More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_2431 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_2431  putative thioredoxin  100 
 
 		 164 aa  337  4e-92  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0475  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  53.46 
 
 		 173 aa  185  2e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0228  redoxin domain-containing protein  52.76 
 
 		 174 aa  181  5.0000000000000004e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.454071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0233  thioredoxin-like protein  51.88 
 
 		 179 aa  179  1e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0196  Redoxin domain protein  54.09 
 
 		 185 aa  177  4e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0104775 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0190  Redoxin domain protein  52.83 
 
 		 186 aa  175  3e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.968687  normal  0.596413 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0479  putative thiol-disulfide oxidoreductase  59.44 
 
 		 178 aa  174  4e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1393  hypothetical protein  59.44 
 
 		 178 aa  174  4e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3225  hypothetical protein  59.44 
 
 		 178 aa  174  4e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0643  resA domain-containing protein  59.44 
 
 		 178 aa  174  4e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.826532  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2819  hypothetical protein  59.44 
 
 		 178 aa  174  4e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0459  putative thiol-disulfide oxidoreductase  59.44 
 
 		 178 aa  174  4e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4194  putative thiol-disulfide isomerase and thioredoxins  57.75 
 
 		 176 aa  174  4e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.462178 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0200  hypothetical protein  59.44 
 
 		 178 aa  174  4e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0402  hypothetical protein  59.44 
 
 		 178 aa  173  8e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0284  putative transmembrane protein  56.74 
 
 		 178 aa  173  9e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0333  putative transmembrane protein  50.61 
 
 		 213 aa  172  9.999999999999999e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.847937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0521  Redoxin domain protein  57.04 
 
 		 176 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.037804  normal  0.85402 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2925  redoxin domain-containing protein  58.74 
 
 		 178 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0433  redoxin domain-containing protein  58.74 
 
 		 179 aa  171  2.9999999999999996e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0350  redoxin domain-containing protein  56.52 
 
 		 168 aa  171  3.9999999999999995e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00112402 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0270  putative transmembrane protein  55.15 
 
 		 174 aa  171  5e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2787  redoxin domain-containing protein  58.04 
 
 		 178 aa  171  5e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.787444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0217  redoxin domain-containing protein  56.3 
 
 		 171 aa  170  5.999999999999999e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.219465 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6212  Thiol-disulfide isomerase/thioredoxin-like  58.04 
 
 		 194 aa  170  6.999999999999999e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2881  redoxin domain-containing protein  57.34 
 
 		 178 aa  169  2e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2256  redoxin  57.34 
 
 		 178 aa  169  2e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.087584  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2870  redoxin domain-containing protein  57.34 
 
 		 178 aa  169  2e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0218082  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0292  redoxin domain-containing protein  55.56 
 
 		 167 aa  167  6e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000102715 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0287  Redoxin domain protein  55.56 
 
 		 167 aa  167  6e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.610229  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4901  Redoxin domain protein  52.59 
 
 		 165 aa  166  2e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.273187  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0405  redoxin domain-containing protein  50.68 
 
 		 203 aa  163  8e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4046  redoxin domain-containing protein  50.66 
 
 		 166 aa  163  1.0000000000000001e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000205313 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0318  hypothetical protein  53.52 
 
 		 166 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0164115  normal  0.0202423 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1278  redoxin domain-containing protein  49.35 
 
 		 167 aa  162  2.0000000000000002e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0247  Redoxin domain protein  51.75 
 
 		 165 aa  156  1e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.549118  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0206  Redoxin domain protein  49.63 
 
 		 167 aa  153  9e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0399  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  41.51 
 
 		 171 aa  142  2e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.689513  normal  0.928423 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2412  Redoxin domain protein  38.92 
 
 		 167 aa  138  3e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0432  redoxin domain-containing protein  39.71 
 
 		 169 aa  124  8.000000000000001e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0116447 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1569  putative thioredoxin  49.19 
 
 		 167 aa  121  3e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000853418  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2145  Redoxin domain protein  36.91 
 
 		 172 aa  111  5e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.765284  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1257  resA domain-containing protein  35.54 
 
 		 165 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1598  thiol-disulfide oxidoreductase  41.67 
 
 		 173 aa  104  5e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.966744  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1356  thiol-disulfide oxidoreductase  41.67 
 
 		 173 aa  104  5e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1533  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  40.82 
 
 		 193 aa  103  7e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2903  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  40.6 
 
 		 184 aa  102  3e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1634  thiol-disulfide oxidoreductase  40.91 
 
 		 173 aa  101  5e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1396  thiol-disulfide oxidoreductase  42.42 
 
 		 173 aa  100  7e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1383  thiol-disulfide oxidoreductase  42.42 
 
 		 173 aa  100  8e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1494  thiol-disulfide oxidoreductase  42.42 
 
 		 173 aa  100  8e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3817  thiol-disulfide oxidoreductase  42.42 
 
 		 173 aa  100  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000518727 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1528  thiol-disulfide oxidoreductase  42.42 
 
 		 173 aa  100  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1566  thiol-disulfide oxidoreductase  41.67 
 
 		 173 aa  99.4  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.62392e-19 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1355  thiol-disulfide oxidoreductase  41.67 
 
 		 173 aa  99.4  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3927  thioredoxin-like  37.68 
 
 		 174 aa  98.6  4e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.298512  normal  0.186192 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0325  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  36.96 
 
 		 189 aa  98.2  5e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0365546 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1890  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  38.89 
 
 		 171 aa  94.7  5e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.326681  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0181  alkyl hydroperoxide reductase  34.75 
 
 		 183 aa  94  9e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0243778  normal  0.461108 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0861  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.61 
 
 		 189 aa  93.6  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.155376  hitchhiker  0.00638708 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1197  thiol-disulfide oxidoreductase  37.88 
 
 		 173 aa  92.4  3e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0760  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  36.31 
 
 		 228 aa  90.9  6e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.173874 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0190  cytochrome c biogenesis protein, putative  35.42 
 
 		 201 aa  89.4  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.648376  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0274  cytochrome c biogenesis protein, putative  35.42 
 
 		 194 aa  89.4  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0525  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  37.7 
 
 		 178 aa  89  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000136072  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4444  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  37.59 
 
 		 196 aa  89  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.133035 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1843  thioredoxin-like  37.34 
 
 		 164 aa  89  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2276  Redoxin domain protein  33.09 
 
 		 171 aa  88.6  3e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0451  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like  34.65 
 
 		 180 aa  88.6  3e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3474  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.06 
 
 		 169 aa  87.8  6e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.163841 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1321  thioredoxin family protein  33.87 
 
 		 168 aa  86.7  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5143  redoxin domain-containing protein  36.88 
 
 		 197 aa  86.7  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00131261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0399  thiol-disulfide oxidoreductase  33.54 
 
 		 174 aa  86.7  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0048  Redoxin domain protein  27.46 
 
 		 172 aa  86.7  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0534182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3412  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.06 
 
 		 169 aa  87  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0047  hypothetical protein  27.46 
 
 		 165 aa  86.7  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.147207  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4615  redoxin domain-containing protein  36.88 
 
 		 197 aa  86.7  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0251  redoxin domain-containing protein  33.1 
 
 		 213 aa  86.7  1e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1098  thioredoxin family protein, putative  37.5 
 
 		 184 aa  86.3  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00211486  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2452  thioredoxin family protein  33.1 
 
 		 170 aa  85.5  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000374764  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1223  Redoxin domain protein  34.57 
 
 		 170 aa  85.1  4e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.337108  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2397  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  36.43 
 
 		 173 aa  84.7  5e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1493  redoxin domain-containing protein  37.01 
 
 		 190 aa  84  9e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3111  redoxin  36.11 
 
 		 193 aa  84  9e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5256  redoxin domain-containing protein  36.11 
 
 		 193 aa  84  9e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5017  redoxin domain-containing protein  36.55 
 
 		 193 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.150202  normal  0.769586 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0243  redoxin domain-containing protein  32.64 
 
 		 184 aa  83.2  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.487537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2011  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.58 
 
 		 378 aa  82.8  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0272  thioredoxin family protein  37.67 
 
 		 182 aa  82.4  0.000000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.900103 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18200  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  36.64 
 
 		 178 aa  82  0.000000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000397372  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2222  thiol-disulfide oxidoreductase  34.85 
 
 		 174 aa  82  0.000000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000493791  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1768  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.43 
 
 		 446 aa  82  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.197214  normal  0.508736 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0547  peroxiredoxin-like protein  31.78 
 
 		 168 aa  82.4  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3640  redoxin domain-containing protein  34.11 
 
 		 195 aa  82  0.000000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.851507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2950  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.11 
 
 		 195 aa  82.4  0.000000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2006  redoxin domain-containing protein  29.93 
 
 		 176 aa  80.9  0.000000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0112011  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5686  redoxin domain-containing protein  33.55 
 
 		 186 aa  80.5  0.000000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.131775 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3942  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.43 
 
 		 455 aa  80.5  0.000000000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1857  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.37 
 
 		 280 aa  80.1  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0607  redoxin domain-containing protein  33.33 
 
 		 182 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>