRNA synthetase  63.15 
 
 		 594 aa  720    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.826253  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0332  arginyl-tRNA synthetase  64.42 
 
 		 567 aa  723    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.960888  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0461  arginyl-tRNA synthetase  68.52 
 
 		 561 aa  762    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.185336  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0820  arginyl-tRNA synthetase  55.24 
 
 		 561 aa  635    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0474084  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0414  arginyl-tRNA synthetase  66.14 
 
 		 569 aa  753    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.872884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3701  arginyl-tRNA synthetase  68.65 
 
 		 558 aa  772    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.70256 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1812  arginyl-tRNA synthetase  55.61 
 
 		 568 aa  633  1e-180  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.246046  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1137  arginyl-tRNA synthetase  55.42 
 
 		 564 aa  630  1e-179  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0701665  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2304  arginyl-tRNA synthetase  54.9 
 
 		 561 aa  626  1e-178  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0307018  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02918  arginyl-tRNA synthetase  56.91 
 
 		 562 aa  616  1e-175  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0109  arginyl-tRNA synthetase  54.63 
 
 		 562 aa  613  9.999999999999999e-175  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1019  arginyl-tRNA synthetase  55.12 
 
 		 563 aa  613  9.999999999999999e-175  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.637999  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0124  arginyl-tRNA synthetase  54.63 
 
 		 562 aa  613  9.999999999999999e-175  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1434  arginyl-tRNA synthetase  54.98 
 
 		 569 aa  610  1e-173  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0988806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1977  arginyl-tRNA synthetase  57.26 
 
 		 575 aa  608  1e-173  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0280  arginyl-tRNA synthetase  54.4 
 
 		 562 aa  610  1e-173  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0920432  normal  0.27324 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3866  arginyl-tRNA synthetase  44.8 
 
 		 587 aa  465  1e-129  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.42649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2456  arginyl-tRNA synthetase  44.42 
 
 		 598 aa  459  9.999999999999999e-129  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0262  arginyl-tRNA synthetase  43.97 
 
 		 553 aa  455  1e-127  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0263  arginyl-tRNA synthetase  42.69 
 
 		 586 aa  449  1e-125  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0720  arginyl-tRNA synthetase  46.11 
 
 		 587 aa  450  1e-125  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2416  arginyl-tRNA synthetase  43.22 
 
 		 584 aa  437  1e-121  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.615558  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3089  arginyl-tRNA synthetase  43.46 
 
 		 586 aa  432  1e-120  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.191401  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2013  arginyl-tRNA synthetase  41.45 
 
 		 589 aa  434  1e-120  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0645  arginyl-tRNA synthetase  41.81 
 
 		 553 aa  433  1e-120  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0630  arginyl-tRNA synthetase  41.81 
 
 		 553 aa  433  1e-120  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2008  arginyl-tRNA synthetase  41.27 
 
 		 589 aa  430  1e-119  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0742  arginyl-tRNA synthetase  43.62 
 
 		 554 aa  431  1e-119  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000856279  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3878  arginyl-tRNA synthetase  41.68 
 
 		 556 aa  429  1e-119  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.542874  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2114  arginyl-tRNA synthetase  43.67 
 
 		 588 aa  429  1e-119  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0561  arginyl-tRNA synthetase  43.01 
 
 		 559 aa  429  1e-119  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.433886 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01700  arginyl-tRNA synthetase  42.29 
 
 		 583 aa  422  1e-117  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000411406  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3348  arginyl-tRNA synthetase  43.55 
 
 		 556 aa  425  1e-117  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000185624  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2283  arginyl-tRNA synthetase  39.58 
 
 		 554 aa  423  1e-117  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.263992  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5493  arginyl-tRNA synthetase  40.71 
 
 		 556 aa  419  1e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5213  arginyl-tRNA synthetase  40.71 
 
 		 556 aa  419  1e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5045  arginyl-tRNA synthetase  40.71 
 
 		 556 aa  421  1e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5455  arginyl-tRNA synthetase  40.71 
 
 		 556 aa  419  1e-116  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5061  arginyl-tRNA synthetase  40.71 
 
 		 556 aa  420  1e-116  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1940  arginyl-tRNA synthetase  39.75 
 
 		 554 aa  421  1e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5611  arginyl-tRNA synthetase  40.71 
 
 		 556 aa  419  1e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5485  arginyl-tRNA synthetase  40.71 
 
 		 556 aa  421  1e-116  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2181  arginyl-tRNA synthetase  42.47 
 
 		 563 aa  419  1e-116  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.264732  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5542  arginyl-tRNA synthetase  40.71 
 
 		 556 aa  419  1e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.051551  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0247  arginyl-tRNA synthetase  44.19 
 
 		 587 aa  419  1e-116  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0358001  normal  0.157381 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0349  arginyl-tRNA synthetase  42.07 
 
 		 579 aa  419  1e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.87333 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0170  arginyl-tRNA synthetase  42.07 
 
 		 579 aa  419  1e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0704  arginyl-tRNA synthetase  42.38 
 
 		 575 aa  421  1e-116  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.281403 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3457  arginyl-tRNA synthetase  44.07 
 
 		 557 aa  419  1e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0077  arginyl-tRNA synthetase  40.14 
 
 		 586 aa  416  9.999999999999999e-116  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2774  arginyl-tRNA synthetase  43.61 
 
 		 611 aa  416  9.999999999999999e-116  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.744463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1944  arginyl-tRNA synthetase  41.31 
 
 		 575 aa  416  9.999999999999999e-116  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.567724  normal  0.240014 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5158  arginyl-tRNA synthetase  40.85 
 
 		 556 aa  412  1e-114  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5465  arginyl-tRNA synthetase  40.64 
 
 		 556 aa  414  1e-114  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2109  arginyl-tRNA synthetase  39.73 
 
 		 592 aa  415  1e-114  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.513959  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3215  arginyl-tRNA synthetase  43.44 
 
 		 556 aa  411  1e-113  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0027  arginyl-tRNA synthetase  41.69 
 
 		 585 aa  410  1e-113  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0198  arginyl-tRNA synthetase  41.59 
 
 		 592 aa  411  1e-113  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0052  arginyl-tRNA synthetase  41.07 
 
 		 570 aa  409  1e-113  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000995895  decreased coverage  0.000521306 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4846  arginyl-tRNA synthetase  40.03 
 
 		 561 aa  411  1e-113  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000272186  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0648  arginyl-tRNA synthetase  40.82 
 
 		 559 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0541152  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06570  arginyl-tRNA synthetase  41.31 
 
 		 575 aa  404  1e-111  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.645664 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1486  arginyl-tRNA synthetase  39.21 
 
 		 550 aa  404  1e-111  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1814  arginyl-tRNA synthetase  42.98 
 
 		 551 aa  403  1e-111  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.679896  normal  0.951448 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2295  arginyl-tRNA synthetase  42.27 
 
 		 551 aa  402  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0598  arginyl-tRNA synthetase  40.22 
 
 		 553 aa  400  9.999999999999999e-111  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0743  arginyl-tRNA synthetase  43.23 
 
 		 550 aa  402  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>