78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_2613 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_2613  hypothetical protein  100 
 
 		 361 aa  699    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.303309 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2103  protein of unknown function DUF81  52.89 
 
 		 352 aa  328  7e-89  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0095  hypothetical protein  51.27 
 
 		 356 aa  326  5e-88  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.571557  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2673  protein of unknown function DUF81  52.3 
 
 		 349 aa  322  7e-87  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.970315  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1799  protein of unknown function DUF81  52.69 
 
 		 356 aa  306  3e-82  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1011  protein of unknown function DUF81  41.5 
 
 		 362 aa  233  3e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0652909 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1512  hypothetical protein  43.26 
 
 		 360 aa  205  1e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.864681  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0315  protein of unknown function DUF81  30.7 
 
 		 415 aa  139  1e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.24542  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3160  protein of unknown function DUF81  33.44 
 
 		 443 aa  129  6e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1353  hypothetical protein  29.57 
 
 		 427 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000251364  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1427  hypothetical protein  31.09 
 
 		 428 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000425148  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1316  hypothetical protein  33.58 
 
 		 339 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.919916  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1425  hypothetical protein  32.65 
 
 		 426 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0163769  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1984  protein of unknown function DUF81  27.43 
 
 		 415 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4296  protein of unknown function DUF81  32.87 
 
 		 346 aa  110  3e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2833  hypothetical protein  30.23 
 
 		 415 aa  110  3e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.260143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2847  hypothetical protein  34.09 
 
 		 306 aa  108  1e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.258589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0644  hypothetical protein  27.35 
 
 		 417 aa  106  7e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0357  protein of unknown function DUF81  29.08 
 
 		 420 aa  106  8e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.968564  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0264  protein of unknown function DUF81  33.07 
 
 		 345 aa  100  3e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0843  hypothetical protein  33.21 
 
 		 307 aa  100  4e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.226682 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0534  hypothetical protein  31.8 
 
 		 310 aa  97.1  4e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.736309  normal  0.683051 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0626  hypothetical protein  31.27 
 
 		 356 aa  96.3  8e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1975  hypothetical protein  31.45 
 
 		 394 aa  95.9  1e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000141125  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1641  protein of unknown function DUF81  30.15 
 
 		 354 aa  95.5  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.407514  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0881  hypothetical protein  33.2 
 
 		 306 aa  95.5  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.308903 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2342  protein of unknown function DUF81  30.62 
 
 		 350 aa  94.7  2e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2818  hypothetical protein  30.35 
 
 		 350 aa  95.1  2e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2206  hypothetical protein  33.2 
 
 		 306 aa  94.4  3e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.767696  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0208  protein of unknown function DUF81  32.24 
 
 		 307 aa  92.8  8e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.61262  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0237  protein of unknown function DUF81  32.24 
 
 		 307 aa  92.4  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.455283  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0967  protein of unknown function DUF81  32.28 
 
 		 303 aa  91.7  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000092207  normal  0.442745 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3098  hypothetical protein  33.98 
 
 		 330 aa  91.7  2e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.075635  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0285  protein of unknown function DUF81  31.75 
 
 		 350 aa  89.7  7e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0253252 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0026  hypothetical protein  31.18 
 
 		 305 aa  89.4  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.25228  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0741  hypothetical protein  30.04 
 
 		 308 aa  88.6  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.610206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4610  hypothetical protein  30 
 
 		 307 aa  88.2  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.427893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0807  putative permease  29.96 
 
 		 308 aa  87.4  4e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0899504 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1032  protein of unknown function DUF81  30.04 
 
 		 329 aa  86.3  7e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0800  hypothetical protein  29.64 
 
 		 307 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.979856  normal  0.617739 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2287  hypothetical protein  33.2 
 
 		 306 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.733159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3721  protein of unknown function DUF81  29.84 
 
 		 346 aa  83.6  0.000000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.766072  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0703  protein of unknown function DUF81  30.48 
 
 		 312 aa  82.8  0.000000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.619223 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0881  protein of unknown function DUF81  29.41 
 
 		 320 aa  82.8  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0603  hypothetical protein  30.82 
 
 		 315 aa  81.3  0.00000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.117453  normal  0.827716 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1905  protein of unknown function DUF81  28.14 
 
 		 305 aa  82  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2258  hypothetical protein  28.78 
 
 		 296 aa  80.5  0.00000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0148  hypothetical protein  29.39 
 
 		 308 aa  79.7  0.00000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.171694 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0457  hypothetical protein  28.46 
 
 		 307 aa  79.3  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1044  protein of unknown function DUF81  28.97 
 
 		 349 aa  78.6  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.161703  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4039  hypothetical protein  32.45 
 
 		 306 aa  77.8  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.995552  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0638  hypothetical protein  27.03 
 
 		 355 aa  77  0.0000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.328833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0772  hypothetical protein  32.08 
 
 		 316 aa  76.3  0.0000000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000254854  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0823  hypothetical protein  31.7 
 
 		 316 aa  73.9  0.000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.580669  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3097  hypothetical protein  28.16 
 
 		 307 aa  73.9  0.000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0521383  normal  0.0206179 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0184  hypothetical protein  29.23 
 
 		 343 aa  73.6  0.000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.249656  normal  0.93927 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2732  hypothetical protein  30 
 
 		 307 aa  73.6  0.000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.990455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0602  hypothetical protein  27.08 
 
 		 307 aa  70.5  0.00000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.116643  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1793  protein of unknown function DUF81  25.86 
 
 		 348 aa  69.3  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5288  protein of unknown function DUF81  30.71 
 
 		 307 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.000586578  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3547  hypothetical protein  30.61 
 
 		 304 aa  68.6  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.519882 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2487  hypothetical protein  31.15 
 
 		 307 aa  67  0.0000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.741718 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2642  hypothetical protein  29.51 
 
 		 304 aa  66.2  0.0000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4256  protein of unknown function DUF81  27.09 
 
 		 330 aa  63.9  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0240  hypothetical protein  25.53 
 
 		 313 aa  63.2  0.000000007  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0364801  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2100  hypothetical protein  30.37 
 
 		 307 aa  61.6  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0245  hypothetical protein  30 
 
 		 308 aa  61.6  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.176673  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0529  protein of unknown function DUF81  32.94 
 
 		 301 aa  59.7  0.00000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.639681  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0758  protein of unknown function DUF81  27.55 
 
 		 342 aa  54.3  0.000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.154844  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3061  protein of unknown function DUF81  26.98 
 
 		 300 aa  49.3  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0568  protein of unknown function DUF81  27.14 
 
 		 264 aa  48.5  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00380  predicted permease  25.09 
 
 		 277 aa  44.3  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1910  hypothetical protein  23.24 
 
 		 283 aa  44.3  0.003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.199806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1173  protein of unknown function DUF81  32.04 
 
 		 267 aa  44.7  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1150  hypothetical protein  22.91 
 
 		 275 aa  43.9  0.004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0071  hypothetical protein  22.22 
 
 		 251 aa  43.9  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0073  hypothetical protein  22.22 
 
 		 251 aa  43.9  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0087  protein of unknown function DUF81  28.45 
 
 		 293 aa  42.7  0.009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>