More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_2673 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007404  Tbd_2673  hypothetical protein  100 
 
 
268 aa  501  1e-141  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1534  hypothetical protein  57.65 
 
 
263 aa  271  9e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.544082 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3512  hypothetical protein  57.76 
 
 
263 aa  253  3e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000688287  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0552  protein of unknown function DUF81  57.64 
 
 
265 aa  253  3e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1097  hypothetical protein  60.87 
 
 
263 aa  250  2e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000323114 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1203  protein of unknown function DUF81  57.83 
 
 
265 aa  246  4e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.129839 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4025  hypothetical protein  51.95 
 
 
266 aa  239  4e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0529  hypothetical protein  57.26 
 
 
266 aa  236  2e-61  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.276386  normal  0.258551 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2628  hypothetical protein  55.08 
 
 
272 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.975369  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1384  hypothetical protein  53.45 
 
 
264 aa  231  7.000000000000001e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0472922  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0158  protein of unknown function DUF81  53.45 
 
 
265 aa  231  9e-60  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.220431 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2237  hypothetical protein  50.64 
 
 
263 aa  229  5e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.102594  normal  0.0571856 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0751  hypothetical protein  56.13 
 
 
265 aa  227  2e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3502  protein of unknown function DUF81  54.51 
 
 
268 aa  226  3e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.923118  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2544  protein of unknown function DUF81  50.94 
 
 
273 aa  225  5.0000000000000005e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.367735  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4771  hypothetical protein  53.59 
 
 
241 aa  224  1e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.838718  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2312  putative integral membrane protein  54.98 
 
 
282 aa  221  7e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0164654  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0613  hypothetical protein  52.34 
 
 
265 aa  221  9e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0059  protein of unknown function DUF81  54.51 
 
 
268 aa  220  1.9999999999999999e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2789  hypothetical protein  53.51 
 
 
266 aa  219  3e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0463907 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2424  protein of unknown function DUF81  58.41 
 
 
263 aa  219  3.9999999999999997e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2672  hypothetical protein  53.31 
 
 
270 aa  219  5e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.562699  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0041  protein of unknown function DUF81  53.69 
 
 
268 aa  215  5.9999999999999996e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0872  protein of unknown function DUF81  51.36 
 
 
267 aa  214  9.999999999999999e-55  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.243092  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2371  hypothetical protein  49.36 
 
 
271 aa  214  9.999999999999999e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.643122  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4013  hypothetical protein  55.2 
 
 
269 aa  213  1.9999999999999998e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4342  hypothetical protein  54.12 
 
 
274 aa  212  3.9999999999999995e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1825  protein of unknown function DUF81  57.26 
 
 
263 aa  213  3.9999999999999995e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.942531  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04440  putative permease  48.43 
 
 
267 aa  209  3e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5375  hypothetical protein  48.84 
 
 
260 aa  208  8e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.243467 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2670  hypothetical protein  51.89 
 
 
270 aa  208  8e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2201  hypothetical protein  47.33 
 
 
262 aa  204  1e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000468231  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0909  protein of unknown function DUF81  45.85 
 
 
268 aa  202  3e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1872  protein of unknown function DUF81  50.22 
 
 
265 aa  203  3e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.829326  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0764  hypothetical protein  45.85 
 
 
264 aa  202  4e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3677  hypothetical protein  43.48 
 
 
267 aa  202  4e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0433  hypothetical protein  47.24 
 
 
260 aa  201  7e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0394251  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4169  hypothetical protein  51.88 
 
 
268 aa  201  9.999999999999999e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1245  hypothetical protein  50.64 
 
 
266 aa  198  6e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4451  protein of unknown function DUF81  51.05 
 
 
268 aa  199  6e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5143  hypothetical protein  46.06 
 
 
260 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.161366  normal  0.891467 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5050  hypothetical protein  46.06 
 
 
260 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0650  hypothetical protein  53.01 
 
 
270 aa  195  6e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2424  protein of unknown function DUF81  47.83 
 
 
261 aa  195  7e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0023  hypothetical protein  46.54 
 
 
294 aa  194  2e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0322  hypothetical protein  45.53 
 
 
260 aa  192  4e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.875431  normal  0.804382 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2434  hypothetical protein  47.93 
 
 
265 aa  190  2e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5196  hypothetical protein  44.36 
 
 
260 aa  187  1e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48190  hypothetical protein  48.43 
 
 
260 aa  185  7e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.627972  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0632  hypothetical protein  45.69 
 
 
272 aa  184  2.0000000000000003e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.818176  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0466  hypothetical protein  42.69 
 
 
270 aa  181  8.000000000000001e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3998  hypothetical protein  42.63 
 
 
268 aa  180  2e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.192524  normal  0.420009 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4215  hypothetical protein  48.73 
 
 
260 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2787  hypothetical protein  47.44 
 
 
272 aa  178  7e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.770752  normal  0.86011 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1225  protein of unknown function DUF81  43.29 
 
 
272 aa  176  4e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2511  hypothetical protein  46.34 
 
 
274 aa  173  1.9999999999999998e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.213064  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1229  hypothetical protein  43.3 
 
 
264 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.341585  hitchhiker  0.00289815 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0904  hypothetical protein  39.92 
 
 
298 aa  174  1.9999999999999998e-42  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.468335  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1556  protein of unknown function DUF81  44.02 
 
 
263 aa  172  5.999999999999999e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0848  transmembrane protein  39.53 
 
 
274 aa  172  6.999999999999999e-42  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.57519 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2279  hypothetical protein  41.11 
 
 
273 aa  171  9e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.705159  normal  0.384237 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1040  hypothetical protein  43.65 
 
 
264 aa  169  6e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0054225  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0865  hypothetical protein  44.05 
 
 
255 aa  167  1e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.130395 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1230  hypothetical protein  42.32 
 
 
266 aa  166  5e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.615784  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1186  hypothetical protein  42.32 
 
 
266 aa  166  5e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0170417  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1178  hypothetical protein  40.26 
 
 
272 aa  165  6.9999999999999995e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1263  hypothetical protein  42.32 
 
 
266 aa  165  8e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.555704  normal  0.128151 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001494  hypothetical protein  38.64 
 
 
268 aa  163  2.0000000000000002e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.696729  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2312  hypothetical protein  41.57 
 
 
265 aa  162  5.0000000000000005e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.597575 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2863  hypothetical protein  41.08 
 
 
266 aa  161  1e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0601492  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2945  hypothetical protein  41.08 
 
 
266 aa  160  1e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00216639  normal  0.75892 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2780  hypothetical protein  42.08 
 
 
264 aa  160  2e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.525966  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3127  protein of unknown function DUF81  42.74 
 
 
266 aa  159  4e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.156153  normal  0.596117 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1139  hypothetical protein  39.92 
 
 
268 aa  159  5e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.248182 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2943  hypothetical protein  42.5 
 
 
266 aa  159  6e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0381677  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02496  hypothetical protein  41.37 
 
 
272 aa  159  7e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.112519  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1134  hypothetical protein  43.82 
 
 
267 aa  158  8e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.010051  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0028  hypothetical protein  43.27 
 
 
269 aa  155  5.0000000000000005e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3041  hypothetical protein  41.49 
 
 
266 aa  155  9e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.297419  normal  0.785978 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1023  hypothetical protein  42.23 
 
 
266 aa  154  1e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4151  hypothetical protein  43.81 
 
 
260 aa  154  1e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.127406  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0571  integral membrane protein  42.02 
 
 
267 aa  154  2e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00851307  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0347  hypothetical protein  39.92 
 
 
268 aa  154  2e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1144  hypothetical protein  41.53 
 
 
266 aa  152  5e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.262413  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00969  hypothetical protein  41.86 
 
 
263 aa  152  7e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0205  hypothetical protein  38.53 
 
 
264 aa  149  4e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3623  hypothetical protein  40.24 
 
 
264 aa  147  2.0000000000000003e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.900128  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1333  hypothetical protein  41.49 
 
 
255 aa  145  5e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0390  protein of unknown function DUF81  40.51 
 
 
268 aa  145  6e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.601931  normal  0.232819 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004429  hypothetical protein  38.36 
 
 
263 aa  145  8.000000000000001e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.108567  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1153  hypothetical protein  41.25 
 
 
269 aa  143  3e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4460  hypothetical protein  43.24 
 
 
270 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0453  hypothetical protein  37.23 
 
 
272 aa  135  5e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0611  hypothetical protein  35.14 
 
 
294 aa  132  6.999999999999999e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0020  hypothetical protein  33.2 
 
 
275 aa  131  1.0000000000000001e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2938  hypothetical protein  37.55 
 
 
272 aa  130  2.0000000000000002e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.436865 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1348  hypothetical protein  39.91 
 
 
276 aa  130  3e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1511  hypothetical protein  41.64 
 
 
278 aa  129  5.0000000000000004e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.224093  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2177  hypothetical protein  38.2 
 
 
274 aa  129  6e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00465003  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03708  hypothetical protein  36.73 
 
 
268 aa  126  4.0000000000000003e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>