More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_2508 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_2508  putative cell cycle control ATPase  100 
 
 		 251 aa  518  1e-146  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.953191 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0207  putative cell cycle control ATPase  63.22 
 
 		 265 aa  301  6.000000000000001e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.727762  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0182  PP-loop  55.42 
 
 		 279 aa  287  1e-76  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1407  PP-loop family protein  59.21 
 
 		 260 aa  283  2.0000000000000002e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2075  PP-loop domain protein  55.79 
 
 		 280 aa  283  2.0000000000000002e-75  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1130  PP-loop domain protein  59.21 
 
 		 256 aa  283  2.0000000000000002e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2579  PP-loop domain protein  59.83 
 
 		 269 aa  280  1e-74  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0282863 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_4708  predicted protein  50 
 
 		 220 aa  221  9e-57  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0127  C32 tRNA thiolase  42.36 
 
 		 282 aa  196  4.0000000000000005e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_10299  predicted protein  48.26 
 
 		 199 aa  190  2e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.127345  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2224  C32 tRNA thiolase  42.56 
 
 		 311 aa  189  5e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00242897  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1993  C32 tRNA thiolase  40.08 
 
 		 302 aa  185  5e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1043  C32 tRNA thiolase  39.44 
 
 		 310 aa  183  2.0000000000000003e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00286005  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1573  C32 tRNA thiolase  39.68 
 
 		 307 aa  182  5.0000000000000004e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.539766  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1463  PP-loop domain-containing protein  40.08 
 
 		 316 aa  181  1e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1896  C32 tRNA thiolase  42.54 
 
 		 289 aa  180  2e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.318261 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1708  PP-loop domain protein  39.66 
 
 		 302 aa  180  2e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2198  PP-loop domain-containing protein  39.43 
 
 		 309 aa  180  2e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.256426  normal  0.397615 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4231  PP-loop domain-containing protein  39.66 
 
 		 310 aa  180  2e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.92927  normal  0.191142 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2544  PP-loop domain protein  39.58 
 
 		 292 aa  179  4e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.203919  normal  0.870169 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2607  C32 tRNA thiolase  39.83 
 
 		 310 aa  179  4e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.560057 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2598  C32 tRNA thiolase  39.2 
 
 		 311 aa  178  5.999999999999999e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0554  C32 tRNA thiolase  41.2 
 
 		 313 aa  177  1e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.637065 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0175  C32 tRNA thiolase  39.41 
 
 		 312 aa  177  1e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.186206 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2316  C32 tRNA thiolase  39.04 
 
 		 311 aa  177  1e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.415676  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0060  C32 tRNA thiolase  39.83 
 
 		 315 aa  176  2e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.867348  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1247  C32 tRNA thiolase  38.89 
 
 		 313 aa  176  2e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0875  PP-loop  40.34 
 
 		 284 aa  176  2e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00139883  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0228  C32 tRNA thiolase  38.78 
 
 		 303 aa  176  3e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.608428 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3479  C32 tRNA thiolase  41.81 
 
 		 258 aa  176  3e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.101099  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1773  C32 tRNA thiolase  40.34 
 
 		 313 aa  176  4e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2975  C32 tRNA thiolase  38.7 
 
 		 331 aa  176  4e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1738  C32 tRNA thiolase  37.85 
 
 		 313 aa  176  4e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0290  C32 tRNA thiolase  39.57 
 
 		 331 aa  175  6e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.583518  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0340  C32 tRNA thiolase  39.13 
 
 		 331 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.576069  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3381  C32 tRNA thiolase  39.13 
 
 		 331 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000151455  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2245  C32 tRNA thiolase  39.13 
 
 		 331 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.705781  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0519  C32 tRNA thiolase  39.13 
 
 		 331 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.339453  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2039  C32 tRNA thiolase  39.13 
 
 		 331 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.605016  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0327  C32 tRNA thiolase  39.13 
 
 		 331 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3054  C32 tRNA thiolase  39.13 
 
 		 331 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.31194  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2415  C32 tRNA thiolase  39.92 
 
 		 319 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.170221  decreased coverage  0.000000170238 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1778  C32 tRNA thiolase  38.59 
 
 		 311 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.446502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1461  C32 tRNA thiolase  38.59 
 
 		 311 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0815  PP-loop  38.4 
 
 		 338 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2281  C32 tRNA thiolase  38.59 
 
 		 311 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.787518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1912  C32 tRNA thiolase  37.85 
 
 		 313 aa  173  1.9999999999999998e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1802  C32 tRNA thiolase  37.85 
 
 		 313 aa  173  1.9999999999999998e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0068  C32 tRNA thiolase  38.98 
 
 		 315 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1993  C32 tRNA thiolase  38.59 
 
 		 311 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.800343 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2206  C32 tRNA thiolase  37.85 
 
 		 313 aa  173  1.9999999999999998e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.840796 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1558  C32 tRNA thiolase  38.59 
 
 		 311 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01321  predicted C32 tRNA thiolase  38.59 
 
 		 311 aa  173  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2299  PP-loop domain protein  38.59 
 
 		 311 aa  172  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00162169  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01331  hypothetical protein  38.59 
 
 		 311 aa  173  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4497  C32 tRNA thiolase  40.34 
 
 		 310 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2211  C32 tRNA thiolase  40.34 
 
 		 310 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000587998  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2980  C32 tRNA thiolase  38.26 
 
 		 331 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1801  C32 tRNA thiolase  40.34 
 
 		 319 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.313433 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2890  C32 tRNA thiolase  38.26 
 
 		 340 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.735906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1589  C32 tRNA thiolase  38.59 
 
 		 311 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2366  C32 tRNA thiolase  38.26 
 
 		 326 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.53458  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0505  PP-loop domain protein  39.06 
 
 		 317 aa  172  3.9999999999999995e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2142  C32 tRNA thiolase  39.42 
 
 		 311 aa  172  3.9999999999999995e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.614557  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0516  C32 tRNA thiolase  37.55 
 
 		 314 aa  172  3.9999999999999995e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.366068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0494  C32 tRNA thiolase  39.06 
 
 		 317 aa  172  3.9999999999999995e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0548366 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0671  C32 tRNA thiolase  38.43 
 
 		 259 aa  172  5e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.51504e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2210  C32 tRNA thiolase  40.34 
 
 		 322 aa  172  5e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000285606  normal  0.272334 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3027  C32 tRNA thiolase  38.26 
 
 		 334 aa  172  5e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2160  C32 tRNA thiolase  40.34 
 
 		 322 aa  172  5.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00960533  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2224  C32 tRNA thiolase  40.34 
 
 		 322 aa  172  5.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000167986  normal  0.0826377 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1949  C32 tRNA thiolase  40.34 
 
 		 310 aa  172  5.999999999999999e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1774  C32 tRNA thiolase  38.59 
 
 		 311 aa  171  6.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.075518 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1681  C32 tRNA thiolase  38.59 
 
 		 311 aa  171  6.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0199988  normal  0.0209698 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1837  C32 tRNA thiolase  38.59 
 
 		 311 aa  171  7.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.555568  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1499  C32 tRNA thiolase  38.59 
 
 		 311 aa  171  9e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1777  C32 tRNA thiolase  38.59 
 
 		 311 aa  171  9e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.101816 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3000  C32 tRNA thiolase  37.83 
 
 		 331 aa  171  9e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2354  C32 tRNA thiolase  40.34 
 
 		 310 aa  171  1e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6329  C32 tRNA thiolase  37.83 
 
 		 331 aa  171  1e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.577363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2892  C32 tRNA thiolase  37.83 
 
 		 336 aa  171  1e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00588342 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0113  PP-loop family protein  41.3 
 
 		 251 aa  169  3e-41  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0153  PP-loop family protein  41.3 
 
 		 251 aa  169  3e-41  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0100242  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3336  C32 tRNA thiolase  39.15 
 
 		 264 aa  169  3e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.167025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2221  C32 tRNA thiolase  39.32 
 
 		 316 aa  169  3e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1841  C32 tRNA thiolase  40.34 
 
 		 323 aa  169  4e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000126519  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3499  C32 tRNA thiolase  40.09 
 
 		 269 aa  168  8e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00810912  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0184  C32 tRNA thiolase  36.86 
 
 		 314 aa  168  1e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.478782 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0799  PP-loop domain protein  37.24 
 
 		 247 aa  167  1e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0509  C32 tRNA thiolase  38.14 
 
 		 298 aa  167  2e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.252102  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2016  C32 tRNA thiolase  38.66 
 
 		 322 aa  167  2e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000499451 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1959  C32 tRNA thiolase  38.66 
 
 		 322 aa  167  2e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00791076 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2020  C32 tRNA thiolase  39.5 
 
 		 312 aa  167  2e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2117  C32 tRNA thiolase  38.66 
 
 		 322 aa  167  2e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0387293 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0206  C32 tRNA thiolase  37.39 
 
 		 336 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0928  PP-loop family protein  39.58 
 
 		 252 aa  166  2.9999999999999998e-40  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1749  PP-loop family protein  39.17 
 
 		 256 aa  166  2.9999999999999998e-40  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.10614  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1793  C32 tRNA thiolase  38.82 
 
 		 302 aa  166  4e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0942  PP-loop domain-containing protein  38.96 
 
 		 294 aa  165  5e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.907512  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1203  C32 tRNA thiolase  38.46 
 
 		 274 aa  165  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>