More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_2729 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_2729  partition-related protein  100 
 
 		 201 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.578011 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0550  putative partition-related protein  51.71 
 
 		 208 aa  209  2e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.840811 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2068  putative partition-related protein  47.83 
 
 		 210 aa  194  5.000000000000001e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0850  cobyrinic acid ac-diamide synthase  51.21 
 
 		 219 aa  194  1e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.668174  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2449  cobyrinic acid ac-diamide synthase  51.21 
 
 		 219 aa  193  1e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0538918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1833  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  51.21 
 
 		 219 aa  193  1e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.510804  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2444  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  51.21 
 
 		 219 aa  193  1e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.313253  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2491  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  51.21 
 
 		 219 aa  193  2e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.926396  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2359  cobyrinic acid ac-diamide synthase  52.17 
 
 		 219 aa  193  2e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.723291  normal  0.455428 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5775  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  50.72 
 
 		 222 aa  192  3e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.381268 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1008  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  50.98 
 
 		 212 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0805  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  45.41 
 
 		 206 aa  187  7e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.50757e-20  unclonable  0.0000000618537 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3490  ParA family ATPase  50.49 
 
 		 212 aa  187  1e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.811141 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2973  ParA family protein  50 
 
 		 207 aa  185  4e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.510642  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0699  ParA family protein  50 
 
 		 207 aa  185  4e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.225956  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2314  ParA family protein  50 
 
 		 207 aa  185  4e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0184356  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1047  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain-containing protein  50 
 
 		 207 aa  185  4e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.4276  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1041  ParA family protein  50 
 
 		 207 aa  185  4e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1626  ParA family protein  50 
 
 		 207 aa  185  4e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00224937  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1202  ParA family protein  50 
 
 		 331 aa  184  7e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2199  cobyrinic acid ac-diamide synthase  49.27 
 
 		 234 aa  184  7e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.685518 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0846  ParA family protein  50 
 
 		 207 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.89485  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2777  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  47.8 
 
 		 220 aa  181  5.0000000000000004e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.84936 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2389  putative partition-related protein  48.06 
 
 		 217 aa  173  9.999999999999999e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00467103 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1153  putative partition-related protein  46.34 
 
 		 206 aa  169  4e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3914  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  47.83 
 
 		 206 aa  168  5e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.639922 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2197  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  45.63 
 
 		 221 aa  167  7e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.139506 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2655  putative partition-related protein  45.63 
 
 		 221 aa  167  9e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.634269 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1675  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  45.63 
 
 		 205 aa  165  4e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2866  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  46.34 
 
 		 206 aa  163  2.0000000000000002e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3543  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  46.34 
 
 		 206 aa  163  2.0000000000000002e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.110983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1239  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  45.85 
 
 		 205 aa  162  4.0000000000000004e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4398  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  43.75 
 
 		 206 aa  159  2e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.230089  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1298  putative partition-related protein  41.7 
 
 		 224 aa  149  3e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0150444 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1550  putative partition-related protein  38.66 
 
 		 212 aa  125  5e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00131235 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1875  ParA-like protein  38.66 
 
 		 212 aa  125  5e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0009  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.27 
 
 		 211 aa  123  2e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.363565  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0189  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.57 
 
 		 235 aa  122  5e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3136  putative partition-related protein  39.41 
 
 		 209 aa  108  5e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0178894  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0391  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.84 
 
 		 264 aa  108  7.000000000000001e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000118454  unclonable  0.000000000458103 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3113  hypothetical protein  34.48 
 
 		 208 aa  107  1e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0098  partition protein  34.62 
 
 		 209 aa  102  5e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.10243  normal  0.0389744 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03580  partition protein  33.97 
 
 		 210 aa  100  1e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0377  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.02 
 
 		 213 aa  98.2  7e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.572043  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0431  partition protein  32.55 
 
 		 213 aa  97.8  1e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1018  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.91 
 
 		 210 aa  83.2  0.000000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.026532  n/a   
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2485  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.41 
 
 		 211 aa  79.7  0.00000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.833437 
 
 
-
 
NC_008763  Pnap_4996  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.51 
 
 		 209 aa  76.6  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.16647  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3192  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.63 
 
 		 212 aa  75.1  0.0000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.164704  n/a   
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0125  plasmid partition protein ParF  29.29 
 
 		 206 aa  74.7  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.369409  normal  0.733147 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0014  ParaA family ATPase  31.94 
 
 		 209 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.308628  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1978  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.63 
 
 		 211 aa  72.8  0.000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3077  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.87 
 
 		 217 aa  72.8  0.000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2641  partition protein A  33.16 
 
 		 212 aa  72  0.000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0869  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.99 
 
 		 211 aa  72  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3579  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36 
 
 		 229 aa  71.6  0.000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.277645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02473  hypothetical protein  28.57 
 
 		 222 aa  71.6  0.000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3697  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36 
 
 		 229 aa  71.2  0.000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.321056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3388  cobyrinic acid ac-diamide synthase  36 
 
 		 229 aa  71.2  0.000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.395731  normal  0.623749 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5343  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.44 
 
 		 219 aa  70.9  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4980  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.51 
 
 		 209 aa  70.9  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.618219  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4342  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.46 
 
 		 211 aa  71.2  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1048  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.85 
 
 		 219 aa  70.9  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3014  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.88 
 
 		 217 aa  69.7  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1510  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.81 
 
 		 226 aa  69.7  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.393497 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0205  putative partitioning protein ParA  21.74 
 
 		 246 aa  70.1  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0522  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.03 
 
 		 212 aa  70.1  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1451  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.81 
 
 		 226 aa  69.7  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.861297 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2882  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35 
 
 		 226 aa  69.7  0.00000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0003  partition protein  34.75 
 
 		 222 aa  69.3  0.00000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000179256  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0532  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.81 
 
 		 234 aa  68.9  0.00000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.503731  normal  0.488377 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1504  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.2 
 
 		 215 aa  69.3  0.00000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0239725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3861  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.96 
 
 		 214 aa  68.9  0.00000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5819  plasmid partitioning ATPase  36.44 
 
 		 218 aa  69.3  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6457  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.73 
 
 		 222 aa  68.9  0.00000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.839742 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7737  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.53 
 
 		 231 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0582  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.95 
 
 		 217 aa  68.6  0.00000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.11868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1986  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.12 
 
 		 212 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.399731  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3896  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.9 
 
 		 222 aa  68.2  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3783  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.9 
 
 		 222 aa  68.2  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0208258  normal  0.232472 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0129  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.22 
 
 		 217 aa  68.2  0.00000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1953  cobyrinic acid ac-diamide synthase  41.67 
 
 		 187 aa  68.2  0.00000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.604126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0912  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.8 
 
 		 216 aa  68.2  0.00000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6807  ATPase, ParA type  35.54 
 
 		 225 aa  68.2  0.00000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.739325 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6160  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.53 
 
 		 231 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.135361 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5758  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.53 
 
 		 231 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.713323  normal  0.732786 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6670  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.53 
 
 		 231 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.734971 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5826  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.53 
 
 		 231 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.493371  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2868  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.96 
 
 		 212 aa  67.8  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0223269 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6002  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.53 
 
 		 231 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.743833 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6193  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.53 
 
 		 231 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.220398 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2510  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.6 
 
 		 207 aa  67  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.746062 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3185  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.41 
 
 		 217 aa  66.6  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.352981  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2799  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.98 
 
 		 212 aa  65.9  0.0000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.392004  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3818  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.51 
 
 		 212 aa  66.2  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.772437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3524  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.93 
 
 		 212 aa  65.5  0.0000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3065  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.15 
 
 		 241 aa  65.5  0.0000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6363  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.35 
 
 		 214 aa  65.5  0.0000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1378  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.47 
 
 		 211 aa  65.5  0.0000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.626674  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1680  hypothetical protein  32.47 
 
 		 211 aa  65.1  0.0000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.679008  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>